Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C2SH88

Protein Details
Accession A0A5C2SH88    Localization Confidence High Confidence Score 21.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-24MSSTTRPKPRPRPRARAPATASLNHydrophilic
92-123DEENRDSPRARNRKKRSQPKRKNDALPDWTKKBasic
157-176SSPRSKTKRARSRSITPPPAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
7-16PKPRPRPRAR
99-114PRARNRKKRSQPKRKN
159-167PRSKTKRAR
Subcellular Location(s) nucl 14, mito 11, cyto_nucl 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR022617  Rad60/SUMO-like_dom  
IPR029071  Ubiquitin-like_domsf  
Pfam View protein in Pfam  
PF11976  Rad60-SLD  
Amino Acid Sequences MSSTTRPKPRPRPRARAPATASLNIDATSSSSPAPSSATQIQATPALATIEDEDALFLRNRTRTPQTWKQLSRMTEVKETRKRKSSASDSSDEENRDSPRARNRKKRSQPKRKNDALPDWTKKTPKEIVISSDSDSDDDIILESKPRKATKNGDEESSPRSKTKRARSRSITPPPALPQFAIQRAQAAVEQLVGSGPRAVTPTYDADESMDNIALDPELASIAQRVRSEALRGDTPEVDMGGPEEVKLKVVWKPHPQDPDGREDSWGITQKRHTNFSLLFDEIADLAGVRVENMVICYEGKRVFAFSNPHSIGIWAEAELEACDKSTYEYLKEHKRFRSPSVAPFLPHGLDGSRRSPSRARSPSLEMLSESDEGPAPSSPAPQGDNSNTFHLTIRSERTKDKDITLVVRPTTKCGAIVRAFLKKAGLDTEYPADGAPAKGRGRGKAVAKVPVLSVDGDRMDPETEIGEADLEDGDQVEVVGL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.94
2 0.9
3 0.89
4 0.84
5 0.82
6 0.77
7 0.71
8 0.62
9 0.52
10 0.47
11 0.36
12 0.3
13 0.2
14 0.17
15 0.14
16 0.13
17 0.11
18 0.11
19 0.11
20 0.12
21 0.16
22 0.14
23 0.19
24 0.22
25 0.26
26 0.26
27 0.27
28 0.28
29 0.26
30 0.26
31 0.19
32 0.16
33 0.12
34 0.11
35 0.11
36 0.11
37 0.1
38 0.1
39 0.09
40 0.09
41 0.08
42 0.11
43 0.11
44 0.1
45 0.15
46 0.18
47 0.2
48 0.26
49 0.34
50 0.39
51 0.48
52 0.57
53 0.62
54 0.69
55 0.71
56 0.71
57 0.7
58 0.66
59 0.63
60 0.59
61 0.53
62 0.52
63 0.54
64 0.57
65 0.61
66 0.65
67 0.66
68 0.69
69 0.67
70 0.64
71 0.67
72 0.67
73 0.67
74 0.67
75 0.63
76 0.57
77 0.59
78 0.58
79 0.5
80 0.42
81 0.35
82 0.3
83 0.31
84 0.3
85 0.31
86 0.37
87 0.47
88 0.55
89 0.63
90 0.7
91 0.77
92 0.86
93 0.92
94 0.93
95 0.93
96 0.94
97 0.94
98 0.95
99 0.93
100 0.91
101 0.88
102 0.87
103 0.84
104 0.83
105 0.79
106 0.73
107 0.69
108 0.65
109 0.58
110 0.54
111 0.51
112 0.47
113 0.45
114 0.42
115 0.42
116 0.42
117 0.43
118 0.37
119 0.34
120 0.29
121 0.23
122 0.21
123 0.16
124 0.11
125 0.09
126 0.08
127 0.07
128 0.07
129 0.11
130 0.12
131 0.15
132 0.2
133 0.23
134 0.27
135 0.33
136 0.42
137 0.47
138 0.55
139 0.53
140 0.5
141 0.49
142 0.47
143 0.47
144 0.42
145 0.35
146 0.28
147 0.28
148 0.33
149 0.4
150 0.49
151 0.54
152 0.56
153 0.65
154 0.69
155 0.76
156 0.79
157 0.81
158 0.77
159 0.68
160 0.63
161 0.57
162 0.53
163 0.45
164 0.35
165 0.28
166 0.25
167 0.27
168 0.26
169 0.22
170 0.19
171 0.19
172 0.19
173 0.15
174 0.12
175 0.09
176 0.08
177 0.08
178 0.06
179 0.06
180 0.06
181 0.05
182 0.05
183 0.05
184 0.05
185 0.06
186 0.07
187 0.07
188 0.09
189 0.11
190 0.12
191 0.12
192 0.11
193 0.11
194 0.12
195 0.12
196 0.1
197 0.09
198 0.07
199 0.07
200 0.07
201 0.05
202 0.05
203 0.04
204 0.03
205 0.03
206 0.03
207 0.03
208 0.04
209 0.05
210 0.08
211 0.08
212 0.09
213 0.11
214 0.11
215 0.13
216 0.14
217 0.15
218 0.14
219 0.14
220 0.15
221 0.14
222 0.14
223 0.12
224 0.11
225 0.08
226 0.07
227 0.06
228 0.05
229 0.05
230 0.04
231 0.06
232 0.06
233 0.06
234 0.07
235 0.08
236 0.1
237 0.15
238 0.21
239 0.28
240 0.33
241 0.37
242 0.42
243 0.42
244 0.46
245 0.43
246 0.46
247 0.41
248 0.36
249 0.32
250 0.28
251 0.27
252 0.24
253 0.28
254 0.21
255 0.2
256 0.24
257 0.3
258 0.33
259 0.36
260 0.33
261 0.31
262 0.31
263 0.34
264 0.32
265 0.25
266 0.22
267 0.19
268 0.18
269 0.13
270 0.12
271 0.07
272 0.04
273 0.03
274 0.04
275 0.04
276 0.03
277 0.03
278 0.03
279 0.03
280 0.04
281 0.05
282 0.05
283 0.05
284 0.06
285 0.09
286 0.1
287 0.11
288 0.1
289 0.12
290 0.12
291 0.16
292 0.2
293 0.19
294 0.27
295 0.27
296 0.27
297 0.26
298 0.25
299 0.21
300 0.18
301 0.17
302 0.07
303 0.07
304 0.07
305 0.07
306 0.06
307 0.07
308 0.05
309 0.05
310 0.05
311 0.05
312 0.07
313 0.09
314 0.11
315 0.12
316 0.17
317 0.23
318 0.34
319 0.41
320 0.46
321 0.5
322 0.57
323 0.59
324 0.59
325 0.64
326 0.57
327 0.57
328 0.59
329 0.54
330 0.46
331 0.44
332 0.41
333 0.31
334 0.27
335 0.2
336 0.13
337 0.16
338 0.18
339 0.2
340 0.23
341 0.23
342 0.27
343 0.32
344 0.37
345 0.44
346 0.47
347 0.48
348 0.48
349 0.54
350 0.57
351 0.54
352 0.48
353 0.38
354 0.33
355 0.32
356 0.27
357 0.21
358 0.15
359 0.13
360 0.12
361 0.13
362 0.11
363 0.1
364 0.1
365 0.12
366 0.12
367 0.13
368 0.15
369 0.16
370 0.21
371 0.24
372 0.27
373 0.28
374 0.31
375 0.29
376 0.29
377 0.28
378 0.24
379 0.23
380 0.23
381 0.28
382 0.32
383 0.35
384 0.4
385 0.45
386 0.51
387 0.5
388 0.49
389 0.47
390 0.43
391 0.44
392 0.45
393 0.44
394 0.38
395 0.42
396 0.4
397 0.39
398 0.39
399 0.34
400 0.3
401 0.28
402 0.34
403 0.3
404 0.35
405 0.36
406 0.39
407 0.39
408 0.38
409 0.37
410 0.3
411 0.29
412 0.26
413 0.24
414 0.18
415 0.21
416 0.24
417 0.22
418 0.22
419 0.2
420 0.17
421 0.16
422 0.16
423 0.15
424 0.18
425 0.19
426 0.25
427 0.29
428 0.32
429 0.36
430 0.42
431 0.44
432 0.46
433 0.5
434 0.51
435 0.5
436 0.47
437 0.42
438 0.38
439 0.34
440 0.26
441 0.22
442 0.18
443 0.18
444 0.17
445 0.17
446 0.16
447 0.16
448 0.14
449 0.14
450 0.12
451 0.1
452 0.1
453 0.1
454 0.09
455 0.07
456 0.08
457 0.07
458 0.06
459 0.06
460 0.06
461 0.06
462 0.05