Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A7TT09

Protein Details
Accession A7TT09    Localization Confidence High Confidence Score 19.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MSYYNRYRNRRRPDSAGGAGHydrophilic
145-166DASEHKEKKRKLKGDKKQPAEPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
149-163HKEKKRKLKGDKKQP
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003173  PC4_C  
IPR009044  ssDNA-bd_transcriptional_reg  
IPR045125  Sub1/Tcp4-like  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003713  F:transcription coactivator activity  
GO:0060261  P:positive regulation of transcription initiation by RNA polymerase II  
KEGG vpo:Kpol_262p5  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02229  PC4  
Amino Acid Sequences MSYYNRYRNRRRPDSAGGAGNGAGNAGPGNAGNPMQAGLGTPDAIFDIGKNKRVTVRQFRNVNLIDIREYYLDNSTGEMRPGKKGISLTEDLYDEFLKHRLNIDEALRRLGSKRPRTKTVLLESDDEDEVNTETSKDKDKENGNDASEHKEKKRKLKGDKKQPAEPSRLITEEKKHMDEREANATLVVPGLNKKQDSTPEAATPPPQQPSTSPATDSAVVVTASADSAAAATPDPEPVSVPEQIPDETAVKVKHETTEAVQIEPQEDNSSDEEFAKHLDDEMNKADDDVSEEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.82
2 0.77
3 0.72
4 0.62
5 0.53
6 0.46
7 0.38
8 0.28
9 0.19
10 0.12
11 0.07
12 0.06
13 0.05
14 0.05
15 0.04
16 0.05
17 0.07
18 0.07
19 0.07
20 0.07
21 0.08
22 0.08
23 0.08
24 0.08
25 0.08
26 0.08
27 0.09
28 0.08
29 0.08
30 0.08
31 0.09
32 0.08
33 0.07
34 0.14
35 0.17
36 0.24
37 0.24
38 0.26
39 0.32
40 0.38
41 0.47
42 0.5
43 0.57
44 0.6
45 0.65
46 0.65
47 0.68
48 0.62
49 0.57
50 0.48
51 0.39
52 0.32
53 0.27
54 0.27
55 0.19
56 0.18
57 0.15
58 0.15
59 0.14
60 0.12
61 0.12
62 0.14
63 0.14
64 0.15
65 0.18
66 0.18
67 0.2
68 0.21
69 0.2
70 0.2
71 0.21
72 0.22
73 0.24
74 0.25
75 0.23
76 0.23
77 0.23
78 0.2
79 0.2
80 0.18
81 0.12
82 0.11
83 0.12
84 0.11
85 0.11
86 0.14
87 0.13
88 0.15
89 0.18
90 0.21
91 0.25
92 0.25
93 0.27
94 0.24
95 0.23
96 0.23
97 0.27
98 0.32
99 0.36
100 0.45
101 0.48
102 0.54
103 0.6
104 0.63
105 0.64
106 0.62
107 0.59
108 0.51
109 0.47
110 0.42
111 0.38
112 0.33
113 0.25
114 0.17
115 0.11
116 0.09
117 0.08
118 0.07
119 0.05
120 0.06
121 0.07
122 0.13
123 0.14
124 0.14
125 0.2
126 0.25
127 0.29
128 0.33
129 0.35
130 0.3
131 0.32
132 0.32
133 0.32
134 0.31
135 0.3
136 0.29
137 0.33
138 0.36
139 0.43
140 0.52
141 0.55
142 0.62
143 0.7
144 0.76
145 0.81
146 0.86
147 0.81
148 0.79
149 0.79
150 0.72
151 0.68
152 0.59
153 0.51
154 0.43
155 0.4
156 0.35
157 0.29
158 0.29
159 0.3
160 0.31
161 0.31
162 0.31
163 0.3
164 0.32
165 0.34
166 0.33
167 0.33
168 0.32
169 0.28
170 0.27
171 0.26
172 0.21
173 0.16
174 0.13
175 0.06
176 0.07
177 0.1
178 0.13
179 0.13
180 0.14
181 0.17
182 0.21
183 0.24
184 0.27
185 0.26
186 0.26
187 0.27
188 0.27
189 0.27
190 0.26
191 0.26
192 0.25
193 0.24
194 0.22
195 0.21
196 0.25
197 0.28
198 0.26
199 0.23
200 0.21
201 0.23
202 0.23
203 0.22
204 0.17
205 0.13
206 0.11
207 0.1
208 0.09
209 0.06
210 0.06
211 0.05
212 0.05
213 0.03
214 0.04
215 0.04
216 0.04
217 0.04
218 0.05
219 0.05
220 0.07
221 0.07
222 0.07
223 0.08
224 0.11
225 0.14
226 0.16
227 0.16
228 0.16
229 0.18
230 0.18
231 0.18
232 0.18
233 0.16
234 0.15
235 0.18
236 0.17
237 0.17
238 0.2
239 0.2
240 0.2
241 0.21
242 0.22
243 0.21
244 0.3
245 0.28
246 0.27
247 0.27
248 0.26
249 0.26
250 0.24
251 0.22
252 0.16
253 0.15
254 0.17
255 0.18
256 0.19
257 0.18
258 0.18
259 0.18
260 0.15
261 0.16
262 0.15
263 0.14
264 0.13
265 0.17
266 0.18
267 0.21
268 0.25
269 0.25
270 0.23
271 0.23
272 0.22
273 0.18