FuNGI

A0A5C2SPK2

Protein Details

Accession

A0A5C2SPK2

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
493-523	ETPEEKKARKQAVKAERQARRSDKKATKEQF	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
277-283	GKKRRRK
497-520	EKKARKQAVKAERQARRSDKKATK

Subcellular Location(s)

nucl 20, mito 4, cyto 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MPPKSIFRQPGAQHFQVVHRSQRDPLIHDPEANKHVLKPVVRGNLVKGKSRAELEQLLAPSDLAHDKQRANIGEAAAYGIYFDDTQYDYMQHLKPVGIQEDGVDSIWLEAPSKSKGKGKAKDPIELLDLPEGTLASKSELPRNYEAQQEIPSSIAGFQPDMDPHLRQVLEALEDDAFVDEGIEDNFFGELVADGERAVDEDFEYEFREEGIPDGELEHVEGETGPADDEDESWEARFARYKREQKSGPQDEETSDLDAYSEGGDTIGTLPQLSVIGGKKRRRKGASDASGYSMSSSSMWRNEHLTVLDERFDQIQREYDSSDEEDEEPSLDDLDEAPDLIAAREDFDSMMDEFLEKYEVIAGKMRPTLPGSATEKLDTVRKALGEAKIRDAEESDSEGDDILMPLDVDEKKDRWDCETILTTYSNLENHPRLIRARNDKSVPKIRLDPKTGLPSVLEEQPSKKPAQADSSETDEDAEENTRPVRVTVSRSKDETPEEKKARKQAVKAERQARRSDKKATKEQFSKATRQQSQSLAQREKTKMKKL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.51
2	0.52
3	0.52
4	0.51
5	0.49
6	0.46
7	0.47
8	0.47
9	0.53
10	0.51
11	0.47
12	0.52
13	0.52
14	0.48
15	0.5
16	0.5
17	0.48
18	0.48
19	0.46
20	0.38
21	0.31
22	0.36
23	0.36
24	0.35
25	0.34
26	0.39
27	0.44
28	0.46
29	0.46
30	0.46
31	0.5
32	0.51
33	0.52
34	0.47
35	0.43
36	0.44
37	0.45
38	0.41
39	0.38
40	0.38
41	0.33
42	0.35
43	0.32
44	0.29
45	0.26
46	0.23
47	0.18
48	0.16
49	0.17
50	0.14
51	0.18
52	0.21
53	0.22
54	0.26
55	0.32
56	0.32
57	0.33
58	0.34
59	0.3
60	0.26
61	0.26
62	0.23
63	0.16
64	0.14
65	0.1
66	0.07
67	0.07
68	0.06
69	0.06
70	0.07
71	0.08
72	0.09
73	0.1
74	0.11
75	0.11
76	0.17
77	0.18
78	0.18
79	0.18
80	0.17
81	0.2
82	0.23
83	0.24
84	0.19
85	0.18
86	0.17
87	0.17
88	0.18
89	0.15
90	0.11
91	0.08
92	0.08
93	0.1
94	0.1
95	0.09
96	0.09
97	0.12
98	0.16
99	0.19
100	0.22
101	0.26
102	0.36
103	0.45
104	0.52
105	0.56
106	0.61
107	0.61
108	0.64
109	0.6
110	0.52
111	0.47
112	0.4
113	0.34
114	0.28
115	0.24
116	0.18
117	0.16
118	0.14
119	0.09
120	0.09
121	0.08
122	0.08
123	0.12
124	0.14
125	0.2
126	0.24
127	0.28
128	0.31
129	0.35
130	0.35
131	0.36
132	0.36
133	0.32
134	0.31
135	0.27
136	0.24
137	0.2
138	0.18
139	0.14
140	0.13
141	0.12
142	0.09
143	0.08
144	0.08
145	0.09
146	0.09
147	0.12
148	0.13
149	0.13
150	0.13
151	0.17
152	0.17
153	0.15
154	0.16
155	0.14
156	0.13
157	0.13
158	0.13
159	0.09
160	0.09
161	0.09
162	0.08
163	0.07
164	0.05
165	0.05
166	0.03
167	0.04
168	0.04
169	0.04
170	0.04
171	0.04
172	0.04
173	0.04
174	0.04
175	0.04
176	0.03
177	0.04
178	0.05
179	0.04
180	0.04
181	0.05
182	0.05
183	0.05
184	0.05
185	0.04
186	0.04
187	0.05
188	0.06
189	0.06
190	0.08
191	0.07
192	0.07
193	0.08
194	0.08
195	0.07
196	0.08
197	0.08
198	0.07
199	0.06
200	0.07
201	0.07
202	0.06
203	0.06
204	0.06
205	0.05
206	0.04
207	0.04
208	0.04
209	0.04
210	0.04
211	0.04
212	0.04
213	0.04
214	0.04
215	0.05
216	0.06
217	0.07
218	0.07
219	0.07
220	0.09
221	0.08
222	0.09
223	0.14
224	0.13
225	0.22
226	0.31
227	0.39
228	0.43
229	0.51
230	0.53
231	0.55
232	0.66
233	0.64
234	0.58
235	0.52
236	0.48
237	0.41
238	0.41
239	0.34
240	0.24
241	0.16
242	0.13
243	0.11
244	0.1
245	0.09
246	0.06
247	0.05
248	0.03
249	0.03
250	0.03
251	0.03
252	0.04
253	0.04
254	0.04
255	0.04
256	0.04
257	0.04
258	0.04
259	0.04
260	0.06
261	0.07
262	0.14
263	0.21
264	0.28
265	0.36
266	0.41
267	0.5
268	0.51
269	0.54
270	0.57
271	0.61
272	0.62
273	0.59
274	0.54
275	0.49
276	0.46
277	0.41
278	0.32
279	0.21
280	0.13
281	0.09
282	0.09
283	0.08
284	0.12
285	0.13
286	0.13
287	0.15
288	0.16
289	0.17
290	0.16
291	0.17
292	0.15
293	0.15
294	0.15
295	0.12
296	0.12
297	0.13
298	0.13
299	0.12
300	0.11
301	0.14
302	0.14
303	0.15
304	0.15
305	0.14
306	0.15
307	0.15
308	0.15
309	0.12
310	0.11
311	0.11
312	0.1
313	0.1
314	0.09
315	0.08
316	0.07
317	0.06
318	0.05
319	0.05
320	0.06
321	0.05
322	0.05
323	0.05
324	0.05
325	0.05
326	0.05
327	0.05
328	0.04
329	0.06
330	0.06
331	0.06
332	0.06
333	0.06
334	0.08
335	0.07
336	0.08
337	0.06
338	0.06
339	0.06
340	0.06
341	0.07
342	0.05
343	0.05
344	0.08
345	0.09
346	0.1
347	0.14
348	0.14
349	0.16
350	0.19
351	0.19
352	0.18
353	0.19
354	0.2
355	0.17
356	0.23
357	0.25
358	0.25
359	0.26
360	0.25
361	0.24
362	0.23
363	0.26
364	0.2
365	0.18
366	0.16
367	0.15
368	0.17
369	0.2
370	0.25
371	0.28
372	0.29
373	0.32
374	0.34
375	0.34
376	0.32
377	0.29
378	0.25
379	0.19
380	0.2
381	0.16
382	0.13
383	0.13
384	0.13
385	0.11
386	0.1
387	0.08
388	0.06
389	0.05
390	0.04
391	0.04
392	0.08
393	0.08
394	0.11
395	0.14
396	0.15
397	0.21
398	0.25
399	0.26
400	0.27
401	0.31
402	0.29
403	0.31
404	0.35
405	0.3
406	0.28
407	0.28
408	0.24
409	0.21
410	0.22
411	0.17
412	0.14
413	0.19
414	0.18
415	0.22
416	0.24
417	0.25
418	0.27
419	0.33
420	0.4
421	0.45
422	0.51
423	0.55
424	0.59
425	0.62
426	0.67
427	0.7
428	0.65
429	0.59
430	0.61
431	0.62
432	0.64
433	0.63
434	0.59
435	0.56
436	0.6
437	0.56
438	0.48
439	0.4
440	0.35
441	0.33
442	0.34
443	0.3
444	0.23
445	0.26
446	0.32
447	0.34
448	0.32
449	0.31
450	0.3
451	0.32
452	0.38
453	0.38
454	0.38
455	0.38
456	0.43
457	0.41
458	0.37
459	0.34
460	0.26
461	0.22
462	0.18
463	0.16
464	0.11
465	0.12
466	0.13
467	0.13
468	0.13
469	0.14
470	0.17
471	0.19
472	0.27
473	0.35
474	0.42
475	0.46
476	0.5
477	0.52
478	0.52
479	0.55
480	0.56
481	0.54
482	0.57
483	0.6
484	0.63
485	0.68
486	0.72
487	0.75
488	0.73
489	0.73
490	0.72
491	0.75
492	0.78
493	0.81
494	0.82
495	0.79
496	0.77
497	0.8
498	0.8
499	0.78
500	0.74
501	0.75
502	0.74
503	0.76
504	0.81
505	0.8
506	0.8
507	0.78
508	0.79
509	0.78
510	0.75
511	0.75
512	0.72
513	0.75
514	0.72
515	0.7
516	0.68
517	0.64
518	0.67
519	0.67
520	0.68
521	0.65
522	0.62
523	0.66
524	0.68
525	0.72

A0A5C2SPK2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer