Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C2SDS6

Protein Details
Accession A0A5C2SDS6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
114-133NSGYNSRRPAKKPKLEDSQFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
39-82RGRGFASRPGPHRGRGFASRGGPPKGRGGYTPRGSSRERGKHNG
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13.833, mito_nucl 11.666, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Amino Acid Sequences MPYNEDAQPNEVRHARKGNTVVPAIRSTVQPRVGPQAQRGRGFASRPGPHRGRGFASRGGPPKGRGGYTPRGSSRERGKHNGQARGSAHGYGPRDPTRANSQHQTFSRGGNSQNSGYNSRRPAKKPKLEDSQFQRGDVAYGFSGSSNGLTGRAVTLDDSNEFTPSTSYAMRMSDAYPLPGHTSNLLPASDLMSTLDTRQKGLCVPRCASAHLPGHSASHKFDAGTVVEMDSATSFDSLQLGQVDEENVMPLAVSPPRQTAFSSSDLSLDSSIPPSNVEPALQPMATIVVEHSQSAISSHLKNPAFTSTAKGVPKFRSGRLRFELPRRQHVNSDGPMTSNAHQSTTFQALQSERRSVSPEYPDIHELLRDNVVEDAGPISGNQGPATPDPDAVELVLMRVDPHDKPRHLFVLPSPSGVLSVTMRGSFDLVEQEPLRRTALRTAGMSEEARQLIDDACLLRSSQGHVVALGRVGDAQQLSVVRILDKVVTDVGTFDRPTQPGKKGGISAICGLPQAGSFATGGYDHIVHRWSLEEHLATPARLPIRHTSTIQSLLHLRDSSDKLLSGSADCSVTVYDISAERVINSLKLSNSVYQVHAAPSPSCALLEVGHRELQFEVRDLRLVPTASVVRFGYPNVKVHGRYTRGQCAPTYVDKHMKRFLQAL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.46
3 0.49
4 0.53
5 0.52
6 0.53
7 0.55
8 0.51
9 0.47
10 0.46
11 0.42
12 0.38
13 0.36
14 0.33
15 0.36
16 0.38
17 0.36
18 0.37
19 0.43
20 0.48
21 0.48
22 0.52
23 0.55
24 0.56
25 0.58
26 0.56
27 0.52
28 0.5
29 0.49
30 0.47
31 0.46
32 0.47
33 0.48
34 0.56
35 0.55
36 0.57
37 0.59
38 0.56
39 0.53
40 0.53
41 0.53
42 0.51
43 0.51
44 0.53
45 0.54
46 0.55
47 0.53
48 0.48
49 0.51
50 0.49
51 0.46
52 0.43
53 0.44
54 0.48
55 0.51
56 0.56
57 0.52
58 0.53
59 0.54
60 0.57
61 0.6
62 0.59
63 0.6
64 0.61
65 0.64
66 0.68
67 0.73
68 0.74
69 0.65
70 0.63
71 0.57
72 0.55
73 0.5
74 0.42
75 0.36
76 0.33
77 0.34
78 0.3
79 0.35
80 0.33
81 0.33
82 0.32
83 0.36
84 0.41
85 0.44
86 0.46
87 0.48
88 0.49
89 0.55
90 0.56
91 0.57
92 0.48
93 0.45
94 0.44
95 0.38
96 0.37
97 0.35
98 0.36
99 0.32
100 0.36
101 0.36
102 0.37
103 0.37
104 0.41
105 0.43
106 0.48
107 0.54
108 0.56
109 0.63
110 0.69
111 0.75
112 0.77
113 0.78
114 0.81
115 0.77
116 0.79
117 0.76
118 0.76
119 0.68
120 0.59
121 0.51
122 0.4
123 0.37
124 0.28
125 0.22
126 0.11
127 0.11
128 0.1
129 0.09
130 0.1
131 0.08
132 0.08
133 0.07
134 0.07
135 0.07
136 0.07
137 0.07
138 0.07
139 0.07
140 0.07
141 0.07
142 0.08
143 0.09
144 0.1
145 0.13
146 0.12
147 0.13
148 0.13
149 0.12
150 0.11
151 0.11
152 0.12
153 0.1
154 0.11
155 0.12
156 0.13
157 0.13
158 0.14
159 0.14
160 0.17
161 0.17
162 0.17
163 0.16
164 0.16
165 0.19
166 0.19
167 0.19
168 0.15
169 0.15
170 0.16
171 0.17
172 0.16
173 0.13
174 0.12
175 0.13
176 0.11
177 0.1
178 0.09
179 0.08
180 0.09
181 0.11
182 0.15
183 0.14
184 0.15
185 0.15
186 0.16
187 0.19
188 0.27
189 0.33
190 0.34
191 0.35
192 0.4
193 0.4
194 0.42
195 0.4
196 0.39
197 0.36
198 0.32
199 0.32
200 0.27
201 0.28
202 0.28
203 0.27
204 0.21
205 0.19
206 0.18
207 0.16
208 0.16
209 0.16
210 0.14
211 0.14
212 0.12
213 0.1
214 0.09
215 0.09
216 0.09
217 0.06
218 0.06
219 0.05
220 0.05
221 0.05
222 0.05
223 0.05
224 0.05
225 0.06
226 0.06
227 0.07
228 0.06
229 0.07
230 0.07
231 0.07
232 0.07
233 0.06
234 0.05
235 0.05
236 0.04
237 0.04
238 0.06
239 0.06
240 0.08
241 0.08
242 0.11
243 0.12
244 0.13
245 0.13
246 0.16
247 0.19
248 0.21
249 0.22
250 0.2
251 0.2
252 0.2
253 0.2
254 0.16
255 0.13
256 0.1
257 0.09
258 0.09
259 0.08
260 0.09
261 0.08
262 0.1
263 0.09
264 0.09
265 0.08
266 0.1
267 0.12
268 0.11
269 0.1
270 0.08
271 0.09
272 0.08
273 0.08
274 0.06
275 0.06
276 0.06
277 0.06
278 0.07
279 0.06
280 0.06
281 0.06
282 0.08
283 0.09
284 0.1
285 0.12
286 0.19
287 0.19
288 0.2
289 0.2
290 0.2
291 0.2
292 0.19
293 0.21
294 0.16
295 0.21
296 0.22
297 0.23
298 0.25
299 0.25
300 0.33
301 0.32
302 0.34
303 0.4
304 0.41
305 0.46
306 0.46
307 0.51
308 0.47
309 0.53
310 0.58
311 0.51
312 0.57
313 0.55
314 0.52
315 0.47
316 0.48
317 0.45
318 0.38
319 0.37
320 0.28
321 0.24
322 0.23
323 0.23
324 0.2
325 0.18
326 0.16
327 0.14
328 0.14
329 0.14
330 0.16
331 0.18
332 0.17
333 0.13
334 0.15
335 0.16
336 0.2
337 0.22
338 0.22
339 0.18
340 0.18
341 0.22
342 0.21
343 0.24
344 0.23
345 0.24
346 0.23
347 0.24
348 0.24
349 0.22
350 0.21
351 0.18
352 0.15
353 0.13
354 0.12
355 0.1
356 0.1
357 0.09
358 0.09
359 0.07
360 0.07
361 0.06
362 0.04
363 0.04
364 0.04
365 0.05
366 0.07
367 0.07
368 0.07
369 0.07
370 0.09
371 0.1
372 0.13
373 0.11
374 0.1
375 0.11
376 0.12
377 0.11
378 0.09
379 0.09
380 0.06
381 0.05
382 0.05
383 0.04
384 0.04
385 0.05
386 0.07
387 0.08
388 0.16
389 0.23
390 0.24
391 0.26
392 0.29
393 0.32
394 0.3
395 0.3
396 0.26
397 0.29
398 0.28
399 0.27
400 0.23
401 0.2
402 0.2
403 0.18
404 0.17
405 0.07
406 0.08
407 0.08
408 0.08
409 0.08
410 0.08
411 0.08
412 0.07
413 0.07
414 0.09
415 0.09
416 0.12
417 0.12
418 0.14
419 0.15
420 0.16
421 0.17
422 0.15
423 0.16
424 0.18
425 0.23
426 0.23
427 0.23
428 0.23
429 0.23
430 0.25
431 0.24
432 0.2
433 0.18
434 0.16
435 0.15
436 0.13
437 0.13
438 0.1
439 0.1
440 0.1
441 0.07
442 0.08
443 0.08
444 0.08
445 0.08
446 0.09
447 0.11
448 0.13
449 0.14
450 0.14
451 0.14
452 0.15
453 0.14
454 0.14
455 0.12
456 0.08
457 0.07
458 0.07
459 0.08
460 0.07
461 0.06
462 0.07
463 0.07
464 0.08
465 0.1
466 0.1
467 0.09
468 0.09
469 0.1
470 0.09
471 0.09
472 0.09
473 0.08
474 0.09
475 0.08
476 0.09
477 0.1
478 0.12
479 0.12
480 0.13
481 0.17
482 0.18
483 0.23
484 0.27
485 0.3
486 0.33
487 0.36
488 0.37
489 0.34
490 0.37
491 0.35
492 0.32
493 0.3
494 0.25
495 0.22
496 0.2
497 0.18
498 0.14
499 0.11
500 0.1
501 0.07
502 0.07
503 0.06
504 0.06
505 0.07
506 0.07
507 0.07
508 0.07
509 0.08
510 0.08
511 0.09
512 0.11
513 0.1
514 0.1
515 0.12
516 0.12
517 0.13
518 0.16
519 0.15
520 0.15
521 0.21
522 0.22
523 0.2
524 0.2
525 0.22
526 0.22
527 0.22
528 0.25
529 0.27
530 0.33
531 0.37
532 0.38
533 0.37
534 0.39
535 0.45
536 0.42
537 0.36
538 0.33
539 0.31
540 0.33
541 0.29
542 0.26
543 0.26
544 0.29
545 0.29
546 0.26
547 0.25
548 0.22
549 0.23
550 0.22
551 0.17
552 0.15
553 0.13
554 0.12
555 0.11
556 0.11
557 0.1
558 0.1
559 0.09
560 0.08
561 0.08
562 0.08
563 0.11
564 0.12
565 0.12
566 0.12
567 0.14
568 0.14
569 0.14
570 0.15
571 0.16
572 0.15
573 0.18
574 0.21
575 0.21
576 0.25
577 0.26
578 0.25
579 0.24
580 0.25
581 0.24
582 0.24
583 0.23
584 0.19
585 0.19
586 0.19
587 0.17
588 0.16
589 0.15
590 0.13
591 0.13
592 0.18
593 0.21
594 0.22
595 0.25
596 0.25
597 0.26
598 0.26
599 0.28
600 0.24
601 0.22
602 0.23
603 0.2
604 0.22
605 0.22
606 0.24
607 0.24
608 0.23
609 0.2
610 0.22
611 0.25
612 0.24
613 0.26
614 0.24
615 0.22
616 0.22
617 0.24
618 0.26
619 0.26
620 0.3
621 0.32
622 0.37
623 0.37
624 0.42
625 0.5
626 0.47
627 0.51
628 0.54
629 0.59
630 0.58
631 0.59
632 0.53
633 0.5
634 0.51
635 0.51
636 0.49
637 0.46
638 0.51
639 0.54
640 0.6
641 0.61
642 0.6