Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C2RVM5

Protein Details
Accession A0A5C2RVM5    Localization Confidence Low Confidence Score 9.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
285-306VSSRSLTGKKPNKKVNGVQTAFHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 12.5, cyto 5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR001356  Homeobox_dom  
IPR036864  Zn2-C6_fun-type_DNA-bd_sf  
IPR001138  Zn2Cys6_DnaBD  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0000981  F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00046  Homeodomain  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50071  HOMEOBOX_2  
PS50048  ZN2_CY6_FUNGAL_2  
CDD cd00067  GAL4  
cd00086  homeodomain  
Amino Acid Sequences MSFPFPDDGNSIHYITPTASQISSHSALGNWDGSRPPPPPNRNHAPAAPAYVTPHVPPPIHNNPPFPPAPSHAGGAQVHGPHMAVPGGHAPAAAVYGGTSNFGAVSSHAAHGQYTGAFPHGPAGVHGPMLSVPGQCAPTTLQAEWRGSSSVASGFQQVAHRGYAPEPLPPTISSIHEESGQAQRPACTHCYLSSRNCDRSMPSCGRCQADGLASTCVYQSVTDTRAVTYKVVMDVLDEYYQTQSKLPTYEERLMLARRTGCRTEDIKNWFGGKRYRDPNYVPSDVSSRSLTGKKPNKKVNGVQTAFLEDYLRRNDNPNGPQRDWIAEQLGMALDTERIQNWFKGRRC
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.19
3 0.2
4 0.17
5 0.16
6 0.15
7 0.15
8 0.16
9 0.22
10 0.23
11 0.21
12 0.19
13 0.17
14 0.19
15 0.2
16 0.22
17 0.16
18 0.16
19 0.17
20 0.19
21 0.23
22 0.24
23 0.3
24 0.37
25 0.45
26 0.51
27 0.59
28 0.66
29 0.67
30 0.7
31 0.63
32 0.58
33 0.52
34 0.49
35 0.41
36 0.33
37 0.3
38 0.27
39 0.26
40 0.22
41 0.25
42 0.24
43 0.23
44 0.24
45 0.3
46 0.37
47 0.45
48 0.47
49 0.47
50 0.46
51 0.51
52 0.5
53 0.44
54 0.38
55 0.33
56 0.36
57 0.32
58 0.31
59 0.26
60 0.3
61 0.27
62 0.25
63 0.24
64 0.19
65 0.17
66 0.16
67 0.15
68 0.11
69 0.11
70 0.1
71 0.06
72 0.07
73 0.09
74 0.1
75 0.09
76 0.09
77 0.08
78 0.07
79 0.08
80 0.07
81 0.04
82 0.03
83 0.05
84 0.05
85 0.06
86 0.05
87 0.05
88 0.05
89 0.05
90 0.05
91 0.05
92 0.08
93 0.09
94 0.1
95 0.11
96 0.11
97 0.11
98 0.11
99 0.11
100 0.08
101 0.07
102 0.07
103 0.07
104 0.07
105 0.07
106 0.09
107 0.09
108 0.08
109 0.09
110 0.12
111 0.11
112 0.11
113 0.11
114 0.09
115 0.08
116 0.1
117 0.1
118 0.07
119 0.07
120 0.08
121 0.09
122 0.09
123 0.1
124 0.1
125 0.13
126 0.15
127 0.15
128 0.18
129 0.2
130 0.21
131 0.21
132 0.2
133 0.17
134 0.15
135 0.15
136 0.11
137 0.09
138 0.09
139 0.09
140 0.09
141 0.08
142 0.1
143 0.11
144 0.12
145 0.12
146 0.11
147 0.11
148 0.11
149 0.11
150 0.14
151 0.13
152 0.14
153 0.14
154 0.14
155 0.15
156 0.15
157 0.16
158 0.13
159 0.14
160 0.13
161 0.13
162 0.14
163 0.13
164 0.13
165 0.13
166 0.17
167 0.18
168 0.17
169 0.16
170 0.17
171 0.17
172 0.19
173 0.19
174 0.16
175 0.14
176 0.16
177 0.21
178 0.24
179 0.26
180 0.33
181 0.37
182 0.38
183 0.39
184 0.37
185 0.35
186 0.35
187 0.39
188 0.36
189 0.32
190 0.34
191 0.36
192 0.37
193 0.34
194 0.31
195 0.25
196 0.2
197 0.2
198 0.17
199 0.15
200 0.14
201 0.14
202 0.12
203 0.11
204 0.09
205 0.07
206 0.07
207 0.09
208 0.1
209 0.12
210 0.13
211 0.13
212 0.15
213 0.16
214 0.15
215 0.13
216 0.12
217 0.11
218 0.11
219 0.1
220 0.09
221 0.09
222 0.1
223 0.1
224 0.09
225 0.09
226 0.1
227 0.11
228 0.11
229 0.11
230 0.11
231 0.12
232 0.14
233 0.16
234 0.2
235 0.26
236 0.3
237 0.3
238 0.3
239 0.31
240 0.32
241 0.3
242 0.29
243 0.27
244 0.26
245 0.3
246 0.31
247 0.29
248 0.33
249 0.35
250 0.36
251 0.39
252 0.42
253 0.39
254 0.4
255 0.42
256 0.37
257 0.39
258 0.41
259 0.39
260 0.42
261 0.48
262 0.51
263 0.53
264 0.55
265 0.59
266 0.6
267 0.56
268 0.47
269 0.41
270 0.39
271 0.35
272 0.34
273 0.27
274 0.2
275 0.23
276 0.26
277 0.28
278 0.35
279 0.44
280 0.51
281 0.59
282 0.67
283 0.71
284 0.76
285 0.8
286 0.8
287 0.81
288 0.73
289 0.66
290 0.58
291 0.54
292 0.45
293 0.37
294 0.28
295 0.19
296 0.22
297 0.25
298 0.27
299 0.24
300 0.29
301 0.35
302 0.42
303 0.5
304 0.55
305 0.57
306 0.56
307 0.59
308 0.57
309 0.55
310 0.49
311 0.43
312 0.37
313 0.29
314 0.27
315 0.24
316 0.21
317 0.16
318 0.14
319 0.11
320 0.08
321 0.09
322 0.1
323 0.1
324 0.13
325 0.15
326 0.19
327 0.27