Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C2SK40

Protein Details
Accession A0A5C2SK40    Localization Confidence High Confidence Score 15.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
90-113SDEYKPEDKVPKRRISRPSHVSDSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
155-172KRRKSSTHAHPVPPPKRP
986-1026RGRGRGRGGDRGRGRDQGWQRGGPKGRGGPPPNGPRSNRGG
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 14, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012921  SPOC_C  
IPR003618  TFIIS_cen_dom  
IPR036575  TFIIS_cen_dom_sf  
IPR011011  Znf_FYVE_PHD  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF07744  SPOC  
PF07500  TFIIS_M  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51321  TFIIS_CENTRAL  
CDD cd21538  SPOC_TFIIS  
Amino Acid Sequences MIHCSTCKDWYHFRCVELSERDAEDIRRYVCPSCHQKTGERTIKEWEEPNPTQVDVATSKATSSPKEKKSSKAQIELKEDADSEPSSDGSDEYKPEDKVPKRRISRPSHVSDSDSDMSRAQSPKRLRRGSVATEKDIAPAAMSDQASPSTEHPSKRRKSSTHAHPVPPPKRPRSESTAGEDAARKYCSIKLQEMFCQIFTRYPFLRDRDEDDEELRGLLQPDKKTEELTPEEKEQLDAKAKQFGIDLEQCMYELYSEPDKQGKHVVAAKYKERFRMLTFNLSKADRIVLHMRIASCHISPKELSTMSSTDLASEEGKQSIKKLEEEALAHSILKKSTVPRAKLTHKGLQDIEDVTGVAQREAERERQEEEEERIERERLARLRLQAQRAQSQGSAPPESPVVGQAPSWGAPPPVPLHAQSTELGSPTSAVPIGRPPPNPLFVPSVSDFAGPLENELNLADLINIDEEASGEVAMTPVDALPTPFGETPPTHPETKSTEHVSQSTPSPITPTLAAGLSPFAAKGSQPETSARSSFNLNSLWTPGPSDAEASDFAAEPEPQDHAEPAAEDQPMGTDPQDGEAEDQDFDMFLNNDQEQEETKAPQSEPVEPAPEVQRVVAFADQAPVWTGTLSMPLDSAIPQEVAVVARQSGGRTLGEDSPLWQSLFPSKELRIDGRVPLEKSAQYLTQVRLNPTKELIAVAFCPTPGSNSAGFDALKNHLISKGRHGLIFPWGHNPKSSAPGRELYVVPLLHTEPIPEYMELLDQLQLPQERSVDYLVGVWVLTKGKLVPPPQPTPTPMPAIAPTVPQTSAAQVAVPNIDIAQLRQLGITLPQSQTLPGFQSQSPVGGSLSPPSVTTHSPAPPLAVPFDPSQIQLMLQALTGGTQQPGTFPQPPPSTATSPPQSVAIPHLTAPNPSQPIALPTAALQPWTANQPQYPPSGPPPYQQPPPYPPHAAPSGTHGSYGGGDRYERDRPYQNNGGYEYDRGFRGRGRGRGGDRGRGRDQGWQRGGPKGRGGPPPNGPRSNRGGGGGGGWHDEQRWN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.52
2 0.5
3 0.52
4 0.48
5 0.45
6 0.39
7 0.38
8 0.38
9 0.36
10 0.35
11 0.32
12 0.31
13 0.31
14 0.3
15 0.31
16 0.33
17 0.35
18 0.43
19 0.47
20 0.48
21 0.54
22 0.54
23 0.6
24 0.64
25 0.71
26 0.7
27 0.64
28 0.6
29 0.6
30 0.62
31 0.59
32 0.54
33 0.49
34 0.49
35 0.47
36 0.49
37 0.43
38 0.38
39 0.33
40 0.29
41 0.28
42 0.2
43 0.21
44 0.2
45 0.17
46 0.18
47 0.22
48 0.24
49 0.24
50 0.32
51 0.4
52 0.45
53 0.56
54 0.6
55 0.63
56 0.71
57 0.78
58 0.77
59 0.77
60 0.77
61 0.76
62 0.79
63 0.74
64 0.65
65 0.56
66 0.48
67 0.38
68 0.33
69 0.25
70 0.19
71 0.16
72 0.15
73 0.13
74 0.13
75 0.13
76 0.12
77 0.15
78 0.15
79 0.19
80 0.24
81 0.24
82 0.29
83 0.38
84 0.44
85 0.52
86 0.6
87 0.65
88 0.69
89 0.76
90 0.81
91 0.81
92 0.83
93 0.82
94 0.8
95 0.78
96 0.73
97 0.67
98 0.59
99 0.57
100 0.5
101 0.43
102 0.36
103 0.29
104 0.28
105 0.3
106 0.32
107 0.28
108 0.33
109 0.41
110 0.5
111 0.59
112 0.64
113 0.61
114 0.65
115 0.7
116 0.7
117 0.71
118 0.67
119 0.6
120 0.57
121 0.55
122 0.47
123 0.4
124 0.3
125 0.2
126 0.14
127 0.12
128 0.14
129 0.14
130 0.13
131 0.13
132 0.14
133 0.15
134 0.16
135 0.16
136 0.2
137 0.25
138 0.3
139 0.38
140 0.47
141 0.54
142 0.62
143 0.7
144 0.66
145 0.7
146 0.75
147 0.77
148 0.78
149 0.78
150 0.73
151 0.72
152 0.78
153 0.77
154 0.76
155 0.74
156 0.71
157 0.73
158 0.73
159 0.72
160 0.7
161 0.7
162 0.66
163 0.64
164 0.61
165 0.52
166 0.49
167 0.46
168 0.39
169 0.35
170 0.31
171 0.24
172 0.2
173 0.23
174 0.28
175 0.29
176 0.34
177 0.35
178 0.38
179 0.43
180 0.48
181 0.46
182 0.4
183 0.37
184 0.31
185 0.3
186 0.28
187 0.29
188 0.23
189 0.27
190 0.31
191 0.33
192 0.39
193 0.38
194 0.43
195 0.44
196 0.47
197 0.44
198 0.39
199 0.37
200 0.3
201 0.28
202 0.22
203 0.16
204 0.13
205 0.16
206 0.2
207 0.21
208 0.24
209 0.29
210 0.29
211 0.3
212 0.3
213 0.33
214 0.33
215 0.35
216 0.35
217 0.33
218 0.35
219 0.33
220 0.33
221 0.27
222 0.26
223 0.29
224 0.29
225 0.28
226 0.32
227 0.32
228 0.31
229 0.31
230 0.26
231 0.26
232 0.25
233 0.25
234 0.18
235 0.18
236 0.18
237 0.17
238 0.16
239 0.1
240 0.08
241 0.1
242 0.14
243 0.14
244 0.16
245 0.21
246 0.21
247 0.22
248 0.27
249 0.24
250 0.25
251 0.3
252 0.33
253 0.36
254 0.41
255 0.46
256 0.48
257 0.5
258 0.51
259 0.48
260 0.45
261 0.42
262 0.46
263 0.43
264 0.47
265 0.45
266 0.43
267 0.43
268 0.42
269 0.38
270 0.29
271 0.28
272 0.18
273 0.2
274 0.22
275 0.2
276 0.21
277 0.23
278 0.22
279 0.21
280 0.23
281 0.21
282 0.17
283 0.21
284 0.2
285 0.2
286 0.2
287 0.21
288 0.23
289 0.22
290 0.22
291 0.19
292 0.2
293 0.19
294 0.21
295 0.18
296 0.14
297 0.14
298 0.14
299 0.12
300 0.12
301 0.11
302 0.11
303 0.12
304 0.12
305 0.13
306 0.17
307 0.19
308 0.19
309 0.2
310 0.22
311 0.23
312 0.24
313 0.25
314 0.22
315 0.2
316 0.19
317 0.19
318 0.17
319 0.14
320 0.14
321 0.13
322 0.14
323 0.23
324 0.3
325 0.32
326 0.37
327 0.44
328 0.49
329 0.55
330 0.58
331 0.56
332 0.5
333 0.52
334 0.46
335 0.41
336 0.37
337 0.29
338 0.23
339 0.17
340 0.15
341 0.1
342 0.12
343 0.09
344 0.07
345 0.08
346 0.07
347 0.1
348 0.12
349 0.17
350 0.18
351 0.19
352 0.21
353 0.22
354 0.25
355 0.25
356 0.26
357 0.27
358 0.26
359 0.26
360 0.25
361 0.24
362 0.22
363 0.21
364 0.24
365 0.21
366 0.24
367 0.25
368 0.26
369 0.35
370 0.39
371 0.42
372 0.39
373 0.4
374 0.41
375 0.39
376 0.38
377 0.29
378 0.26
379 0.25
380 0.25
381 0.23
382 0.18
383 0.17
384 0.16
385 0.16
386 0.15
387 0.12
388 0.1
389 0.08
390 0.08
391 0.08
392 0.09
393 0.09
394 0.09
395 0.09
396 0.08
397 0.08
398 0.1
399 0.1
400 0.11
401 0.12
402 0.13
403 0.16
404 0.16
405 0.18
406 0.16
407 0.17
408 0.15
409 0.15
410 0.14
411 0.1
412 0.1
413 0.08
414 0.08
415 0.06
416 0.06
417 0.06
418 0.1
419 0.15
420 0.18
421 0.19
422 0.23
423 0.25
424 0.28
425 0.28
426 0.27
427 0.26
428 0.22
429 0.26
430 0.22
431 0.21
432 0.19
433 0.18
434 0.15
435 0.12
436 0.13
437 0.09
438 0.08
439 0.07
440 0.07
441 0.07
442 0.07
443 0.07
444 0.05
445 0.05
446 0.04
447 0.04
448 0.04
449 0.04
450 0.04
451 0.03
452 0.03
453 0.03
454 0.04
455 0.04
456 0.03
457 0.03
458 0.03
459 0.03
460 0.03
461 0.03
462 0.03
463 0.02
464 0.03
465 0.03
466 0.03
467 0.04
468 0.04
469 0.06
470 0.06
471 0.07
472 0.09
473 0.1
474 0.13
475 0.19
476 0.21
477 0.21
478 0.2
479 0.23
480 0.26
481 0.29
482 0.29
483 0.28
484 0.28
485 0.28
486 0.3
487 0.29
488 0.25
489 0.22
490 0.21
491 0.16
492 0.13
493 0.14
494 0.13
495 0.12
496 0.11
497 0.1
498 0.08
499 0.08
500 0.08
501 0.06
502 0.06
503 0.05
504 0.05
505 0.05
506 0.04
507 0.04
508 0.04
509 0.06
510 0.08
511 0.09
512 0.1
513 0.12
514 0.14
515 0.16
516 0.18
517 0.16
518 0.15
519 0.16
520 0.15
521 0.16
522 0.14
523 0.13
524 0.12
525 0.14
526 0.14
527 0.12
528 0.12
529 0.1
530 0.1
531 0.09
532 0.1
533 0.07
534 0.08
535 0.08
536 0.08
537 0.08
538 0.07
539 0.07
540 0.07
541 0.07
542 0.06
543 0.06
544 0.07
545 0.07
546 0.07
547 0.07
548 0.06
549 0.07
550 0.07
551 0.07
552 0.09
553 0.08
554 0.07
555 0.07
556 0.07
557 0.08
558 0.08
559 0.07
560 0.05
561 0.05
562 0.07
563 0.08
564 0.07
565 0.08
566 0.08
567 0.09
568 0.08
569 0.08
570 0.06
571 0.06
572 0.06
573 0.06
574 0.05
575 0.05
576 0.07
577 0.07
578 0.08
579 0.08
580 0.09
581 0.09
582 0.12
583 0.13
584 0.12
585 0.13
586 0.15
587 0.15
588 0.19
589 0.19
590 0.19
591 0.21
592 0.21
593 0.22
594 0.2
595 0.21
596 0.19
597 0.19
598 0.16
599 0.13
600 0.12
601 0.1
602 0.11
603 0.1
604 0.08
605 0.07
606 0.08
607 0.08
608 0.08
609 0.08
610 0.07
611 0.07
612 0.06
613 0.07
614 0.05
615 0.08
616 0.08
617 0.07
618 0.07
619 0.07
620 0.08
621 0.07
622 0.08
623 0.06
624 0.06
625 0.06
626 0.06
627 0.06
628 0.06
629 0.06
630 0.06
631 0.05
632 0.06
633 0.07
634 0.07
635 0.07
636 0.09
637 0.08
638 0.09
639 0.12
640 0.12
641 0.13
642 0.13
643 0.13
644 0.15
645 0.16
646 0.15
647 0.12
648 0.12
649 0.16
650 0.17
651 0.18
652 0.18
653 0.18
654 0.22
655 0.24
656 0.25
657 0.24
658 0.24
659 0.24
660 0.27
661 0.3
662 0.27
663 0.27
664 0.28
665 0.24
666 0.24
667 0.23
668 0.18
669 0.17
670 0.19
671 0.19
672 0.23
673 0.25
674 0.26
675 0.31
676 0.32
677 0.3
678 0.28
679 0.27
680 0.21
681 0.2
682 0.17
683 0.12
684 0.11
685 0.12
686 0.1
687 0.09
688 0.1
689 0.09
690 0.1
691 0.11
692 0.13
693 0.12
694 0.13
695 0.14
696 0.15
697 0.15
698 0.14
699 0.15
700 0.14
701 0.16
702 0.15
703 0.14
704 0.17
705 0.2
706 0.21
707 0.26
708 0.32
709 0.31
710 0.31
711 0.31
712 0.28
713 0.32
714 0.34
715 0.28
716 0.29
717 0.31
718 0.31
719 0.32
720 0.33
721 0.27
722 0.32
723 0.35
724 0.28
725 0.29
726 0.31
727 0.31
728 0.32
729 0.3
730 0.24
731 0.24
732 0.21
733 0.18
734 0.17
735 0.16
736 0.14
737 0.14
738 0.13
739 0.09
740 0.12
741 0.14
742 0.12
743 0.12
744 0.11
745 0.12
746 0.11
747 0.11
748 0.09
749 0.08
750 0.08
751 0.11
752 0.12
753 0.13
754 0.14
755 0.14
756 0.13
757 0.14
758 0.15
759 0.12
760 0.11
761 0.1
762 0.09
763 0.08
764 0.08
765 0.06
766 0.07
767 0.08
768 0.08
769 0.07
770 0.08
771 0.12
772 0.18
773 0.21
774 0.26
775 0.32
776 0.38
777 0.42
778 0.44
779 0.44
780 0.45
781 0.46
782 0.43
783 0.36
784 0.33
785 0.3
786 0.31
787 0.27
788 0.23
789 0.21
790 0.19
791 0.19
792 0.18
793 0.17
794 0.15
795 0.16
796 0.14
797 0.12
798 0.11
799 0.12
800 0.11
801 0.1
802 0.09
803 0.07
804 0.09
805 0.08
806 0.08
807 0.11
808 0.12
809 0.12
810 0.11
811 0.12
812 0.1
813 0.13
814 0.16
815 0.15
816 0.15
817 0.17
818 0.17
819 0.17
820 0.18
821 0.17
822 0.17
823 0.15
824 0.18
825 0.16
826 0.19
827 0.19
828 0.2
829 0.18
830 0.16
831 0.15
832 0.12
833 0.13
834 0.12
835 0.13
836 0.12
837 0.12
838 0.14
839 0.16
840 0.16
841 0.18
842 0.21
843 0.22
844 0.24
845 0.24
846 0.24
847 0.23
848 0.24
849 0.24
850 0.2
851 0.2
852 0.19
853 0.22
854 0.2
855 0.18
856 0.18
857 0.16
858 0.15
859 0.14
860 0.14
861 0.11
862 0.1
863 0.1
864 0.08
865 0.08
866 0.08
867 0.08
868 0.07
869 0.08
870 0.08
871 0.09
872 0.13
873 0.18
874 0.23
875 0.24
876 0.32
877 0.34
878 0.36
879 0.4
880 0.42
881 0.41
882 0.39
883 0.44
884 0.4
885 0.39
886 0.38
887 0.35
888 0.3
889 0.27
890 0.28
891 0.24
892 0.2
893 0.19
894 0.24
895 0.23
896 0.25
897 0.26
898 0.29
899 0.28
900 0.27
901 0.27
902 0.22
903 0.25
904 0.27
905 0.24
906 0.17
907 0.15
908 0.21
909 0.2
910 0.2
911 0.17
912 0.14
913 0.16
914 0.21
915 0.22
916 0.19
917 0.2
918 0.25
919 0.28
920 0.32
921 0.32
922 0.31
923 0.36
924 0.42
925 0.42
926 0.4
927 0.46
928 0.48
929 0.54
930 0.55
931 0.55
932 0.53
933 0.58
934 0.61
935 0.58
936 0.53
937 0.5
938 0.5
939 0.45
940 0.38
941 0.38
942 0.39
943 0.34
944 0.33
945 0.27
946 0.23
947 0.23
948 0.25
949 0.2
950 0.14
951 0.14
952 0.17
953 0.22
954 0.28
955 0.29
956 0.32
957 0.38
958 0.41
959 0.5
960 0.56
961 0.54
962 0.52
963 0.53
964 0.53
965 0.46
966 0.45
967 0.38
968 0.32
969 0.3
970 0.27
971 0.25
972 0.24
973 0.32
974 0.37
975 0.41
976 0.46
977 0.52
978 0.56
979 0.65
980 0.66
981 0.67
982 0.66
983 0.67
984 0.64
985 0.61
986 0.57
987 0.56
988 0.59
989 0.6
990 0.59
991 0.58
992 0.56
993 0.6
994 0.65
995 0.6
996 0.59
997 0.56
998 0.58
999 0.61
1000 0.63
1001 0.61
1002 0.65
1003 0.71
1004 0.72
1005 0.72
1006 0.68
1007 0.65
1008 0.68
1009 0.66
1010 0.58
1011 0.51
1012 0.44
1013 0.36
1014 0.34
1015 0.3
1016 0.24
1017 0.21
1018 0.2
1019 0.18