Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C2S6E0

Protein Details
Accession A0A5C2S6E0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
20-44EDSNEKAPRRKIRKLVPPRPFPTVPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
12-36RKRKREEVEDSNEKAPRRKIRKLVP
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 15, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036882  Alba-like_dom_sf  
IPR014612  Pop7/Rpp20  
Gene Ontology GO:0005655  C:nucleolar ribonuclease P complex  
GO:0000172  C:ribonuclease MRP complex  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0004526  F:ribonuclease P activity  
GO:0001682  P:tRNA 5'-leader removal  
Pfam View protein in Pfam  
PF12328  Rpp20  
Amino Acid Sequences MDAESPVQSASRKRKREEVEDSNEKAPRRKIRKLVPPRPFPTVPASVSATGPRSAHTEGKNYICITRRTELGAYLTRCKDVLIKDGYKSLHLSAMGAAIPHLMQLALSLPPILPFPQDEIHTEILTGTVEVQDEVIPDDEDEDISYRTRGKSTVSVTIKVGDGVDEPVAGPVRGSGRKNKLNHGASSGGQTNAKRKQGGQSGDKGSVQVTEQIVIREDELDDET
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.62
2 0.68
3 0.75
4 0.76
5 0.75
6 0.75
7 0.76
8 0.75
9 0.71
10 0.67
11 0.59
12 0.56
13 0.54
14 0.55
15 0.55
16 0.61
17 0.64
18 0.71
19 0.8
20 0.85
21 0.86
22 0.86
23 0.87
24 0.82
25 0.81
26 0.71
27 0.63
28 0.58
29 0.53
30 0.44
31 0.37
32 0.36
33 0.29
34 0.29
35 0.29
36 0.24
37 0.21
38 0.2
39 0.18
40 0.19
41 0.2
42 0.25
43 0.25
44 0.28
45 0.3
46 0.33
47 0.35
48 0.32
49 0.33
50 0.31
51 0.32
52 0.31
53 0.3
54 0.28
55 0.27
56 0.27
57 0.24
58 0.24
59 0.27
60 0.25
61 0.29
62 0.28
63 0.26
64 0.25
65 0.24
66 0.23
67 0.19
68 0.23
69 0.23
70 0.24
71 0.25
72 0.28
73 0.28
74 0.26
75 0.26
76 0.2
77 0.16
78 0.14
79 0.13
80 0.09
81 0.1
82 0.09
83 0.07
84 0.06
85 0.05
86 0.04
87 0.04
88 0.04
89 0.03
90 0.02
91 0.03
92 0.04
93 0.04
94 0.04
95 0.04
96 0.04
97 0.05
98 0.05
99 0.05
100 0.05
101 0.05
102 0.07
103 0.09
104 0.1
105 0.11
106 0.14
107 0.15
108 0.15
109 0.15
110 0.12
111 0.11
112 0.1
113 0.08
114 0.05
115 0.04
116 0.04
117 0.04
118 0.04
119 0.04
120 0.04
121 0.05
122 0.06
123 0.05
124 0.05
125 0.06
126 0.06
127 0.06
128 0.06
129 0.06
130 0.06
131 0.07
132 0.08
133 0.09
134 0.1
135 0.11
136 0.12
137 0.13
138 0.19
139 0.21
140 0.3
141 0.31
142 0.32
143 0.32
144 0.33
145 0.3
146 0.24
147 0.21
148 0.12
149 0.1
150 0.09
151 0.09
152 0.07
153 0.07
154 0.08
155 0.09
156 0.08
157 0.07
158 0.08
159 0.13
160 0.18
161 0.21
162 0.28
163 0.36
164 0.45
165 0.48
166 0.54
167 0.59
168 0.59
169 0.58
170 0.53
171 0.48
172 0.4
173 0.42
174 0.37
175 0.29
176 0.27
177 0.28
178 0.31
179 0.36
180 0.4
181 0.37
182 0.37
183 0.44
184 0.49
185 0.55
186 0.53
187 0.54
188 0.54
189 0.55
190 0.54
191 0.45
192 0.37
193 0.31
194 0.26
195 0.22
196 0.18
197 0.17
198 0.18
199 0.18
200 0.2
201 0.19
202 0.18
203 0.14
204 0.14