Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C2SKR2

Protein Details
Accession A0A5C2SKR2    Localization Confidence Low Confidence Score 9.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
787-812LPEPFPPPTHLRRKERSQHNRGALFVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 12.5, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007201  Mei2-like_Rrm_C  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PF04059  RRM_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MDLHAVPFPTTHQTEESSFVDKKPAVPPRLHSTPSLPNLLVPHHYNSLPTVLPLQGPARHRPHLRPLDLASSPSSSPTRRDPNAPSRRAPSLLTPPLTPSSSFNSTSNDTPSTPPDSHSPLRWVSSSERERVFSAAHSAYTAGLKSHMSASSATAAHNAGYLTPTSARSQSLSSDDSAGGTSAPAATSDVSSIASGLASVEITPRDERSFVLDGQDDVASDLAIGELSCEKPTRLLLVRNVPRAASGNALLEAFSTMGDVKGVMARFQASHGVIIIAFFDTRHAVRALRQISGVPLPTLDEVRLESAFVSPAQVEKLIGKSDFLSALDGSFLVTVEARAVVPKDVQNMLASFGELAAFVGAGTDPHDQTFHVDYYDCRDAANAYTHLNNRTIFGARLKMFTNKEVLEHPVLLMQGDAPSQDSDSDSQRVAEGRVRPRSVSVSEGVGTPDGVRKVKKVKEIAQDHGRRSSNDLFFDAVGKGFDQSHAASSRPRSISASAEDLAGLVKMHHPPINAYVAAPLFPYSDPSYTPYGHPATVPHMYHHPTHPYPYAVYAPGMGMYPTSEVEGSDWRYASPHPPQVDYYLPPIQRAPAPIYAPPMAVKHVARPTPDIILNGSAHAPAPCYVERRVSGTPPSDGVDVAQNGQRAPGTKNLLDIAAIESGMDTRTTVMIKNIPNKMTDKDLKNFIDRVCPRRIDFMYLRMDFQNGCNVGYAFVNFITVQDLLHFAKTQIGVKWNMYSSEKTLQMCYATYQGKESLVEKFKNSCIMDEKEAWRPKIYHSDGPNQGLPEPFPPPTHLRRKERSQHNRGALFVPGTHHQPSGGGGLYHHRPQPPRMNLR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.33
3 0.32
4 0.31
5 0.31
6 0.29
7 0.33
8 0.31
9 0.33
10 0.37
11 0.44
12 0.43
13 0.47
14 0.52
15 0.55
16 0.61
17 0.59
18 0.53
19 0.5
20 0.54
21 0.54
22 0.53
23 0.44
24 0.38
25 0.39
26 0.39
27 0.37
28 0.31
29 0.31
30 0.29
31 0.29
32 0.28
33 0.28
34 0.28
35 0.24
36 0.21
37 0.2
38 0.17
39 0.17
40 0.19
41 0.22
42 0.23
43 0.27
44 0.35
45 0.39
46 0.46
47 0.51
48 0.55
49 0.62
50 0.66
51 0.65
52 0.62
53 0.59
54 0.58
55 0.54
56 0.49
57 0.41
58 0.33
59 0.3
60 0.29
61 0.29
62 0.24
63 0.27
64 0.34
65 0.41
66 0.41
67 0.48
68 0.53
69 0.6
70 0.69
71 0.71
72 0.68
73 0.64
74 0.65
75 0.61
76 0.54
77 0.5
78 0.49
79 0.51
80 0.47
81 0.42
82 0.41
83 0.43
84 0.42
85 0.36
86 0.29
87 0.28
88 0.31
89 0.33
90 0.3
91 0.31
92 0.33
93 0.34
94 0.36
95 0.31
96 0.28
97 0.28
98 0.3
99 0.32
100 0.3
101 0.29
102 0.3
103 0.35
104 0.36
105 0.37
106 0.39
107 0.35
108 0.37
109 0.36
110 0.35
111 0.32
112 0.4
113 0.41
114 0.42
115 0.42
116 0.41
117 0.41
118 0.39
119 0.35
120 0.26
121 0.27
122 0.22
123 0.19
124 0.18
125 0.17
126 0.16
127 0.16
128 0.15
129 0.1
130 0.1
131 0.1
132 0.11
133 0.13
134 0.13
135 0.13
136 0.13
137 0.15
138 0.18
139 0.18
140 0.17
141 0.16
142 0.15
143 0.14
144 0.14
145 0.12
146 0.08
147 0.09
148 0.09
149 0.09
150 0.11
151 0.12
152 0.14
153 0.15
154 0.16
155 0.17
156 0.18
157 0.19
158 0.21
159 0.21
160 0.2
161 0.2
162 0.19
163 0.18
164 0.17
165 0.14
166 0.1
167 0.08
168 0.07
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.06
173 0.06
174 0.06
175 0.07
176 0.07
177 0.07
178 0.07
179 0.07
180 0.06
181 0.05
182 0.05
183 0.05
184 0.04
185 0.04
186 0.04
187 0.06
188 0.06
189 0.09
190 0.1
191 0.12
192 0.13
193 0.14
194 0.14
195 0.18
196 0.21
197 0.19
198 0.21
199 0.2
200 0.18
201 0.19
202 0.19
203 0.13
204 0.11
205 0.1
206 0.07
207 0.06
208 0.05
209 0.04
210 0.04
211 0.03
212 0.04
213 0.05
214 0.06
215 0.08
216 0.09
217 0.09
218 0.1
219 0.11
220 0.16
221 0.18
222 0.23
223 0.27
224 0.37
225 0.43
226 0.46
227 0.46
228 0.41
229 0.38
230 0.36
231 0.31
232 0.23
233 0.18
234 0.14
235 0.14
236 0.14
237 0.12
238 0.1
239 0.09
240 0.07
241 0.06
242 0.05
243 0.04
244 0.04
245 0.05
246 0.04
247 0.04
248 0.07
249 0.08
250 0.08
251 0.08
252 0.09
253 0.09
254 0.1
255 0.13
256 0.11
257 0.11
258 0.11
259 0.1
260 0.09
261 0.09
262 0.09
263 0.05
264 0.05
265 0.05
266 0.05
267 0.07
268 0.07
269 0.09
270 0.1
271 0.1
272 0.13
273 0.21
274 0.22
275 0.21
276 0.21
277 0.2
278 0.21
279 0.22
280 0.2
281 0.12
282 0.1
283 0.11
284 0.11
285 0.11
286 0.09
287 0.08
288 0.08
289 0.09
290 0.09
291 0.08
292 0.08
293 0.08
294 0.08
295 0.07
296 0.08
297 0.06
298 0.07
299 0.07
300 0.07
301 0.07
302 0.07
303 0.09
304 0.1
305 0.1
306 0.1
307 0.1
308 0.11
309 0.11
310 0.1
311 0.1
312 0.08
313 0.08
314 0.08
315 0.07
316 0.06
317 0.05
318 0.05
319 0.04
320 0.04
321 0.04
322 0.04
323 0.04
324 0.04
325 0.05
326 0.05
327 0.06
328 0.08
329 0.09
330 0.12
331 0.12
332 0.12
333 0.13
334 0.12
335 0.14
336 0.12
337 0.11
338 0.08
339 0.07
340 0.06
341 0.05
342 0.05
343 0.03
344 0.03
345 0.03
346 0.03
347 0.03
348 0.03
349 0.05
350 0.06
351 0.07
352 0.07
353 0.08
354 0.08
355 0.1
356 0.13
357 0.11
358 0.1
359 0.1
360 0.1
361 0.16
362 0.18
363 0.15
364 0.13
365 0.13
366 0.13
367 0.14
368 0.17
369 0.12
370 0.11
371 0.14
372 0.16
373 0.18
374 0.19
375 0.18
376 0.15
377 0.16
378 0.16
379 0.14
380 0.14
381 0.18
382 0.16
383 0.18
384 0.18
385 0.22
386 0.22
387 0.22
388 0.24
389 0.19
390 0.19
391 0.19
392 0.2
393 0.16
394 0.15
395 0.14
396 0.11
397 0.11
398 0.1
399 0.08
400 0.06
401 0.05
402 0.05
403 0.05
404 0.04
405 0.05
406 0.05
407 0.05
408 0.06
409 0.07
410 0.09
411 0.11
412 0.1
413 0.1
414 0.1
415 0.11
416 0.11
417 0.14
418 0.18
419 0.23
420 0.29
421 0.29
422 0.29
423 0.3
424 0.32
425 0.29
426 0.25
427 0.19
428 0.15
429 0.14
430 0.15
431 0.14
432 0.11
433 0.09
434 0.07
435 0.09
436 0.09
437 0.11
438 0.11
439 0.14
440 0.21
441 0.26
442 0.32
443 0.35
444 0.41
445 0.49
446 0.53
447 0.56
448 0.58
449 0.59
450 0.55
451 0.56
452 0.5
453 0.41
454 0.42
455 0.42
456 0.35
457 0.31
458 0.3
459 0.24
460 0.23
461 0.24
462 0.18
463 0.11
464 0.09
465 0.08
466 0.07
467 0.07
468 0.07
469 0.07
470 0.07
471 0.1
472 0.11
473 0.11
474 0.13
475 0.15
476 0.22
477 0.21
478 0.22
479 0.21
480 0.22
481 0.24
482 0.24
483 0.25
484 0.18
485 0.17
486 0.16
487 0.14
488 0.12
489 0.09
490 0.07
491 0.04
492 0.06
493 0.08
494 0.1
495 0.11
496 0.11
497 0.12
498 0.15
499 0.18
500 0.16
501 0.14
502 0.15
503 0.13
504 0.13
505 0.12
506 0.1
507 0.08
508 0.08
509 0.11
510 0.11
511 0.11
512 0.12
513 0.15
514 0.18
515 0.17
516 0.18
517 0.2
518 0.2
519 0.19
520 0.19
521 0.17
522 0.19
523 0.23
524 0.23
525 0.19
526 0.22
527 0.24
528 0.26
529 0.27
530 0.3
531 0.26
532 0.29
533 0.29
534 0.27
535 0.25
536 0.25
537 0.24
538 0.18
539 0.17
540 0.14
541 0.12
542 0.11
543 0.1
544 0.07
545 0.06
546 0.05
547 0.06
548 0.06
549 0.06
550 0.06
551 0.06
552 0.07
553 0.11
554 0.13
555 0.14
556 0.14
557 0.13
558 0.15
559 0.16
560 0.2
561 0.23
562 0.26
563 0.26
564 0.28
565 0.29
566 0.31
567 0.33
568 0.29
569 0.28
570 0.28
571 0.27
572 0.26
573 0.26
574 0.24
575 0.23
576 0.24
577 0.22
578 0.21
579 0.22
580 0.22
581 0.26
582 0.25
583 0.24
584 0.22
585 0.19
586 0.17
587 0.19
588 0.18
589 0.2
590 0.26
591 0.27
592 0.28
593 0.3
594 0.3
595 0.3
596 0.31
597 0.26
598 0.21
599 0.22
600 0.2
601 0.18
602 0.16
603 0.13
604 0.12
605 0.11
606 0.11
607 0.09
608 0.13
609 0.14
610 0.17
611 0.18
612 0.22
613 0.23
614 0.27
615 0.28
616 0.27
617 0.31
618 0.3
619 0.3
620 0.27
621 0.27
622 0.23
623 0.2
624 0.18
625 0.17
626 0.15
627 0.15
628 0.16
629 0.15
630 0.15
631 0.16
632 0.16
633 0.14
634 0.15
635 0.21
636 0.24
637 0.23
638 0.25
639 0.25
640 0.24
641 0.22
642 0.21
643 0.16
644 0.11
645 0.1
646 0.08
647 0.07
648 0.07
649 0.07
650 0.07
651 0.05
652 0.05
653 0.07
654 0.08
655 0.09
656 0.12
657 0.17
658 0.23
659 0.3
660 0.35
661 0.35
662 0.37
663 0.39
664 0.39
665 0.41
666 0.44
667 0.42
668 0.42
669 0.49
670 0.49
671 0.5
672 0.51
673 0.44
674 0.46
675 0.46
676 0.47
677 0.46
678 0.47
679 0.44
680 0.49
681 0.49
682 0.47
683 0.44
684 0.45
685 0.47
686 0.44
687 0.45
688 0.37
689 0.37
690 0.29
691 0.28
692 0.29
693 0.21
694 0.2
695 0.2
696 0.19
697 0.19
698 0.19
699 0.18
700 0.11
701 0.1
702 0.11
703 0.09
704 0.09
705 0.1
706 0.1
707 0.09
708 0.09
709 0.12
710 0.12
711 0.13
712 0.14
713 0.12
714 0.16
715 0.19
716 0.21
717 0.21
718 0.25
719 0.27
720 0.28
721 0.32
722 0.29
723 0.3
724 0.3
725 0.3
726 0.3
727 0.33
728 0.36
729 0.33
730 0.33
731 0.31
732 0.3
733 0.28
734 0.25
735 0.25
736 0.24
737 0.23
738 0.24
739 0.24
740 0.24
741 0.25
742 0.25
743 0.27
744 0.31
745 0.33
746 0.33
747 0.36
748 0.37
749 0.43
750 0.42
751 0.37
752 0.37
753 0.4
754 0.42
755 0.44
756 0.46
757 0.47
758 0.54
759 0.52
760 0.5
761 0.46
762 0.47
763 0.51
764 0.53
765 0.51
766 0.5
767 0.58
768 0.59
769 0.63
770 0.6
771 0.51
772 0.47
773 0.41
774 0.37
775 0.3
776 0.28
777 0.25
778 0.24
779 0.27
780 0.32
781 0.4
782 0.5
783 0.56
784 0.62
785 0.69
786 0.78
787 0.83
788 0.88
789 0.89
790 0.88
791 0.88
792 0.88
793 0.82
794 0.74
795 0.66
796 0.58
797 0.49
798 0.4
799 0.34
800 0.27
801 0.29
802 0.28
803 0.26
804 0.23
805 0.22
806 0.22
807 0.22
808 0.2
809 0.16
810 0.15
811 0.21
812 0.26
813 0.31
814 0.34
815 0.37
816 0.39
817 0.48
818 0.57