Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C2SLF1

Protein Details
Accession A0A5C2SLF1    Localization Confidence Low Confidence Score 6.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
743-763ASPGVRCPKKRKQTEMFWIEKHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto 9.5, cyto_nucl 8.5, nucl 6.5, plas 3, mito 2, extr 2, pero 2, E.R. 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012310  DNA_ligase_ATP-dep_cent  
IPR016059  DNA_ligase_ATP-dep_CS  
IPR012308  DNA_ligase_ATP-dep_N  
IPR036599  DNA_ligase_N_sf  
IPR029710  LIG4  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003910  F:DNA ligase (ATP) activity  
GO:0051103  P:DNA ligation involved in DNA repair  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006260  P:DNA replication  
Pfam View protein in Pfam  
PF01068  DNA_ligase_A_M  
PF04675  DNA_ligase_A_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00697  DNA_LIGASE_A1  
PS50160  DNA_LIGASE_A3  
Amino Acid Sequences MSALPDDDGIPFSFFVELVDAIADIRPHKVSEKQSRTTRYVETPAYKTFRRWVERFRERYSPLPPDTTAIVFRLLFPDEDVKRKYGLQETRLAQHLVKILGVSSATQCRGERLRNWQQEDTMGCLGDEVKDVMLGTAHSQASTVAVTIAQVDALLTELAAKSAYSHSAVHASFSATNSPRRSREAILTTLYHSLSPNECAVVTQIILKDLRPILYPIPRSANHPTIALLHYNSTAVTPLSKESAMRAWDPSGRMSVIFRSRANIEDAAQTYERLKPGDAMPDPVCGTPIQVRIPKCSKGLGCVQALKLLRGADKVWVETKYDGERAQIHLRLDEAGDPHIKIYSKSGRESTLDRAGIHDIVCDALGISRQPSTGDGQADEPSLKQDIVVEAEMVAFSETTNRIDEFWRIRSLIASTAIGVRHKTPPPAPSTAEGMDSQCSMISNGSDGGTRHLALVFFDILLLDGTSLLSFPYSERRAVLERVIRTTPGYSMLAERTCIDMKHGDPADALRKTFATLVADYQEGAVLKADGAQYGEWRLPWVKLKRDYIDGYGDTVDLVLLGAAWDKDRARELRVSPTVYTTFYFGLLANADDCKSNPSSRPLFEVVFTSAYGLSRQQLEQVNFMIKSMDAVPYSARVCKDVIEQLPYAFNLCPNLPQPAVLLQKPLLAELFGAGFSKAQGSMFYELRFPRVSKVHRPSERPWSDGITLQEYQQIARAAVGRDRPGKAEDDWAKTIFRPDEPASPGVRCPKKRKQTEMFWIEKLEVADGKTRSGGSPSKRARPDTAATRRKANGVGNTENIANGGEGMIDENAPDTGTESLRSRLGLACLTSVTNVAVAAAVSSPIQHLSGTSVDVLPRVYPSSTTPVRDLPKSMDKTLRRASLGQAPPPVATPGVPLPQTPPLTTMKPARQGPQPTLILKAEDVEGRLDLGAPLASPVTLHRFLQDSVVWLARPHGTARPLWRAPSHSVVPTGNHVNTLDAVMIACGWDSTPPCGWAKRGVIFVDVSEQAQGFLKNTLNELASRRAALLERKMTARCKPILILNMKMLAYDALDETLTADEVEARAICRFG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.11
3 0.11
4 0.1
5 0.09
6 0.09
7 0.08
8 0.08
9 0.1
10 0.1
11 0.09
12 0.12
13 0.14
14 0.15
15 0.19
16 0.27
17 0.36
18 0.46
19 0.54
20 0.6
21 0.68
22 0.73
23 0.74
24 0.71
25 0.67
26 0.62
27 0.6
28 0.59
29 0.57
30 0.54
31 0.57
32 0.58
33 0.54
34 0.51
35 0.52
36 0.54
37 0.56
38 0.57
39 0.6
40 0.65
41 0.73
42 0.77
43 0.75
44 0.75
45 0.7
46 0.71
47 0.69
48 0.67
49 0.6
50 0.57
51 0.52
52 0.45
53 0.43
54 0.39
55 0.33
56 0.25
57 0.25
58 0.2
59 0.2
60 0.2
61 0.19
62 0.17
63 0.17
64 0.24
65 0.25
66 0.32
67 0.34
68 0.33
69 0.33
70 0.35
71 0.38
72 0.39
73 0.44
74 0.41
75 0.47
76 0.49
77 0.51
78 0.53
79 0.49
80 0.4
81 0.36
82 0.35
83 0.27
84 0.25
85 0.2
86 0.17
87 0.16
88 0.16
89 0.13
90 0.13
91 0.17
92 0.18
93 0.21
94 0.21
95 0.26
96 0.32
97 0.37
98 0.39
99 0.44
100 0.54
101 0.59
102 0.66
103 0.63
104 0.59
105 0.58
106 0.54
107 0.49
108 0.4
109 0.31
110 0.24
111 0.21
112 0.2
113 0.15
114 0.15
115 0.1
116 0.08
117 0.08
118 0.08
119 0.08
120 0.08
121 0.08
122 0.08
123 0.13
124 0.13
125 0.12
126 0.12
127 0.12
128 0.13
129 0.13
130 0.11
131 0.06
132 0.06
133 0.06
134 0.07
135 0.07
136 0.05
137 0.05
138 0.04
139 0.04
140 0.05
141 0.05
142 0.04
143 0.05
144 0.05
145 0.06
146 0.06
147 0.06
148 0.07
149 0.08
150 0.11
151 0.11
152 0.12
153 0.13
154 0.19
155 0.19
156 0.19
157 0.18
158 0.19
159 0.18
160 0.19
161 0.25
162 0.22
163 0.29
164 0.33
165 0.39
166 0.4
167 0.44
168 0.47
169 0.43
170 0.49
171 0.47
172 0.45
173 0.43
174 0.41
175 0.37
176 0.36
177 0.32
178 0.25
179 0.2
180 0.2
181 0.18
182 0.19
183 0.17
184 0.15
185 0.15
186 0.14
187 0.15
188 0.13
189 0.11
190 0.12
191 0.11
192 0.13
193 0.14
194 0.14
195 0.17
196 0.18
197 0.18
198 0.17
199 0.19
200 0.21
201 0.28
202 0.31
203 0.29
204 0.34
205 0.34
206 0.38
207 0.43
208 0.43
209 0.37
210 0.35
211 0.32
212 0.29
213 0.3
214 0.27
215 0.2
216 0.16
217 0.16
218 0.15
219 0.14
220 0.11
221 0.11
222 0.09
223 0.09
224 0.08
225 0.09
226 0.11
227 0.12
228 0.12
229 0.13
230 0.17
231 0.19
232 0.2
233 0.2
234 0.2
235 0.23
236 0.24
237 0.24
238 0.21
239 0.19
240 0.18
241 0.18
242 0.22
243 0.24
244 0.26
245 0.25
246 0.26
247 0.27
248 0.28
249 0.3
250 0.25
251 0.21
252 0.22
253 0.23
254 0.24
255 0.22
256 0.21
257 0.19
258 0.21
259 0.22
260 0.18
261 0.17
262 0.15
263 0.17
264 0.25
265 0.24
266 0.26
267 0.25
268 0.27
269 0.27
270 0.25
271 0.24
272 0.15
273 0.17
274 0.16
275 0.19
276 0.21
277 0.25
278 0.27
279 0.33
280 0.38
281 0.4
282 0.37
283 0.39
284 0.34
285 0.34
286 0.39
287 0.37
288 0.35
289 0.35
290 0.34
291 0.33
292 0.33
293 0.29
294 0.24
295 0.21
296 0.18
297 0.17
298 0.17
299 0.17
300 0.17
301 0.18
302 0.19
303 0.19
304 0.2
305 0.19
306 0.22
307 0.2
308 0.21
309 0.2
310 0.2
311 0.21
312 0.23
313 0.27
314 0.28
315 0.25
316 0.23
317 0.23
318 0.21
319 0.2
320 0.17
321 0.13
322 0.12
323 0.12
324 0.12
325 0.12
326 0.14
327 0.14
328 0.12
329 0.18
330 0.24
331 0.26
332 0.29
333 0.31
334 0.31
335 0.33
336 0.35
337 0.34
338 0.33
339 0.31
340 0.28
341 0.28
342 0.27
343 0.26
344 0.23
345 0.17
346 0.1
347 0.09
348 0.09
349 0.07
350 0.05
351 0.04
352 0.05
353 0.05
354 0.06
355 0.06
356 0.07
357 0.07
358 0.09
359 0.11
360 0.13
361 0.14
362 0.14
363 0.15
364 0.16
365 0.16
366 0.15
367 0.12
368 0.11
369 0.11
370 0.09
371 0.08
372 0.08
373 0.08
374 0.1
375 0.1
376 0.08
377 0.07
378 0.07
379 0.07
380 0.07
381 0.06
382 0.04
383 0.03
384 0.06
385 0.07
386 0.08
387 0.09
388 0.09
389 0.1
390 0.12
391 0.16
392 0.18
393 0.2
394 0.21
395 0.2
396 0.2
397 0.2
398 0.2
399 0.18
400 0.15
401 0.12
402 0.11
403 0.12
404 0.13
405 0.13
406 0.13
407 0.13
408 0.17
409 0.19
410 0.22
411 0.23
412 0.26
413 0.3
414 0.33
415 0.32
416 0.28
417 0.3
418 0.27
419 0.26
420 0.22
421 0.19
422 0.16
423 0.14
424 0.12
425 0.08
426 0.08
427 0.07
428 0.06
429 0.06
430 0.05
431 0.06
432 0.06
433 0.07
434 0.07
435 0.09
436 0.1
437 0.1
438 0.1
439 0.1
440 0.1
441 0.09
442 0.1
443 0.07
444 0.06
445 0.06
446 0.05
447 0.05
448 0.05
449 0.05
450 0.03
451 0.03
452 0.03
453 0.03
454 0.03
455 0.03
456 0.03
457 0.03
458 0.04
459 0.1
460 0.12
461 0.13
462 0.13
463 0.16
464 0.18
465 0.2
466 0.23
467 0.22
468 0.22
469 0.25
470 0.24
471 0.23
472 0.21
473 0.2
474 0.16
475 0.14
476 0.13
477 0.1
478 0.11
479 0.13
480 0.13
481 0.12
482 0.12
483 0.12
484 0.12
485 0.12
486 0.12
487 0.12
488 0.12
489 0.18
490 0.18
491 0.16
492 0.15
493 0.17
494 0.22
495 0.21
496 0.2
497 0.14
498 0.14
499 0.14
500 0.15
501 0.14
502 0.1
503 0.09
504 0.1
505 0.1
506 0.1
507 0.09
508 0.09
509 0.08
510 0.06
511 0.06
512 0.05
513 0.04
514 0.04
515 0.06
516 0.06
517 0.05
518 0.06
519 0.06
520 0.06
521 0.07
522 0.08
523 0.06
524 0.07
525 0.08
526 0.09
527 0.16
528 0.21
529 0.27
530 0.32
531 0.36
532 0.37
533 0.4
534 0.4
535 0.35
536 0.33
537 0.27
538 0.22
539 0.18
540 0.16
541 0.12
542 0.1
543 0.07
544 0.04
545 0.04
546 0.02
547 0.02
548 0.02
549 0.02
550 0.03
551 0.03
552 0.05
553 0.05
554 0.06
555 0.1
556 0.11
557 0.13
558 0.18
559 0.2
560 0.26
561 0.29
562 0.3
563 0.27
564 0.29
565 0.27
566 0.24
567 0.22
568 0.16
569 0.13
570 0.11
571 0.12
572 0.09
573 0.08
574 0.08
575 0.07
576 0.06
577 0.06
578 0.06
579 0.06
580 0.06
581 0.08
582 0.1
583 0.11
584 0.13
585 0.19
586 0.22
587 0.22
588 0.26
589 0.26
590 0.25
591 0.24
592 0.23
593 0.18
594 0.16
595 0.15
596 0.12
597 0.1
598 0.09
599 0.09
600 0.08
601 0.08
602 0.08
603 0.08
604 0.12
605 0.17
606 0.17
607 0.18
608 0.19
609 0.2
610 0.19
611 0.19
612 0.15
613 0.1
614 0.1
615 0.09
616 0.1
617 0.07
618 0.08
619 0.08
620 0.1
621 0.12
622 0.13
623 0.13
624 0.12
625 0.12
626 0.13
627 0.15
628 0.18
629 0.18
630 0.19
631 0.19
632 0.18
633 0.19
634 0.18
635 0.17
636 0.12
637 0.11
638 0.1
639 0.09
640 0.11
641 0.11
642 0.14
643 0.12
644 0.13
645 0.13
646 0.17
647 0.2
648 0.18
649 0.19
650 0.16
651 0.18
652 0.18
653 0.18
654 0.12
655 0.09
656 0.08
657 0.07
658 0.07
659 0.05
660 0.05
661 0.05
662 0.05
663 0.05
664 0.05
665 0.05
666 0.05
667 0.06
668 0.08
669 0.11
670 0.12
671 0.13
672 0.16
673 0.16
674 0.19
675 0.21
676 0.18
677 0.2
678 0.26
679 0.31
680 0.37
681 0.45
682 0.52
683 0.57
684 0.62
685 0.62
686 0.66
687 0.64
688 0.55
689 0.49
690 0.43
691 0.38
692 0.35
693 0.33
694 0.26
695 0.23
696 0.22
697 0.23
698 0.19
699 0.18
700 0.18
701 0.17
702 0.12
703 0.13
704 0.15
705 0.13
706 0.16
707 0.19
708 0.2
709 0.24
710 0.25
711 0.25
712 0.24
713 0.26
714 0.24
715 0.3
716 0.31
717 0.32
718 0.34
719 0.33
720 0.32
721 0.3
722 0.33
723 0.26
724 0.21
725 0.22
726 0.21
727 0.26
728 0.28
729 0.31
730 0.28
731 0.28
732 0.3
733 0.34
734 0.4
735 0.42
736 0.48
737 0.55
738 0.64
739 0.72
740 0.78
741 0.77
742 0.79
743 0.82
744 0.82
745 0.76
746 0.68
747 0.6
748 0.5
749 0.43
750 0.34
751 0.24
752 0.17
753 0.13
754 0.17
755 0.17
756 0.17
757 0.16
758 0.16
759 0.16
760 0.19
761 0.24
762 0.23
763 0.33
764 0.38
765 0.45
766 0.5
767 0.53
768 0.53
769 0.53
770 0.54
771 0.55
772 0.6
773 0.6
774 0.57
775 0.6
776 0.57
777 0.53
778 0.51
779 0.46
780 0.42
781 0.41
782 0.42
783 0.37
784 0.37
785 0.35
786 0.3
787 0.25
788 0.18
789 0.11
790 0.07
791 0.06
792 0.04
793 0.04
794 0.05
795 0.05
796 0.04
797 0.04
798 0.05
799 0.05
800 0.05
801 0.05
802 0.05
803 0.07
804 0.08
805 0.1
806 0.11
807 0.13
808 0.14
809 0.15
810 0.15
811 0.15
812 0.16
813 0.16
814 0.15
815 0.14
816 0.13
817 0.14
818 0.12
819 0.11
820 0.09
821 0.08
822 0.07
823 0.06
824 0.05
825 0.05
826 0.05
827 0.04
828 0.05
829 0.04
830 0.05
831 0.05
832 0.06
833 0.06
834 0.06
835 0.06
836 0.08
837 0.09
838 0.1
839 0.11
840 0.11
841 0.11
842 0.12
843 0.12
844 0.1
845 0.1
846 0.11
847 0.11
848 0.11
849 0.14
850 0.21
851 0.24
852 0.27
853 0.28
854 0.33
855 0.37
856 0.37
857 0.37
858 0.35
859 0.42
860 0.44
861 0.46
862 0.48
863 0.47
864 0.53
865 0.58
866 0.57
867 0.5
868 0.47
869 0.46
870 0.47
871 0.48
872 0.45
873 0.41
874 0.37
875 0.35
876 0.34
877 0.32
878 0.22
879 0.17
880 0.16
881 0.16
882 0.19
883 0.19
884 0.18
885 0.2
886 0.27
887 0.29
888 0.26
889 0.26
890 0.26
891 0.28
892 0.33
893 0.37
894 0.37
895 0.43
896 0.46
897 0.48
898 0.51
899 0.54
900 0.54
901 0.55
902 0.52
903 0.45
904 0.46
905 0.43
906 0.36
907 0.3
908 0.27
909 0.21
910 0.17
911 0.17
912 0.14
913 0.13
914 0.12
915 0.11
916 0.11
917 0.09
918 0.08
919 0.07
920 0.06
921 0.06
922 0.06
923 0.06
924 0.06
925 0.08
926 0.14
927 0.16
928 0.17
929 0.18
930 0.2
931 0.21
932 0.25
933 0.23
934 0.2
935 0.2
936 0.22
937 0.2
938 0.18
939 0.2
940 0.19
941 0.19
942 0.19
943 0.21
944 0.23
945 0.27
946 0.34
947 0.41
948 0.41
949 0.44
950 0.46
951 0.45
952 0.48
953 0.5
954 0.47
955 0.4
956 0.41
957 0.38
958 0.36
959 0.37
960 0.38
961 0.31
962 0.29
963 0.27
964 0.24
965 0.23
966 0.22
967 0.16
968 0.1
969 0.1
970 0.08
971 0.07
972 0.06
973 0.05
974 0.04
975 0.04
976 0.08
977 0.09
978 0.13
979 0.15
980 0.18
981 0.22
982 0.25
983 0.27
984 0.31
985 0.36
986 0.36
987 0.39
988 0.37
989 0.36
990 0.34
991 0.32
992 0.29
993 0.24
994 0.2
995 0.17
996 0.16
997 0.14
998 0.16
999 0.16
1000 0.12
1001 0.15
1002 0.18
1003 0.17
1004 0.19
1005 0.21
1006 0.2
1007 0.22
1008 0.25
1009 0.28
1010 0.26
1011 0.26
1012 0.25
1013 0.25
1014 0.28
1015 0.32
1016 0.36
1017 0.36
1018 0.38
1019 0.42
1020 0.46
1021 0.49
1022 0.52
1023 0.53
1024 0.48
1025 0.45
1026 0.45
1027 0.47
1028 0.52
1029 0.51
1030 0.49
1031 0.45
1032 0.46
1033 0.42
1034 0.39
1035 0.33
1036 0.24
1037 0.19
1038 0.16
1039 0.13
1040 0.09
1041 0.09
1042 0.09
1043 0.1
1044 0.1
1045 0.1
1046 0.08
1047 0.07
1048 0.08
1049 0.08
1050 0.1
1051 0.1
1052 0.1