Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C2SEL1

Protein Details
Accession A0A5C2SEL1    Localization Confidence High Confidence Score 15.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
89-109ADGKRKVKKIKDPLAPKRPPSBasic
254-273AATPSKEEGKKEKKHKKAKABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
79-107GKKRKSRGEDADGKRKVKKIKDPLAPKRP
243-273PPKKSKKEAVAAATPSKEEGKKEKKHKKAKA
Subcellular Location(s) cyto_nucl 11.5, nucl 11, cyto 10, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
CDD cd00084  HMG-box_SF  
Amino Acid Sequences MSNMNEHMASYEYHKMQLIGNLNQMATNMREAANAAEQLVQMIGAFPYGANPGAFAALANGQYQMPVMPPMPMVQDEHGKKRKSRGEDADGKRKVKKIKDPLAPKRPPSSYLLFQNDVRNELKAKNPGMRNNELLSAIAKLWSEMPQDQKDQYEQRNKAAKDTWLAQKLVYEQGKAGAAAVPVKVAAVPAVAAPVAAIPVAAAPAPAAAAAQSDTSEEEEDDDEESSGSADASSDGESPVEPPPKKSKKEAVAAATPSKEEGKKEKKHKKAKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.24
3 0.24
4 0.29
5 0.31
6 0.27
7 0.3
8 0.3
9 0.29
10 0.28
11 0.27
12 0.23
13 0.18
14 0.17
15 0.14
16 0.12
17 0.13
18 0.13
19 0.15
20 0.16
21 0.15
22 0.14
23 0.13
24 0.13
25 0.13
26 0.12
27 0.09
28 0.06
29 0.07
30 0.06
31 0.04
32 0.04
33 0.04
34 0.05
35 0.06
36 0.08
37 0.07
38 0.07
39 0.07
40 0.08
41 0.08
42 0.07
43 0.07
44 0.07
45 0.08
46 0.08
47 0.09
48 0.08
49 0.08
50 0.09
51 0.08
52 0.07
53 0.08
54 0.08
55 0.08
56 0.08
57 0.09
58 0.11
59 0.11
60 0.12
61 0.12
62 0.2
63 0.23
64 0.32
65 0.39
66 0.41
67 0.43
68 0.5
69 0.55
70 0.54
71 0.6
72 0.59
73 0.61
74 0.68
75 0.72
76 0.74
77 0.72
78 0.68
79 0.62
80 0.59
81 0.57
82 0.54
83 0.57
84 0.57
85 0.61
86 0.67
87 0.74
88 0.79
89 0.83
90 0.8
91 0.74
92 0.7
93 0.62
94 0.55
95 0.49
96 0.44
97 0.38
98 0.4
99 0.41
100 0.37
101 0.37
102 0.39
103 0.35
104 0.33
105 0.29
106 0.23
107 0.2
108 0.2
109 0.22
110 0.22
111 0.23
112 0.26
113 0.3
114 0.35
115 0.39
116 0.4
117 0.38
118 0.34
119 0.33
120 0.27
121 0.23
122 0.18
123 0.13
124 0.1
125 0.08
126 0.07
127 0.06
128 0.07
129 0.08
130 0.09
131 0.11
132 0.16
133 0.17
134 0.19
135 0.2
136 0.2
137 0.22
138 0.25
139 0.31
140 0.35
141 0.35
142 0.4
143 0.47
144 0.46
145 0.46
146 0.44
147 0.38
148 0.32
149 0.35
150 0.34
151 0.31
152 0.31
153 0.28
154 0.26
155 0.26
156 0.3
157 0.26
158 0.2
159 0.16
160 0.17
161 0.17
162 0.16
163 0.14
164 0.09
165 0.08
166 0.09
167 0.09
168 0.07
169 0.06
170 0.07
171 0.06
172 0.05
173 0.04
174 0.03
175 0.03
176 0.03
177 0.04
178 0.04
179 0.04
180 0.03
181 0.03
182 0.03
183 0.03
184 0.03
185 0.02
186 0.03
187 0.03
188 0.03
189 0.03
190 0.03
191 0.03
192 0.03
193 0.03
194 0.03
195 0.03
196 0.04
197 0.04
198 0.05
199 0.05
200 0.06
201 0.07
202 0.08
203 0.09
204 0.09
205 0.09
206 0.1
207 0.1
208 0.11
209 0.1
210 0.09
211 0.08
212 0.08
213 0.07
214 0.07
215 0.06
216 0.05
217 0.05
218 0.05
219 0.06
220 0.07
221 0.07
222 0.08
223 0.08
224 0.08
225 0.1
226 0.16
227 0.23
228 0.23
229 0.28
230 0.39
231 0.48
232 0.53
233 0.6
234 0.63
235 0.63
236 0.72
237 0.74
238 0.69
239 0.67
240 0.67
241 0.64
242 0.55
243 0.47
244 0.4
245 0.38
246 0.34
247 0.32
248 0.38
249 0.43
250 0.52
251 0.63
252 0.72
253 0.77