Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C2S4W1

Protein Details
Accession A0A5C2S4W1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
817-839VKSYAKSNKYPSKKKADPRSDIAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
381-391RAGGKKQEKRK
488-505SERKAEGKGPIALPKAKD
512-536SEALKRKDREKQERAASRRRVRGGA
Subcellular Location(s) cysk 15, cyto 8, nucl 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006166  ERCC4_domain  
IPR011335  Restrct_endonuc-II-like  
IPR010994  RuvA_2-like  
IPR006167  XPF  
IPR047520  XPF_nuclease  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004520  F:DNA endonuclease activity  
GO:0003697  F:single-stranded DNA binding  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF02732  ERCC4  
CDD cd20078  XPF_nuclease_XPF_euk  
Amino Acid Sequences MSTLLPYHTSILEKVHDPATSELVLLARGVGLRRIVCKLLQIYDSPQNLILLVNATPEEEAAIGEELGIMGCRNPGLRIVGFETGRKDRQDLYKKGGLLSITSQIFTVDMLTSDIPTHLITGILVLHAERVTPTSAEAFIVRLYREKNKNGFLKAFSDQPEHITSGMSPLRTIMKELQLRTVHIYPRFHAELKQSLDRKTPDIVELHQGMTEPMSEIHHAIVQCMTTTLSELKRANTMLDLDDLTIDNAYFRSFDMIVRRILDPVWHKVGPRTKQLVSDLATLRRLLTYLLTYDALAFHAYLETLIASNTTSDSGNVRQNQSPWMLTDAANVIFQYAKRRCYVMSSKSAPAKAPPPKMIDLTGDDYEWAIMEEMEAEERARAGGKKQEKRKAWVPEGMEPVLEELPKWHLLADVLQEIEEEMIRREPMLSSLSPGTNTVLVMASSLHTCTLIKDFLATMDADAPRGSQGRRMMEDKLRLYLWWKGKLSERKAEGKGPIALPKAKDNAQGEISEALKRKDREKQERAASRRRVRGGAPPAATSGRDVAGATGEVEIKKEADDIADFLLTQGVEAAEAALTQDLQLFTMDDDFDTHYGLLAPEQTVIVRAYSDDSDDQMLQEIKPRFIVMYEPNLEFIRRIEVYRNSNPGLGVRVYFMMYKLSCEEGKYLTGLRREKESFERLIKERGSMLMPIYEDHTTPAGEALIKTISTRIAGGRKEVSTEPARVVVDMREFRSSLPSLLHASGLLVLPVTLTVGDYILTPDICVERKSIPDLVSSFNSGRLYTQCELMSAHYKQPILLIEFEEHKSFSLEAVADVKSYAKSNKYPSKKKADPRSDIASTASQSIQSKLVLLTLTFPRVRIIWSSSPYATAEIFNDLKTLSAQPDPAKAVLVGAEEDPEAGAGVNAAAEELLRSLPGITAKNVKHVMSRVQSVRELCELEMKDVQEILGVEPGKACWEFIHRGEVRRGSAAS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.25
3 0.24
4 0.25
5 0.26
6 0.26
7 0.23
8 0.21
9 0.19
10 0.17
11 0.16
12 0.13
13 0.11
14 0.08
15 0.09
16 0.1
17 0.11
18 0.15
19 0.17
20 0.2
21 0.24
22 0.25
23 0.25
24 0.3
25 0.32
26 0.32
27 0.32
28 0.31
29 0.34
30 0.4
31 0.41
32 0.36
33 0.33
34 0.29
35 0.26
36 0.24
37 0.19
38 0.12
39 0.1
40 0.11
41 0.1
42 0.1
43 0.09
44 0.09
45 0.09
46 0.07
47 0.07
48 0.07
49 0.08
50 0.07
51 0.07
52 0.07
53 0.06
54 0.06
55 0.06
56 0.05
57 0.05
58 0.05
59 0.07
60 0.08
61 0.08
62 0.11
63 0.16
64 0.16
65 0.19
66 0.23
67 0.28
68 0.28
69 0.3
70 0.34
71 0.36
72 0.4
73 0.38
74 0.37
75 0.37
76 0.47
77 0.54
78 0.54
79 0.55
80 0.56
81 0.55
82 0.54
83 0.5
84 0.4
85 0.32
86 0.29
87 0.28
88 0.23
89 0.22
90 0.21
91 0.18
92 0.18
93 0.15
94 0.14
95 0.07
96 0.07
97 0.09
98 0.09
99 0.1
100 0.1
101 0.1
102 0.1
103 0.09
104 0.1
105 0.08
106 0.08
107 0.07
108 0.07
109 0.07
110 0.07
111 0.07
112 0.06
113 0.07
114 0.07
115 0.07
116 0.07
117 0.09
118 0.1
119 0.1
120 0.11
121 0.11
122 0.12
123 0.13
124 0.13
125 0.12
126 0.12
127 0.14
128 0.14
129 0.16
130 0.2
131 0.29
132 0.36
133 0.43
134 0.48
135 0.54
136 0.6
137 0.62
138 0.62
139 0.56
140 0.53
141 0.48
142 0.46
143 0.41
144 0.38
145 0.33
146 0.32
147 0.32
148 0.28
149 0.26
150 0.21
151 0.18
152 0.21
153 0.22
154 0.19
155 0.16
156 0.16
157 0.21
158 0.2
159 0.24
160 0.22
161 0.28
162 0.33
163 0.34
164 0.41
165 0.38
166 0.39
167 0.41
168 0.42
169 0.39
170 0.4
171 0.41
172 0.34
173 0.4
174 0.41
175 0.37
176 0.35
177 0.35
178 0.37
179 0.4
180 0.47
181 0.43
182 0.43
183 0.48
184 0.47
185 0.44
186 0.4
187 0.36
188 0.31
189 0.29
190 0.28
191 0.28
192 0.27
193 0.25
194 0.22
195 0.2
196 0.17
197 0.15
198 0.14
199 0.08
200 0.08
201 0.09
202 0.09
203 0.1
204 0.1
205 0.13
206 0.12
207 0.12
208 0.12
209 0.11
210 0.1
211 0.1
212 0.1
213 0.07
214 0.09
215 0.13
216 0.13
217 0.19
218 0.2
219 0.21
220 0.24
221 0.24
222 0.23
223 0.2
224 0.21
225 0.16
226 0.16
227 0.15
228 0.12
229 0.12
230 0.12
231 0.1
232 0.09
233 0.07
234 0.06
235 0.06
236 0.06
237 0.06
238 0.06
239 0.08
240 0.09
241 0.11
242 0.17
243 0.19
244 0.21
245 0.23
246 0.23
247 0.21
248 0.2
249 0.24
250 0.21
251 0.25
252 0.28
253 0.27
254 0.27
255 0.34
256 0.42
257 0.41
258 0.46
259 0.46
260 0.42
261 0.45
262 0.47
263 0.45
264 0.39
265 0.41
266 0.35
267 0.32
268 0.32
269 0.28
270 0.26
271 0.21
272 0.18
273 0.12
274 0.11
275 0.09
276 0.09
277 0.11
278 0.11
279 0.1
280 0.1
281 0.1
282 0.09
283 0.08
284 0.07
285 0.06
286 0.05
287 0.05
288 0.05
289 0.05
290 0.04
291 0.04
292 0.04
293 0.04
294 0.04
295 0.04
296 0.05
297 0.06
298 0.06
299 0.06
300 0.09
301 0.12
302 0.18
303 0.22
304 0.25
305 0.26
306 0.27
307 0.29
308 0.29
309 0.26
310 0.21
311 0.21
312 0.19
313 0.17
314 0.17
315 0.16
316 0.14
317 0.14
318 0.12
319 0.1
320 0.09
321 0.1
322 0.18
323 0.19
324 0.21
325 0.22
326 0.23
327 0.23
328 0.3
329 0.37
330 0.34
331 0.4
332 0.41
333 0.45
334 0.48
335 0.49
336 0.42
337 0.37
338 0.39
339 0.38
340 0.39
341 0.39
342 0.39
343 0.4
344 0.4
345 0.39
346 0.32
347 0.28
348 0.27
349 0.23
350 0.19
351 0.17
352 0.15
353 0.14
354 0.11
355 0.08
356 0.04
357 0.03
358 0.03
359 0.04
360 0.04
361 0.04
362 0.05
363 0.04
364 0.04
365 0.04
366 0.05
367 0.06
368 0.07
369 0.09
370 0.16
371 0.26
372 0.34
373 0.43
374 0.52
375 0.54
376 0.6
377 0.66
378 0.67
379 0.62
380 0.6
381 0.54
382 0.51
383 0.51
384 0.44
385 0.36
386 0.27
387 0.24
388 0.19
389 0.16
390 0.09
391 0.06
392 0.09
393 0.1
394 0.1
395 0.08
396 0.08
397 0.09
398 0.1
399 0.11
400 0.09
401 0.08
402 0.08
403 0.08
404 0.07
405 0.07
406 0.06
407 0.05
408 0.05
409 0.06
410 0.06
411 0.06
412 0.06
413 0.06
414 0.08
415 0.1
416 0.09
417 0.11
418 0.12
419 0.13
420 0.13
421 0.13
422 0.12
423 0.09
424 0.09
425 0.08
426 0.06
427 0.06
428 0.06
429 0.05
430 0.05
431 0.05
432 0.05
433 0.05
434 0.05
435 0.05
436 0.06
437 0.07
438 0.07
439 0.07
440 0.07
441 0.07
442 0.07
443 0.08
444 0.07
445 0.05
446 0.08
447 0.09
448 0.08
449 0.08
450 0.08
451 0.08
452 0.1
453 0.1
454 0.11
455 0.15
456 0.18
457 0.2
458 0.22
459 0.25
460 0.27
461 0.33
462 0.29
463 0.27
464 0.25
465 0.22
466 0.22
467 0.25
468 0.26
469 0.26
470 0.26
471 0.26
472 0.33
473 0.41
474 0.44
475 0.43
476 0.43
477 0.43
478 0.45
479 0.46
480 0.4
481 0.35
482 0.33
483 0.28
484 0.27
485 0.23
486 0.23
487 0.21
488 0.22
489 0.22
490 0.21
491 0.25
492 0.22
493 0.23
494 0.22
495 0.21
496 0.19
497 0.18
498 0.17
499 0.15
500 0.15
501 0.14
502 0.18
503 0.19
504 0.22
505 0.28
506 0.37
507 0.45
508 0.5
509 0.56
510 0.61
511 0.68
512 0.71
513 0.73
514 0.72
515 0.69
516 0.69
517 0.64
518 0.57
519 0.5
520 0.52
521 0.5
522 0.46
523 0.4
524 0.34
525 0.33
526 0.31
527 0.29
528 0.21
529 0.15
530 0.09
531 0.09
532 0.08
533 0.07
534 0.06
535 0.06
536 0.06
537 0.06
538 0.06
539 0.06
540 0.06
541 0.07
542 0.06
543 0.06
544 0.06
545 0.06
546 0.05
547 0.06
548 0.06
549 0.06
550 0.06
551 0.06
552 0.05
553 0.06
554 0.05
555 0.05
556 0.05
557 0.04
558 0.04
559 0.04
560 0.04
561 0.03
562 0.03
563 0.03
564 0.03
565 0.03
566 0.03
567 0.04
568 0.04
569 0.05
570 0.05
571 0.05
572 0.05
573 0.06
574 0.06
575 0.05
576 0.06
577 0.07
578 0.07
579 0.07
580 0.07
581 0.06
582 0.07
583 0.07
584 0.06
585 0.06
586 0.06
587 0.05
588 0.06
589 0.05
590 0.06
591 0.07
592 0.07
593 0.06
594 0.06
595 0.07
596 0.07
597 0.09
598 0.08
599 0.09
600 0.1
601 0.1
602 0.1
603 0.11
604 0.11
605 0.1
606 0.16
607 0.17
608 0.16
609 0.16
610 0.17
611 0.14
612 0.14
613 0.18
614 0.14
615 0.19
616 0.22
617 0.21
618 0.23
619 0.23
620 0.23
621 0.2
622 0.17
623 0.15
624 0.13
625 0.14
626 0.18
627 0.24
628 0.31
629 0.35
630 0.39
631 0.35
632 0.35
633 0.34
634 0.3
635 0.26
636 0.2
637 0.15
638 0.12
639 0.12
640 0.11
641 0.11
642 0.11
643 0.12
644 0.11
645 0.12
646 0.13
647 0.15
648 0.14
649 0.15
650 0.16
651 0.14
652 0.14
653 0.14
654 0.16
655 0.17
656 0.23
657 0.26
658 0.26
659 0.31
660 0.31
661 0.34
662 0.38
663 0.39
664 0.38
665 0.39
666 0.44
667 0.4
668 0.45
669 0.41
670 0.36
671 0.32
672 0.28
673 0.25
674 0.2
675 0.18
676 0.14
677 0.14
678 0.13
679 0.14
680 0.13
681 0.12
682 0.12
683 0.12
684 0.1
685 0.1
686 0.1
687 0.08
688 0.08
689 0.08
690 0.08
691 0.08
692 0.08
693 0.08
694 0.09
695 0.09
696 0.09
697 0.1
698 0.12
699 0.17
700 0.18
701 0.21
702 0.24
703 0.24
704 0.26
705 0.26
706 0.28
707 0.25
708 0.26
709 0.24
710 0.24
711 0.24
712 0.21
713 0.21
714 0.18
715 0.21
716 0.23
717 0.24
718 0.22
719 0.23
720 0.23
721 0.27
722 0.25
723 0.2
724 0.18
725 0.18
726 0.19
727 0.19
728 0.19
729 0.14
730 0.13
731 0.13
732 0.12
733 0.09
734 0.06
735 0.05
736 0.05
737 0.05
738 0.05
739 0.03
740 0.03
741 0.04
742 0.04
743 0.04
744 0.04
745 0.06
746 0.07
747 0.07
748 0.06
749 0.07
750 0.1
751 0.11
752 0.11
753 0.13
754 0.14
755 0.16
756 0.2
757 0.23
758 0.21
759 0.24
760 0.25
761 0.27
762 0.26
763 0.27
764 0.24
765 0.24
766 0.24
767 0.21
768 0.21
769 0.19
770 0.24
771 0.21
772 0.24
773 0.2
774 0.2
775 0.21
776 0.23
777 0.28
778 0.24
779 0.27
780 0.27
781 0.27
782 0.26
783 0.28
784 0.28
785 0.23
786 0.22
787 0.2
788 0.19
789 0.22
790 0.24
791 0.22
792 0.19
793 0.17
794 0.17
795 0.16
796 0.13
797 0.13
798 0.11
799 0.11
800 0.14
801 0.13
802 0.12
803 0.12
804 0.13
805 0.11
806 0.14
807 0.17
808 0.19
809 0.25
810 0.34
811 0.44
812 0.54
813 0.63
814 0.69
815 0.75
816 0.79
817 0.84
818 0.86
819 0.86
820 0.83
821 0.79
822 0.78
823 0.69
824 0.62
825 0.55
826 0.47
827 0.37
828 0.33
829 0.27
830 0.22
831 0.21
832 0.22
833 0.21
834 0.18
835 0.18
836 0.15
837 0.17
838 0.14
839 0.13
840 0.15
841 0.16
842 0.22
843 0.21
844 0.21
845 0.21
846 0.21
847 0.23
848 0.22
849 0.26
850 0.27
851 0.3
852 0.34
853 0.33
854 0.34
855 0.33
856 0.31
857 0.25
858 0.2
859 0.18
860 0.19
861 0.19
862 0.17
863 0.17
864 0.15
865 0.15
866 0.15
867 0.16
868 0.14
869 0.15
870 0.19
871 0.21
872 0.25
873 0.27
874 0.26
875 0.25
876 0.22
877 0.2
878 0.17
879 0.16
880 0.13
881 0.11
882 0.11
883 0.1
884 0.1
885 0.09
886 0.08
887 0.07
888 0.05
889 0.05
890 0.04
891 0.04
892 0.04
893 0.04
894 0.04
895 0.03
896 0.03
897 0.04
898 0.05
899 0.05
900 0.05
901 0.05
902 0.06
903 0.08
904 0.13
905 0.15
906 0.17
907 0.26
908 0.27
909 0.35
910 0.38
911 0.37
912 0.38
913 0.4
914 0.45
915 0.42
916 0.5
917 0.46
918 0.47
919 0.51
920 0.48
921 0.47
922 0.43
923 0.39
924 0.31
925 0.35
926 0.32
927 0.31
928 0.33
929 0.3
930 0.27
931 0.25
932 0.24
933 0.19
934 0.18
935 0.15
936 0.17
937 0.16
938 0.15
939 0.16
940 0.16
941 0.17
942 0.17
943 0.16
944 0.13
945 0.19
946 0.24
947 0.26
948 0.36
949 0.36
950 0.41
951 0.49
952 0.52
953 0.48