Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C2SGH6

Protein Details
Accession A0A5C2SGH6    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
66-85LTDRKKRQVIRDLRNHRTSTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
193-205KGGKKKGKGGLKK
Subcellular Location(s) mito 12, cyto_nucl 8.5, cyto 8, nucl 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF13384  HTH_23  
Amino Acid Sequences MPPPGFSELSPGRRAAICELHRAGWSYHHIADKTGVSTSTAWYTVQRERNFHTHESLPRSGRPSTLTDRKKRQVIRDLRNHRTSTFKAIADSEGDISEEQVRRIATGAGYHRRVARPIRKRHAWVRENAERDWSKVIWTDETTLELGKRVGHLRVTRKAGEEFLPENIEPTSRSGRPLIRLDLNVTPEQEGSKGGKKKGKGGLKKEQYVSQVLEGPLLEFYTTLNKERGGGMLVVEDGAPAHTAGLSKSARLRLGIHTLTHPPNSPEAVRKAQGMHSPF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.33
3 0.35
4 0.32
5 0.37
6 0.39
7 0.38
8 0.38
9 0.38
10 0.34
11 0.3
12 0.33
13 0.29
14 0.31
15 0.34
16 0.33
17 0.32
18 0.35
19 0.31
20 0.27
21 0.24
22 0.2
23 0.17
24 0.17
25 0.18
26 0.17
27 0.15
28 0.14
29 0.16
30 0.2
31 0.26
32 0.34
33 0.36
34 0.38
35 0.42
36 0.5
37 0.52
38 0.5
39 0.47
40 0.45
41 0.47
42 0.51
43 0.52
44 0.46
45 0.45
46 0.46
47 0.42
48 0.38
49 0.34
50 0.33
51 0.36
52 0.43
53 0.49
54 0.54
55 0.63
56 0.68
57 0.73
58 0.73
59 0.73
60 0.73
61 0.74
62 0.75
63 0.76
64 0.79
65 0.79
66 0.8
67 0.73
68 0.64
69 0.6
70 0.53
71 0.5
72 0.45
73 0.37
74 0.32
75 0.31
76 0.3
77 0.25
78 0.23
79 0.16
80 0.11
81 0.11
82 0.09
83 0.09
84 0.13
85 0.12
86 0.11
87 0.13
88 0.13
89 0.12
90 0.13
91 0.13
92 0.09
93 0.12
94 0.18
95 0.22
96 0.24
97 0.25
98 0.28
99 0.28
100 0.32
101 0.36
102 0.4
103 0.44
104 0.52
105 0.59
106 0.61
107 0.66
108 0.71
109 0.73
110 0.67
111 0.64
112 0.62
113 0.6
114 0.58
115 0.53
116 0.51
117 0.41
118 0.38
119 0.34
120 0.25
121 0.19
122 0.19
123 0.2
124 0.14
125 0.15
126 0.15
127 0.13
128 0.14
129 0.13
130 0.11
131 0.1
132 0.09
133 0.08
134 0.07
135 0.09
136 0.09
137 0.1
138 0.13
139 0.19
140 0.24
141 0.3
142 0.34
143 0.33
144 0.34
145 0.34
146 0.32
147 0.28
148 0.25
149 0.2
150 0.18
151 0.18
152 0.16
153 0.16
154 0.14
155 0.13
156 0.1
157 0.13
158 0.16
159 0.14
160 0.17
161 0.19
162 0.22
163 0.27
164 0.3
165 0.3
166 0.28
167 0.29
168 0.3
169 0.3
170 0.31
171 0.26
172 0.24
173 0.2
174 0.17
175 0.17
176 0.14
177 0.13
178 0.13
179 0.19
180 0.24
181 0.29
182 0.33
183 0.34
184 0.42
185 0.49
186 0.55
187 0.56
188 0.6
189 0.65
190 0.69
191 0.74
192 0.68
193 0.64
194 0.57
195 0.52
196 0.45
197 0.36
198 0.32
199 0.26
200 0.24
201 0.2
202 0.17
203 0.14
204 0.13
205 0.1
206 0.06
207 0.06
208 0.13
209 0.15
210 0.17
211 0.18
212 0.18
213 0.2
214 0.2
215 0.21
216 0.15
217 0.14
218 0.12
219 0.11
220 0.11
221 0.1
222 0.09
223 0.07
224 0.05
225 0.05
226 0.06
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.06
231 0.07
232 0.14
233 0.14
234 0.16
235 0.21
236 0.25
237 0.25
238 0.27
239 0.29
240 0.27
241 0.35
242 0.36
243 0.33
244 0.33
245 0.38
246 0.41
247 0.41
248 0.38
249 0.33
250 0.34
251 0.36
252 0.35
253 0.36
254 0.38
255 0.42
256 0.41
257 0.41
258 0.41
259 0.43