Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C2SD42

Protein Details
Accession A0A5C2SD42    Localization Confidence High Confidence Score 20
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
33-58AVVRDPRKETKVKKLPTQRPLRTDLYHydrophilic
170-197MTELDNRRRREREEKRKKEKEEKAAAALBasic
597-619ELVVERPKKKLKKSKKVVVEEKVBasic
647-671IEVPVKKKAKPVPRPKKVKKVTVVDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
176-193RRRREREEKRKKEKEEKA
602-612RPKKKLKKSKK
652-666KKKAKPVPRPKKVKK
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 14.833, cyto 11.5, mito_nucl 8.499
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024657  COMPASS_Set1_N-SET  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR003616  Post-SET_dom  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR044570  Set1-like  
IPR001214  SET_dom  
IPR046341  SET_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005694  C:chromosome  
GO:0140999  F:histone H3K4 trimethyltransferase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0051568  P:histone H3-K4 methylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF11764  N-SET  
PF00076  RRM_1  
PF00856  SET  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50868  POST_SET  
PS50102  RRM  
PS50280  SET  
Amino Acid Sequences MDQGDEPRVKGKGKGKEIILRYDGEVIDGEHEAVVRDPRKETKVKKLPTQRPLRTDLYQCKYEHDTNSVGPEPTTVLILGLPPLMSNQHVRRHFEMYGTIMSFEPQIDKLSGASLGIVSIRFATQEEAKKCIESQHGKKLSVALAIPGSGEAEELRVVSDREGKLLKAVMTELDNRRRREREEKRKKEKEEKAAAALKSTPTSSASHTPVPPVHSNNPWRNGLQGLQGLQSMQNMQNMQVPPRSSHHVPRPPPPSAHLPMRPQGLTPMSMSNSPAPMHGKASPLPSGTPTGPRNGPAHPARIRKPQNAAFRGRGMHVLRAVPPQNIHPPIHLFPNGIENGPVLPPSLQFGLNAVSMPMPIPTMPTMPFLPSRSPSPVSRRPFGKDAKRVDYAAVKAALAQNGYEHIAIDGDVGNVGEDAVRMFMAEFPVDQIIRDRHSWYVTFKTADSARRAQAVVKLTRRTLANHMVTVTARPAPTHVPLAHKTKWTDEEMLEQAESTLFAELRKMLEKDVIERVVAPRVARMVIEQRGKAGSRIVHAAGADGHVAEVHDGLDPKYLDRNGLRGLSFRKKRVREELTPAVSTETVAVSDKVEEEEELVVERPKKKLKKSKKVVVEEKVIESEDEDVTLVPTVPQPRKRAMSEASDIEVPVKKKAKPVPRPKKVKKVTVVDTVQDSRQTSVFEDEVVHEVLPDGLPFEQPSVAQVRVTPYDYSPSPVLSPIVPPPVALPDVPPIDPISEGICEDDEDMYFAKLALERMLFGKTAPAEEIEELETEGPRPFRKHLTGSARTEGYYKIPHTEKSSYVAQYALRGMTATINTEAENAPPPPKAIATSRSNRANARRRAQGLEEMNQVQRAMALSKGEAAAPDSVKYNQLQTRKKHLRFARSPIHDWGLYAMEKINRGDLVIEYVGEVIRAQVADKREKAYERQGIGSSYLFRIDEDLVVDATKKGNLGRLINHSCDPNCTAKIITISGEKKIVIYAKQDIELGSEITYDYHFPIEQDKIPCLCGSAKCRGTLN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.57
2 0.59
3 0.64
4 0.66
5 0.66
6 0.6
7 0.52
8 0.45
9 0.43
10 0.37
11 0.29
12 0.25
13 0.18
14 0.18
15 0.16
16 0.15
17 0.1
18 0.1
19 0.1
20 0.11
21 0.18
22 0.2
23 0.22
24 0.27
25 0.33
26 0.41
27 0.5
28 0.55
29 0.59
30 0.65
31 0.7
32 0.76
33 0.8
34 0.83
35 0.84
36 0.88
37 0.85
38 0.81
39 0.8
40 0.76
41 0.72
42 0.71
43 0.71
44 0.66
45 0.64
46 0.58
47 0.57
48 0.57
49 0.56
50 0.51
51 0.45
52 0.42
53 0.37
54 0.43
55 0.41
56 0.34
57 0.29
58 0.26
59 0.23
60 0.2
61 0.19
62 0.12
63 0.09
64 0.09
65 0.1
66 0.1
67 0.08
68 0.08
69 0.07
70 0.08
71 0.09
72 0.11
73 0.18
74 0.24
75 0.33
76 0.39
77 0.45
78 0.48
79 0.52
80 0.5
81 0.45
82 0.42
83 0.36
84 0.35
85 0.3
86 0.27
87 0.21
88 0.21
89 0.19
90 0.17
91 0.15
92 0.12
93 0.13
94 0.13
95 0.13
96 0.13
97 0.14
98 0.13
99 0.11
100 0.1
101 0.08
102 0.07
103 0.08
104 0.07
105 0.07
106 0.07
107 0.07
108 0.07
109 0.08
110 0.11
111 0.17
112 0.25
113 0.27
114 0.31
115 0.32
116 0.32
117 0.33
118 0.35
119 0.38
120 0.39
121 0.45
122 0.52
123 0.57
124 0.57
125 0.57
126 0.55
127 0.48
128 0.41
129 0.34
130 0.25
131 0.2
132 0.19
133 0.17
134 0.13
135 0.12
136 0.08
137 0.08
138 0.06
139 0.06
140 0.06
141 0.06
142 0.07
143 0.08
144 0.08
145 0.1
146 0.18
147 0.17
148 0.21
149 0.22
150 0.21
151 0.22
152 0.25
153 0.23
154 0.17
155 0.17
156 0.15
157 0.17
158 0.24
159 0.29
160 0.37
161 0.43
162 0.46
163 0.54
164 0.57
165 0.61
166 0.65
167 0.69
168 0.7
169 0.75
170 0.82
171 0.85
172 0.91
173 0.93
174 0.93
175 0.91
176 0.9
177 0.88
178 0.81
179 0.78
180 0.75
181 0.66
182 0.57
183 0.49
184 0.4
185 0.32
186 0.28
187 0.21
188 0.16
189 0.18
190 0.2
191 0.24
192 0.26
193 0.3
194 0.3
195 0.33
196 0.33
197 0.37
198 0.37
199 0.37
200 0.38
201 0.41
202 0.5
203 0.53
204 0.56
205 0.54
206 0.5
207 0.45
208 0.42
209 0.36
210 0.31
211 0.26
212 0.22
213 0.2
214 0.2
215 0.18
216 0.17
217 0.16
218 0.14
219 0.13
220 0.15
221 0.15
222 0.15
223 0.21
224 0.22
225 0.23
226 0.25
227 0.24
228 0.24
229 0.27
230 0.33
231 0.31
232 0.38
233 0.46
234 0.51
235 0.54
236 0.6
237 0.63
238 0.6
239 0.58
240 0.54
241 0.52
242 0.48
243 0.52
244 0.49
245 0.48
246 0.48
247 0.5
248 0.46
249 0.38
250 0.37
251 0.31
252 0.26
253 0.23
254 0.21
255 0.18
256 0.19
257 0.2
258 0.18
259 0.18
260 0.17
261 0.18
262 0.18
263 0.18
264 0.2
265 0.2
266 0.21
267 0.21
268 0.24
269 0.24
270 0.22
271 0.22
272 0.2
273 0.22
274 0.2
275 0.25
276 0.23
277 0.25
278 0.25
279 0.28
280 0.29
281 0.27
282 0.33
283 0.29
284 0.36
285 0.38
286 0.44
287 0.46
288 0.54
289 0.6
290 0.57
291 0.63
292 0.62
293 0.66
294 0.65
295 0.65
296 0.58
297 0.55
298 0.51
299 0.44
300 0.42
301 0.34
302 0.3
303 0.27
304 0.26
305 0.24
306 0.29
307 0.3
308 0.24
309 0.24
310 0.25
311 0.3
312 0.32
313 0.31
314 0.26
315 0.29
316 0.29
317 0.32
318 0.29
319 0.22
320 0.19
321 0.24
322 0.23
323 0.18
324 0.17
325 0.13
326 0.13
327 0.13
328 0.12
329 0.07
330 0.07
331 0.07
332 0.08
333 0.1
334 0.09
335 0.09
336 0.09
337 0.1
338 0.1
339 0.1
340 0.08
341 0.07
342 0.07
343 0.07
344 0.06
345 0.05
346 0.05
347 0.06
348 0.07
349 0.08
350 0.09
351 0.11
352 0.12
353 0.14
354 0.16
355 0.17
356 0.19
357 0.19
358 0.21
359 0.24
360 0.26
361 0.29
362 0.35
363 0.42
364 0.44
365 0.48
366 0.48
367 0.48
368 0.52
369 0.56
370 0.56
371 0.56
372 0.57
373 0.57
374 0.56
375 0.52
376 0.47
377 0.43
378 0.35
379 0.29
380 0.23
381 0.17
382 0.16
383 0.17
384 0.16
385 0.12
386 0.11
387 0.08
388 0.09
389 0.1
390 0.08
391 0.07
392 0.06
393 0.06
394 0.06
395 0.06
396 0.05
397 0.04
398 0.04
399 0.04
400 0.04
401 0.04
402 0.04
403 0.03
404 0.03
405 0.03
406 0.03
407 0.03
408 0.03
409 0.03
410 0.04
411 0.05
412 0.05
413 0.05
414 0.05
415 0.07
416 0.07
417 0.07
418 0.09
419 0.1
420 0.13
421 0.14
422 0.15
423 0.15
424 0.17
425 0.18
426 0.18
427 0.21
428 0.21
429 0.21
430 0.2
431 0.22
432 0.23
433 0.26
434 0.27
435 0.26
436 0.25
437 0.26
438 0.26
439 0.24
440 0.25
441 0.26
442 0.28
443 0.3
444 0.31
445 0.29
446 0.32
447 0.32
448 0.3
449 0.29
450 0.31
451 0.28
452 0.26
453 0.26
454 0.24
455 0.23
456 0.21
457 0.17
458 0.11
459 0.1
460 0.09
461 0.1
462 0.11
463 0.12
464 0.16
465 0.16
466 0.19
467 0.23
468 0.29
469 0.3
470 0.31
471 0.31
472 0.3
473 0.32
474 0.3
475 0.28
476 0.22
477 0.23
478 0.21
479 0.21
480 0.17
481 0.14
482 0.11
483 0.09
484 0.08
485 0.05
486 0.04
487 0.04
488 0.04
489 0.05
490 0.05
491 0.06
492 0.09
493 0.09
494 0.09
495 0.12
496 0.12
497 0.14
498 0.17
499 0.16
500 0.14
501 0.14
502 0.15
503 0.14
504 0.15
505 0.12
506 0.1
507 0.1
508 0.1
509 0.09
510 0.1
511 0.12
512 0.17
513 0.19
514 0.19
515 0.19
516 0.2
517 0.21
518 0.2
519 0.18
520 0.13
521 0.12
522 0.14
523 0.13
524 0.13
525 0.12
526 0.12
527 0.09
528 0.09
529 0.07
530 0.05
531 0.05
532 0.04
533 0.04
534 0.03
535 0.03
536 0.03
537 0.04
538 0.05
539 0.05
540 0.08
541 0.08
542 0.09
543 0.12
544 0.12
545 0.13
546 0.13
547 0.16
548 0.15
549 0.17
550 0.17
551 0.17
552 0.22
553 0.29
554 0.34
555 0.38
556 0.45
557 0.48
558 0.53
559 0.6
560 0.62
561 0.57
562 0.61
563 0.62
564 0.57
565 0.52
566 0.47
567 0.38
568 0.31
569 0.25
570 0.18
571 0.09
572 0.06
573 0.07
574 0.07
575 0.06
576 0.06
577 0.06
578 0.06
579 0.07
580 0.06
581 0.06
582 0.06
583 0.06
584 0.06
585 0.07
586 0.08
587 0.12
588 0.14
589 0.17
590 0.25
591 0.32
592 0.41
593 0.51
594 0.6
595 0.68
596 0.76
597 0.81
598 0.83
599 0.86
600 0.85
601 0.8
602 0.75
603 0.65
604 0.56
605 0.48
606 0.39
607 0.29
608 0.21
609 0.17
610 0.1
611 0.08
612 0.07
613 0.06
614 0.06
615 0.07
616 0.06
617 0.05
618 0.07
619 0.13
620 0.19
621 0.25
622 0.28
623 0.32
624 0.37
625 0.38
626 0.41
627 0.38
628 0.38
629 0.36
630 0.35
631 0.31
632 0.27
633 0.25
634 0.22
635 0.22
636 0.17
637 0.19
638 0.22
639 0.22
640 0.29
641 0.37
642 0.45
643 0.53
644 0.63
645 0.69
646 0.75
647 0.85
648 0.87
649 0.9
650 0.87
651 0.86
652 0.83
653 0.79
654 0.75
655 0.72
656 0.65
657 0.56
658 0.52
659 0.45
660 0.37
661 0.31
662 0.26
663 0.18
664 0.18
665 0.17
666 0.14
667 0.15
668 0.14
669 0.12
670 0.12
671 0.12
672 0.13
673 0.13
674 0.12
675 0.09
676 0.09
677 0.08
678 0.08
679 0.06
680 0.05
681 0.05
682 0.06
683 0.06
684 0.07
685 0.07
686 0.07
687 0.09
688 0.11
689 0.11
690 0.11
691 0.12
692 0.14
693 0.16
694 0.19
695 0.18
696 0.15
697 0.19
698 0.19
699 0.21
700 0.19
701 0.17
702 0.16
703 0.16
704 0.16
705 0.12
706 0.14
707 0.13
708 0.17
709 0.16
710 0.15
711 0.15
712 0.16
713 0.17
714 0.15
715 0.13
716 0.14
717 0.16
718 0.16
719 0.16
720 0.14
721 0.14
722 0.14
723 0.13
724 0.1
725 0.09
726 0.09
727 0.09
728 0.09
729 0.08
730 0.09
731 0.09
732 0.07
733 0.07
734 0.08
735 0.07
736 0.07
737 0.07
738 0.07
739 0.08
740 0.08
741 0.1
742 0.09
743 0.1
744 0.11
745 0.12
746 0.11
747 0.1
748 0.13
749 0.11
750 0.12
751 0.12
752 0.12
753 0.12
754 0.13
755 0.14
756 0.11
757 0.11
758 0.1
759 0.1
760 0.09
761 0.09
762 0.11
763 0.12
764 0.14
765 0.17
766 0.2
767 0.26
768 0.31
769 0.35
770 0.42
771 0.5
772 0.55
773 0.57
774 0.58
775 0.53
776 0.48
777 0.45
778 0.37
779 0.31
780 0.27
781 0.23
782 0.25
783 0.27
784 0.29
785 0.34
786 0.36
787 0.34
788 0.33
789 0.38
790 0.32
791 0.31
792 0.3
793 0.24
794 0.23
795 0.23
796 0.19
797 0.13
798 0.12
799 0.12
800 0.12
801 0.12
802 0.12
803 0.12
804 0.12
805 0.12
806 0.14
807 0.14
808 0.12
809 0.15
810 0.15
811 0.15
812 0.16
813 0.16
814 0.16
815 0.16
816 0.18
817 0.2
818 0.25
819 0.31
820 0.37
821 0.44
822 0.49
823 0.52
824 0.55
825 0.61
826 0.64
827 0.65
828 0.65
829 0.66
830 0.64
831 0.64
832 0.62
833 0.6
834 0.55
835 0.5
836 0.48
837 0.43
838 0.4
839 0.37
840 0.33
841 0.24
842 0.2
843 0.17
844 0.13
845 0.11
846 0.11
847 0.1
848 0.12
849 0.13
850 0.12
851 0.11
852 0.12
853 0.14
854 0.14
855 0.14
856 0.15
857 0.16
858 0.18
859 0.19
860 0.24
861 0.26
862 0.35
863 0.42
864 0.46
865 0.56
866 0.65
867 0.68
868 0.71
869 0.73
870 0.75
871 0.75
872 0.78
873 0.77
874 0.73
875 0.73
876 0.69
877 0.66
878 0.55
879 0.47
880 0.4
881 0.33
882 0.26
883 0.23
884 0.21
885 0.18
886 0.2
887 0.21
888 0.21
889 0.17
890 0.17
891 0.18
892 0.15
893 0.17
894 0.14
895 0.14
896 0.12
897 0.12
898 0.12
899 0.1
900 0.1
901 0.06
902 0.07
903 0.07
904 0.07
905 0.11
906 0.16
907 0.24
908 0.27
909 0.3
910 0.34
911 0.38
912 0.43
913 0.49
914 0.52
915 0.47
916 0.48
917 0.47
918 0.43
919 0.42
920 0.38
921 0.31
922 0.24
923 0.23
924 0.19
925 0.17
926 0.18
927 0.17
928 0.16
929 0.14
930 0.14
931 0.13
932 0.13
933 0.14
934 0.12
935 0.12
936 0.12
937 0.12
938 0.12
939 0.18
940 0.23
941 0.26
942 0.31
943 0.39
944 0.44
945 0.46
946 0.47
947 0.47
948 0.42
949 0.43
950 0.41
951 0.37
952 0.33
953 0.31
954 0.3
955 0.27
956 0.3
957 0.27
958 0.25
959 0.28
960 0.29
961 0.3
962 0.31
963 0.28
964 0.26
965 0.28
966 0.29
967 0.24
968 0.27
969 0.31
970 0.32
971 0.33
972 0.34
973 0.3
974 0.29
975 0.27
976 0.23
977 0.16
978 0.13
979 0.12
980 0.12
981 0.13
982 0.11
983 0.11
984 0.12
985 0.12
986 0.12
987 0.18
988 0.22
989 0.27
990 0.29
991 0.33
992 0.32
993 0.34
994 0.33
995 0.3
996 0.31
997 0.32
998 0.35
999 0.4
1000 0.42