Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C2SM05

Protein Details
Accession A0A5C2SM05    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
41-68GPSSRPHGEDPKKDKRRKETVTKIAKELBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
51-58PKKDKRRK
148-170KRGRERIRERMLEGIEERRRRAR
317-325RGNRRRRAA
Subcellular Location(s) mito 15, nucl 8, cyto_nucl 7, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013907  Sds3  
Gene Ontology GO:0005654  C:nucleoplasm  
Pfam View protein in Pfam  
PF08598  Sds3  
Amino Acid Sequences MPPQQGVFAVSHTSTHKVRGGAPVSVTEVASVNMHFESVAGPSSRPHGEDPKKDKRRKETVTKIAKELADRREDFGRHYTETISELHSLAQQLATRPETSPAYQLRLYPLTLERGALLSSIEFQERHALQVVQTAYDEERERVEEEWKRGRERIRERMLEGIEERRRRAREEKDGEGTVADGSGDPQSRPHITRKLRNKMGGTSPPPTPVPGGHPGLGNGAIAPISSGPVTSGPLLNPHSLSVDELPSPFPLPLISGHSAGGQSYGYGAGNGGAGNGRRRAKGGGQAQAPGTLGKSLNVFHPLKESEYDADMGEIRRGNRRRRAAAGTLAGKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.26
3 0.28
4 0.27
5 0.3
6 0.36
7 0.38
8 0.36
9 0.35
10 0.33
11 0.32
12 0.31
13 0.28
14 0.2
15 0.17
16 0.15
17 0.14
18 0.12
19 0.1
20 0.09
21 0.09
22 0.08
23 0.08
24 0.07
25 0.08
26 0.11
27 0.1
28 0.1
29 0.11
30 0.16
31 0.17
32 0.19
33 0.22
34 0.3
35 0.38
36 0.48
37 0.57
38 0.64
39 0.73
40 0.78
41 0.82
42 0.82
43 0.84
44 0.83
45 0.84
46 0.84
47 0.84
48 0.87
49 0.82
50 0.75
51 0.7
52 0.62
53 0.56
54 0.52
55 0.48
56 0.45
57 0.43
58 0.42
59 0.43
60 0.42
61 0.4
62 0.39
63 0.37
64 0.31
65 0.31
66 0.29
67 0.24
68 0.25
69 0.23
70 0.19
71 0.16
72 0.14
73 0.14
74 0.14
75 0.13
76 0.12
77 0.13
78 0.11
79 0.12
80 0.15
81 0.16
82 0.16
83 0.16
84 0.19
85 0.2
86 0.19
87 0.24
88 0.22
89 0.25
90 0.25
91 0.25
92 0.26
93 0.26
94 0.25
95 0.21
96 0.2
97 0.2
98 0.19
99 0.18
100 0.14
101 0.13
102 0.13
103 0.11
104 0.09
105 0.05
106 0.06
107 0.07
108 0.08
109 0.07
110 0.07
111 0.13
112 0.13
113 0.14
114 0.15
115 0.14
116 0.13
117 0.18
118 0.18
119 0.12
120 0.12
121 0.12
122 0.1
123 0.13
124 0.14
125 0.1
126 0.1
127 0.11
128 0.12
129 0.12
130 0.18
131 0.2
132 0.24
133 0.31
134 0.34
135 0.35
136 0.37
137 0.42
138 0.45
139 0.49
140 0.54
141 0.54
142 0.53
143 0.52
144 0.53
145 0.48
146 0.4
147 0.33
148 0.31
149 0.29
150 0.29
151 0.29
152 0.29
153 0.3
154 0.33
155 0.4
156 0.39
157 0.44
158 0.48
159 0.51
160 0.49
161 0.48
162 0.44
163 0.36
164 0.29
165 0.18
166 0.12
167 0.08
168 0.04
169 0.04
170 0.06
171 0.07
172 0.06
173 0.08
174 0.1
175 0.13
176 0.16
177 0.2
178 0.28
179 0.33
180 0.42
181 0.52
182 0.59
183 0.63
184 0.66
185 0.63
186 0.58
187 0.58
188 0.57
189 0.51
190 0.43
191 0.39
192 0.36
193 0.34
194 0.3
195 0.24
196 0.18
197 0.18
198 0.21
199 0.22
200 0.2
201 0.2
202 0.2
203 0.2
204 0.19
205 0.14
206 0.09
207 0.06
208 0.05
209 0.05
210 0.05
211 0.03
212 0.04
213 0.04
214 0.04
215 0.05
216 0.05
217 0.07
218 0.07
219 0.08
220 0.08
221 0.12
222 0.15
223 0.15
224 0.15
225 0.14
226 0.15
227 0.14
228 0.16
229 0.13
230 0.13
231 0.12
232 0.12
233 0.13
234 0.13
235 0.13
236 0.11
237 0.1
238 0.08
239 0.09
240 0.1
241 0.14
242 0.16
243 0.15
244 0.16
245 0.17
246 0.17
247 0.16
248 0.15
249 0.09
250 0.07
251 0.06
252 0.07
253 0.06
254 0.06
255 0.06
256 0.05
257 0.06
258 0.06
259 0.06
260 0.07
261 0.09
262 0.13
263 0.19
264 0.22
265 0.22
266 0.25
267 0.28
268 0.31
269 0.38
270 0.42
271 0.42
272 0.41
273 0.44
274 0.42
275 0.4
276 0.36
277 0.27
278 0.21
279 0.16
280 0.14
281 0.13
282 0.14
283 0.13
284 0.16
285 0.23
286 0.23
287 0.21
288 0.27
289 0.27
290 0.28
291 0.29
292 0.29
293 0.24
294 0.25
295 0.26
296 0.2
297 0.19
298 0.19
299 0.18
300 0.19
301 0.2
302 0.2
303 0.29
304 0.37
305 0.45
306 0.53
307 0.61
308 0.64
309 0.68
310 0.74
311 0.71
312 0.71
313 0.7