Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C2SS43

Protein Details
Accession A0A5C2SS43    Localization Confidence High Confidence Score 19.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
311-336GGGKTKGEGKKPKKTNTPFQRVKADEBasic
368-394IVTRGAGFRKEKNKKKRGSYHGGEITMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
118-151KVKAKSKSKTAGAAKPTAVKGKAISSKPAKAKSP
259-274KKAKKAKTAAKAGPAK
313-324GKTKGEGKKPKK
374-384GFRKEKNKKKR
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MTVPQVDGNLASTYTYIYTFLVKQEHKKAAEALKKAVKDVVVLKDGMEAEGPSLDAIIKEWKELKDKYASSDSESSSEDESSSEESSSEESSSEESSDSDSDSDSSSSSSSSSASSSKVKAKSKSKTAGAAKPTAVKGKAISSKPAKAKSPSPPSSKTLSSDDDESSSESENSSDESSSDEKDEKAKSKSASKTAKKEKDSDSDSSSPDSSDSSESEDSDSVPAAKAKTKVASESDSSSSSEESDELDSDSDSSSDASKKAKKAKTAAKAGPAKEDVSVTKKRRTGDDGASVPTAVAVNSPREDASPQPNGGGKTKGEGKKPKKTNTPFQRVKADEVTYADPRLKDNRFESRGASTSDYGARASRDLIVTRGAGFRKEKNKKKRGSYHGGEITMQSYSIKFND
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.11
3 0.1
4 0.1
5 0.13
6 0.14
7 0.18
8 0.25
9 0.28
10 0.36
11 0.44
12 0.51
13 0.5
14 0.51
15 0.54
16 0.56
17 0.59
18 0.55
19 0.54
20 0.53
21 0.52
22 0.51
23 0.47
24 0.38
25 0.33
26 0.35
27 0.33
28 0.29
29 0.28
30 0.27
31 0.28
32 0.27
33 0.24
34 0.19
35 0.13
36 0.11
37 0.11
38 0.11
39 0.07
40 0.07
41 0.06
42 0.06
43 0.07
44 0.13
45 0.13
46 0.16
47 0.21
48 0.24
49 0.31
50 0.33
51 0.36
52 0.38
53 0.39
54 0.42
55 0.45
56 0.43
57 0.41
58 0.44
59 0.41
60 0.34
61 0.34
62 0.3
63 0.24
64 0.24
65 0.18
66 0.14
67 0.14
68 0.14
69 0.13
70 0.12
71 0.1
72 0.1
73 0.12
74 0.13
75 0.12
76 0.09
77 0.09
78 0.1
79 0.11
80 0.11
81 0.1
82 0.09
83 0.11
84 0.11
85 0.11
86 0.1
87 0.09
88 0.09
89 0.1
90 0.1
91 0.08
92 0.09
93 0.08
94 0.08
95 0.08
96 0.08
97 0.08
98 0.08
99 0.09
100 0.1
101 0.13
102 0.16
103 0.19
104 0.26
105 0.32
106 0.38
107 0.45
108 0.53
109 0.58
110 0.63
111 0.67
112 0.63
113 0.65
114 0.65
115 0.64
116 0.59
117 0.55
118 0.47
119 0.44
120 0.42
121 0.38
122 0.32
123 0.26
124 0.23
125 0.25
126 0.31
127 0.28
128 0.34
129 0.34
130 0.41
131 0.46
132 0.49
133 0.47
134 0.43
135 0.49
136 0.51
137 0.57
138 0.57
139 0.57
140 0.57
141 0.56
142 0.57
143 0.52
144 0.45
145 0.39
146 0.35
147 0.3
148 0.28
149 0.25
150 0.22
151 0.21
152 0.18
153 0.15
154 0.13
155 0.11
156 0.09
157 0.09
158 0.08
159 0.08
160 0.08
161 0.07
162 0.06
163 0.09
164 0.1
165 0.11
166 0.12
167 0.11
168 0.11
169 0.15
170 0.18
171 0.2
172 0.22
173 0.25
174 0.26
175 0.33
176 0.37
177 0.42
178 0.49
179 0.51
180 0.58
181 0.64
182 0.7
183 0.65
184 0.66
185 0.62
186 0.59
187 0.57
188 0.5
189 0.45
190 0.39
191 0.37
192 0.33
193 0.29
194 0.21
195 0.18
196 0.15
197 0.11
198 0.1
199 0.09
200 0.11
201 0.12
202 0.12
203 0.13
204 0.12
205 0.11
206 0.1
207 0.1
208 0.07
209 0.07
210 0.08
211 0.08
212 0.11
213 0.12
214 0.14
215 0.17
216 0.17
217 0.19
218 0.2
219 0.22
220 0.21
221 0.22
222 0.22
223 0.2
224 0.2
225 0.18
226 0.16
227 0.14
228 0.12
229 0.09
230 0.09
231 0.08
232 0.08
233 0.08
234 0.08
235 0.07
236 0.07
237 0.07
238 0.06
239 0.05
240 0.06
241 0.07
242 0.08
243 0.1
244 0.15
245 0.2
246 0.26
247 0.35
248 0.39
249 0.44
250 0.51
251 0.59
252 0.62
253 0.66
254 0.64
255 0.64
256 0.66
257 0.6
258 0.56
259 0.49
260 0.4
261 0.32
262 0.3
263 0.23
264 0.24
265 0.32
266 0.31
267 0.36
268 0.39
269 0.4
270 0.43
271 0.47
272 0.47
273 0.45
274 0.48
275 0.44
276 0.43
277 0.41
278 0.37
279 0.3
280 0.24
281 0.18
282 0.09
283 0.09
284 0.08
285 0.11
286 0.11
287 0.13
288 0.12
289 0.13
290 0.15
291 0.18
292 0.23
293 0.25
294 0.24
295 0.26
296 0.29
297 0.3
298 0.32
299 0.31
300 0.24
301 0.24
302 0.33
303 0.35
304 0.41
305 0.5
306 0.56
307 0.63
308 0.72
309 0.76
310 0.78
311 0.81
312 0.83
313 0.84
314 0.86
315 0.84
316 0.81
317 0.82
318 0.73
319 0.71
320 0.65
321 0.56
322 0.48
323 0.43
324 0.42
325 0.34
326 0.33
327 0.31
328 0.26
329 0.27
330 0.33
331 0.32
332 0.34
333 0.39
334 0.47
335 0.48
336 0.49
337 0.49
338 0.47
339 0.47
340 0.43
341 0.41
342 0.31
343 0.3
344 0.31
345 0.29
346 0.24
347 0.23
348 0.21
349 0.18
350 0.19
351 0.19
352 0.19
353 0.19
354 0.2
355 0.21
356 0.2
357 0.21
358 0.25
359 0.23
360 0.26
361 0.29
362 0.36
363 0.45
364 0.55
365 0.63
366 0.69
367 0.78
368 0.82
369 0.88
370 0.9
371 0.9
372 0.89
373 0.86
374 0.85
375 0.82
376 0.75
377 0.65
378 0.56
379 0.47
380 0.36
381 0.3
382 0.2
383 0.13