Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C2S3H1

Protein Details
Accession A0A5C2S3H1    Localization Confidence Low Confidence Score 9.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
51-80GDVERGEGKKDKKKSKKRKTVKDDDGPIIEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
55-71RGEGKKDKKKSKKRKTV
Subcellular Location(s) cyto 11.5, cyto_nucl 9.5, nucl 6.5, mito 3, extr 2, plas 1, pero 1, E.R. 1, vacu 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
Pfam View protein in Pfam  
PF13432  TPR_16  
PF13431  TPR_17  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
Amino Acid Sequences MSSSTSSQGVADRVQNFVSEHKHAVLLGTAAALVAIGGVAYYASSSRGPGGDVERGEGKKDKKKSKKRKTVKDDDGPIIEERKPKPAAVEEEDREYSAEEIAAMSHEERTKVAASLKAKGNSAYQARKFATAIDYYTRAIAVTPKPEPVFFSNRAACYVNLNPPQHDKVVEDCDAALALDKKYLKALNRRATALEALERYEEALRDFTAAAILDQFQNMSSAEAVERVLKKLATKKATDILSTRERRLPSHMFTSAYFGAFRQRPLPELPENPTTGDNTLILALEALGASDYAHAFTLVNEAIEQGISWDKGQAEALNLRGTFKFLMTDVDGAKEDFLKSLELDPSLTQTWVKIASVWMEQSDPTKAFECFEEAIKHNPNDPDIYYHRGQVLFIMNEFDQAAENYTKSTELDDKFVFSHIQLAVAQYKSGNLANSMATFRRTLKSFPDRSEPQNYYGELLLDQQRYPDAIEKFDRAIEIERAKTPPMNVLPMVNKGLAMFQWQQDVATAEKCCQEALEIDPECEAAVATLAQLSLQQGKIDVAMRMFDKQSQLARSEPELVNALTYQYATEAQVQFMHTYPDMAAQLGQMARMMA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.25
3 0.24
4 0.27
5 0.29
6 0.27
7 0.28
8 0.28
9 0.28
10 0.26
11 0.26
12 0.22
13 0.17
14 0.13
15 0.1
16 0.09
17 0.07
18 0.07
19 0.06
20 0.04
21 0.03
22 0.02
23 0.02
24 0.02
25 0.02
26 0.02
27 0.02
28 0.03
29 0.03
30 0.06
31 0.06
32 0.08
33 0.1
34 0.1
35 0.11
36 0.14
37 0.18
38 0.22
39 0.22
40 0.24
41 0.29
42 0.29
43 0.32
44 0.36
45 0.4
46 0.43
47 0.53
48 0.61
49 0.66
50 0.76
51 0.84
52 0.89
53 0.92
54 0.94
55 0.96
56 0.96
57 0.96
58 0.95
59 0.93
60 0.89
61 0.83
62 0.75
63 0.66
64 0.57
65 0.49
66 0.42
67 0.39
68 0.33
69 0.36
70 0.35
71 0.33
72 0.35
73 0.39
74 0.43
75 0.42
76 0.49
77 0.43
78 0.47
79 0.47
80 0.43
81 0.36
82 0.3
83 0.24
84 0.16
85 0.13
86 0.07
87 0.07
88 0.07
89 0.07
90 0.07
91 0.07
92 0.1
93 0.12
94 0.12
95 0.13
96 0.15
97 0.16
98 0.17
99 0.2
100 0.22
101 0.23
102 0.29
103 0.36
104 0.36
105 0.36
106 0.35
107 0.34
108 0.35
109 0.4
110 0.42
111 0.38
112 0.42
113 0.43
114 0.43
115 0.41
116 0.36
117 0.32
118 0.25
119 0.25
120 0.21
121 0.22
122 0.2
123 0.2
124 0.18
125 0.15
126 0.13
127 0.17
128 0.17
129 0.2
130 0.21
131 0.25
132 0.26
133 0.26
134 0.3
135 0.29
136 0.33
137 0.31
138 0.36
139 0.36
140 0.36
141 0.38
142 0.36
143 0.31
144 0.29
145 0.3
146 0.31
147 0.35
148 0.35
149 0.35
150 0.38
151 0.4
152 0.36
153 0.33
154 0.27
155 0.24
156 0.28
157 0.27
158 0.22
159 0.19
160 0.18
161 0.17
162 0.15
163 0.12
164 0.09
165 0.08
166 0.12
167 0.12
168 0.12
169 0.15
170 0.19
171 0.23
172 0.31
173 0.4
174 0.45
175 0.48
176 0.49
177 0.47
178 0.46
179 0.42
180 0.33
181 0.27
182 0.19
183 0.16
184 0.15
185 0.14
186 0.13
187 0.13
188 0.11
189 0.09
190 0.09
191 0.09
192 0.09
193 0.1
194 0.08
195 0.08
196 0.08
197 0.07
198 0.06
199 0.07
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.05
204 0.06
205 0.06
206 0.06
207 0.05
208 0.06
209 0.06
210 0.06
211 0.07
212 0.1
213 0.11
214 0.11
215 0.13
216 0.13
217 0.16
218 0.23
219 0.3
220 0.3
221 0.31
222 0.32
223 0.37
224 0.38
225 0.36
226 0.3
227 0.28
228 0.33
229 0.35
230 0.35
231 0.33
232 0.33
233 0.33
234 0.39
235 0.38
236 0.31
237 0.34
238 0.33
239 0.3
240 0.29
241 0.32
242 0.26
243 0.22
244 0.18
245 0.13
246 0.18
247 0.18
248 0.18
249 0.18
250 0.17
251 0.19
252 0.21
253 0.26
254 0.23
255 0.25
256 0.28
257 0.27
258 0.27
259 0.26
260 0.25
261 0.21
262 0.18
263 0.15
264 0.11
265 0.08
266 0.08
267 0.07
268 0.06
269 0.05
270 0.04
271 0.03
272 0.03
273 0.03
274 0.02
275 0.02
276 0.02
277 0.03
278 0.03
279 0.03
280 0.04
281 0.04
282 0.04
283 0.04
284 0.06
285 0.06
286 0.06
287 0.05
288 0.05
289 0.05
290 0.05
291 0.05
292 0.03
293 0.04
294 0.05
295 0.05
296 0.06
297 0.06
298 0.07
299 0.07
300 0.07
301 0.08
302 0.09
303 0.1
304 0.11
305 0.11
306 0.12
307 0.11
308 0.12
309 0.11
310 0.1
311 0.09
312 0.07
313 0.09
314 0.09
315 0.1
316 0.09
317 0.1
318 0.11
319 0.1
320 0.1
321 0.09
322 0.08
323 0.07
324 0.07
325 0.07
326 0.07
327 0.09
328 0.1
329 0.09
330 0.1
331 0.09
332 0.12
333 0.12
334 0.11
335 0.09
336 0.08
337 0.09
338 0.09
339 0.09
340 0.07
341 0.07
342 0.09
343 0.1
344 0.1
345 0.1
346 0.09
347 0.1
348 0.11
349 0.12
350 0.11
351 0.12
352 0.13
353 0.13
354 0.13
355 0.13
356 0.15
357 0.13
358 0.15
359 0.17
360 0.17
361 0.22
362 0.26
363 0.26
364 0.27
365 0.27
366 0.26
367 0.24
368 0.23
369 0.24
370 0.22
371 0.27
372 0.24
373 0.24
374 0.25
375 0.23
376 0.23
377 0.2
378 0.21
379 0.16
380 0.15
381 0.16
382 0.14
383 0.14
384 0.14
385 0.12
386 0.08
387 0.08
388 0.1
389 0.09
390 0.09
391 0.09
392 0.09
393 0.1
394 0.09
395 0.12
396 0.16
397 0.16
398 0.2
399 0.2
400 0.21
401 0.21
402 0.22
403 0.2
404 0.13
405 0.17
406 0.13
407 0.14
408 0.13
409 0.14
410 0.17
411 0.16
412 0.17
413 0.12
414 0.12
415 0.13
416 0.14
417 0.12
418 0.1
419 0.11
420 0.11
421 0.13
422 0.14
423 0.14
424 0.14
425 0.15
426 0.17
427 0.2
428 0.21
429 0.21
430 0.29
431 0.38
432 0.42
433 0.44
434 0.5
435 0.5
436 0.54
437 0.61
438 0.54
439 0.48
440 0.47
441 0.44
442 0.36
443 0.32
444 0.28
445 0.19
446 0.2
447 0.21
448 0.19
449 0.18
450 0.17
451 0.17
452 0.17
453 0.18
454 0.21
455 0.17
456 0.2
457 0.24
458 0.25
459 0.26
460 0.26
461 0.25
462 0.19
463 0.22
464 0.23
465 0.25
466 0.25
467 0.27
468 0.28
469 0.3
470 0.3
471 0.28
472 0.29
473 0.27
474 0.29
475 0.26
476 0.29
477 0.3
478 0.31
479 0.33
480 0.25
481 0.22
482 0.18
483 0.19
484 0.14
485 0.17
486 0.16
487 0.15
488 0.18
489 0.18
490 0.18
491 0.18
492 0.2
493 0.16
494 0.18
495 0.18
496 0.17
497 0.19
498 0.19
499 0.18
500 0.16
501 0.16
502 0.14
503 0.17
504 0.23
505 0.21
506 0.21
507 0.21
508 0.21
509 0.2
510 0.17
511 0.14
512 0.05
513 0.05
514 0.05
515 0.05
516 0.05
517 0.05
518 0.05
519 0.06
520 0.08
521 0.11
522 0.12
523 0.12
524 0.13
525 0.13
526 0.16
527 0.17
528 0.17
529 0.14
530 0.16
531 0.17
532 0.2
533 0.2
534 0.21
535 0.22
536 0.25
537 0.3
538 0.31
539 0.33
540 0.32
541 0.35
542 0.35
543 0.39
544 0.34
545 0.31
546 0.3
547 0.28
548 0.26
549 0.23
550 0.21
551 0.14
552 0.14
553 0.11
554 0.1
555 0.11
556 0.11
557 0.18
558 0.18
559 0.19
560 0.21
561 0.23
562 0.23
563 0.22
564 0.24
565 0.17
566 0.18
567 0.17
568 0.19
569 0.18
570 0.17
571 0.17
572 0.13
573 0.17
574 0.16
575 0.16