Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C2SDM1

Protein Details
Accession A0A5C2SDM1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
687-712RGPGAKKWEERERRKKDTVRRFSRARBasic
899-919APSPPPSRPPQQPQQQQQQYPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
686-707GRGPGAKKWEERERRKKDTVRR
Subcellular Location(s) cyto 8.5cyto_nucl 8.5, mito 8, nucl 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025304  ALIX_V_dom  
IPR004328  BRO1_dom  
IPR038499  BRO1_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF13949  ALIX_LYPXL_bnd  
PF03097  BRO1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51180  BRO1  
CDD cd09242  BRO1_ScBro1_like  
cd09237  V_ScBro1_like  
Amino Acid Sequences MSLISAHNSPMISIPKKTTEEVDWTGPIRNAIAHSYGEDPDNYAAECANLQRCRQDAVKGAGSDMTAKDLLHKYFGQLELLELRFSEIRVNFPWRDAFTNKLTTQTSIAYEKASIIFQIAATHSAIAASQNRSDPEGLKRAFYYFRTTAGMLTYINDNFLHAPSTDLSREVIKFLVGIILAQATEVFFEKCTDEKKSNALVAKIAAQTAFMYTSLSEEVKEFMGKGIFDRNWVTIIQAKAKYFTSVSQYYRGLADAAAGKHGDALVRYTVAETAAKEANRTASSFASLFVTQMSPNLPPDAGPALQELTKAHLALIGDKKNEAQRENDLIYNAVLPTPETLPQIDKAAVATPITIQEVYASPDVQKVIGVDLFIRLIPLSVHESASVYSEEKAKLVRGEVEKADNAEVEVKSALDSMGIKEGLVRYKAIAEGSVGGEAELPVEVRRWKEDIALMEEREGVEGIMAELTRMKETVRRELEGVSRDLDAESRECEAMRVKYDHLWTQAPSASLTKTLRQDVKSHLSALDAAAQSDQQVVQLWDSVKGEIRLLLSPEIEDVFRASTEKGGAGTENLLDLDVGSEAQDDEERSKVRQFVDEIEERLGRLNKISHERGQVLKDLKDKVQQDDVSHLLLLNRRNTGVESTLFAGELEKFRPYQQRLTATVHHEQVALQELNQLWRGLRDLAGRGPGAKKWEERERRKKDTVRRFSRARDVYMEVRDGLAKGLQFYTELTELAAGLKRNAGSFVSERNVEREALASQAETERRLAIPKPSRASTFGGKPPVPPPPPKPSSGLESSFGSMNLGPSSSPPAPQPQRQQWTSPSPSQHYAPPPPVSQPPPSSQVYPPPPPSSQPSAPYLPSPPSQPSSQPSYQQQQQPLSAPPPDPYAALGMFANNAAAPSPPPSRPPQQPQQQQQQYPPYAQPYAQQYGQPQQQHQRQGSYPPPPPQYGGASRLSYGTPPPGQQQQSSLFPPPPPPVNYQSQYGNVQPPPPPQQQQQGGAAGYYYTPPPPPGSGGTYQYTQGQGYGGRV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.38
3 0.42
4 0.43
5 0.42
6 0.38
7 0.42
8 0.43
9 0.43
10 0.39
11 0.37
12 0.39
13 0.36
14 0.32
15 0.25
16 0.22
17 0.2
18 0.2
19 0.21
20 0.18
21 0.19
22 0.21
23 0.22
24 0.21
25 0.2
26 0.19
27 0.18
28 0.18
29 0.16
30 0.14
31 0.12
32 0.11
33 0.13
34 0.15
35 0.22
36 0.25
37 0.26
38 0.31
39 0.33
40 0.36
41 0.38
42 0.39
43 0.38
44 0.42
45 0.47
46 0.42
47 0.41
48 0.38
49 0.35
50 0.33
51 0.25
52 0.22
53 0.16
54 0.15
55 0.21
56 0.25
57 0.26
58 0.27
59 0.27
60 0.26
61 0.3
62 0.32
63 0.27
64 0.22
65 0.23
66 0.25
67 0.25
68 0.23
69 0.17
70 0.19
71 0.18
72 0.18
73 0.22
74 0.17
75 0.21
76 0.25
77 0.32
78 0.3
79 0.33
80 0.37
81 0.34
82 0.38
83 0.37
84 0.37
85 0.36
86 0.43
87 0.41
88 0.41
89 0.4
90 0.36
91 0.35
92 0.33
93 0.31
94 0.26
95 0.26
96 0.21
97 0.2
98 0.2
99 0.19
100 0.17
101 0.13
102 0.12
103 0.12
104 0.1
105 0.13
106 0.12
107 0.12
108 0.12
109 0.12
110 0.11
111 0.1
112 0.1
113 0.11
114 0.15
115 0.16
116 0.19
117 0.21
118 0.23
119 0.25
120 0.27
121 0.26
122 0.28
123 0.35
124 0.33
125 0.32
126 0.32
127 0.33
128 0.36
129 0.35
130 0.36
131 0.28
132 0.3
133 0.31
134 0.3
135 0.28
136 0.25
137 0.24
138 0.16
139 0.16
140 0.17
141 0.14
142 0.15
143 0.14
144 0.14
145 0.14
146 0.14
147 0.14
148 0.1
149 0.12
150 0.12
151 0.16
152 0.16
153 0.15
154 0.16
155 0.18
156 0.19
157 0.18
158 0.17
159 0.13
160 0.12
161 0.12
162 0.12
163 0.08
164 0.07
165 0.06
166 0.06
167 0.06
168 0.06
169 0.06
170 0.04
171 0.05
172 0.06
173 0.07
174 0.07
175 0.08
176 0.1
177 0.13
178 0.16
179 0.22
180 0.24
181 0.26
182 0.31
183 0.34
184 0.37
185 0.38
186 0.36
187 0.31
188 0.29
189 0.32
190 0.27
191 0.23
192 0.18
193 0.14
194 0.14
195 0.13
196 0.12
197 0.08
198 0.08
199 0.07
200 0.09
201 0.1
202 0.1
203 0.09
204 0.09
205 0.1
206 0.11
207 0.11
208 0.1
209 0.1
210 0.11
211 0.11
212 0.12
213 0.18
214 0.18
215 0.2
216 0.22
217 0.21
218 0.2
219 0.2
220 0.21
221 0.18
222 0.2
223 0.25
224 0.26
225 0.26
226 0.27
227 0.28
228 0.28
229 0.24
230 0.24
231 0.24
232 0.26
233 0.28
234 0.3
235 0.3
236 0.29
237 0.29
238 0.27
239 0.2
240 0.14
241 0.14
242 0.13
243 0.13
244 0.13
245 0.13
246 0.12
247 0.12
248 0.13
249 0.11
250 0.07
251 0.09
252 0.08
253 0.09
254 0.09
255 0.09
256 0.09
257 0.1
258 0.11
259 0.09
260 0.12
261 0.15
262 0.15
263 0.15
264 0.15
265 0.18
266 0.18
267 0.19
268 0.17
269 0.14
270 0.16
271 0.16
272 0.16
273 0.14
274 0.13
275 0.13
276 0.12
277 0.12
278 0.09
279 0.1
280 0.11
281 0.1
282 0.11
283 0.12
284 0.11
285 0.1
286 0.12
287 0.14
288 0.13
289 0.12
290 0.12
291 0.12
292 0.12
293 0.13
294 0.11
295 0.12
296 0.13
297 0.13
298 0.11
299 0.12
300 0.12
301 0.17
302 0.23
303 0.23
304 0.22
305 0.23
306 0.25
307 0.28
308 0.31
309 0.27
310 0.24
311 0.25
312 0.3
313 0.31
314 0.3
315 0.26
316 0.23
317 0.22
318 0.2
319 0.15
320 0.1
321 0.08
322 0.07
323 0.08
324 0.08
325 0.1
326 0.1
327 0.11
328 0.12
329 0.13
330 0.15
331 0.14
332 0.12
333 0.11
334 0.12
335 0.11
336 0.1
337 0.09
338 0.08
339 0.08
340 0.09
341 0.08
342 0.07
343 0.07
344 0.08
345 0.1
346 0.11
347 0.1
348 0.09
349 0.11
350 0.11
351 0.1
352 0.1
353 0.07
354 0.08
355 0.08
356 0.08
357 0.07
358 0.07
359 0.07
360 0.07
361 0.07
362 0.05
363 0.05
364 0.05
365 0.06
366 0.1
367 0.1
368 0.11
369 0.11
370 0.11
371 0.11
372 0.13
373 0.12
374 0.09
375 0.09
376 0.12
377 0.12
378 0.12
379 0.12
380 0.12
381 0.12
382 0.12
383 0.17
384 0.16
385 0.19
386 0.2
387 0.22
388 0.21
389 0.21
390 0.2
391 0.15
392 0.13
393 0.13
394 0.12
395 0.1
396 0.1
397 0.09
398 0.08
399 0.09
400 0.08
401 0.05
402 0.06
403 0.05
404 0.08
405 0.08
406 0.07
407 0.08
408 0.1
409 0.12
410 0.12
411 0.12
412 0.1
413 0.1
414 0.11
415 0.1
416 0.09
417 0.07
418 0.08
419 0.08
420 0.08
421 0.07
422 0.06
423 0.06
424 0.05
425 0.05
426 0.04
427 0.04
428 0.04
429 0.05
430 0.07
431 0.08
432 0.1
433 0.12
434 0.12
435 0.14
436 0.16
437 0.17
438 0.21
439 0.23
440 0.21
441 0.2
442 0.19
443 0.18
444 0.15
445 0.13
446 0.07
447 0.04
448 0.04
449 0.04
450 0.04
451 0.04
452 0.03
453 0.05
454 0.05
455 0.06
456 0.06
457 0.06
458 0.1
459 0.13
460 0.22
461 0.23
462 0.23
463 0.24
464 0.26
465 0.29
466 0.28
467 0.26
468 0.18
469 0.16
470 0.15
471 0.14
472 0.13
473 0.1
474 0.08
475 0.08
476 0.08
477 0.08
478 0.08
479 0.09
480 0.11
481 0.12
482 0.14
483 0.14
484 0.14
485 0.17
486 0.19
487 0.21
488 0.2
489 0.2
490 0.18
491 0.18
492 0.19
493 0.16
494 0.15
495 0.14
496 0.12
497 0.14
498 0.15
499 0.16
500 0.17
501 0.21
502 0.24
503 0.24
504 0.27
505 0.28
506 0.33
507 0.31
508 0.29
509 0.25
510 0.21
511 0.2
512 0.18
513 0.17
514 0.11
515 0.1
516 0.09
517 0.09
518 0.09
519 0.09
520 0.08
521 0.04
522 0.05
523 0.05
524 0.05
525 0.08
526 0.08
527 0.09
528 0.1
529 0.1
530 0.1
531 0.1
532 0.1
533 0.09
534 0.1
535 0.09
536 0.1
537 0.1
538 0.09
539 0.09
540 0.09
541 0.08
542 0.07
543 0.06
544 0.05
545 0.05
546 0.05
547 0.06
548 0.06
549 0.06
550 0.07
551 0.07
552 0.07
553 0.07
554 0.07
555 0.06
556 0.07
557 0.06
558 0.05
559 0.05
560 0.05
561 0.04
562 0.04
563 0.04
564 0.03
565 0.03
566 0.03
567 0.03
568 0.03
569 0.04
570 0.04
571 0.05
572 0.06
573 0.08
574 0.09
575 0.1
576 0.12
577 0.15
578 0.16
579 0.18
580 0.18
581 0.19
582 0.24
583 0.25
584 0.24
585 0.23
586 0.22
587 0.2
588 0.21
589 0.19
590 0.14
591 0.14
592 0.15
593 0.17
594 0.24
595 0.27
596 0.28
597 0.3
598 0.33
599 0.34
600 0.33
601 0.34
602 0.31
603 0.3
604 0.31
605 0.3
606 0.29
607 0.32
608 0.32
609 0.3
610 0.34
611 0.32
612 0.28
613 0.29
614 0.29
615 0.23
616 0.21
617 0.18
618 0.13
619 0.15
620 0.18
621 0.17
622 0.17
623 0.16
624 0.17
625 0.18
626 0.18
627 0.17
628 0.14
629 0.12
630 0.13
631 0.13
632 0.12
633 0.11
634 0.1
635 0.09
636 0.1
637 0.1
638 0.09
639 0.1
640 0.13
641 0.21
642 0.24
643 0.29
644 0.34
645 0.38
646 0.41
647 0.45
648 0.47
649 0.44
650 0.45
651 0.4
652 0.34
653 0.29
654 0.25
655 0.21
656 0.22
657 0.16
658 0.12
659 0.14
660 0.13
661 0.15
662 0.16
663 0.15
664 0.1
665 0.11
666 0.13
667 0.11
668 0.13
669 0.13
670 0.14
671 0.15
672 0.17
673 0.17
674 0.17
675 0.18
676 0.18
677 0.2
678 0.21
679 0.22
680 0.26
681 0.37
682 0.45
683 0.55
684 0.64
685 0.7
686 0.75
687 0.81
688 0.83
689 0.83
690 0.84
691 0.84
692 0.83
693 0.81
694 0.78
695 0.74
696 0.76
697 0.69
698 0.61
699 0.54
700 0.49
701 0.46
702 0.43
703 0.39
704 0.28
705 0.25
706 0.23
707 0.18
708 0.15
709 0.11
710 0.09
711 0.09
712 0.09
713 0.08
714 0.08
715 0.09
716 0.11
717 0.1
718 0.1
719 0.08
720 0.08
721 0.08
722 0.09
723 0.11
724 0.09
725 0.09
726 0.11
727 0.11
728 0.11
729 0.12
730 0.11
731 0.12
732 0.13
733 0.17
734 0.18
735 0.2
736 0.2
737 0.22
738 0.23
739 0.2
740 0.18
741 0.16
742 0.14
743 0.13
744 0.12
745 0.1
746 0.09
747 0.12
748 0.13
749 0.13
750 0.13
751 0.13
752 0.14
753 0.17
754 0.18
755 0.24
756 0.31
757 0.37
758 0.42
759 0.43
760 0.44
761 0.45
762 0.47
763 0.43
764 0.42
765 0.41
766 0.42
767 0.4
768 0.41
769 0.41
770 0.46
771 0.45
772 0.44
773 0.45
774 0.48
775 0.51
776 0.51
777 0.52
778 0.46
779 0.47
780 0.46
781 0.42
782 0.34
783 0.33
784 0.31
785 0.27
786 0.24
787 0.2
788 0.14
789 0.13
790 0.11
791 0.09
792 0.08
793 0.08
794 0.15
795 0.15
796 0.15
797 0.16
798 0.26
799 0.31
800 0.39
801 0.47
802 0.51
803 0.59
804 0.6
805 0.63
806 0.59
807 0.63
808 0.62
809 0.58
810 0.54
811 0.51
812 0.52
813 0.5
814 0.49
815 0.47
816 0.47
817 0.47
818 0.45
819 0.41
820 0.42
821 0.46
822 0.44
823 0.44
824 0.42
825 0.4
826 0.41
827 0.42
828 0.42
829 0.38
830 0.43
831 0.44
832 0.47
833 0.48
834 0.48
835 0.47
836 0.46
837 0.5
838 0.49
839 0.46
840 0.42
841 0.42
842 0.41
843 0.41
844 0.4
845 0.37
846 0.33
847 0.3
848 0.3
849 0.29
850 0.29
851 0.3
852 0.32
853 0.34
854 0.38
855 0.4
856 0.42
857 0.44
858 0.49
859 0.53
860 0.55
861 0.58
862 0.54
863 0.53
864 0.5
865 0.48
866 0.44
867 0.41
868 0.35
869 0.3
870 0.3
871 0.27
872 0.24
873 0.21
874 0.2
875 0.16
876 0.16
877 0.15
878 0.11
879 0.11
880 0.1
881 0.1
882 0.06
883 0.06
884 0.06
885 0.06
886 0.07
887 0.11
888 0.16
889 0.17
890 0.22
891 0.28
892 0.36
893 0.45
894 0.52
895 0.58
896 0.64
897 0.73
898 0.77
899 0.82
900 0.84
901 0.79
902 0.78
903 0.78
904 0.7
905 0.64
906 0.59
907 0.53
908 0.46
909 0.42
910 0.39
911 0.37
912 0.38
913 0.36
914 0.35
915 0.34
916 0.4
917 0.46
918 0.46
919 0.45
920 0.5
921 0.55
922 0.61
923 0.61
924 0.58
925 0.54
926 0.58
927 0.6
928 0.59
929 0.59
930 0.58
931 0.59
932 0.55
933 0.55
934 0.51
935 0.5
936 0.46
937 0.44
938 0.41
939 0.37
940 0.36
941 0.35
942 0.32
943 0.26
944 0.24
945 0.26
946 0.23
947 0.24
948 0.29
949 0.36
950 0.38
951 0.38
952 0.41
953 0.4
954 0.43
955 0.44
956 0.44
957 0.39
958 0.38
959 0.42
960 0.42
961 0.43
962 0.41
963 0.44
964 0.45
965 0.51
966 0.51
967 0.5
968 0.48
969 0.46
970 0.45
971 0.44
972 0.45
973 0.39
974 0.4
975 0.41
976 0.44
977 0.47
978 0.52
979 0.53
980 0.52
981 0.59
982 0.62
983 0.63
984 0.6
985 0.56
986 0.48
987 0.42
988 0.36
989 0.27
990 0.2
991 0.17
992 0.14
993 0.12
994 0.13
995 0.15
996 0.18
997 0.2
998 0.23
999 0.25
1000 0.29
1001 0.32
1002 0.35
1003 0.36
1004 0.35
1005 0.34
1006 0.34
1007 0.32
1008 0.26
1009 0.22
1010 0.19