Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C2SPB8

Protein Details
Accession A0A5C2SPB8    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
9-31SWAERAKKGHNAKSQQPPPRPGSHydrophilic
294-316GPPRTQHARQRSQNPDRNNRQMGHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 11.5, mito 10, cyto_nucl 9, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045180  La_dom_prot  
IPR006630  La_HTH  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF05383  La  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50961  HTH_LA  
CDD cd07323  LAM  
Amino Acid Sequences MVAPNQPLSWAERAKKGHNAKSQQPPPRPGSQSTSEAFPAASSSSTARPSPTVSPSIHKAPSGNGSSNARILPFNSHTSPPSSSKTAPLPSAITAPKPNGDVNHHGDSSSSGPSTTSAQKQTAAPPVNVWNIRKEQMARASMQSRPTASQSSASAPMSPPSSSQEPSPTPILPTPASTDPPASSHPAATSSTGAVPPTTNGHLAPHPNTVKYDDPFVVKPGRSPSSVNISPPAIDDKESWPEVGHTVATPPNGKEVREEDVRGHEREPSQGHGSKKSEKPKWVAVPPEELHFEGPPRTQHARQRSQNPDRNNRQMGSSSAGASSSSGHASQQQSRTHSAAGRRHTPSHAGSVSHSQAQSRTGSVHSSPRHPTIRGGGRRLPDDSSSVYGANRSLRSSNANSPATYAQPQPLPIQEFIPGGRSYAGTNFTQGSRDPPALSAIPDSAISELNPHAAYFPPPPPQFGVSPYHSPRPAGSPANNPYPLPPMPYPGPGQPGMPPIPMPGYGTPPYPMYPPYGYYGSPYMYWSPPGAPPAMSSPMTNGQPPDGVPPPTMMARPPPPGESDAVAGYRDVGFTLPPAAEVQHDIGEERGRRVRELSFGSITVGVDELGKTPSPELLTQGLGAVPEGAALGLDVSGGQAHVPAREEGTSTSQEEGAIGESKTFTVFSVGIAPGEPGPARLRSRTRTQSRGAVASVSAPAMIPSPSKEADQGDAPAEDPVVRLADAAARIIDLTDSDTKYEFGTTKQADTASGSSSGPALPVPSEVSVVEASIGPASIPVFVPQYAPPYVPPVTIPGGPVPGIPTAPSPSAYAPRQPLSAPAEDEWEVRDYGYGFGRGGPPQVYPQATAPPNDNRHYRDREERQQHYGRPRRGSYGQGGYGYERGGERGSYGGRRGRGLDGGYRGRGYGGRGYSGRGGYSGQQRQQAYVPPAQPQPEINGYYAPPMPALATYIPPPYDPYAYSTYAQPPPQPVPASNSQSVSPPVPAPQTSVGFPLDATRYWLLGQLEYYLSAQNLAQDFWLRQQMDSRGWIPISLIASFNRVRALTTEMHLVVEVLMLSSLVEVKGSHVRMRQWQQYVLPTAPVSSVPEDDATPQSPAAYDGQYAHAPVHTQEEGHYEAQQNHDGDEDEEEDVVFVM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.58
3 0.63
4 0.65
5 0.68
6 0.71
7 0.72
8 0.78
9 0.82
10 0.82
11 0.82
12 0.8
13 0.76
14 0.78
15 0.74
16 0.68
17 0.65
18 0.61
19 0.58
20 0.52
21 0.5
22 0.41
23 0.37
24 0.31
25 0.24
26 0.2
27 0.15
28 0.13
29 0.11
30 0.13
31 0.16
32 0.2
33 0.21
34 0.22
35 0.23
36 0.26
37 0.3
38 0.33
39 0.34
40 0.34
41 0.38
42 0.42
43 0.47
44 0.45
45 0.41
46 0.37
47 0.36
48 0.42
49 0.41
50 0.39
51 0.36
52 0.39
53 0.4
54 0.41
55 0.38
56 0.31
57 0.27
58 0.25
59 0.28
60 0.27
61 0.31
62 0.31
63 0.33
64 0.34
65 0.37
66 0.41
67 0.38
68 0.39
69 0.39
70 0.37
71 0.4
72 0.45
73 0.45
74 0.42
75 0.4
76 0.36
77 0.32
78 0.37
79 0.34
80 0.31
81 0.31
82 0.32
83 0.31
84 0.31
85 0.32
86 0.3
87 0.35
88 0.37
89 0.4
90 0.43
91 0.41
92 0.38
93 0.36
94 0.34
95 0.3
96 0.26
97 0.2
98 0.14
99 0.14
100 0.15
101 0.2
102 0.23
103 0.27
104 0.28
105 0.3
106 0.33
107 0.35
108 0.39
109 0.44
110 0.42
111 0.36
112 0.35
113 0.38
114 0.43
115 0.45
116 0.42
117 0.39
118 0.4
119 0.42
120 0.43
121 0.41
122 0.4
123 0.43
124 0.45
125 0.41
126 0.42
127 0.44
128 0.43
129 0.45
130 0.41
131 0.35
132 0.34
133 0.35
134 0.33
135 0.31
136 0.3
137 0.28
138 0.29
139 0.3
140 0.28
141 0.26
142 0.23
143 0.25
144 0.24
145 0.22
146 0.19
147 0.21
148 0.24
149 0.23
150 0.25
151 0.3
152 0.3
153 0.33
154 0.35
155 0.3
156 0.29
157 0.3
158 0.32
159 0.25
160 0.25
161 0.26
162 0.26
163 0.28
164 0.26
165 0.26
166 0.23
167 0.24
168 0.25
169 0.26
170 0.24
171 0.22
172 0.22
173 0.22
174 0.22
175 0.21
176 0.2
177 0.16
178 0.16
179 0.16
180 0.16
181 0.14
182 0.13
183 0.13
184 0.15
185 0.16
186 0.15
187 0.14
188 0.17
189 0.21
190 0.25
191 0.26
192 0.31
193 0.32
194 0.32
195 0.33
196 0.35
197 0.36
198 0.32
199 0.34
200 0.28
201 0.29
202 0.29
203 0.31
204 0.33
205 0.28
206 0.3
207 0.33
208 0.34
209 0.32
210 0.33
211 0.34
212 0.37
213 0.39
214 0.37
215 0.33
216 0.3
217 0.29
218 0.28
219 0.28
220 0.2
221 0.19
222 0.2
223 0.2
224 0.25
225 0.25
226 0.24
227 0.2
228 0.2
229 0.19
230 0.18
231 0.15
232 0.09
233 0.11
234 0.13
235 0.15
236 0.16
237 0.16
238 0.23
239 0.24
240 0.24
241 0.26
242 0.26
243 0.3
244 0.31
245 0.32
246 0.26
247 0.34
248 0.38
249 0.36
250 0.33
251 0.33
252 0.3
253 0.34
254 0.34
255 0.29
256 0.32
257 0.35
258 0.37
259 0.4
260 0.44
261 0.48
262 0.53
263 0.58
264 0.58
265 0.6
266 0.62
267 0.64
268 0.67
269 0.64
270 0.64
271 0.57
272 0.58
273 0.52
274 0.49
275 0.42
276 0.35
277 0.3
278 0.24
279 0.23
280 0.17
281 0.19
282 0.18
283 0.22
284 0.27
285 0.31
286 0.39
287 0.47
288 0.55
289 0.6
290 0.68
291 0.73
292 0.78
293 0.8
294 0.81
295 0.81
296 0.8
297 0.81
298 0.76
299 0.66
300 0.58
301 0.52
302 0.45
303 0.38
304 0.31
305 0.23
306 0.18
307 0.17
308 0.15
309 0.13
310 0.12
311 0.09
312 0.09
313 0.08
314 0.09
315 0.14
316 0.18
317 0.23
318 0.29
319 0.32
320 0.34
321 0.37
322 0.38
323 0.35
324 0.35
325 0.37
326 0.37
327 0.38
328 0.43
329 0.43
330 0.44
331 0.44
332 0.45
333 0.39
334 0.39
335 0.35
336 0.28
337 0.27
338 0.29
339 0.29
340 0.28
341 0.26
342 0.21
343 0.2
344 0.21
345 0.2
346 0.16
347 0.16
348 0.13
349 0.15
350 0.16
351 0.23
352 0.23
353 0.28
354 0.31
355 0.36
356 0.39
357 0.37
358 0.37
359 0.38
360 0.45
361 0.46
362 0.47
363 0.45
364 0.45
365 0.46
366 0.45
367 0.39
368 0.3
369 0.27
370 0.23
371 0.21
372 0.19
373 0.17
374 0.16
375 0.14
376 0.15
377 0.16
378 0.16
379 0.15
380 0.15
381 0.16
382 0.21
383 0.24
384 0.29
385 0.33
386 0.33
387 0.32
388 0.33
389 0.33
390 0.3
391 0.28
392 0.23
393 0.17
394 0.17
395 0.19
396 0.18
397 0.19
398 0.2
399 0.18
400 0.18
401 0.17
402 0.17
403 0.15
404 0.18
405 0.14
406 0.12
407 0.12
408 0.12
409 0.1
410 0.12
411 0.15
412 0.11
413 0.13
414 0.13
415 0.13
416 0.14
417 0.13
418 0.15
419 0.15
420 0.16
421 0.15
422 0.15
423 0.17
424 0.16
425 0.16
426 0.14
427 0.11
428 0.1
429 0.1
430 0.1
431 0.08
432 0.07
433 0.07
434 0.07
435 0.07
436 0.08
437 0.08
438 0.08
439 0.08
440 0.08
441 0.11
442 0.12
443 0.15
444 0.21
445 0.22
446 0.23
447 0.24
448 0.26
449 0.25
450 0.25
451 0.27
452 0.22
453 0.29
454 0.3
455 0.33
456 0.31
457 0.31
458 0.28
459 0.28
460 0.29
461 0.26
462 0.27
463 0.29
464 0.33
465 0.38
466 0.38
467 0.34
468 0.31
469 0.31
470 0.28
471 0.26
472 0.22
473 0.2
474 0.2
475 0.23
476 0.23
477 0.2
478 0.23
479 0.19
480 0.2
481 0.17
482 0.2
483 0.18
484 0.17
485 0.15
486 0.13
487 0.13
488 0.13
489 0.13
490 0.1
491 0.13
492 0.14
493 0.15
494 0.15
495 0.15
496 0.15
497 0.14
498 0.14
499 0.13
500 0.13
501 0.14
502 0.16
503 0.16
504 0.16
505 0.16
506 0.17
507 0.14
508 0.14
509 0.14
510 0.13
511 0.12
512 0.13
513 0.12
514 0.12
515 0.12
516 0.13
517 0.12
518 0.1
519 0.1
520 0.12
521 0.15
522 0.14
523 0.12
524 0.13
525 0.16
526 0.17
527 0.17
528 0.15
529 0.12
530 0.12
531 0.12
532 0.14
533 0.13
534 0.13
535 0.12
536 0.13
537 0.13
538 0.14
539 0.14
540 0.11
541 0.12
542 0.15
543 0.17
544 0.18
545 0.18
546 0.18
547 0.19
548 0.2
549 0.17
550 0.14
551 0.12
552 0.11
553 0.11
554 0.09
555 0.08
556 0.07
557 0.06
558 0.05
559 0.04
560 0.04
561 0.04
562 0.05
563 0.04
564 0.05
565 0.05
566 0.05
567 0.05
568 0.06
569 0.07
570 0.07
571 0.07
572 0.07
573 0.08
574 0.1
575 0.11
576 0.12
577 0.15
578 0.14
579 0.15
580 0.17
581 0.17
582 0.19
583 0.21
584 0.22
585 0.19
586 0.19
587 0.19
588 0.17
589 0.16
590 0.12
591 0.09
592 0.06
593 0.05
594 0.05
595 0.05
596 0.05
597 0.06
598 0.06
599 0.06
600 0.07
601 0.08
602 0.08
603 0.1
604 0.1
605 0.11
606 0.1
607 0.1
608 0.09
609 0.08
610 0.07
611 0.05
612 0.03
613 0.03
614 0.03
615 0.03
616 0.02
617 0.02
618 0.02
619 0.02
620 0.02
621 0.02
622 0.02
623 0.02
624 0.02
625 0.02
626 0.04
627 0.04
628 0.05
629 0.07
630 0.07
631 0.08
632 0.08
633 0.09
634 0.09
635 0.12
636 0.13
637 0.13
638 0.13
639 0.13
640 0.12
641 0.12
642 0.11
643 0.08
644 0.08
645 0.07
646 0.07
647 0.07
648 0.07
649 0.07
650 0.07
651 0.06
652 0.06
653 0.06
654 0.06
655 0.09
656 0.09
657 0.09
658 0.09
659 0.09
660 0.08
661 0.08
662 0.08
663 0.06
664 0.08
665 0.13
666 0.14
667 0.19
668 0.24
669 0.27
670 0.36
671 0.44
672 0.49
673 0.51
674 0.53
675 0.55
676 0.52
677 0.5
678 0.42
679 0.32
680 0.26
681 0.21
682 0.18
683 0.11
684 0.08
685 0.06
686 0.06
687 0.06
688 0.06
689 0.06
690 0.07
691 0.1
692 0.11
693 0.11
694 0.13
695 0.13
696 0.14
697 0.15
698 0.15
699 0.13
700 0.12
701 0.12
702 0.1
703 0.09
704 0.08
705 0.07
706 0.06
707 0.06
708 0.05
709 0.05
710 0.05
711 0.07
712 0.07
713 0.07
714 0.06
715 0.06
716 0.06
717 0.06
718 0.05
719 0.04
720 0.07
721 0.1
722 0.1
723 0.11
724 0.12
725 0.12
726 0.13
727 0.14
728 0.12
729 0.1
730 0.17
731 0.18
732 0.18
733 0.19
734 0.19
735 0.18
736 0.19
737 0.19
738 0.13
739 0.13
740 0.12
741 0.11
742 0.11
743 0.11
744 0.09
745 0.08
746 0.06
747 0.05
748 0.06
749 0.07
750 0.07
751 0.08
752 0.08
753 0.09
754 0.09
755 0.08
756 0.08
757 0.07
758 0.07
759 0.06
760 0.06
761 0.04
762 0.04
763 0.05
764 0.05
765 0.05
766 0.06
767 0.07
768 0.08
769 0.09
770 0.1
771 0.14
772 0.14
773 0.14
774 0.14
775 0.17
776 0.18
777 0.16
778 0.16
779 0.16
780 0.17
781 0.17
782 0.17
783 0.14
784 0.14
785 0.14
786 0.14
787 0.12
788 0.1
789 0.1
790 0.09
791 0.1
792 0.11
793 0.12
794 0.13
795 0.13
796 0.14
797 0.2
798 0.21
799 0.24
800 0.26
801 0.27
802 0.27
803 0.25
804 0.29
805 0.27
806 0.28
807 0.26
808 0.22
809 0.24
810 0.23
811 0.24
812 0.2
813 0.17
814 0.15
815 0.12
816 0.13
817 0.1
818 0.11
819 0.12
820 0.12
821 0.1
822 0.12
823 0.14
824 0.14
825 0.16
826 0.14
827 0.14
828 0.16
829 0.2
830 0.2
831 0.19
832 0.2
833 0.25
834 0.26
835 0.26
836 0.28
837 0.32
838 0.36
839 0.39
840 0.42
841 0.4
842 0.46
843 0.52
844 0.53
845 0.55
846 0.59
847 0.65
848 0.69
849 0.7
850 0.7
851 0.7
852 0.72
853 0.72
854 0.73
855 0.7
856 0.68
857 0.65
858 0.63
859 0.59
860 0.58
861 0.54
862 0.51
863 0.46
864 0.4
865 0.39
866 0.33
867 0.31
868 0.26
869 0.2
870 0.14
871 0.12
872 0.11
873 0.1
874 0.09
875 0.11
876 0.14
877 0.15
878 0.2
879 0.23
880 0.24
881 0.26
882 0.28
883 0.27
884 0.28
885 0.27
886 0.28
887 0.3
888 0.32
889 0.32
890 0.3
891 0.28
892 0.25
893 0.25
894 0.22
895 0.22
896 0.19
897 0.21
898 0.22
899 0.24
900 0.27
901 0.26
902 0.24
903 0.18
904 0.18
905 0.2
906 0.29
907 0.33
908 0.33
909 0.39
910 0.39
911 0.41
912 0.42
913 0.44
914 0.39
915 0.39
916 0.37
917 0.35
918 0.38
919 0.39
920 0.37
921 0.31
922 0.31
923 0.3
924 0.3
925 0.26
926 0.25
927 0.23
928 0.25
929 0.25
930 0.2
931 0.15
932 0.13
933 0.12
934 0.1
935 0.12
936 0.1
937 0.11
938 0.13
939 0.15
940 0.16
941 0.16
942 0.19
943 0.19
944 0.2
945 0.19
946 0.22
947 0.24
948 0.26
949 0.27
950 0.27
951 0.31
952 0.34
953 0.36
954 0.33
955 0.34
956 0.35
957 0.39
958 0.39
959 0.34
960 0.35
961 0.41
962 0.45
963 0.43
964 0.41
965 0.36
966 0.36
967 0.37
968 0.32
969 0.26
970 0.21
971 0.21
972 0.23
973 0.23
974 0.24
975 0.26
976 0.26
977 0.25
978 0.26
979 0.24
980 0.2
981 0.2
982 0.2
983 0.17
984 0.15
985 0.19
986 0.17
987 0.17
988 0.17
989 0.22
990 0.19
991 0.18
992 0.18
993 0.16
994 0.15
995 0.16
996 0.16
997 0.13
998 0.12
999 0.12
1000 0.11
1001 0.14
1002 0.14
1003 0.13
1004 0.13
1005 0.15
1006 0.16
1007 0.19
1008 0.26
1009 0.22
1010 0.22
1011 0.28
1012 0.32
1013 0.33
1014 0.37
1015 0.35
1016 0.31
1017 0.31
1018 0.3
1019 0.25
1020 0.24
1021 0.22
1022 0.18
1023 0.18
1024 0.15
1025 0.2
1026 0.21
1027 0.21
1028 0.2
1029 0.19
1030 0.18
1031 0.19
1032 0.23
1033 0.21
1034 0.21
1035 0.26
1036 0.22
1037 0.23
1038 0.22
1039 0.2
1040 0.15
1041 0.13
1042 0.11
1043 0.06
1044 0.05
1045 0.05
1046 0.05
1047 0.05
1048 0.06
1049 0.05
1050 0.06
1051 0.06
1052 0.09
1053 0.16
1054 0.19
1055 0.23
1056 0.27
1057 0.32
1058 0.41
1059 0.5
1060 0.55
1061 0.53
1062 0.56
1063 0.56
1064 0.58
1065 0.59
1066 0.5
1067 0.45
1068 0.36
1069 0.32
1070 0.28
1071 0.25
1072 0.21
1073 0.18
1074 0.18
1075 0.17
1076 0.18
1077 0.18
1078 0.2
1079 0.23
1080 0.21
1081 0.2
1082 0.19
1083 0.17
1084 0.16
1085 0.18
1086 0.18
1087 0.15
1088 0.15
1089 0.15
1090 0.19
1091 0.2
1092 0.2
1093 0.19
1094 0.17
1095 0.17
1096 0.16
1097 0.21
1098 0.18
1099 0.17
1100 0.18
1101 0.21
1102 0.24
1103 0.24
1104 0.27
1105 0.25
1106 0.27
1107 0.31
1108 0.36
1109 0.32
1110 0.28
1111 0.29
1112 0.26
1113 0.23
1114 0.23
1115 0.21
1116 0.15
1117 0.15
1118 0.14