FuNGI

A0A5C2SFF0

Protein Details

Accession

A0A5C2SFF0

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
299-318	NEAKKKEQERDSKKVKPRAC	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
284-285	KR
288-288	K
302-314	KKKEQERDSKKVK

Subcellular Location(s)

mito 11, cyto 6, nucl 4, extr 2, plas 1, pero 1, E.R. 1, vacu 1

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR004871 Cleavage/polyA-sp_fac_asu_C IPR018846 Cleavage/polyA-sp_fac_asu_N IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003676 F:nucleic acid binding
Pfam	View protein in Pfam PF03178 CPSF_A PF10433 MMS1_N

Amino Acid Sequences

MRVVSTFHPSSSVSRSLKCRLTPDAEHLVVAKTDKLEVHSLQPDGLRRECVVDMWGRVVGLQAIPAREDGRSHILAMIDHPDPKLVVFALEIEDGVASLNSKSSLSLADRAPRPAEFITDVQVDPTGKIAVACCFTGKLKVVPLEDGELGNSFDVSLPELNLLAFTFLYTGDAKRHTLGLLHLNHRRQIQLLCRDVDLQELELSPAHSNLIITTLLSDRTFPILEPPPILVPVPPNEAEINNDDDYDPEMAPHRGGVLVLGGKKVIFYENSKPQQQMTRHGKQKRLSKRLASDKQVEVNEAKKKEQERDSKKVKPRACVKWPWGPVTAWSVVDDACRKVLLGDAFGRLAMLAFDDVKMCLTLIPLGEASAPTTLSYLSSQVFYLGSHSGDSQLFRIHPSPIANASSDTLPIPKGITTISPTSLASSDKGKGRASADDSPEDQSGRIVNTKGTFLEVLQTYDNIAPIMDAVLEDIDGSGQPQVITCSGARNTGSLRVIRSEADFHETARLQGLSGITDVWPVKSHSGDPTHSHLVVSTLRETLVFSFTDKETISLLDPSLTGFVTDVPTMALGNIPRRQPGAGGKSTYIDSPLVVQITSEGAHLIEYDPALGAFTRTVGGWYPQKAGPGFAGKEVVAAAMNASQFVVGLSGGRLALLNLGNDDTVQLLRTRDFADEICAVSCRPLDSSKNFTTLIAVSFWGSNRVAVLSVTGTEVLSTVCETTLPALPRSVLIHNFGKGAGPNSPDFHLHLLAGLADGTLVTYTLRDKELHDRKQSGLGNAPASLSVCDVDGRMVVVASGTRANVLFWDKQRVRPSPTSLKDIVKSATLHATAFPSCLVIATASALLIGRVRGVDKMQIRTIPLGLDNPRKIGYHAGQEVFGVACIRIAPGRIGDLEEVTGSFKLLDAHSSRELHEFNCSAEEEPASVLVLPGAGSGKSPAFALGTVFIRPDEREPSTGRIVLFSVASTEGTNTRSLDVLATEDVRGCVYAIARLADDLIAAAINTSVVLFRIRENDSAELSPLMLERVTEWNHSHFVTNLVFDGQYLLVGDAISSVAVLVWNEERGRLEAAGRDYGPLWPVSIESTGNGIIGANSDCNLFSFKATPAPPPPGRNVRVILEKDGVYHIDDVVNRFLRGALSSADVSDQQSVKASHVFFTSTGRIGAIMDIDDSVSLHMTALQRNMAKKIQGPGGVNLTKYRAPASPRGHTDAEEAYGFLDGDFLELFLSQSEPEEFMVGDVEAERIILPIDHVKDVLVQMQSLH

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.39
2	0.45
3	0.5
4	0.55
5	0.55
6	0.55
7	0.53
8	0.57
9	0.55
10	0.56
11	0.57
12	0.51
13	0.47
14	0.43
15	0.37
16	0.31
17	0.28
18	0.23
19	0.15
20	0.17
21	0.17
22	0.2
23	0.23
24	0.24
25	0.29
26	0.31
27	0.31
28	0.31
29	0.33
30	0.36
31	0.36
32	0.37
33	0.33
34	0.29
35	0.32
36	0.31
37	0.28
38	0.26
39	0.25
40	0.24
41	0.23
42	0.23
43	0.19
44	0.18
45	0.18
46	0.15
47	0.11
48	0.14
49	0.14
50	0.14
51	0.15
52	0.17
53	0.17
54	0.17
55	0.18
56	0.18
57	0.22
58	0.23
59	0.23
60	0.23
61	0.23
62	0.23
63	0.24
64	0.23
65	0.19
66	0.19
67	0.19
68	0.17
69	0.17
70	0.16
71	0.16
72	0.12
73	0.11
74	0.09
75	0.1
76	0.11
77	0.11
78	0.11
79	0.09
80	0.09
81	0.08
82	0.08
83	0.07
84	0.05
85	0.05
86	0.07
87	0.07
88	0.08
89	0.08
90	0.09
91	0.13
92	0.15
93	0.2
94	0.23
95	0.31
96	0.34
97	0.37
98	0.38
99	0.34
100	0.35
101	0.31
102	0.31
103	0.27
104	0.25
105	0.25
106	0.26
107	0.25
108	0.22
109	0.24
110	0.21
111	0.17
112	0.17
113	0.14
114	0.11
115	0.12
116	0.13
117	0.13
118	0.15
119	0.15
120	0.14
121	0.16
122	0.17
123	0.21
124	0.22
125	0.21
126	0.25
127	0.29
128	0.3
129	0.3
130	0.31
131	0.29
132	0.27
133	0.25
134	0.2
135	0.16
136	0.15
137	0.13
138	0.11
139	0.08
140	0.08
141	0.08
142	0.09
143	0.09
144	0.09
145	0.09
146	0.1
147	0.09
148	0.09
149	0.08
150	0.07
151	0.06
152	0.06
153	0.06
154	0.06
155	0.08
156	0.09
157	0.1
158	0.13
159	0.16
160	0.18
161	0.19
162	0.2
163	0.18
164	0.18
165	0.21
166	0.25
167	0.29
168	0.35
169	0.41
170	0.43
171	0.46
172	0.46
173	0.44
174	0.39
175	0.38
176	0.4
177	0.43
178	0.45
179	0.42
180	0.42
181	0.42
182	0.39
183	0.36
184	0.28
185	0.2
186	0.16
187	0.15
188	0.14
189	0.13
190	0.15
191	0.12
192	0.11
193	0.1
194	0.09
195	0.09
196	0.08
197	0.1
198	0.08
199	0.07
200	0.09
201	0.1
202	0.11
203	0.11
204	0.12
205	0.11
206	0.14
207	0.14
208	0.13
209	0.18
210	0.23
211	0.24
212	0.24
213	0.25
214	0.23
215	0.24
216	0.24
217	0.18
218	0.16
219	0.17
220	0.21
221	0.2
222	0.2
223	0.21
224	0.21
225	0.23
226	0.22
227	0.24
228	0.19
229	0.19
230	0.17
231	0.16
232	0.18
233	0.17
234	0.14
235	0.1
236	0.13
237	0.13
238	0.13
239	0.13
240	0.11
241	0.09
242	0.09
243	0.09
244	0.08
245	0.11
246	0.12
247	0.12
248	0.12
249	0.11
250	0.12
251	0.12
252	0.12
253	0.11
254	0.15
255	0.23
256	0.33
257	0.39
258	0.42
259	0.42
260	0.43
261	0.49
262	0.47
263	0.5
264	0.49
265	0.53
266	0.59
267	0.65
268	0.69
269	0.68
270	0.75
271	0.75
272	0.75
273	0.73
274	0.72
275	0.75
276	0.79
277	0.8
278	0.77
279	0.72
280	0.66
281	0.65
282	0.57
283	0.5
284	0.41
285	0.4
286	0.41
287	0.37
288	0.35
289	0.34
290	0.37
291	0.43
292	0.5
293	0.54
294	0.55
295	0.63
296	0.7
297	0.74
298	0.79
299	0.8
300	0.76
301	0.74
302	0.75
303	0.75
304	0.75
305	0.74
306	0.71
307	0.71
308	0.71
309	0.65
310	0.59
311	0.49
312	0.42
313	0.38
314	0.34
315	0.25
316	0.22
317	0.18
318	0.16
319	0.18
320	0.18
321	0.14
322	0.13
323	0.12
324	0.11
325	0.11
326	0.14
327	0.12
328	0.13
329	0.14
330	0.15
331	0.15
332	0.15
333	0.14
334	0.1
335	0.09
336	0.06
337	0.05
338	0.04
339	0.05
340	0.05
341	0.06
342	0.06
343	0.06
344	0.07
345	0.06
346	0.06
347	0.06
348	0.07
349	0.07
350	0.08
351	0.07
352	0.07
353	0.08
354	0.07
355	0.08
356	0.07
357	0.07
358	0.06
359	0.06
360	0.06
361	0.07
362	0.08
363	0.08
364	0.08
365	0.09
366	0.09
367	0.09
368	0.09
369	0.08
370	0.1
371	0.09
372	0.09
373	0.09
374	0.09
375	0.11
376	0.11
377	0.12
378	0.11
379	0.12
380	0.12
381	0.14
382	0.15
383	0.14
384	0.16
385	0.17
386	0.18
387	0.19
388	0.2
389	0.18
390	0.17
391	0.17
392	0.15
393	0.14
394	0.12
395	0.11
396	0.09
397	0.09
398	0.09
399	0.08
400	0.08
401	0.08
402	0.09
403	0.11
404	0.13
405	0.13
406	0.14
407	0.14
408	0.14
409	0.15
410	0.14
411	0.12
412	0.14
413	0.16
414	0.19
415	0.22
416	0.21
417	0.23
418	0.24
419	0.27
420	0.29
421	0.31
422	0.31
423	0.3
424	0.31
425	0.3
426	0.29
427	0.26
428	0.2
429	0.15
430	0.13
431	0.12
432	0.13
433	0.11
434	0.13
435	0.13
436	0.14
437	0.14
438	0.14
439	0.13
440	0.1
441	0.14
442	0.12
443	0.13
444	0.12
445	0.12
446	0.12
447	0.12
448	0.12
449	0.08
450	0.07
451	0.05
452	0.05
453	0.05
454	0.04
455	0.03
456	0.03
457	0.03
458	0.03
459	0.03
460	0.03
461	0.03
462	0.03
463	0.03
464	0.03
465	0.04
466	0.04
467	0.04
468	0.06
469	0.06
470	0.08
471	0.07
472	0.11
473	0.11
474	0.13
475	0.13
476	0.13
477	0.14
478	0.17
479	0.19
480	0.17
481	0.17
482	0.17
483	0.18
484	0.17
485	0.17
486	0.15
487	0.14
488	0.17
489	0.16
490	0.15
491	0.18
492	0.17
493	0.16
494	0.16
495	0.15
496	0.1
497	0.12
498	0.11
499	0.08
500	0.08
501	0.08
502	0.06
503	0.09
504	0.09
505	0.08
506	0.09
507	0.09
508	0.1
509	0.11
510	0.12
511	0.14
512	0.18
513	0.19
514	0.21
515	0.26
516	0.27
517	0.26
518	0.25
519	0.21
520	0.2
521	0.19
522	0.18
523	0.13
524	0.11
525	0.11
526	0.11
527	0.11
528	0.1
529	0.1
530	0.08
531	0.08
532	0.1
533	0.1
534	0.12
535	0.11
536	0.11
537	0.1
538	0.1
539	0.1
540	0.09
541	0.09
542	0.07
543	0.07
544	0.07
545	0.07
546	0.06
547	0.05
548	0.04
549	0.05
550	0.06
551	0.06
552	0.06
553	0.05
554	0.05
555	0.05
556	0.05
557	0.06
558	0.06
559	0.1
560	0.14
561	0.14
562	0.15
563	0.16
564	0.16
565	0.17
566	0.22
567	0.24
568	0.23
569	0.24
570	0.23
571	0.24
572	0.24
573	0.22
574	0.17
575	0.11
576	0.09
577	0.08
578	0.09
579	0.08
580	0.07
581	0.07
582	0.06
583	0.06
584	0.07
585	0.05
586	0.05
587	0.04
588	0.04
589	0.05
590	0.05
591	0.05
592	0.04
593	0.04
594	0.04
595	0.04
596	0.04
597	0.04
598	0.04
599	0.03
600	0.04
601	0.04
602	0.04
603	0.05
604	0.05
605	0.08
606	0.1
607	0.11
608	0.14
609	0.14
610	0.17
611	0.16
612	0.16
613	0.15
614	0.16
615	0.15
616	0.13
617	0.13
618	0.11
619	0.11
620	0.1
621	0.09
622	0.05
623	0.05
624	0.04
625	0.05
626	0.05
627	0.05
628	0.05
629	0.04
630	0.04
631	0.04
632	0.04
633	0.03
634	0.03
635	0.03
636	0.03
637	0.03
638	0.04
639	0.04
640	0.03
641	0.05
642	0.06
643	0.06
644	0.05
645	0.06
646	0.06
647	0.06
648	0.06
649	0.05
650	0.04
651	0.05
652	0.06
653	0.06
654	0.07
655	0.08
656	0.09
657	0.09
658	0.1
659	0.1
660	0.12
661	0.12
662	0.12
663	0.11
664	0.1
665	0.1
666	0.09
667	0.09
668	0.07
669	0.07
670	0.1
671	0.13
672	0.17
673	0.24
674	0.25
675	0.27
676	0.27
677	0.26
678	0.24
679	0.21
680	0.18
681	0.12
682	0.1
683	0.08
684	0.08
685	0.09
686	0.1
687	0.09
688	0.08
689	0.08
690	0.08
691	0.07
692	0.07
693	0.07
694	0.05
695	0.05
696	0.05
697	0.05
698	0.05
699	0.04
700	0.05
701	0.04
702	0.04
703	0.04
704	0.04
705	0.04
706	0.04
707	0.04
708	0.05
709	0.09
710	0.1
711	0.11
712	0.11
713	0.11
714	0.12
715	0.14
716	0.15
717	0.13
718	0.16
719	0.17
720	0.17
721	0.17
722	0.16
723	0.15
724	0.13
725	0.13
726	0.11
727	0.12
728	0.12
729	0.14
730	0.15
731	0.15
732	0.15
733	0.15
734	0.14
735	0.11
736	0.1
737	0.09
738	0.08
739	0.07
740	0.06
741	0.04
742	0.03
743	0.03
744	0.03
745	0.02
746	0.02
747	0.02
748	0.03
749	0.04
750	0.06
751	0.08
752	0.08
753	0.11
754	0.22
755	0.31
756	0.38
757	0.43
758	0.44
759	0.43
760	0.51
761	0.5
762	0.42
763	0.37
764	0.32
765	0.28
766	0.25
767	0.24
768	0.17
769	0.15
770	0.13
771	0.09
772	0.06
773	0.06
774	0.06
775	0.06
776	0.06
777	0.05
778	0.05
779	0.05
780	0.04
781	0.04
782	0.04
783	0.04
784	0.04
785	0.05
786	0.05
787	0.05
788	0.06
789	0.06
790	0.07
791	0.11
792	0.14
793	0.15
794	0.25
795	0.26
796	0.33
797	0.4
798	0.43
799	0.46
800	0.47
801	0.53
802	0.53
803	0.55
804	0.54
805	0.51
806	0.5
807	0.45
808	0.42
809	0.35
810	0.28
811	0.25
812	0.21
813	0.2
814	0.18
815	0.16
816	0.15
817	0.16
818	0.13
819	0.13
820	0.12
821	0.08
822	0.08
823	0.08
824	0.07
825	0.05
826	0.05
827	0.05
828	0.05
829	0.05
830	0.05
831	0.05
832	0.04
833	0.05
834	0.05
835	0.04
836	0.05
837	0.06
838	0.07
839	0.08
840	0.14
841	0.17
842	0.21
843	0.23
844	0.24
845	0.24
846	0.25
847	0.24
848	0.19
849	0.16
850	0.17
851	0.2
852	0.26
853	0.25
854	0.26
855	0.27
856	0.26
857	0.26
858	0.28
859	0.26
860	0.25
861	0.29
862	0.27
863	0.26
864	0.25
865	0.25
866	0.19
867	0.17
868	0.1
869	0.06
870	0.05
871	0.05
872	0.06
873	0.06
874	0.07
875	0.07
876	0.07
877	0.08
878	0.09
879	0.1
880	0.1
881	0.1
882	0.09
883	0.08
884	0.08
885	0.08
886	0.08
887	0.06
888	0.06
889	0.06
890	0.07
891	0.08
892	0.11
893	0.12
894	0.16
895	0.2
896	0.22
897	0.22
898	0.25
899	0.26
900	0.22
901	0.25
902	0.21
903	0.18
904	0.19
905	0.18
906	0.15
907	0.15
908	0.15
909	0.11
910	0.11
911	0.1
912	0.08
913	0.07
914	0.06
915	0.05
916	0.05
917	0.04
918	0.04
919	0.05
920	0.05
921	0.05
922	0.07
923	0.07
924	0.07
925	0.07
926	0.07
927	0.07
928	0.07
929	0.08
930	0.09
931	0.1
932	0.1
933	0.11
934	0.11
935	0.11
936	0.12
937	0.15
938	0.17
939	0.19
940	0.22
941	0.24
942	0.29
943	0.31
944	0.32
945	0.29
946	0.25
947	0.23
948	0.2
949	0.18
950	0.13
951	0.11
952	0.09
953	0.09
954	0.08
955	0.09
956	0.1
957	0.11
958	0.13
959	0.12
960	0.12
961	0.12
962	0.12
963	0.11
964	0.1
965	0.1
966	0.1
967	0.1
968	0.1
969	0.1
970	0.1
971	0.1
972	0.09
973	0.08
974	0.08
975	0.07
976	0.09
977	0.1
978	0.1
979	0.1
980	0.1
981	0.1
982	0.08
983	0.08
984	0.06
985	0.05
986	0.04
987	0.04
988	0.04
989	0.03
990	0.03
991	0.03
992	0.03
993	0.03
994	0.04
995	0.06
996	0.06
997	0.08
998	0.14
999	0.16
1000	0.19
1001	0.22
1002	0.24
1003	0.25
1004	0.25
1005	0.25
1006	0.19
1007	0.17
1008	0.15
1009	0.12
1010	0.1
1011	0.07
1012	0.07
1013	0.08
1014	0.13
1015	0.15
1016	0.18
1017	0.2
1018	0.22
1019	0.24
1020	0.25
1021	0.24
1022	0.19
1023	0.22
1024	0.19
1025	0.18
1026	0.16
1027	0.15
1028	0.14
1029	0.12
1030	0.13
1031	0.09
1032	0.08
1033	0.08
1034	0.07
1035	0.06
1036	0.06
1037	0.06
1038	0.05
1039	0.05
1040	0.04
1041	0.04
1042	0.03
1043	0.03
1044	0.04
1045	0.04
1046	0.06
1047	0.07
1048	0.1
1049	0.1
1050	0.12
1051	0.13
1052	0.14
1053	0.16
1054	0.15
1055	0.16
1056	0.18
1057	0.21
1058	0.23
1059	0.22
1060	0.21
1061	0.2
1062	0.2
1063	0.2
1064	0.16
1065	0.13
1066	0.1
1067	0.1
1068	0.11
1069	0.12
1070	0.11
1071	0.1
1072	0.12
1073	0.12
1074	0.11
1075	0.11
1076	0.09
1077	0.07
1078	0.09
1079	0.09
1080	0.07
1081	0.07
1082	0.08
1083	0.08
1084	0.09
1085	0.12
1086	0.11
1087	0.12
1088	0.14
1089	0.14
1090	0.21
1091	0.22
1092	0.27
1093	0.3
1094	0.38
1095	0.42
1096	0.44
1097	0.51
1098	0.53
1099	0.55
1100	0.54
1101	0.53
1102	0.48
1103	0.52
1104	0.51
1105	0.47
1106	0.41
1107	0.38
1108	0.34
1109	0.32
1110	0.28
1111	0.21
1112	0.2
1113	0.16
1114	0.16
1115	0.17
1116	0.18
1117	0.23
1118	0.24
1119	0.22
1120	0.22
1121	0.22
1122	0.19
1123	0.19
1124	0.18
1125	0.13
1126	0.14
1127	0.14
1128	0.14
1129	0.15
1130	0.15
1131	0.15
1132	0.18
1133	0.17
1134	0.15
1135	0.19
1136	0.19
1137	0.2
1138	0.24
1139	0.23
1140	0.2
1141	0.21
1142	0.22
1143	0.19
1144	0.23
1145	0.24
1146	0.21
1147	0.2
1148	0.18
1149	0.17
1150	0.16
1151	0.16
1152	0.12
1153	0.09
1154	0.08
1155	0.08
1156	0.08
1157	0.07
1158	0.07
1159	0.07
1160	0.07
1161	0.06
1162	0.06
1163	0.1
1164	0.12
1165	0.15
1166	0.17
1167	0.22
1168	0.25
1169	0.28
1170	0.33
1171	0.33
1172	0.34
1173	0.36
1174	0.4
1175	0.41
1176	0.43
1177	0.43
1178	0.42
1179	0.47
1180	0.46
1181	0.42
1182	0.38
1183	0.36
1184	0.33
1185	0.31
1186	0.3
1187	0.26
1188	0.29
1189	0.38
1190	0.43
1191	0.48
1192	0.52
1193	0.57
1194	0.55
1195	0.52
1196	0.5
1197	0.43
1198	0.38
1199	0.29
1200	0.23
1201	0.17
1202	0.16
1203	0.15
1204	0.11
1205	0.09
1206	0.06
1207	0.07
1208	0.07
1209	0.06
1210	0.06
1211	0.06
1212	0.06
1213	0.06
1214	0.08
1215	0.07
1216	0.09
1217	0.1
1218	0.11
1219	0.11
1220	0.12
1221	0.11
1222	0.11
1223	0.12
1224	0.1
1225	0.09
1226	0.08
1227	0.08
1228	0.07
1229	0.07
1230	0.07
1231	0.06
1232	0.07
1233	0.06
1234	0.08
1235	0.14
1236	0.17
1237	0.18
1238	0.18
1239	0.18
1240	0.21
1241	0.22
1242	0.24
1243	0.19

A0A5C2SFF0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer