Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C2SN43

Protein Details
Accession A0A5C2SN43    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
14-49IPPPTITPKPTDKRNENNKKRRPKRKRIASEASASIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
26-41KRNENNKKRRPKRKRI
552-561RSPPRRRRKA
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 13, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR043519  NT_sf  
IPR002058  PAP_assoc  
IPR002934  Polymerase_NTP_transf_dom  
IPR045862  Trf4-like  
Gene Ontology GO:0031499  C:TRAMP complex  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:1990817  F:poly(A) RNA polymerase activity  
GO:0031123  P:RNA 3'-end processing  
GO:0043631  P:RNA polyadenylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF01909  NTP_transf_2  
PF03828  PAP_assoc  
CDD cd05402  NT_PAP_TUTase  
Amino Acid Sequences MDPSTVVAAGPSNIPPPTITPKPTDKRNENNKKRRPKRKRIASEASASIAGEHPEAGETDSVHVGVEAEGWSAPWLEELGTTSYESKQQRLHDEIVAFFNYISPTPNETHARGMVIAQVSEVARRRFRDASVETFGSVAQNLYLPDGDTDLVIQTSEPFDDERKKSALFQLAAMMRNSRITRYVQVIHRARVPVISFETQPDLGSLKVDISFNATDGVKAVPILRDYFDKMPALRYLVLCVKSLLSRHKLNTASSSGLSSYGVILLAINFLQLNPLKRPAAYLEQPMENESLGILLTDFLDYYGNLFDYAESVVSVSQGKVLSKEEKGWDGLNNPESLCIECMLNPENDVGRPTSKIWKIRKVLKGAHSLLESYAFSDVPAAHNILGRILGISDATLEHRILLKDIVTSGRLSQALREVQSAATLYSNAPRRPQSSYQQYNPRYNSRPYPSSAGNDRPRNNLPPKPPPPRQPSGPPRQPSGSGYNLPPRPGPSPKSHYVAQGPSLAALRAAASASADASANPNTRANDKPGDAGSTANTHSNGNGRSAQGMRSPPRRRRKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.15
3 0.19
4 0.27
5 0.31
6 0.33
7 0.37
8 0.47
9 0.54
10 0.63
11 0.68
12 0.69
13 0.74
14 0.82
15 0.87
16 0.88
17 0.91
18 0.92
19 0.93
20 0.94
21 0.95
22 0.95
23 0.95
24 0.95
25 0.95
26 0.96
27 0.95
28 0.94
29 0.89
30 0.85
31 0.76
32 0.67
33 0.56
34 0.45
35 0.35
36 0.27
37 0.21
38 0.14
39 0.11
40 0.09
41 0.09
42 0.1
43 0.1
44 0.09
45 0.09
46 0.11
47 0.11
48 0.11
49 0.1
50 0.1
51 0.09
52 0.08
53 0.08
54 0.07
55 0.07
56 0.07
57 0.07
58 0.07
59 0.07
60 0.07
61 0.06
62 0.07
63 0.06
64 0.07
65 0.09
66 0.1
67 0.11
68 0.12
69 0.14
70 0.15
71 0.22
72 0.23
73 0.25
74 0.28
75 0.32
76 0.38
77 0.42
78 0.44
79 0.41
80 0.41
81 0.39
82 0.37
83 0.33
84 0.26
85 0.2
86 0.18
87 0.15
88 0.13
89 0.14
90 0.13
91 0.15
92 0.17
93 0.23
94 0.26
95 0.26
96 0.29
97 0.28
98 0.27
99 0.24
100 0.23
101 0.2
102 0.17
103 0.15
104 0.11
105 0.12
106 0.11
107 0.15
108 0.2
109 0.2
110 0.24
111 0.26
112 0.32
113 0.32
114 0.34
115 0.39
116 0.38
117 0.4
118 0.41
119 0.4
120 0.34
121 0.32
122 0.31
123 0.22
124 0.18
125 0.12
126 0.06
127 0.07
128 0.07
129 0.08
130 0.08
131 0.07
132 0.07
133 0.08
134 0.08
135 0.07
136 0.07
137 0.06
138 0.06
139 0.06
140 0.05
141 0.05
142 0.06
143 0.06
144 0.07
145 0.07
146 0.11
147 0.19
148 0.21
149 0.24
150 0.25
151 0.26
152 0.28
153 0.32
154 0.36
155 0.29
156 0.27
157 0.29
158 0.3
159 0.31
160 0.29
161 0.25
162 0.18
163 0.22
164 0.22
165 0.17
166 0.17
167 0.18
168 0.2
169 0.24
170 0.3
171 0.29
172 0.38
173 0.41
174 0.4
175 0.42
176 0.4
177 0.35
178 0.32
179 0.29
180 0.22
181 0.22
182 0.22
183 0.18
184 0.18
185 0.21
186 0.18
187 0.17
188 0.15
189 0.12
190 0.1
191 0.1
192 0.09
193 0.07
194 0.08
195 0.08
196 0.07
197 0.11
198 0.11
199 0.1
200 0.12
201 0.11
202 0.1
203 0.1
204 0.11
205 0.07
206 0.07
207 0.08
208 0.07
209 0.08
210 0.09
211 0.09
212 0.11
213 0.14
214 0.15
215 0.17
216 0.17
217 0.16
218 0.17
219 0.17
220 0.18
221 0.16
222 0.15
223 0.16
224 0.19
225 0.19
226 0.18
227 0.17
228 0.16
229 0.15
230 0.18
231 0.21
232 0.21
233 0.24
234 0.25
235 0.3
236 0.31
237 0.31
238 0.32
239 0.28
240 0.25
241 0.22
242 0.21
243 0.15
244 0.14
245 0.13
246 0.09
247 0.07
248 0.05
249 0.05
250 0.04
251 0.04
252 0.03
253 0.04
254 0.03
255 0.03
256 0.03
257 0.03
258 0.05
259 0.07
260 0.09
261 0.1
262 0.14
263 0.14
264 0.14
265 0.15
266 0.16
267 0.19
268 0.19
269 0.21
270 0.2
271 0.21
272 0.21
273 0.22
274 0.19
275 0.14
276 0.11
277 0.08
278 0.06
279 0.04
280 0.04
281 0.03
282 0.03
283 0.03
284 0.03
285 0.03
286 0.03
287 0.04
288 0.04
289 0.04
290 0.05
291 0.05
292 0.05
293 0.05
294 0.04
295 0.05
296 0.05
297 0.05
298 0.04
299 0.04
300 0.04
301 0.05
302 0.05
303 0.05
304 0.07
305 0.08
306 0.08
307 0.09
308 0.12
309 0.15
310 0.15
311 0.18
312 0.18
313 0.19
314 0.2
315 0.19
316 0.18
317 0.17
318 0.2
319 0.18
320 0.17
321 0.16
322 0.15
323 0.15
324 0.14
325 0.12
326 0.09
327 0.08
328 0.08
329 0.1
330 0.11
331 0.1
332 0.1
333 0.11
334 0.11
335 0.11
336 0.12
337 0.11
338 0.11
339 0.12
340 0.14
341 0.21
342 0.25
343 0.34
344 0.39
345 0.46
346 0.52
347 0.59
348 0.64
349 0.63
350 0.64
351 0.62
352 0.64
353 0.57
354 0.53
355 0.44
356 0.38
357 0.32
358 0.27
359 0.2
360 0.12
361 0.11
362 0.08
363 0.08
364 0.08
365 0.09
366 0.08
367 0.1
368 0.1
369 0.1
370 0.11
371 0.11
372 0.1
373 0.1
374 0.08
375 0.07
376 0.06
377 0.06
378 0.04
379 0.04
380 0.04
381 0.04
382 0.06
383 0.07
384 0.07
385 0.08
386 0.11
387 0.11
388 0.12
389 0.12
390 0.11
391 0.1
392 0.12
393 0.12
394 0.11
395 0.11
396 0.11
397 0.13
398 0.14
399 0.14
400 0.14
401 0.18
402 0.21
403 0.21
404 0.21
405 0.19
406 0.18
407 0.19
408 0.18
409 0.13
410 0.1
411 0.1
412 0.09
413 0.14
414 0.21
415 0.21
416 0.26
417 0.29
418 0.31
419 0.38
420 0.43
421 0.47
422 0.51
423 0.58
424 0.62
425 0.68
426 0.72
427 0.73
428 0.72
429 0.71
430 0.65
431 0.62
432 0.63
433 0.6
434 0.58
435 0.53
436 0.53
437 0.49
438 0.5
439 0.51
440 0.52
441 0.54
442 0.58
443 0.57
444 0.58
445 0.6
446 0.62
447 0.64
448 0.62
449 0.61
450 0.63
451 0.7
452 0.74
453 0.77
454 0.78
455 0.79
456 0.78
457 0.77
458 0.77
459 0.77
460 0.78
461 0.8
462 0.74
463 0.71
464 0.67
465 0.63
466 0.57
467 0.53
468 0.48
469 0.42
470 0.43
471 0.47
472 0.46
473 0.45
474 0.42
475 0.4
476 0.4
477 0.43
478 0.44
479 0.44
480 0.49
481 0.53
482 0.55
483 0.54
484 0.54
485 0.53
486 0.52
487 0.45
488 0.41
489 0.36
490 0.32
491 0.31
492 0.25
493 0.18
494 0.15
495 0.12
496 0.09
497 0.09
498 0.07
499 0.07
500 0.07
501 0.07
502 0.08
503 0.07
504 0.07
505 0.1
506 0.15
507 0.16
508 0.18
509 0.22
510 0.24
511 0.28
512 0.32
513 0.35
514 0.37
515 0.36
516 0.38
517 0.36
518 0.37
519 0.33
520 0.31
521 0.27
522 0.24
523 0.24
524 0.23
525 0.22
526 0.19
527 0.21
528 0.26
529 0.25
530 0.26
531 0.28
532 0.26
533 0.3
534 0.31
535 0.32
536 0.31
537 0.39
538 0.43
539 0.5
540 0.59
541 0.65