FuNGI

A0A5C2STA9

Protein Details

Accession

A0A5C2STA9

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
9-28	LFNPKPSRPTLPKKESPAAN	Hydrophilic
55-76	TASPRPGPPRPAPLRRPPVKTE	Hydrophilic
186-211	ADDKGKEKGKGKKKFQKKTRQVFMIP	Basic
263-282	VPAHRWYKFRKQPSHHIIRD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
58-70	PRPGPPRPAPLRR
189-204	KGKEKGKGKKKFQKKT
611-617	RPKKRKA

Subcellular Location(s)

nucl 14, mito 11

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MAKKGAPTLFNPKPSRPTLPKKESPAANTPSPGSSQSLPNTQSQPETPKKPPVATASPRPGPPRPAPLRRPPVKTEDETAPQMPEGPFSEYRLVSSKLNGWKYDIMKFDSRKKVEINDWAKPVKLNRKDMHRDDSAAQGPKQAVAPMVGSDGKLVIGADGKVVMVDAQGKVVRDADAAAAAAAAAADDKGKEKGKGKKKFQKKTRQVFMIPEETRQLRREEKYPWVIEDAQKTEVWTAQMEEVAKSQTYAMFMPAAGDVFKFVPAHRWYKFRKQPSHHIIRDLNAIENYMSKAQKLNARTLSSLVAKTEEAAASGSSLVHNVGQSRGPGGRKLRTVDSGPSDLFGDDEEEGVDSKRRVKRELGQEGFLDELDFEESFADDEEKMEADDKEDDETKELEERLKREYKTANKLREGYIDESESESEDEAKLTGAGKNLQKTLKKLEKGGGYEDSDDEKNPYASSEEEEEEEEPPQAPTGPAILPPEPKPGTQRSASQTPSTGAPPGAKVNGQAPISVKTEIQSQSRATSPVPNHGGHSIVAKRATSPKMPKPKTGIPSRAGSPLASPNGASPPASRATSPVAANGAAVSPGGKLLKRKATEEGTTTATDGAPRPKKRKAPAGELEDRMVIDWLRNTPNATTRECIQHFTKYLTDEAKKSKFTALVKEVAQLSGGVLILRPAYRGTAPSPAPTPAAA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.62
2	0.67
3	0.67
4	0.7
5	0.72
6	0.77
7	0.79
8	0.8
9	0.83
10	0.79
11	0.76
12	0.74
13	0.69
14	0.64
15	0.58
16	0.51
17	0.44
18	0.4
19	0.36
20	0.3
21	0.27
22	0.29
23	0.3
24	0.36
25	0.36
26	0.39
27	0.41
28	0.39
29	0.4
30	0.38
31	0.43
32	0.45
33	0.5
34	0.51
35	0.57
36	0.6
37	0.59
38	0.6
39	0.59
40	0.6
41	0.6
42	0.64
43	0.63
44	0.63
45	0.65
46	0.66
47	0.62
48	0.6
49	0.59
50	0.6
51	0.61
52	0.66
53	0.7
54	0.75
55	0.8
56	0.81
57	0.81
58	0.76
59	0.75
60	0.72
61	0.67
62	0.61
63	0.57
64	0.54
65	0.52
66	0.48
67	0.41
68	0.33
69	0.33
70	0.28
71	0.24
72	0.21
73	0.23
74	0.22
75	0.25
76	0.29
77	0.25
78	0.27
79	0.29
80	0.3
81	0.25
82	0.26
83	0.3
84	0.34
85	0.38
86	0.36
87	0.36
88	0.4
89	0.42
90	0.45
91	0.42
92	0.39
93	0.42
94	0.47
95	0.52
96	0.56
97	0.55
98	0.54
99	0.53
100	0.54
101	0.52
102	0.58
103	0.55
104	0.51
105	0.54
106	0.51
107	0.49
108	0.46
109	0.48
110	0.48
111	0.5
112	0.53
113	0.53
114	0.62
115	0.71
116	0.73
117	0.72
118	0.65
119	0.6
120	0.52
121	0.53
122	0.49
123	0.44
124	0.38
125	0.35
126	0.32
127	0.3
128	0.29
129	0.23
130	0.17
131	0.13
132	0.14
133	0.11
134	0.13
135	0.12
136	0.11
137	0.1
138	0.1
139	0.08
140	0.08
141	0.07
142	0.05
143	0.07
144	0.07
145	0.07
146	0.06
147	0.06
148	0.06
149	0.06
150	0.05
151	0.04
152	0.07
153	0.06
154	0.09
155	0.11
156	0.11
157	0.12
158	0.13
159	0.13
160	0.11
161	0.11
162	0.09
163	0.08
164	0.08
165	0.07
166	0.05
167	0.05
168	0.04
169	0.03
170	0.03
171	0.02
172	0.02
173	0.03
174	0.04
175	0.05
176	0.1
177	0.12
178	0.16
179	0.24
180	0.34
181	0.44
182	0.54
183	0.63
184	0.7
185	0.78
186	0.85
187	0.88
188	0.9
189	0.9
190	0.91
191	0.89
192	0.86
193	0.78
194	0.74
195	0.68
196	0.67
197	0.56
198	0.47
199	0.42
200	0.37
201	0.37
202	0.33
203	0.32
204	0.3
205	0.32
206	0.35
207	0.36
208	0.41
209	0.46
210	0.45
211	0.42
212	0.39
213	0.39
214	0.38
215	0.38
216	0.33
217	0.27
218	0.26
219	0.25
220	0.21
221	0.2
222	0.17
223	0.13
224	0.11
225	0.1
226	0.11
227	0.11
228	0.11
229	0.11
230	0.11
231	0.1
232	0.09
233	0.09
234	0.08
235	0.09
236	0.09
237	0.09
238	0.08
239	0.08
240	0.09
241	0.08
242	0.08
243	0.06
244	0.06
245	0.06
246	0.06
247	0.07
248	0.07
249	0.07
250	0.14
251	0.18
252	0.24
253	0.25
254	0.33
255	0.37
256	0.48
257	0.56
258	0.58
259	0.64
260	0.65
261	0.73
262	0.76
263	0.8
264	0.72
265	0.7
266	0.62
267	0.54
268	0.52
269	0.42
270	0.34
271	0.23
272	0.22
273	0.15
274	0.14
275	0.14
276	0.13
277	0.12
278	0.11
279	0.12
280	0.15
281	0.19
282	0.21
283	0.26
284	0.27
285	0.29
286	0.29
287	0.28
288	0.28
289	0.26
290	0.24
291	0.18
292	0.14
293	0.12
294	0.12
295	0.12
296	0.09
297	0.07
298	0.07
299	0.07
300	0.06
301	0.06
302	0.06
303	0.04
304	0.05
305	0.05
306	0.05
307	0.05
308	0.06
309	0.07
310	0.07
311	0.07
312	0.09
313	0.12
314	0.12
315	0.16
316	0.2
317	0.22
318	0.24
319	0.27
320	0.27
321	0.27
322	0.28
323	0.27
324	0.26
325	0.24
326	0.21
327	0.19
328	0.17
329	0.14
330	0.13
331	0.1
332	0.08
333	0.05
334	0.06
335	0.05
336	0.05
337	0.05
338	0.06
339	0.07
340	0.06
341	0.13
342	0.17
343	0.19
344	0.22
345	0.26
346	0.33
347	0.41
348	0.51
349	0.46
350	0.45
351	0.43
352	0.41
353	0.37
354	0.29
355	0.19
356	0.08
357	0.06
358	0.05
359	0.05
360	0.05
361	0.04
362	0.04
363	0.04
364	0.05
365	0.05
366	0.04
367	0.05
368	0.05
369	0.05
370	0.05
371	0.07
372	0.06
373	0.07
374	0.08
375	0.08
376	0.1
377	0.11
378	0.12
379	0.12
380	0.12
381	0.11
382	0.12
383	0.13
384	0.15
385	0.16
386	0.17
387	0.22
388	0.28
389	0.28
390	0.3
391	0.37
392	0.41
393	0.49
394	0.56
395	0.56
396	0.55
397	0.57
398	0.54
399	0.5
400	0.46
401	0.38
402	0.32
403	0.26
404	0.22
405	0.21
406	0.19
407	0.16
408	0.12
409	0.09
410	0.08
411	0.07
412	0.07
413	0.06
414	0.06
415	0.06
416	0.06
417	0.08
418	0.08
419	0.13
420	0.16
421	0.18
422	0.22
423	0.26
424	0.28
425	0.3
426	0.38
427	0.41
428	0.41
429	0.41
430	0.42
431	0.42
432	0.42
433	0.42
434	0.36
435	0.29
436	0.28
437	0.27
438	0.24
439	0.2
440	0.18
441	0.16
442	0.14
443	0.13
444	0.12
445	0.12
446	0.1
447	0.1
448	0.12
449	0.13
450	0.13
451	0.13
452	0.14
453	0.14
454	0.14
455	0.14
456	0.12
457	0.1
458	0.09
459	0.09
460	0.08
461	0.07
462	0.07
463	0.08
464	0.08
465	0.1
466	0.13
467	0.14
468	0.17
469	0.19
470	0.26
471	0.25
472	0.26
473	0.29
474	0.31
475	0.33
476	0.33
477	0.37
478	0.36
479	0.41
480	0.43
481	0.4
482	0.36
483	0.33
484	0.32
485	0.27
486	0.23
487	0.17
488	0.16
489	0.16
490	0.17
491	0.17
492	0.15
493	0.15
494	0.16
495	0.2
496	0.19
497	0.19
498	0.19
499	0.21
500	0.23
501	0.22
502	0.2
503	0.15
504	0.21
505	0.23
506	0.24
507	0.23
508	0.23
509	0.24
510	0.26
511	0.27
512	0.22
513	0.26
514	0.26
515	0.31
516	0.34
517	0.32
518	0.32
519	0.32
520	0.32
521	0.24
522	0.28
523	0.22
524	0.21
525	0.22
526	0.2
527	0.22
528	0.28
529	0.31
530	0.34
531	0.4
532	0.46
533	0.56
534	0.59
535	0.62
536	0.63
537	0.68
538	0.68
539	0.7
540	0.68
541	0.6
542	0.61
543	0.58
544	0.54
545	0.46
546	0.38
547	0.31
548	0.3
549	0.28
550	0.24
551	0.22
552	0.19
553	0.22
554	0.22
555	0.2
556	0.15
557	0.16
558	0.2
559	0.21
560	0.19
561	0.18
562	0.23
563	0.26
564	0.26
565	0.24
566	0.22
567	0.21
568	0.2
569	0.18
570	0.13
571	0.09
572	0.08
573	0.07
574	0.05
575	0.07
576	0.1
577	0.11
578	0.16
579	0.23
580	0.32
581	0.34
582	0.37
583	0.42
584	0.46
585	0.48
586	0.47
587	0.43
588	0.38
589	0.36
590	0.34
591	0.27
592	0.21
593	0.2
594	0.19
595	0.26
596	0.32
597	0.4
598	0.46
599	0.55
600	0.63
601	0.7
602	0.77
603	0.75
604	0.76
605	0.77
606	0.8
607	0.78
608	0.72
609	0.65
610	0.56
611	0.47
612	0.37
613	0.29
614	0.2
615	0.14
616	0.15
617	0.18
618	0.2
619	0.22
620	0.23
621	0.25
622	0.32
623	0.34
624	0.35
625	0.33
626	0.34
627	0.42
628	0.42
629	0.44
630	0.4
631	0.43
632	0.42
633	0.43
634	0.42
635	0.35
636	0.39
637	0.41
638	0.43
639	0.41
640	0.48
641	0.5
642	0.49
643	0.49
644	0.49
645	0.48
646	0.47
647	0.51
648	0.47
649	0.46
650	0.45
651	0.47
652	0.43
653	0.37
654	0.33
655	0.23
656	0.18
657	0.14
658	0.13
659	0.09
660	0.07
661	0.08
662	0.1
663	0.1
664	0.11
665	0.1
666	0.13
667	0.14
668	0.18
669	0.19
670	0.26
671	0.27
672	0.31
673	0.33
674	0.32

A0A5C2STA9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer