Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C2SSB1

Protein Details
Accession A0A5C2SSB1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-41MANPRQRRKLRSGSHKPVQHSRRAKKLLKKQPPIRGPKLLQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
5-38RQRRKLRSGSHKPVQHSRRAKKLLKKQPPIRGPK
Subcellular Location(s) nucl 11, mito 11, mito_nucl 11
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019002  Ribosome_biogenesis_Nop16  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF09420  Nop16  
Amino Acid Sequences MANPRQRRKLRSGSHKPVQHSRRAKKLLKKQPPIRGPKLLQEAWDARKTVRQNYEALGLAASLNPTASGGTERALCTHGGDEKNCEKPEASTSGSSKALGANGVRKGFGKIIRDAEGKVVEVQLGDESGEDEDMAREETMEEVPDPSADEQLAGWVGLGSDPRTRAPQGASTGVVQGLEQLSERGAKAVERFTSKGERGTLSQLVAKYGEDVEAMARDRKVNTDQRTAGELRRAIRKAGGFAAVGRAG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.86
2 0.84
3 0.81
4 0.81
5 0.77
6 0.76
7 0.76
8 0.74
9 0.76
10 0.79
11 0.81
12 0.81
13 0.85
14 0.86
15 0.86
16 0.89
17 0.87
18 0.88
19 0.89
20 0.89
21 0.85
22 0.83
23 0.75
24 0.72
25 0.71
26 0.62
27 0.53
28 0.5
29 0.49
30 0.45
31 0.46
32 0.39
33 0.31
34 0.37
35 0.38
36 0.4
37 0.41
38 0.38
39 0.36
40 0.37
41 0.4
42 0.35
43 0.32
44 0.23
45 0.16
46 0.13
47 0.12
48 0.1
49 0.06
50 0.05
51 0.04
52 0.05
53 0.04
54 0.05
55 0.06
56 0.06
57 0.07
58 0.1
59 0.1
60 0.11
61 0.12
62 0.11
63 0.11
64 0.12
65 0.16
66 0.17
67 0.18
68 0.22
69 0.26
70 0.32
71 0.32
72 0.31
73 0.26
74 0.25
75 0.28
76 0.26
77 0.24
78 0.2
79 0.21
80 0.24
81 0.24
82 0.23
83 0.19
84 0.16
85 0.14
86 0.12
87 0.11
88 0.13
89 0.15
90 0.16
91 0.16
92 0.15
93 0.17
94 0.18
95 0.21
96 0.19
97 0.19
98 0.22
99 0.25
100 0.25
101 0.24
102 0.23
103 0.2
104 0.17
105 0.14
106 0.12
107 0.08
108 0.07
109 0.07
110 0.05
111 0.04
112 0.04
113 0.03
114 0.04
115 0.04
116 0.04
117 0.03
118 0.03
119 0.03
120 0.04
121 0.04
122 0.04
123 0.04
124 0.04
125 0.05
126 0.05
127 0.06
128 0.06
129 0.05
130 0.06
131 0.06
132 0.07
133 0.06
134 0.07
135 0.06
136 0.06
137 0.05
138 0.06
139 0.06
140 0.05
141 0.04
142 0.03
143 0.04
144 0.04
145 0.05
146 0.06
147 0.08
148 0.09
149 0.1
150 0.13
151 0.14
152 0.15
153 0.17
154 0.2
155 0.22
156 0.22
157 0.23
158 0.2
159 0.2
160 0.19
161 0.16
162 0.11
163 0.09
164 0.08
165 0.07
166 0.06
167 0.06
168 0.06
169 0.08
170 0.08
171 0.07
172 0.08
173 0.09
174 0.11
175 0.15
176 0.18
177 0.21
178 0.22
179 0.25
180 0.32
181 0.32
182 0.34
183 0.32
184 0.31
185 0.29
186 0.33
187 0.31
188 0.25
189 0.28
190 0.24
191 0.23
192 0.21
193 0.19
194 0.15
195 0.14
196 0.13
197 0.09
198 0.09
199 0.08
200 0.1
201 0.12
202 0.14
203 0.15
204 0.17
205 0.18
206 0.22
207 0.29
208 0.36
209 0.4
210 0.46
211 0.48
212 0.48
213 0.52
214 0.51
215 0.47
216 0.45
217 0.42
218 0.38
219 0.44
220 0.43
221 0.39
222 0.42
223 0.41
224 0.37
225 0.37
226 0.35
227 0.27
228 0.26