Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C2SWG5

Protein Details
Accession A0A5C2SWG5    Localization Confidence High Confidence Score 24.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
332-359AETLVSDKQKKKKQRREEKKQKAQEGETHydrophilic
724-751DDDEASHKKRKGKDRKGKGRNTGVKQAKBasic
886-933NDAGSKKKASRRQSLLNIKREDTEGTEEQRPKKKRRVSDPPKPSAKSAHydrophilic
946-968GKQVGSLIGRKRKERKMKKARGKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
214-238KRLDGLAKAAAAKKAKAPTKPKAGP
339-353KQKKKKQRREEKKQK
730-746HKKRKGKDRKGKGRNTG
870-900GKDGKGGRQAKESKRANDAGSKKKASRRQSL
914-968QRPKKKRRVSDPPKPSAKSAKQAEEGASPSKAGKQVGSLIGRKRKERKMKKARGK
Subcellular Location(s) nucl 20, mito 4, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034808  Nop4p_RRM3  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12676  RRM3_Nop4p  
Amino Acid Sequences MTTLGKRKEREEGQEKSHGSTLFVSNLPYTATSTDLKTLFSDIAPVRTAFVVLEHGTGVSKGVGYVSFAIREDAAMAIDKISKEGIILDGRSLRVQWAGSKNKDHEHIEDAQEKPAKTPATRPHKPAGPSDPLAIRTVVISGLPAGIDSKTLWKKVRKLQGAEKVEWPIKAESGEEDASVAHATFETPATASEAVNKLHAHVFKGSLLSATLKKRLDGLAKAAAAKKAKAPTKPKAGPAPTHASRLIVRNLPFDITEQDLRAIFLPHGPIYSVHIPLASDVKHEDDVKPEEGESKPSRPRSKGFAFVWFLSRKDAEKAMEACNGMTVEAGMAETLVSDKQKKKKQRREEKKQKAQEGETAAGDEVEEEQEGPGKKRTIAVDWALSKDKWEAEKAKLEEKQGDGDIEMGEGSEEEDESGDESSSEESAESGNEDEEEQLGVHEDGSDESGESDSDREDESDEEDEDQKPAKPALPAPEVGTTVFVRNVPFEATDDELRTLFRAFGPLRYARITMDHDSCRSRGTGFVCFWNKEDADKAIEQSNILRAETVGNEPVVAKKNPFKMPSLLTPDPSASIAQNLVLHGRTLDVSRAVTRDEASKLKEAGERQREKADKRNLYLLREGIILPNTPAAESLPAAEIEKRTQSFNARRALLRSNPSLFVSRTRLSIRQLPLFVTERMLKRLAIHAIRAFESEVKAEKRESLNSDELAEPTPAEDDEDVKMEDDDEASHKKRKGKDRKGKGRNTGVKQAKVVRQQDRVDPVTGKGRSRGYGFLELGTHADALRVLRWANNNFAVGRLFEEWWKAELEDLIAAEKHKDAAKRDETRIKRIREEIEKGVPPKSRGTLIVEFSIENIQVVQRRATRTGADAGKDGKGGRQAKESKRANDAGSKKKASRRQSLLNIKREDTEGTEEQRPKKKRRVSDPPKPSAKSAKQAEEGASPSKAGKQVGSLIGRKRKERKMKKARGK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.69
2 0.66
3 0.6
4 0.58
5 0.48
6 0.41
7 0.37
8 0.33
9 0.29
10 0.28
11 0.26
12 0.21
13 0.21
14 0.21
15 0.17
16 0.16
17 0.13
18 0.16
19 0.16
20 0.18
21 0.23
22 0.22
23 0.22
24 0.21
25 0.23
26 0.21
27 0.19
28 0.23
29 0.2
30 0.22
31 0.23
32 0.22
33 0.22
34 0.2
35 0.21
36 0.14
37 0.13
38 0.14
39 0.13
40 0.14
41 0.12
42 0.12
43 0.12
44 0.12
45 0.12
46 0.08
47 0.07
48 0.07
49 0.08
50 0.08
51 0.09
52 0.12
53 0.13
54 0.14
55 0.14
56 0.15
57 0.14
58 0.14
59 0.13
60 0.11
61 0.1
62 0.1
63 0.1
64 0.1
65 0.12
66 0.12
67 0.12
68 0.12
69 0.11
70 0.1
71 0.11
72 0.14
73 0.14
74 0.15
75 0.17
76 0.2
77 0.21
78 0.22
79 0.21
80 0.18
81 0.17
82 0.18
83 0.23
84 0.29
85 0.37
86 0.42
87 0.49
88 0.52
89 0.55
90 0.61
91 0.57
92 0.5
93 0.47
94 0.46
95 0.44
96 0.47
97 0.42
98 0.43
99 0.44
100 0.41
101 0.37
102 0.38
103 0.36
104 0.31
105 0.38
106 0.42
107 0.48
108 0.54
109 0.58
110 0.6
111 0.63
112 0.64
113 0.63
114 0.61
115 0.58
116 0.54
117 0.52
118 0.48
119 0.43
120 0.41
121 0.34
122 0.26
123 0.18
124 0.17
125 0.13
126 0.09
127 0.08
128 0.06
129 0.06
130 0.06
131 0.06
132 0.06
133 0.06
134 0.07
135 0.07
136 0.16
137 0.2
138 0.26
139 0.33
140 0.39
141 0.48
142 0.56
143 0.66
144 0.65
145 0.68
146 0.73
147 0.76
148 0.75
149 0.7
150 0.65
151 0.61
152 0.55
153 0.48
154 0.41
155 0.32
156 0.27
157 0.24
158 0.21
159 0.16
160 0.18
161 0.18
162 0.15
163 0.14
164 0.12
165 0.12
166 0.12
167 0.1
168 0.06
169 0.05
170 0.06
171 0.06
172 0.07
173 0.07
174 0.07
175 0.07
176 0.1
177 0.11
178 0.1
179 0.15
180 0.18
181 0.18
182 0.2
183 0.2
184 0.19
185 0.23
186 0.24
187 0.21
188 0.2
189 0.21
190 0.2
191 0.21
192 0.19
193 0.15
194 0.15
195 0.16
196 0.19
197 0.21
198 0.26
199 0.25
200 0.26
201 0.28
202 0.31
203 0.33
204 0.3
205 0.31
206 0.31
207 0.31
208 0.34
209 0.34
210 0.34
211 0.31
212 0.29
213 0.3
214 0.32
215 0.36
216 0.41
217 0.47
218 0.51
219 0.6
220 0.64
221 0.65
222 0.66
223 0.66
224 0.62
225 0.6
226 0.6
227 0.52
228 0.51
229 0.45
230 0.38
231 0.35
232 0.36
233 0.34
234 0.3
235 0.29
236 0.27
237 0.28
238 0.26
239 0.24
240 0.21
241 0.19
242 0.18
243 0.18
244 0.16
245 0.16
246 0.15
247 0.16
248 0.15
249 0.14
250 0.1
251 0.11
252 0.13
253 0.11
254 0.12
255 0.12
256 0.11
257 0.15
258 0.18
259 0.17
260 0.15
261 0.15
262 0.15
263 0.15
264 0.18
265 0.12
266 0.11
267 0.11
268 0.13
269 0.15
270 0.17
271 0.16
272 0.18
273 0.22
274 0.23
275 0.22
276 0.2
277 0.21
278 0.21
279 0.27
280 0.26
281 0.29
282 0.34
283 0.42
284 0.48
285 0.49
286 0.51
287 0.53
288 0.54
289 0.56
290 0.51
291 0.5
292 0.47
293 0.44
294 0.47
295 0.4
296 0.36
297 0.3
298 0.29
299 0.23
300 0.22
301 0.24
302 0.19
303 0.23
304 0.25
305 0.25
306 0.26
307 0.25
308 0.22
309 0.2
310 0.19
311 0.13
312 0.11
313 0.08
314 0.05
315 0.04
316 0.04
317 0.03
318 0.03
319 0.02
320 0.03
321 0.03
322 0.04
323 0.06
324 0.12
325 0.18
326 0.27
327 0.36
328 0.47
329 0.57
330 0.67
331 0.77
332 0.83
333 0.88
334 0.91
335 0.95
336 0.96
337 0.95
338 0.93
339 0.89
340 0.83
341 0.74
342 0.68
343 0.6
344 0.51
345 0.4
346 0.32
347 0.24
348 0.18
349 0.15
350 0.1
351 0.06
352 0.05
353 0.05
354 0.04
355 0.04
356 0.08
357 0.09
358 0.11
359 0.14
360 0.15
361 0.16
362 0.19
363 0.21
364 0.21
365 0.24
366 0.24
367 0.25
368 0.26
369 0.28
370 0.27
371 0.25
372 0.22
373 0.2
374 0.2
375 0.17
376 0.2
377 0.21
378 0.22
379 0.3
380 0.31
381 0.35
382 0.36
383 0.36
384 0.34
385 0.32
386 0.3
387 0.23
388 0.22
389 0.15
390 0.13
391 0.11
392 0.08
393 0.07
394 0.05
395 0.04
396 0.03
397 0.04
398 0.03
399 0.03
400 0.03
401 0.03
402 0.03
403 0.04
404 0.04
405 0.04
406 0.04
407 0.04
408 0.05
409 0.05
410 0.05
411 0.04
412 0.04
413 0.05
414 0.05
415 0.05
416 0.04
417 0.04
418 0.05
419 0.05
420 0.05
421 0.05
422 0.05
423 0.04
424 0.04
425 0.05
426 0.05
427 0.05
428 0.04
429 0.04
430 0.04
431 0.05
432 0.05
433 0.04
434 0.05
435 0.05
436 0.05
437 0.05
438 0.05
439 0.04
440 0.05
441 0.05
442 0.05
443 0.06
444 0.06
445 0.08
446 0.08
447 0.09
448 0.09
449 0.1
450 0.1
451 0.1
452 0.11
453 0.1
454 0.1
455 0.1
456 0.11
457 0.11
458 0.13
459 0.18
460 0.19
461 0.19
462 0.2
463 0.2
464 0.19
465 0.18
466 0.17
467 0.12
468 0.11
469 0.11
470 0.1
471 0.09
472 0.08
473 0.09
474 0.08
475 0.07
476 0.08
477 0.08
478 0.1
479 0.1
480 0.11
481 0.11
482 0.1
483 0.1
484 0.1
485 0.09
486 0.07
487 0.06
488 0.11
489 0.1
490 0.12
491 0.16
492 0.17
493 0.18
494 0.19
495 0.2
496 0.15
497 0.18
498 0.2
499 0.19
500 0.22
501 0.22
502 0.23
503 0.24
504 0.24
505 0.22
506 0.18
507 0.15
508 0.15
509 0.16
510 0.19
511 0.18
512 0.24
513 0.27
514 0.27
515 0.27
516 0.27
517 0.25
518 0.21
519 0.21
520 0.16
521 0.16
522 0.15
523 0.16
524 0.15
525 0.15
526 0.14
527 0.13
528 0.16
529 0.14
530 0.13
531 0.12
532 0.1
533 0.11
534 0.12
535 0.12
536 0.09
537 0.08
538 0.08
539 0.08
540 0.11
541 0.14
542 0.13
543 0.14
544 0.18
545 0.25
546 0.3
547 0.32
548 0.31
549 0.31
550 0.34
551 0.38
552 0.41
553 0.35
554 0.32
555 0.31
556 0.29
557 0.26
558 0.23
559 0.18
560 0.09
561 0.09
562 0.08
563 0.08
564 0.08
565 0.08
566 0.08
567 0.08
568 0.08
569 0.07
570 0.07
571 0.07
572 0.07
573 0.08
574 0.07
575 0.08
576 0.09
577 0.1
578 0.1
579 0.1
580 0.11
581 0.13
582 0.15
583 0.17
584 0.18
585 0.2
586 0.2
587 0.21
588 0.24
589 0.25
590 0.31
591 0.38
592 0.4
593 0.39
594 0.47
595 0.49
596 0.5
597 0.56
598 0.57
599 0.53
600 0.51
601 0.58
602 0.53
603 0.51
604 0.5
605 0.41
606 0.32
607 0.28
608 0.25
609 0.18
610 0.16
611 0.13
612 0.1
613 0.11
614 0.1
615 0.09
616 0.09
617 0.08
618 0.07
619 0.07
620 0.08
621 0.07
622 0.07
623 0.08
624 0.09
625 0.1
626 0.11
627 0.15
628 0.15
629 0.16
630 0.18
631 0.26
632 0.32
633 0.37
634 0.42
635 0.41
636 0.41
637 0.43
638 0.46
639 0.43
640 0.41
641 0.39
642 0.35
643 0.34
644 0.34
645 0.34
646 0.29
647 0.28
648 0.29
649 0.26
650 0.27
651 0.28
652 0.3
653 0.3
654 0.37
655 0.36
656 0.35
657 0.35
658 0.32
659 0.33
660 0.33
661 0.3
662 0.26
663 0.27
664 0.24
665 0.26
666 0.26
667 0.22
668 0.21
669 0.25
670 0.28
671 0.25
672 0.26
673 0.26
674 0.27
675 0.27
676 0.26
677 0.23
678 0.18
679 0.17
680 0.15
681 0.17
682 0.17
683 0.18
684 0.18
685 0.22
686 0.24
687 0.27
688 0.29
689 0.3
690 0.31
691 0.3
692 0.32
693 0.28
694 0.26
695 0.23
696 0.2
697 0.13
698 0.11
699 0.11
700 0.08
701 0.09
702 0.08
703 0.08
704 0.09
705 0.11
706 0.11
707 0.11
708 0.11
709 0.1
710 0.09
711 0.08
712 0.08
713 0.1
714 0.15
715 0.18
716 0.25
717 0.29
718 0.35
719 0.43
720 0.53
721 0.61
722 0.67
723 0.75
724 0.8
725 0.87
726 0.91
727 0.93
728 0.91
729 0.91
730 0.89
731 0.84
732 0.83
733 0.79
734 0.72
735 0.67
736 0.65
737 0.61
738 0.6
739 0.62
740 0.59
741 0.59
742 0.59
743 0.6
744 0.6
745 0.56
746 0.5
747 0.43
748 0.38
749 0.39
750 0.39
751 0.35
752 0.33
753 0.33
754 0.32
755 0.34
756 0.35
757 0.31
758 0.35
759 0.34
760 0.3
761 0.28
762 0.26
763 0.24
764 0.21
765 0.16
766 0.09
767 0.09
768 0.08
769 0.09
770 0.09
771 0.1
772 0.1
773 0.13
774 0.2
775 0.22
776 0.26
777 0.27
778 0.28
779 0.27
780 0.28
781 0.25
782 0.19
783 0.2
784 0.17
785 0.16
786 0.15
787 0.18
788 0.18
789 0.18
790 0.18
791 0.15
792 0.14
793 0.14
794 0.13
795 0.11
796 0.1
797 0.11
798 0.1
799 0.11
800 0.11
801 0.11
802 0.12
803 0.15
804 0.19
805 0.22
806 0.31
807 0.41
808 0.47
809 0.54
810 0.62
811 0.63
812 0.7
813 0.74
814 0.7
815 0.67
816 0.66
817 0.67
818 0.65
819 0.66
820 0.63
821 0.62
822 0.63
823 0.58
824 0.57
825 0.54
826 0.47
827 0.46
828 0.42
829 0.37
830 0.33
831 0.39
832 0.38
833 0.36
834 0.37
835 0.33
836 0.3
837 0.28
838 0.27
839 0.2
840 0.14
841 0.12
842 0.12
843 0.15
844 0.17
845 0.21
846 0.24
847 0.29
848 0.31
849 0.34
850 0.33
851 0.32
852 0.38
853 0.37
854 0.34
855 0.33
856 0.33
857 0.31
858 0.31
859 0.28
860 0.23
861 0.28
862 0.31
863 0.31
864 0.38
865 0.46
866 0.52
867 0.62
868 0.67
869 0.63
870 0.66
871 0.67
872 0.61
873 0.61
874 0.63
875 0.62
876 0.64
877 0.65
878 0.64
879 0.69
880 0.74
881 0.74
882 0.75
883 0.73
884 0.74
885 0.78
886 0.83
887 0.84
888 0.84
889 0.8
890 0.71
891 0.65
892 0.57
893 0.49
894 0.41
895 0.39
896 0.35
897 0.35
898 0.42
899 0.46
900 0.52
901 0.6
902 0.64
903 0.66
904 0.71
905 0.76
906 0.77
907 0.82
908 0.85
909 0.86
910 0.89
911 0.9
912 0.9
913 0.91
914 0.84
915 0.79
916 0.78
917 0.75
918 0.74
919 0.71
920 0.69
921 0.64
922 0.64
923 0.6
924 0.54
925 0.5
926 0.43
927 0.36
928 0.29
929 0.25
930 0.27
931 0.28
932 0.25
933 0.23
934 0.23
935 0.28
936 0.34
937 0.39
938 0.41
939 0.46
940 0.54
941 0.59
942 0.64
943 0.68
944 0.72
945 0.77
946 0.82
947 0.84
948 0.86