Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C2SIH6

Protein Details
Accession A0A5C2SIH6    Localization Confidence Medium Confidence Score 14
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
42-62AASGKRIRARLKPKVKRLEVHBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
45-58GKRIRARLKPKVKR
187-191KKEKK
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 13.333, mito_nucl 11.333, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006886  RNA_pol_III_Rpc5  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF04801  RPC5  
Amino Acid Sequences MEAEDRLVRVIPVHYTNALEPNIHLHQYPLLTRPLEVPPSAAASGKRIRARLKPKVKRLEVHVPVDTRPEVWNGERSRDLGSARVEDDKEKNQEEPKVKQREGEEPRLSEVRLRSEQVPQIGVYVLGILREGRLHLMPISETHQFRPTLTYMDMHLRKTRRTRGDDSDEDDGPPPDPDEPAPIPAPKKEKKPAGEAKEVQVAVRKTAESQGLQFQGGMTQIRRDMLTLMHQEEDEQWDEYEYFEGEAAEANEAFESVFSTSFEELECKSDITSLLKNVPGL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.23
3 0.25
4 0.28
5 0.27
6 0.23
7 0.2
8 0.24
9 0.25
10 0.24
11 0.22
12 0.18
13 0.2
14 0.22
15 0.24
16 0.21
17 0.23
18 0.22
19 0.23
20 0.25
21 0.27
22 0.28
23 0.26
24 0.24
25 0.2
26 0.23
27 0.23
28 0.22
29 0.18
30 0.21
31 0.26
32 0.31
33 0.34
34 0.35
35 0.4
36 0.47
37 0.57
38 0.61
39 0.68
40 0.71
41 0.77
42 0.83
43 0.84
44 0.79
45 0.77
46 0.77
47 0.73
48 0.68
49 0.62
50 0.53
51 0.47
52 0.46
53 0.39
54 0.29
55 0.23
56 0.2
57 0.19
58 0.19
59 0.26
60 0.24
61 0.28
62 0.28
63 0.28
64 0.28
65 0.28
66 0.27
67 0.23
68 0.24
69 0.21
70 0.21
71 0.23
72 0.21
73 0.22
74 0.25
75 0.27
76 0.29
77 0.28
78 0.31
79 0.31
80 0.38
81 0.4
82 0.43
83 0.47
84 0.51
85 0.5
86 0.51
87 0.5
88 0.53
89 0.54
90 0.56
91 0.5
92 0.42
93 0.45
94 0.42
95 0.39
96 0.32
97 0.28
98 0.24
99 0.23
100 0.24
101 0.23
102 0.26
103 0.28
104 0.26
105 0.25
106 0.18
107 0.17
108 0.15
109 0.13
110 0.08
111 0.06
112 0.05
113 0.04
114 0.04
115 0.03
116 0.04
117 0.04
118 0.04
119 0.05
120 0.05
121 0.06
122 0.06
123 0.06
124 0.06
125 0.07
126 0.1
127 0.13
128 0.13
129 0.14
130 0.18
131 0.18
132 0.18
133 0.19
134 0.17
135 0.16
136 0.16
137 0.15
138 0.13
139 0.21
140 0.23
141 0.22
142 0.26
143 0.26
144 0.3
145 0.37
146 0.44
147 0.44
148 0.49
149 0.54
150 0.56
151 0.62
152 0.6
153 0.57
154 0.52
155 0.44
156 0.38
157 0.33
158 0.25
159 0.17
160 0.15
161 0.11
162 0.08
163 0.09
164 0.08
165 0.12
166 0.13
167 0.15
168 0.16
169 0.18
170 0.19
171 0.23
172 0.31
173 0.31
174 0.38
175 0.44
176 0.5
177 0.51
178 0.59
179 0.64
180 0.63
181 0.67
182 0.61
183 0.56
184 0.55
185 0.51
186 0.41
187 0.38
188 0.31
189 0.24
190 0.24
191 0.21
192 0.16
193 0.19
194 0.22
195 0.18
196 0.19
197 0.23
198 0.23
199 0.22
200 0.21
201 0.18
202 0.15
203 0.16
204 0.16
205 0.11
206 0.12
207 0.13
208 0.14
209 0.14
210 0.14
211 0.13
212 0.13
213 0.19
214 0.21
215 0.21
216 0.21
217 0.21
218 0.21
219 0.22
220 0.24
221 0.19
222 0.16
223 0.14
224 0.15
225 0.15
226 0.15
227 0.15
228 0.11
229 0.09
230 0.08
231 0.08
232 0.07
233 0.09
234 0.09
235 0.09
236 0.09
237 0.08
238 0.08
239 0.08
240 0.08
241 0.06
242 0.07
243 0.06
244 0.07
245 0.07
246 0.1
247 0.11
248 0.11
249 0.12
250 0.13
251 0.13
252 0.15
253 0.16
254 0.14
255 0.14
256 0.15
257 0.17
258 0.19
259 0.22
260 0.23
261 0.26