FuNGI

A0A5C2T1A1

Protein Details

Accession

A0A5C2T1A1

Localization Confidence

Low

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
3-28	ANIDTRTSPPPRKRARVDAPDTQSKQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

plas 11, mito 4, cyto 4, cyto_mito 4, nucl 3, cyto_pero 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR024977 Apc4-like_WD40_dom IPR011047 Quinoprotein_ADH-like_supfam IPR007319 SSU_processome_Utp21 IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR001680 WD40_repeat
Gene Ontology	GO:0032040 C:small-subunit processome GO:0006364 P:rRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF12894 ANAPC4_WD40 PF04192 Utp21 PF00400 WD40
PROSITE	View protein in PROSITE PS50082 WD_REPEATS_2 PS50294 WD_REPEATS_REGION

Amino Acid Sequences

MGANIDTRTSPPPRKRARVDAPDTQSKQEPRLFAPFRALGLITNGVPFVLQPRSHKGATDGPRIHLVTCLGKAWAMWEGGKMGLLFVGPDAPMPIACIAMDGNAVWVSSGPYLIKYLRGKEVNRLVNPLENSLTHILVFGPQLLALTEDGSRMLVWDIANGELQSTIQFEPGFTAIMLHHPATYVNKVLVASSQGSMQLWNIRTQTLIHAFPAASLLTSPSNTATTAITALARSPAIDVVGIGFSSGEISVYDIRADERLMRMVMQDGGIRAMSFRSDGHPILATASSTGHIALWDLNSGGRLLHIVRGAHDGAVTALEWVPGQPVLISSGEDNSVKQWLFDSPTEAPRLLKFRSGHHAPPHLIRYYGEDGKQLLTASRDRSLRCTSVVRDSRSFELSQGSLVKKATSLSIPIASLKFPPITALSYSTTRSKDWDDILTAHTDEAVARSWTMKDKRVGKHVFKVSGEKKGATVGSVKAVCVSACGNFGLTASSTGGINMYNMQSGILRRTYSVGPCPSNVVSRFRPTGNRKKEERCITGLASDALDRIVVASTLDGTINFFDFHTAALEHTLVLPSAAVSITLNRDSGLLAVICDDLIVRIVDIETRRVVRELDGFRGRVLDVTFSPDSRWLVTTSLDSIIRTFDVPTGRLIDLFRTSSVAISISFSPTNDFLATSHVDSVGVFLWANRAQYTEVPLRSIAEDDVVDVSMPSMQGVAEDEALDALSALTVQDKPADVFSTPPQLDGELVTFTLLPRSRWQTLLNLEVIQQRNKPKEPAKQPEKAPFFLPTLPGVEPRFAVDAKKSDEAQKSTRRLQHAAGSTESMFYKKLVDAHDSNSVDYEDFFNYAKALSPAAMDLELRSLVSLDALRMFLRALIGRLHSHRDFEAVQTFMNVFLRMHGDVLACNAELQREVETLAEAQHKESERLLELLASSIGTLGFVRDTM

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.74
2	0.79
3	0.83
4	0.86
5	0.86
6	0.84
7	0.84
8	0.81
9	0.82
10	0.76
11	0.7
12	0.67
13	0.59
14	0.59
15	0.54
16	0.5
17	0.44
18	0.52
19	0.51
20	0.45
21	0.49
22	0.44
23	0.4
24	0.39
25	0.34
26	0.24
27	0.24
28	0.25
29	0.18
30	0.16
31	0.15
32	0.13
33	0.12
34	0.11
35	0.12
36	0.16
37	0.19
38	0.23
39	0.31
40	0.37
41	0.38
42	0.39
43	0.39
44	0.42
45	0.47
46	0.53
47	0.48
48	0.45
49	0.5
50	0.5
51	0.46
52	0.39
53	0.34
54	0.28
55	0.27
56	0.26
57	0.2
58	0.19
59	0.18
60	0.18
61	0.18
62	0.15
63	0.14
64	0.14
65	0.14
66	0.14
67	0.16
68	0.14
69	0.1
70	0.09
71	0.08
72	0.07
73	0.06
74	0.08
75	0.06
76	0.06
77	0.07
78	0.07
79	0.07
80	0.09
81	0.09
82	0.08
83	0.08
84	0.08
85	0.07
86	0.07
87	0.08
88	0.06
89	0.07
90	0.07
91	0.07
92	0.06
93	0.07
94	0.08
95	0.08
96	0.09
97	0.08
98	0.09
99	0.12
100	0.13
101	0.2
102	0.23
103	0.27
104	0.34
105	0.4
106	0.41
107	0.48
108	0.56
109	0.57
110	0.55
111	0.55
112	0.48
113	0.48
114	0.47
115	0.41
116	0.34
117	0.25
118	0.28
119	0.25
120	0.24
121	0.18
122	0.17
123	0.14
124	0.13
125	0.14
126	0.1
127	0.08
128	0.08
129	0.08
130	0.08
131	0.09
132	0.07
133	0.08
134	0.07
135	0.07
136	0.08
137	0.08
138	0.08
139	0.07
140	0.08
141	0.08
142	0.08
143	0.1
144	0.1
145	0.11
146	0.12
147	0.11
148	0.11
149	0.09
150	0.09
151	0.08
152	0.1
153	0.09
154	0.1
155	0.1
156	0.1
157	0.12
158	0.12
159	0.12
160	0.1
161	0.1
162	0.09
163	0.12
164	0.15
165	0.13
166	0.12
167	0.12
168	0.14
169	0.16
170	0.18
171	0.17
172	0.15
173	0.16
174	0.16
175	0.16
176	0.15
177	0.14
178	0.13
179	0.12
180	0.12
181	0.12
182	0.12
183	0.12
184	0.13
185	0.16
186	0.16
187	0.19
188	0.19
189	0.19
190	0.19
191	0.2
192	0.24
193	0.23
194	0.23
195	0.19
196	0.2
197	0.2
198	0.19
199	0.2
200	0.13
201	0.09
202	0.08
203	0.09
204	0.09
205	0.09
206	0.1
207	0.1
208	0.11
209	0.11
210	0.12
211	0.1
212	0.1
213	0.1
214	0.1
215	0.09
216	0.08
217	0.09
218	0.09
219	0.09
220	0.08
221	0.08
222	0.08
223	0.07
224	0.07
225	0.07
226	0.06
227	0.07
228	0.06
229	0.05
230	0.05
231	0.04
232	0.05
233	0.05
234	0.04
235	0.04
236	0.06
237	0.07
238	0.08
239	0.08
240	0.08
241	0.08
242	0.09
243	0.1
244	0.1
245	0.1
246	0.12
247	0.12
248	0.12
249	0.12
250	0.13
251	0.13
252	0.12
253	0.11
254	0.1
255	0.1
256	0.1
257	0.09
258	0.08
259	0.07
260	0.07
261	0.07
262	0.07
263	0.09
264	0.13
265	0.13
266	0.15
267	0.15
268	0.15
269	0.15
270	0.15
271	0.12
272	0.09
273	0.09
274	0.08
275	0.08
276	0.08
277	0.06
278	0.05
279	0.06
280	0.06
281	0.06
282	0.06
283	0.06
284	0.06
285	0.06
286	0.07
287	0.06
288	0.05
289	0.06
290	0.06
291	0.08
292	0.11
293	0.1
294	0.12
295	0.15
296	0.15
297	0.14
298	0.14
299	0.11
300	0.09
301	0.09
302	0.08
303	0.05
304	0.05
305	0.05
306	0.05
307	0.05
308	0.06
309	0.05
310	0.05
311	0.04
312	0.05
313	0.06
314	0.07
315	0.07
316	0.07
317	0.08
318	0.09
319	0.1
320	0.09
321	0.08
322	0.11
323	0.11
324	0.1
325	0.1
326	0.11
327	0.14
328	0.14
329	0.18
330	0.18
331	0.21
332	0.23
333	0.22
334	0.21
335	0.21
336	0.24
337	0.21
338	0.24
339	0.23
340	0.25
341	0.33
342	0.36
343	0.39
344	0.4
345	0.45
346	0.4
347	0.43
348	0.43
349	0.36
350	0.32
351	0.27
352	0.27
353	0.27
354	0.28
355	0.24
356	0.21
357	0.21
358	0.21
359	0.22
360	0.16
361	0.12
362	0.12
363	0.14
364	0.15
365	0.19
366	0.21
367	0.21
368	0.26
369	0.29
370	0.27
371	0.27
372	0.28
373	0.26
374	0.33
375	0.38
376	0.37
377	0.36
378	0.37
379	0.37
380	0.36
381	0.34
382	0.25
383	0.21
384	0.17
385	0.16
386	0.17
387	0.16
388	0.15
389	0.15
390	0.14
391	0.12
392	0.13
393	0.12
394	0.09
395	0.1
396	0.1
397	0.11
398	0.11
399	0.12
400	0.12
401	0.11
402	0.11
403	0.11
404	0.1
405	0.08
406	0.09
407	0.09
408	0.1
409	0.1
410	0.12
411	0.13
412	0.14
413	0.16
414	0.19
415	0.19
416	0.18
417	0.19
418	0.19
419	0.2
420	0.2
421	0.2
422	0.18
423	0.17
424	0.18
425	0.17
426	0.15
427	0.12
428	0.1
429	0.08
430	0.07
431	0.06
432	0.06
433	0.05
434	0.05
435	0.06
436	0.07
437	0.14
438	0.16
439	0.2
440	0.25
441	0.33
442	0.36
443	0.45
444	0.51
445	0.48
446	0.54
447	0.54
448	0.51
449	0.44
450	0.49
451	0.42
452	0.43
453	0.41
454	0.33
455	0.28
456	0.27
457	0.26
458	0.18
459	0.17
460	0.1
461	0.13
462	0.13
463	0.12
464	0.11
465	0.11
466	0.1
467	0.09
468	0.09
469	0.06
470	0.07
471	0.07
472	0.06
473	0.06
474	0.06
475	0.06
476	0.06
477	0.06
478	0.05
479	0.05
480	0.05
481	0.05
482	0.05
483	0.05
484	0.05
485	0.05
486	0.05
487	0.05
488	0.05
489	0.06
490	0.06
491	0.07
492	0.09
493	0.09
494	0.09
495	0.09
496	0.12
497	0.13
498	0.14
499	0.19
500	0.21
501	0.2
502	0.21
503	0.23
504	0.22
505	0.24
506	0.24
507	0.24
508	0.23
509	0.25
510	0.27
511	0.26
512	0.34
513	0.39
514	0.47
515	0.52
516	0.57
517	0.59
518	0.64
519	0.71
520	0.7
521	0.65
522	0.58
523	0.51
524	0.45
525	0.39
526	0.33
527	0.25
528	0.18
529	0.14
530	0.1
531	0.07
532	0.06
533	0.05
534	0.04
535	0.04
536	0.03
537	0.03
538	0.03
539	0.04
540	0.04
541	0.04
542	0.04
543	0.05
544	0.05
545	0.05
546	0.06
547	0.05
548	0.06
549	0.06
550	0.06
551	0.07
552	0.06
553	0.06
554	0.07
555	0.07
556	0.06
557	0.06
558	0.06
559	0.05
560	0.05
561	0.04
562	0.03
563	0.04
564	0.04
565	0.04
566	0.04
567	0.05
568	0.07
569	0.08
570	0.08
571	0.08
572	0.08
573	0.08
574	0.08
575	0.08
576	0.06
577	0.05
578	0.06
579	0.05
580	0.05
581	0.05
582	0.05
583	0.03
584	0.04
585	0.04
586	0.03
587	0.04
588	0.04
589	0.07
590	0.07
591	0.09
592	0.11
593	0.12
594	0.13
595	0.14
596	0.14
597	0.13
598	0.2
599	0.21
600	0.26
601	0.28
602	0.27
603	0.27
604	0.27
605	0.25
606	0.2
607	0.18
608	0.13
609	0.1
610	0.16
611	0.16
612	0.15
613	0.16
614	0.17
615	0.17
616	0.16
617	0.17
618	0.12
619	0.13
620	0.13
621	0.14
622	0.13
623	0.14
624	0.14
625	0.13
626	0.12
627	0.12
628	0.11
629	0.11
630	0.1
631	0.1
632	0.12
633	0.12
634	0.13
635	0.16
636	0.15
637	0.16
638	0.16
639	0.15
640	0.16
641	0.16
642	0.15
643	0.13
644	0.13
645	0.12
646	0.12
647	0.11
648	0.08
649	0.09
650	0.1
651	0.11
652	0.11
653	0.11
654	0.13
655	0.12
656	0.14
657	0.12
658	0.12
659	0.09
660	0.12
661	0.14
662	0.13
663	0.13
664	0.11
665	0.11
666	0.1
667	0.11
668	0.08
669	0.07
670	0.06
671	0.05
672	0.09
673	0.11
674	0.12
675	0.11
676	0.12
677	0.13
678	0.14
679	0.19
680	0.22
681	0.21
682	0.21
683	0.21
684	0.21
685	0.2
686	0.2
687	0.15
688	0.11
689	0.1
690	0.09
691	0.1
692	0.08
693	0.08
694	0.07
695	0.06
696	0.06
697	0.06
698	0.05
699	0.04
700	0.04
701	0.04
702	0.06
703	0.07
704	0.07
705	0.07
706	0.07
707	0.07
708	0.07
709	0.06
710	0.05
711	0.04
712	0.03
713	0.03
714	0.03
715	0.05
716	0.05
717	0.06
718	0.07
719	0.08
720	0.09
721	0.1
722	0.12
723	0.11
724	0.13
725	0.15
726	0.23
727	0.22
728	0.22
729	0.21
730	0.2
731	0.2
732	0.19
733	0.17
734	0.09
735	0.09
736	0.08
737	0.08
738	0.08
739	0.14
740	0.14
741	0.15
742	0.2
743	0.27
744	0.29
745	0.31
746	0.33
747	0.34
748	0.37
749	0.39
750	0.35
751	0.29
752	0.29
753	0.33
754	0.34
755	0.31
756	0.32
757	0.36
758	0.42
759	0.45
760	0.51
761	0.52
762	0.59
763	0.66
764	0.71
765	0.72
766	0.73
767	0.76
768	0.78
769	0.75
770	0.67
771	0.59
772	0.51
773	0.46
774	0.4
775	0.35
776	0.27
777	0.24
778	0.23
779	0.26
780	0.24
781	0.22
782	0.2
783	0.2
784	0.21
785	0.18
786	0.2
787	0.2
788	0.24
789	0.27
790	0.31
791	0.3
792	0.35
793	0.42
794	0.45
795	0.49
796	0.53
797	0.55
798	0.59
799	0.64
800	0.62
801	0.58
802	0.57
803	0.57
804	0.54
805	0.51
806	0.44
807	0.4
808	0.35
809	0.34
810	0.31
811	0.24
812	0.18
813	0.15
814	0.15
815	0.14
816	0.18
817	0.19
818	0.25
819	0.26
820	0.3
821	0.38
822	0.36
823	0.35
824	0.32
825	0.3
826	0.23
827	0.22
828	0.2
829	0.12
830	0.13
831	0.13
832	0.12
833	0.12
834	0.12
835	0.13
836	0.11
837	0.11
838	0.1
839	0.1
840	0.1
841	0.11
842	0.12
843	0.1
844	0.09
845	0.11
846	0.1
847	0.1
848	0.09
849	0.08
850	0.07
851	0.09
852	0.09
853	0.09
854	0.1
855	0.11
856	0.11
857	0.11
858	0.11
859	0.1
860	0.12
861	0.13
862	0.12
863	0.15
864	0.18
865	0.23
866	0.26
867	0.33
868	0.31
869	0.33
870	0.32
871	0.33
872	0.31
873	0.3
874	0.32
875	0.25
876	0.24
877	0.23
878	0.23
879	0.2
880	0.21
881	0.18
882	0.12
883	0.14
884	0.17
885	0.16
886	0.16
887	0.16
888	0.15
889	0.14
890	0.17
891	0.17
892	0.13
893	0.14
894	0.13
895	0.13
896	0.13
897	0.14
898	0.14
899	0.13
900	0.13
901	0.12
902	0.13
903	0.13
904	0.15
905	0.2
906	0.18
907	0.19
908	0.25
909	0.27
910	0.28
911	0.29
912	0.3
913	0.26
914	0.27
915	0.26
916	0.21
917	0.19
918	0.18
919	0.16
920	0.12
921	0.09
922	0.08
923	0.08
924	0.07
925	0.07
926	0.06

A0A5C2T1A1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer