FuNGI

A0A5C2SHA8

Protein Details

Accession

A0A5C2SHA8

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
810-837	TERTHYGGFEKRRRGKRKAAEANQPNAS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
820-828	KRRRGKRKA

Subcellular Location(s)

extr 9, cyto 6.5, mito 5, cyto_nucl 5, nucl 2.5, plas 2, pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR046351 UTP4 IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR001680 WD40_repeat IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Gene Ontology	GO:0030686 C:90S preribosome GO:0000462 P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)
Pfam	View protein in Pfam PF00400 WD40

Amino Acid Sequences

MVEGTATLAVHRCRFVDFTPSAVTALCFPPLPLPSVKGKKAATNSRFPGFGILVVGRANGNIELCEWTGSNPRSQAPQAWVVRKTLVGPYPSKVESLALTFRSPRHAAQEDVASWSNLRLFSAGGGSELVEWDIERGCIKRTLSSQGGPIWSISPNPASTILALGCEDGSVRLVSLQYDELNHLRRLDRVKSRILSIAWGPPVPRQSKTQATNDESDSDDDDDEWTDSWLVTACSDSSLRKWDFSTGRSLERMGTDKIRGERTLVWAVGVLGDGTIVSGDSMGIVKFWDSRTCTQLQSFQGHAADVLCLTIGPDGTAVYTSGVDQKVTQFSYVKTSRSSKNPSPLVSRAPGRWVQSCSRRLHSHDVRALAIWPPYTPLPSSHQRHFPADIAPVLASGGLDMSVVVTPAALPTATLTGKVMNPLATSTQATFEDAYHRRLAYTTGTASSSAVHVAKKARLVMCTREAGLTVWRIAKRKPKGDDFDADLEGPSSQDGGWERVLDMDLAVQTNVAAGAISDDGKWIAVADWYETKLFQMTEEKNGDLKPRRIRDFAATLQSQLASTSTGASSLTFTPDSSKLILAASESAAVVIVDLGTTDRAPRVLRKFEQHRLRDGYVRGRVVVGRKTSASAEGGEDVEMAPGDANDDAQAAHDDAGSSSAESDVEDSKLIHTTVTRMAVSPDGQWLATSDARRRTHVFNLDAVQHHCTLPTFPQPIHALAFDPSARSTLVLGFADNQLEVYDVEARHFPRWARSLINALPQRFTHLHDPVLGVTFDPGSRVGGAEEGGSPLPPKTALFWGATWLCKVILTERTHYGGFEKRRRGKRKAAEANQPNASGRVEVSVEDGQQEVQQRNFKLITHYRPLLLVDFVSPGQLVVVERPLVDVLAKLPPAYFKPKYGAT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.26
2	0.27
3	0.31
4	0.28
5	0.29
6	0.31
7	0.31
8	0.29
9	0.26
10	0.24
11	0.19
12	0.2
13	0.17
14	0.14
15	0.13
16	0.18
17	0.19
18	0.22
19	0.21
20	0.23
21	0.32
22	0.41
23	0.43
24	0.46
25	0.46
26	0.5
27	0.58
28	0.65
29	0.61
30	0.62
31	0.64
32	0.6
33	0.58
34	0.51
35	0.46
36	0.36
37	0.31
38	0.24
39	0.19
40	0.17
41	0.17
42	0.17
43	0.12
44	0.11
45	0.12
46	0.1
47	0.1
48	0.09
49	0.1
50	0.12
51	0.13
52	0.14
53	0.13
54	0.14
55	0.22
56	0.24
57	0.27
58	0.27
59	0.29
60	0.33
61	0.35
62	0.38
63	0.34
64	0.42
65	0.45
66	0.49
67	0.49
68	0.46
69	0.45
70	0.4
71	0.37
72	0.35
73	0.32
74	0.3
75	0.31
76	0.32
77	0.36
78	0.35
79	0.34
80	0.28
81	0.24
82	0.21
83	0.22
84	0.24
85	0.2
86	0.22
87	0.25
88	0.25
89	0.31
90	0.32
91	0.29
92	0.33
93	0.35
94	0.35
95	0.35
96	0.39
97	0.33
98	0.36
99	0.35
100	0.27
101	0.24
102	0.23
103	0.22
104	0.16
105	0.16
106	0.11
107	0.1
108	0.11
109	0.12
110	0.11
111	0.09
112	0.09
113	0.09
114	0.08
115	0.08
116	0.08
117	0.06
118	0.06
119	0.06
120	0.07
121	0.07
122	0.09
123	0.1
124	0.12
125	0.17
126	0.18
127	0.22
128	0.25
129	0.32
130	0.35
131	0.36
132	0.37
133	0.36
134	0.36
135	0.32
136	0.29
137	0.23
138	0.19
139	0.18
140	0.17
141	0.16
142	0.14
143	0.16
144	0.16
145	0.15
146	0.15
147	0.16
148	0.14
149	0.12
150	0.12
151	0.1
152	0.08
153	0.08
154	0.08
155	0.06
156	0.07
157	0.06
158	0.06
159	0.07
160	0.07
161	0.08
162	0.09
163	0.1
164	0.1
165	0.11
166	0.14
167	0.17
168	0.21
169	0.22
170	0.24
171	0.23
172	0.27
173	0.32
174	0.37
175	0.42
176	0.43
177	0.49
178	0.49
179	0.5
180	0.5
181	0.45
182	0.39
183	0.33
184	0.33
185	0.27
186	0.26
187	0.24
188	0.24
189	0.3
190	0.3
191	0.3
192	0.29
193	0.34
194	0.41
195	0.46
196	0.5
197	0.51
198	0.53
199	0.54
200	0.51
201	0.46
202	0.39
203	0.34
204	0.28
205	0.21
206	0.17
207	0.14
208	0.13
209	0.12
210	0.11
211	0.1
212	0.09
213	0.08
214	0.07
215	0.07
216	0.07
217	0.07
218	0.06
219	0.07
220	0.06
221	0.08
222	0.1
223	0.11
224	0.12
225	0.19
226	0.2
227	0.21
228	0.22
229	0.28
230	0.3
231	0.3
232	0.37
233	0.32
234	0.34
235	0.33
236	0.33
237	0.27
238	0.27
239	0.29
240	0.23
241	0.23
242	0.22
243	0.25
244	0.29
245	0.31
246	0.28
247	0.28
248	0.27
249	0.29
250	0.31
251	0.26
252	0.22
253	0.19
254	0.19
255	0.16
256	0.14
257	0.08
258	0.04
259	0.04
260	0.03
261	0.03
262	0.03
263	0.02
264	0.02
265	0.02
266	0.02
267	0.03
268	0.04
269	0.03
270	0.04
271	0.04
272	0.05
273	0.07
274	0.08
275	0.12
276	0.16
277	0.19
278	0.23
279	0.25
280	0.27
281	0.27
282	0.32
283	0.31
284	0.3
285	0.29
286	0.27
287	0.24
288	0.23
289	0.21
290	0.15
291	0.12
292	0.08
293	0.07
294	0.04
295	0.04
296	0.04
297	0.04
298	0.04
299	0.04
300	0.04
301	0.04
302	0.04
303	0.05
304	0.05
305	0.05
306	0.05
307	0.05
308	0.09
309	0.1
310	0.1
311	0.1
312	0.12
313	0.15
314	0.15
315	0.16
316	0.14
317	0.14
318	0.22
319	0.24
320	0.23
321	0.24
322	0.29
323	0.32
324	0.39
325	0.46
326	0.43
327	0.5
328	0.52
329	0.51
330	0.52
331	0.5
332	0.46
333	0.42
334	0.39
335	0.31
336	0.31
337	0.32
338	0.29
339	0.3
340	0.3
341	0.32
342	0.38
343	0.45
344	0.44
345	0.46
346	0.47
347	0.48
348	0.54
349	0.54
350	0.53
351	0.5
352	0.47
353	0.42
354	0.39
355	0.35
356	0.27
357	0.22
358	0.14
359	0.1
360	0.1
361	0.1
362	0.11
363	0.11
364	0.11
365	0.16
366	0.24
367	0.29
368	0.31
369	0.38
370	0.4
371	0.42
372	0.42
373	0.38
374	0.31
375	0.28
376	0.24
377	0.17
378	0.14
379	0.12
380	0.09
381	0.08
382	0.05
383	0.04
384	0.03
385	0.02
386	0.02
387	0.02
388	0.03
389	0.03
390	0.03
391	0.03
392	0.03
393	0.03
394	0.03
395	0.03
396	0.03
397	0.02
398	0.03
399	0.05
400	0.06
401	0.06
402	0.06
403	0.08
404	0.08
405	0.09
406	0.09
407	0.08
408	0.08
409	0.08
410	0.09
411	0.08
412	0.09
413	0.08
414	0.09
415	0.09
416	0.1
417	0.1
418	0.09
419	0.15
420	0.17
421	0.19
422	0.18
423	0.18
424	0.17
425	0.17
426	0.18
427	0.13
428	0.13
429	0.11
430	0.11
431	0.11
432	0.12
433	0.11
434	0.1
435	0.08
436	0.08
437	0.08
438	0.07
439	0.09
440	0.11
441	0.12
442	0.13
443	0.16
444	0.16
445	0.18
446	0.2
447	0.22
448	0.23
449	0.23
450	0.22
451	0.18
452	0.18
453	0.15
454	0.15
455	0.12
456	0.1
457	0.13
458	0.15
459	0.17
460	0.2
461	0.29
462	0.34
463	0.4
464	0.44
465	0.48
466	0.51
467	0.53
468	0.53
469	0.48
470	0.44
471	0.37
472	0.32
473	0.24
474	0.19
475	0.15
476	0.11
477	0.07
478	0.05
479	0.04
480	0.05
481	0.07
482	0.08
483	0.09
484	0.09
485	0.09
486	0.09
487	0.1
488	0.08
489	0.07
490	0.05
491	0.05
492	0.05
493	0.05
494	0.04
495	0.04
496	0.04
497	0.04
498	0.03
499	0.02
500	0.02
501	0.03
502	0.03
503	0.04
504	0.04
505	0.04
506	0.04
507	0.04
508	0.04
509	0.04
510	0.04
511	0.04
512	0.05
513	0.06
514	0.07
515	0.08
516	0.09
517	0.09
518	0.09
519	0.09
520	0.09
521	0.09
522	0.15
523	0.15
524	0.21
525	0.23
526	0.23
527	0.23
528	0.24
529	0.3
530	0.29
531	0.35
532	0.37
533	0.43
534	0.46
535	0.47
536	0.48
537	0.46
538	0.46
539	0.42
540	0.4
541	0.33
542	0.3
543	0.28
544	0.26
545	0.21
546	0.15
547	0.12
548	0.07
549	0.06
550	0.07
551	0.06
552	0.06
553	0.06
554	0.06
555	0.08
556	0.07
557	0.09
558	0.09
559	0.09
560	0.12
561	0.13
562	0.14
563	0.13
564	0.13
565	0.11
566	0.11
567	0.11
568	0.09
569	0.08
570	0.07
571	0.06
572	0.06
573	0.05
574	0.05
575	0.05
576	0.04
577	0.03
578	0.03
579	0.02
580	0.02
581	0.03
582	0.03
583	0.04
584	0.04
585	0.05
586	0.07
587	0.08
588	0.15
589	0.21
590	0.28
591	0.32
592	0.4
593	0.48
594	0.56
595	0.64
596	0.61
597	0.62
598	0.6
599	0.6
600	0.56
601	0.52
602	0.5
603	0.46
604	0.44
605	0.37
606	0.32
607	0.32
608	0.31
609	0.32
610	0.26
611	0.23
612	0.23
613	0.24
614	0.23
615	0.23
616	0.19
617	0.15
618	0.14
619	0.13
620	0.13
621	0.11
622	0.11
623	0.09
624	0.08
625	0.07
626	0.05
627	0.04
628	0.03
629	0.04
630	0.04
631	0.04
632	0.04
633	0.05
634	0.04
635	0.05
636	0.06
637	0.06
638	0.07
639	0.07
640	0.07
641	0.06
642	0.08
643	0.07
644	0.06
645	0.06
646	0.06
647	0.06
648	0.06
649	0.07
650	0.07
651	0.08
652	0.08
653	0.08
654	0.09
655	0.11
656	0.11
657	0.1
658	0.09
659	0.11
660	0.14
661	0.17
662	0.16
663	0.15
664	0.16
665	0.18
666	0.18
667	0.16
668	0.15
669	0.13
670	0.13
671	0.12
672	0.12
673	0.14
674	0.16
675	0.19
676	0.22
677	0.3
678	0.32
679	0.36
680	0.39
681	0.39
682	0.44
683	0.49
684	0.46
685	0.4
686	0.41
687	0.42
688	0.41
689	0.38
690	0.33
691	0.27
692	0.24
693	0.21
694	0.19
695	0.17
696	0.17
697	0.23
698	0.23
699	0.22
700	0.27
701	0.29
702	0.3
703	0.3
704	0.26
705	0.2
706	0.18
707	0.21
708	0.16
709	0.15
710	0.13
711	0.13
712	0.12
713	0.12
714	0.11
715	0.1
716	0.13
717	0.12
718	0.12
719	0.12
720	0.13
721	0.13
722	0.12
723	0.11
724	0.08
725	0.09
726	0.08
727	0.08
728	0.11
729	0.11
730	0.13
731	0.16
732	0.18
733	0.19
734	0.23
735	0.22
736	0.26
737	0.3
738	0.31
739	0.31
740	0.32
741	0.37
742	0.37
743	0.45
744	0.43
745	0.41
746	0.41
747	0.37
748	0.41
749	0.35
750	0.36
751	0.35
752	0.32
753	0.33
754	0.31
755	0.33
756	0.27
757	0.28
758	0.24
759	0.16
760	0.14
761	0.13
762	0.11
763	0.11
764	0.1
765	0.09
766	0.09
767	0.1
768	0.09
769	0.09
770	0.09
771	0.09
772	0.09
773	0.1
774	0.09
775	0.09
776	0.1
777	0.09
778	0.1
779	0.1
780	0.1
781	0.11
782	0.16
783	0.18
784	0.2
785	0.2
786	0.25
787	0.27
788	0.28
789	0.25
790	0.22
791	0.19
792	0.18
793	0.19
794	0.17
795	0.22
796	0.26
797	0.29
798	0.32
799	0.34
800	0.34
801	0.33
802	0.33
803	0.33
804	0.39
805	0.44
806	0.51
807	0.58
808	0.69
809	0.77
810	0.81
811	0.83
812	0.84
813	0.86
814	0.87
815	0.86
816	0.86
817	0.86
818	0.85
819	0.78
820	0.7
821	0.6
822	0.5
823	0.43
824	0.32
825	0.24
826	0.19
827	0.16
828	0.14
829	0.17
830	0.17
831	0.17
832	0.17
833	0.17
834	0.14
835	0.16
836	0.22
837	0.21
838	0.24
839	0.31
840	0.3
841	0.36
842	0.36
843	0.35
844	0.39
845	0.44
846	0.46
847	0.49
848	0.51
849	0.46
850	0.47
851	0.47
852	0.4
853	0.33
854	0.25
855	0.17
856	0.17
857	0.16
858	0.15
859	0.13
860	0.11
861	0.09
862	0.1
863	0.1
864	0.1
865	0.13
866	0.13
867	0.13
868	0.15
869	0.15
870	0.14
871	0.13
872	0.12
873	0.11
874	0.15
875	0.16
876	0.15
877	0.15
878	0.19
879	0.24
880	0.32
881	0.33
882	0.32

A0A5C2SHA8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer