Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C2SKD1

Protein Details
Accession A0A5C2SKD1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
35-55KADVGRKYARRDKRPLDPPPVBasic
244-269IRSADHKIGKGRKKRKTSHSRSPADGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
250-262KIGKGRKKRKTSH
Subcellular Location(s) nucl 11.5, cyto_nucl 9, cyto 5.5, mito 4, cysk 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021740  Velvet  
IPR037525  Velvet_dom  
IPR038491  Velvet_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF11754  Velvet  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51821  VELVET  
Amino Acid Sequences MPISVGSSTIGGPIYFTEGPFAGKTIRTSATELQKADVGRKYARRDKRPLDPPPVVQVRFFEVLNAGTSRQCEKEITVYDDRLTLGFLCQAELFPVGVDAGPDGSTRDTDPGAATQPSNNAKIIAYYGNYPIKESSNSTAILAGAHVATPITTSHNNGRVLLFVFSASPSDLAVQQEGTFTLRYCIFDIFSKTTVDGGLSHRAPVLASCFGGVFKVWSTKTFPGLPSSTELTKRLSLLGAPVNIRSADHKIGKGRKKRKTSHSRSPADGGSSFQRQPGGSEMVCSPEERIYKLGIDPGWLPMGHAPTRSGALWEWPSGLNVEQVQGSRGL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.14
3 0.14
4 0.15
5 0.15
6 0.17
7 0.17
8 0.18
9 0.14
10 0.16
11 0.18
12 0.2
13 0.23
14 0.23
15 0.28
16 0.33
17 0.4
18 0.43
19 0.42
20 0.39
21 0.39
22 0.38
23 0.39
24 0.36
25 0.31
26 0.32
27 0.39
28 0.46
29 0.53
30 0.62
31 0.66
32 0.72
33 0.74
34 0.78
35 0.81
36 0.8
37 0.8
38 0.75
39 0.69
40 0.68
41 0.69
42 0.59
43 0.5
44 0.43
45 0.39
46 0.35
47 0.32
48 0.23
49 0.17
50 0.16
51 0.18
52 0.17
53 0.13
54 0.12
55 0.14
56 0.17
57 0.17
58 0.18
59 0.17
60 0.17
61 0.23
62 0.26
63 0.31
64 0.32
65 0.31
66 0.3
67 0.3
68 0.29
69 0.22
70 0.19
71 0.12
72 0.09
73 0.1
74 0.1
75 0.1
76 0.09
77 0.09
78 0.1
79 0.1
80 0.09
81 0.06
82 0.06
83 0.06
84 0.06
85 0.05
86 0.05
87 0.04
88 0.05
89 0.05
90 0.06
91 0.06
92 0.07
93 0.08
94 0.09
95 0.09
96 0.09
97 0.1
98 0.1
99 0.12
100 0.12
101 0.12
102 0.11
103 0.17
104 0.19
105 0.2
106 0.19
107 0.17
108 0.16
109 0.16
110 0.17
111 0.13
112 0.11
113 0.1
114 0.15
115 0.17
116 0.17
117 0.18
118 0.17
119 0.18
120 0.18
121 0.19
122 0.17
123 0.16
124 0.16
125 0.16
126 0.15
127 0.13
128 0.12
129 0.09
130 0.07
131 0.05
132 0.04
133 0.04
134 0.03
135 0.03
136 0.04
137 0.04
138 0.07
139 0.08
140 0.1
141 0.14
142 0.2
143 0.2
144 0.2
145 0.2
146 0.18
147 0.18
148 0.17
149 0.13
150 0.08
151 0.07
152 0.07
153 0.07
154 0.06
155 0.05
156 0.05
157 0.05
158 0.06
159 0.06
160 0.07
161 0.06
162 0.06
163 0.06
164 0.07
165 0.07
166 0.06
167 0.06
168 0.08
169 0.08
170 0.09
171 0.1
172 0.1
173 0.1
174 0.12
175 0.15
176 0.16
177 0.16
178 0.16
179 0.15
180 0.15
181 0.14
182 0.12
183 0.1
184 0.11
185 0.15
186 0.15
187 0.15
188 0.14
189 0.14
190 0.14
191 0.13
192 0.13
193 0.09
194 0.09
195 0.09
196 0.09
197 0.09
198 0.09
199 0.08
200 0.06
201 0.06
202 0.11
203 0.11
204 0.13
205 0.18
206 0.19
207 0.23
208 0.25
209 0.25
210 0.25
211 0.26
212 0.25
213 0.24
214 0.25
215 0.24
216 0.24
217 0.24
218 0.23
219 0.23
220 0.22
221 0.2
222 0.17
223 0.15
224 0.16
225 0.18
226 0.17
227 0.17
228 0.17
229 0.17
230 0.17
231 0.17
232 0.16
233 0.17
234 0.21
235 0.23
236 0.27
237 0.33
238 0.43
239 0.51
240 0.59
241 0.65
242 0.68
243 0.75
244 0.81
245 0.84
246 0.86
247 0.87
248 0.88
249 0.89
250 0.85
251 0.79
252 0.74
253 0.65
254 0.57
255 0.48
256 0.39
257 0.33
258 0.33
259 0.29
260 0.26
261 0.27
262 0.23
263 0.24
264 0.26
265 0.26
266 0.21
267 0.23
268 0.22
269 0.23
270 0.23
271 0.22
272 0.19
273 0.2
274 0.21
275 0.21
276 0.22
277 0.2
278 0.21
279 0.22
280 0.25
281 0.2
282 0.2
283 0.19
284 0.2
285 0.21
286 0.18
287 0.18
288 0.17
289 0.22
290 0.22
291 0.22
292 0.21
293 0.2
294 0.23
295 0.23
296 0.21
297 0.17
298 0.22
299 0.24
300 0.24
301 0.24
302 0.22
303 0.22
304 0.22
305 0.22
306 0.18
307 0.16
308 0.17
309 0.17
310 0.17