Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C2SFH2

Protein Details
Accession A0A5C2SFH2    Localization Confidence High Confidence Score 22.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
24-44ASPPVSRIRNRPPAAKRPRLSHydrophilic
234-259YSPAGPKFTPQRRRSRPPPKTPGDDLHydrophilic
298-321SPEPSPPKPKPTPQQRGRSRPGPQHydrophilic
394-416ETPSPKFPKPRARYTPRPRTPSDHydrophilic
852-901PTTTEPSPRVHRRGRGREKAKLEPSPSRNRNAERRKRARTTNRLHGPRAGBasic
914-945LSACRASLLAPRRRRQVRKRTRPQSLRSESIEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
30-41RIRNRPPAAKRP
304-342PKPKPTPQQRGRSRPGPQPENRARSHTRSNSKPPNPAPA
438-456PRGVKKQTAKKQTSVKGKE
465-504VPPKKLNGKAKSARPPSPEPPSTPSPPPSKSNKGKGKEKA
860-899RVHRRGRGREKAKLEPSPSRNRNAERRKRARTTNRLHGPR
924-935PRRRRQVRKRTR
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 13, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018465  Scm3/HJURP  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0042393  F:histone binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF10384  Scm3  
Amino Acid Sequences MDAQFARPADKPPLRRPPLITPSASPPVSRIRNRPPAAKRPRLSATPSASSSAQRSSSVANDLDAERTRLESLDRLFKTWDQLAERYHKPLDEDDIVDLRDLAILKDRGVTRGTAGTYAIGSMIVPTDEASSQAGDDDNTGEEEEEESADELDLISDPPGPSVPEEYKKWYVPPADQTNPEDAEMFREFEEAEKKMRELYGLDGDEATAEPEQDGGSEPPLEGEEEEMDEQMVYSPAGPKFTPQRRRSRPPPKTPGDDLSEDEFAAWDFDETPVPQRRSAPLPQPAADDDDIIDLTGSPEPSPPKPKPTPQQRGRSRPGPQPENRARSHTRSNSKPPNPAPAEKRDRTPEIGQSSADEQLVLQLLTPPRSSSAPESITSIPDHESAPSPLPPAETPSPKFPKPRARYTPRPRTPSDDEDDDLPPPPPPLNLPFKVGPPRGVKKQTAKKQTSVKGKELKVEVFISVPPKKLNGKAKSARPPSPEPPSTPSPPPSKSNKGKGKEKAVPEPPSNTDIAPTTLRRRRSQSQPRLPTRVSDSPQPLPPPRGTKRRRVSSLSSLSDSSPARPVTPDPISVPRNAARTNRLTRSGSSKSGYSSDIPPPTSSPVHSDADDGRLHGSSGRVTMLKISAQTTRALAAQVAAVHAQPVSRLTCHHTHTHLPCSLLIPGMAIARRRAHAVINRKNDTLLPFQRQAYKTHKRSLCSHTHGTVYHTLWHRGRSQLLRPQAPAILQASHSRMRLGRHTPQVTSDIVPIRSTRLHLPQKQVPHARRHTSLRHIIHIRIHTPTTRCFPTVPCHHLRPYLPLLRHLPLRYAPPPYLLDSGVAPGGDASRSSWTSTTGRSRSLRGVLTIPPTTTEPSPRVHRRGRGREKAKLEPSPSRNRNAERRKRARTTNRLHGPRAGVRCSERAPLHRHLSACRASLLAPRRRRQVRKRTRPQSLRSESIELRVSRSDCARGFSV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.66
2 0.7
3 0.72
4 0.72
5 0.74
6 0.72
7 0.64
8 0.57
9 0.58
10 0.6
11 0.55
12 0.44
13 0.38
14 0.42
15 0.48
16 0.51
17 0.53
18 0.55
19 0.65
20 0.7
21 0.76
22 0.76
23 0.78
24 0.82
25 0.83
26 0.76
27 0.74
28 0.75
29 0.71
30 0.69
31 0.67
32 0.63
33 0.58
34 0.57
35 0.52
36 0.47
37 0.44
38 0.4
39 0.36
40 0.31
41 0.26
42 0.26
43 0.25
44 0.27
45 0.29
46 0.26
47 0.21
48 0.22
49 0.22
50 0.25
51 0.24
52 0.23
53 0.19
54 0.2
55 0.2
56 0.18
57 0.19
58 0.2
59 0.23
60 0.31
61 0.31
62 0.32
63 0.34
64 0.35
65 0.39
66 0.37
67 0.38
68 0.33
69 0.36
70 0.4
71 0.44
72 0.46
73 0.45
74 0.43
75 0.39
76 0.37
77 0.36
78 0.36
79 0.33
80 0.31
81 0.29
82 0.29
83 0.28
84 0.25
85 0.23
86 0.16
87 0.14
88 0.13
89 0.1
90 0.15
91 0.16
92 0.16
93 0.22
94 0.23
95 0.23
96 0.24
97 0.24
98 0.19
99 0.23
100 0.23
101 0.18
102 0.18
103 0.16
104 0.15
105 0.14
106 0.12
107 0.07
108 0.06
109 0.06
110 0.06
111 0.05
112 0.05
113 0.06
114 0.07
115 0.07
116 0.08
117 0.09
118 0.09
119 0.09
120 0.09
121 0.09
122 0.08
123 0.09
124 0.09
125 0.08
126 0.09
127 0.09
128 0.09
129 0.09
130 0.09
131 0.09
132 0.08
133 0.08
134 0.08
135 0.08
136 0.07
137 0.07
138 0.06
139 0.06
140 0.06
141 0.06
142 0.06
143 0.08
144 0.08
145 0.09
146 0.1
147 0.1
148 0.11
149 0.16
150 0.22
151 0.25
152 0.28
153 0.34
154 0.39
155 0.39
156 0.4
157 0.41
158 0.39
159 0.39
160 0.45
161 0.46
162 0.47
163 0.5
164 0.5
165 0.49
166 0.46
167 0.41
168 0.33
169 0.25
170 0.25
171 0.22
172 0.2
173 0.15
174 0.15
175 0.14
176 0.16
177 0.21
178 0.17
179 0.2
180 0.2
181 0.2
182 0.22
183 0.22
184 0.21
185 0.17
186 0.2
187 0.23
188 0.22
189 0.23
190 0.2
191 0.2
192 0.19
193 0.18
194 0.14
195 0.07
196 0.06
197 0.06
198 0.06
199 0.06
200 0.06
201 0.08
202 0.07
203 0.09
204 0.09
205 0.09
206 0.09
207 0.1
208 0.1
209 0.08
210 0.09
211 0.08
212 0.09
213 0.1
214 0.09
215 0.09
216 0.08
217 0.08
218 0.07
219 0.07
220 0.05
221 0.06
222 0.11
223 0.11
224 0.14
225 0.14
226 0.17
227 0.27
228 0.37
229 0.46
230 0.5
231 0.61
232 0.68
233 0.78
234 0.85
235 0.87
236 0.88
237 0.88
238 0.9
239 0.86
240 0.84
241 0.79
242 0.73
243 0.67
244 0.58
245 0.5
246 0.43
247 0.36
248 0.29
249 0.24
250 0.18
251 0.13
252 0.11
253 0.08
254 0.05
255 0.05
256 0.06
257 0.07
258 0.08
259 0.15
260 0.23
261 0.24
262 0.26
263 0.28
264 0.31
265 0.35
266 0.4
267 0.42
268 0.42
269 0.44
270 0.43
271 0.43
272 0.4
273 0.39
274 0.33
275 0.25
276 0.17
277 0.14
278 0.13
279 0.11
280 0.09
281 0.05
282 0.06
283 0.07
284 0.07
285 0.07
286 0.1
287 0.13
288 0.17
289 0.25
290 0.27
291 0.34
292 0.4
293 0.48
294 0.56
295 0.64
296 0.71
297 0.72
298 0.8
299 0.81
300 0.85
301 0.84
302 0.82
303 0.76
304 0.73
305 0.73
306 0.72
307 0.66
308 0.67
309 0.69
310 0.68
311 0.63
312 0.63
313 0.58
314 0.54
315 0.6
316 0.58
317 0.57
318 0.58
319 0.66
320 0.7
321 0.7
322 0.73
323 0.66
324 0.67
325 0.63
326 0.62
327 0.58
328 0.57
329 0.61
330 0.55
331 0.57
332 0.53
333 0.51
334 0.49
335 0.47
336 0.44
337 0.39
338 0.38
339 0.33
340 0.29
341 0.27
342 0.23
343 0.2
344 0.13
345 0.09
346 0.09
347 0.09
348 0.08
349 0.06
350 0.08
351 0.1
352 0.11
353 0.12
354 0.11
355 0.12
356 0.13
357 0.15
358 0.15
359 0.19
360 0.2
361 0.2
362 0.24
363 0.23
364 0.23
365 0.22
366 0.19
367 0.15
368 0.14
369 0.14
370 0.11
371 0.12
372 0.12
373 0.13
374 0.13
375 0.13
376 0.12
377 0.13
378 0.12
379 0.16
380 0.19
381 0.22
382 0.24
383 0.31
384 0.36
385 0.38
386 0.43
387 0.45
388 0.52
389 0.53
390 0.62
391 0.63
392 0.67
393 0.75
394 0.8
395 0.84
396 0.82
397 0.81
398 0.73
399 0.71
400 0.68
401 0.63
402 0.57
403 0.48
404 0.41
405 0.37
406 0.36
407 0.29
408 0.23
409 0.17
410 0.13
411 0.11
412 0.1
413 0.08
414 0.09
415 0.14
416 0.2
417 0.21
418 0.24
419 0.25
420 0.28
421 0.34
422 0.33
423 0.34
424 0.34
425 0.38
426 0.41
427 0.45
428 0.47
429 0.49
430 0.58
431 0.61
432 0.64
433 0.63
434 0.62
435 0.65
436 0.68
437 0.69
438 0.64
439 0.63
440 0.61
441 0.58
442 0.56
443 0.5
444 0.43
445 0.35
446 0.3
447 0.23
448 0.16
449 0.16
450 0.17
451 0.16
452 0.17
453 0.15
454 0.17
455 0.19
456 0.25
457 0.33
458 0.32
459 0.4
460 0.45
461 0.52
462 0.59
463 0.63
464 0.61
465 0.57
466 0.58
467 0.54
468 0.55
469 0.5
470 0.43
471 0.42
472 0.42
473 0.4
474 0.38
475 0.37
476 0.35
477 0.36
478 0.38
479 0.4
480 0.45
481 0.49
482 0.56
483 0.6
484 0.62
485 0.67
486 0.68
487 0.69
488 0.66
489 0.63
490 0.61
491 0.6
492 0.57
493 0.5
494 0.48
495 0.41
496 0.37
497 0.34
498 0.26
499 0.19
500 0.15
501 0.16
502 0.15
503 0.15
504 0.21
505 0.25
506 0.29
507 0.32
508 0.38
509 0.43
510 0.52
511 0.61
512 0.64
513 0.7
514 0.75
515 0.78
516 0.77
517 0.71
518 0.62
519 0.58
520 0.54
521 0.45
522 0.41
523 0.39
524 0.36
525 0.39
526 0.41
527 0.36
528 0.32
529 0.34
530 0.36
531 0.39
532 0.46
533 0.48
534 0.54
535 0.62
536 0.67
537 0.69
538 0.66
539 0.65
540 0.64
541 0.68
542 0.6
543 0.52
544 0.44
545 0.39
546 0.37
547 0.31
548 0.23
549 0.19
550 0.17
551 0.16
552 0.16
553 0.17
554 0.19
555 0.2
556 0.2
557 0.18
558 0.25
559 0.26
560 0.25
561 0.28
562 0.25
563 0.27
564 0.28
565 0.28
566 0.27
567 0.33
568 0.38
569 0.39
570 0.41
571 0.39
572 0.38
573 0.43
574 0.42
575 0.38
576 0.33
577 0.3
578 0.27
579 0.27
580 0.27
581 0.21
582 0.21
583 0.23
584 0.25
585 0.25
586 0.24
587 0.23
588 0.25
589 0.24
590 0.21
591 0.2
592 0.21
593 0.22
594 0.21
595 0.22
596 0.19
597 0.22
598 0.21
599 0.17
600 0.14
601 0.12
602 0.12
603 0.11
604 0.11
605 0.08
606 0.09
607 0.1
608 0.09
609 0.09
610 0.11
611 0.11
612 0.11
613 0.11
614 0.12
615 0.13
616 0.14
617 0.15
618 0.14
619 0.14
620 0.14
621 0.13
622 0.11
623 0.09
624 0.08
625 0.08
626 0.08
627 0.07
628 0.06
629 0.06
630 0.06
631 0.06
632 0.05
633 0.07
634 0.08
635 0.08
636 0.1
637 0.15
638 0.2
639 0.23
640 0.26
641 0.28
642 0.34
643 0.38
644 0.43
645 0.4
646 0.36
647 0.34
648 0.32
649 0.29
650 0.21
651 0.17
652 0.11
653 0.1
654 0.1
655 0.11
656 0.11
657 0.14
658 0.15
659 0.16
660 0.18
661 0.18
662 0.22
663 0.27
664 0.37
665 0.43
666 0.5
667 0.52
668 0.51
669 0.5
670 0.47
671 0.44
672 0.42
673 0.38
674 0.35
675 0.35
676 0.37
677 0.44
678 0.44
679 0.45
680 0.46
681 0.51
682 0.51
683 0.58
684 0.59
685 0.55
686 0.61
687 0.63
688 0.63
689 0.59
690 0.58
691 0.51
692 0.5
693 0.47
694 0.44
695 0.42
696 0.33
697 0.32
698 0.3
699 0.34
700 0.33
701 0.36
702 0.35
703 0.33
704 0.38
705 0.37
706 0.42
707 0.44
708 0.5
709 0.5
710 0.48
711 0.47
712 0.42
713 0.37
714 0.32
715 0.26
716 0.19
717 0.17
718 0.19
719 0.21
720 0.23
721 0.23
722 0.23
723 0.24
724 0.26
725 0.32
726 0.36
727 0.4
728 0.46
729 0.48
730 0.47
731 0.47
732 0.46
733 0.41
734 0.35
735 0.32
736 0.27
737 0.24
738 0.25
739 0.22
740 0.23
741 0.22
742 0.23
743 0.24
744 0.29
745 0.38
746 0.43
747 0.5
748 0.53
749 0.59
750 0.66
751 0.7
752 0.67
753 0.67
754 0.7
755 0.69
756 0.69
757 0.68
758 0.66
759 0.65
760 0.69
761 0.62
762 0.62
763 0.59
764 0.57
765 0.56
766 0.53
767 0.47
768 0.41
769 0.4
770 0.37
771 0.36
772 0.37
773 0.37
774 0.36
775 0.35
776 0.33
777 0.34
778 0.39
779 0.44
780 0.47
781 0.47
782 0.49
783 0.51
784 0.55
785 0.53
786 0.51
787 0.5
788 0.5
789 0.46
790 0.47
791 0.48
792 0.46
793 0.5
794 0.44
795 0.4
796 0.35
797 0.4
798 0.38
799 0.39
800 0.36
801 0.34
802 0.35
803 0.35
804 0.34
805 0.28
806 0.25
807 0.2
808 0.2
809 0.17
810 0.14
811 0.1
812 0.08
813 0.08
814 0.08
815 0.08
816 0.08
817 0.12
818 0.13
819 0.15
820 0.16
821 0.19
822 0.21
823 0.28
824 0.36
825 0.34
826 0.4
827 0.41
828 0.45
829 0.46
830 0.49
831 0.44
832 0.38
833 0.38
834 0.35
835 0.38
836 0.36
837 0.31
838 0.27
839 0.28
840 0.28
841 0.27
842 0.29
843 0.26
844 0.3
845 0.39
846 0.46
847 0.53
848 0.58
849 0.65
850 0.7
851 0.79
852 0.84
853 0.85
854 0.84
855 0.84
856 0.84
857 0.85
858 0.82
859 0.78
860 0.74
861 0.73
862 0.74
863 0.75
864 0.74
865 0.71
866 0.71
867 0.71
868 0.75
869 0.77
870 0.8
871 0.8
872 0.85
873 0.87
874 0.88
875 0.91
876 0.91
877 0.9
878 0.89
879 0.89
880 0.89
881 0.86
882 0.81
883 0.76
884 0.72
885 0.69
886 0.65
887 0.58
888 0.53
889 0.5
890 0.52
891 0.49
892 0.49
893 0.47
894 0.48
895 0.51
896 0.54
897 0.57
898 0.56
899 0.55
900 0.52
901 0.54
902 0.52
903 0.47
904 0.4
905 0.34
906 0.31
907 0.36
908 0.41
909 0.43
910 0.47
911 0.52
912 0.62
913 0.71
914 0.81
915 0.84
916 0.86
917 0.87
918 0.89
919 0.94
920 0.94
921 0.95
922 0.94
923 0.92
924 0.92
925 0.89
926 0.84
927 0.78
928 0.75
929 0.65
930 0.6
931 0.59
932 0.48
933 0.44
934 0.43
935 0.39
936 0.36
937 0.38
938 0.4
939 0.34