Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C2SMU5

Protein Details
Accession A0A5C2SMU5    Localization Confidence Low Confidence Score 5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MDAVHRPKLRTAFKKGRVVAHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto 13, mito 8, cyto_nucl 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020472  G-protein_beta_WD-40_rep  
IPR013934  Utp13_C  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF08625  Utp13  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
CDD cd00200  WD40  
Amino Acid Sequences MDAVHRPKLRTAFKKGRVVAPLHTAGPVAITPDGSRLVTCVGEDALLTDIKAGVEICRFSGDTESITSLCITPSSSHLLIFTSSLSLRIYEIPSSFTPQTKPIKPVRVIARAHDAPVHVCKSDPTSTYLASGSADGVVKVWDIHRGYVTHLFKGHGGVVSALAFNYPFDPSSVVREQKMQLITASVDTRIRIFDLSAAAARASGGSKPEAVLEGHVSVPRGLDVSPDGKWLVSGGRDSVVLIWDISSKASSVQKSNKGKGRAAEFSPVLHKTIPVLERVEAVGLLHPDEDLAGAPSGPGKLRFYTGGERGLVRIWDARDGNVLFTLGQEQGDTTEDQEEQRQIVDAIYVPSTSTIVSVHADQNILFHSLSTQTLSRQFIGFNDEIIDATFLSPYLPVQASAPSSQLSDTHVALATNSSLIRVYSTSSLDARLISGHSEIVLCLDHDAQGRVLASGSKDRSARIWAPVRPQASGGETDAQTVPEWRCVAVCEGHAESVGAIAMSRQAFSGDSPSASGSGGDNLRFMFTGSQDRTIKMWDLSSVPLAADDEGAHAVKCKSLTTHKAHDKDINSLDVAPNDRLLVSGSQDRTAKVWEIEYVATGTGVRGELRLVGTCKGHKRGVWCVRFGKAERVLATGSGDKTVKLWSLDDFTCVKTFEGHTNSVLRVDFINAGMQMVSSASDGLVKLWNVRDETCAATMDNHEDKVWALAISSDESTIVSGAADSVVTFWKDCTEEQQVEKETQRAELVLKEQDFANYLALHDYRNAILLAISMAQPGRLHSLFSSLPSSANADADTDTDASMRTPSISITGHPAVDEVLRTLPGADLARLLRYVRDWNANARTSVVAQRVLHAIVKLRPAEDLARAFDEEAALNVVVAGGTEGAVAPSEGRGATALKEIVDALIPYTERHLTRMEKLLQDSYVVEHLLSEMDDGMFGELGDDDEDADAFAMDVDRSVAVSV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.81
2 0.79
3 0.77
4 0.73
5 0.68
6 0.62
7 0.58
8 0.52
9 0.43
10 0.39
11 0.32
12 0.25
13 0.23
14 0.19
15 0.14
16 0.11
17 0.11
18 0.11
19 0.13
20 0.15
21 0.14
22 0.14
23 0.13
24 0.14
25 0.14
26 0.13
27 0.12
28 0.11
29 0.1
30 0.1
31 0.1
32 0.1
33 0.1
34 0.09
35 0.08
36 0.09
37 0.08
38 0.09
39 0.09
40 0.09
41 0.12
42 0.13
43 0.14
44 0.16
45 0.16
46 0.16
47 0.2
48 0.19
49 0.17
50 0.19
51 0.2
52 0.18
53 0.18
54 0.18
55 0.14
56 0.13
57 0.12
58 0.12
59 0.11
60 0.14
61 0.2
62 0.2
63 0.19
64 0.2
65 0.2
66 0.19
67 0.18
68 0.16
69 0.12
70 0.12
71 0.13
72 0.13
73 0.12
74 0.13
75 0.16
76 0.17
77 0.18
78 0.18
79 0.21
80 0.22
81 0.28
82 0.29
83 0.28
84 0.28
85 0.33
86 0.42
87 0.43
88 0.49
89 0.51
90 0.58
91 0.58
92 0.64
93 0.65
94 0.65
95 0.61
96 0.58
97 0.59
98 0.51
99 0.49
100 0.44
101 0.36
102 0.31
103 0.35
104 0.33
105 0.24
106 0.23
107 0.23
108 0.26
109 0.3
110 0.28
111 0.26
112 0.27
113 0.27
114 0.29
115 0.27
116 0.22
117 0.18
118 0.17
119 0.12
120 0.11
121 0.11
122 0.09
123 0.09
124 0.09
125 0.08
126 0.09
127 0.09
128 0.14
129 0.15
130 0.16
131 0.19
132 0.19
133 0.23
134 0.31
135 0.33
136 0.29
137 0.3
138 0.29
139 0.27
140 0.29
141 0.26
142 0.18
143 0.17
144 0.14
145 0.13
146 0.13
147 0.12
148 0.1
149 0.08
150 0.07
151 0.07
152 0.08
153 0.08
154 0.07
155 0.08
156 0.11
157 0.12
158 0.19
159 0.25
160 0.27
161 0.27
162 0.31
163 0.32
164 0.35
165 0.36
166 0.29
167 0.23
168 0.22
169 0.22
170 0.2
171 0.2
172 0.15
173 0.15
174 0.15
175 0.15
176 0.14
177 0.14
178 0.12
179 0.11
180 0.11
181 0.12
182 0.13
183 0.13
184 0.12
185 0.11
186 0.11
187 0.1
188 0.09
189 0.08
190 0.08
191 0.09
192 0.1
193 0.1
194 0.11
195 0.11
196 0.12
197 0.11
198 0.12
199 0.12
200 0.12
201 0.13
202 0.13
203 0.14
204 0.12
205 0.12
206 0.11
207 0.1
208 0.08
209 0.08
210 0.1
211 0.12
212 0.12
213 0.13
214 0.14
215 0.12
216 0.12
217 0.12
218 0.11
219 0.1
220 0.11
221 0.1
222 0.11
223 0.11
224 0.11
225 0.11
226 0.1
227 0.09
228 0.08
229 0.07
230 0.08
231 0.08
232 0.08
233 0.08
234 0.07
235 0.1
236 0.15
237 0.17
238 0.23
239 0.3
240 0.39
241 0.47
242 0.54
243 0.58
244 0.58
245 0.59
246 0.57
247 0.56
248 0.51
249 0.46
250 0.44
251 0.38
252 0.34
253 0.35
254 0.31
255 0.27
256 0.22
257 0.19
258 0.15
259 0.2
260 0.2
261 0.18
262 0.19
263 0.18
264 0.18
265 0.18
266 0.17
267 0.11
268 0.11
269 0.1
270 0.08
271 0.08
272 0.07
273 0.07
274 0.06
275 0.06
276 0.06
277 0.04
278 0.05
279 0.05
280 0.05
281 0.05
282 0.06
283 0.07
284 0.08
285 0.09
286 0.1
287 0.11
288 0.13
289 0.15
290 0.17
291 0.22
292 0.24
293 0.25
294 0.24
295 0.24
296 0.23
297 0.22
298 0.19
299 0.15
300 0.15
301 0.12
302 0.17
303 0.17
304 0.16
305 0.19
306 0.19
307 0.19
308 0.16
309 0.15
310 0.1
311 0.1
312 0.11
313 0.07
314 0.07
315 0.06
316 0.06
317 0.07
318 0.08
319 0.08
320 0.07
321 0.09
322 0.09
323 0.1
324 0.12
325 0.12
326 0.11
327 0.11
328 0.11
329 0.09
330 0.09
331 0.09
332 0.07
333 0.08
334 0.08
335 0.07
336 0.07
337 0.07
338 0.07
339 0.06
340 0.06
341 0.05
342 0.06
343 0.07
344 0.09
345 0.1
346 0.1
347 0.11
348 0.1
349 0.11
350 0.1
351 0.11
352 0.09
353 0.08
354 0.08
355 0.09
356 0.09
357 0.1
358 0.1
359 0.1
360 0.14
361 0.16
362 0.16
363 0.15
364 0.15
365 0.14
366 0.2
367 0.18
368 0.14
369 0.14
370 0.13
371 0.12
372 0.12
373 0.12
374 0.06
375 0.06
376 0.06
377 0.04
378 0.04
379 0.04
380 0.04
381 0.06
382 0.06
383 0.06
384 0.07
385 0.09
386 0.1
387 0.11
388 0.12
389 0.1
390 0.1
391 0.1
392 0.1
393 0.11
394 0.11
395 0.11
396 0.11
397 0.11
398 0.1
399 0.1
400 0.1
401 0.07
402 0.06
403 0.06
404 0.05
405 0.05
406 0.05
407 0.06
408 0.06
409 0.07
410 0.08
411 0.09
412 0.1
413 0.1
414 0.11
415 0.11
416 0.11
417 0.09
418 0.08
419 0.08
420 0.07
421 0.07
422 0.06
423 0.06
424 0.06
425 0.05
426 0.05
427 0.05
428 0.04
429 0.05
430 0.05
431 0.06
432 0.07
433 0.08
434 0.07
435 0.08
436 0.08
437 0.07
438 0.07
439 0.07
440 0.07
441 0.11
442 0.12
443 0.14
444 0.14
445 0.15
446 0.16
447 0.2
448 0.2
449 0.22
450 0.27
451 0.27
452 0.31
453 0.35
454 0.35
455 0.31
456 0.3
457 0.24
458 0.2
459 0.19
460 0.15
461 0.13
462 0.12
463 0.13
464 0.12
465 0.11
466 0.1
467 0.12
468 0.11
469 0.11
470 0.11
471 0.1
472 0.1
473 0.1
474 0.12
475 0.1
476 0.1
477 0.1
478 0.1
479 0.1
480 0.1
481 0.09
482 0.07
483 0.06
484 0.06
485 0.03
486 0.03
487 0.02
488 0.05
489 0.05
490 0.05
491 0.05
492 0.06
493 0.06
494 0.07
495 0.1
496 0.08
497 0.08
498 0.08
499 0.09
500 0.09
501 0.08
502 0.08
503 0.05
504 0.08
505 0.09
506 0.08
507 0.09
508 0.08
509 0.09
510 0.08
511 0.08
512 0.06
513 0.07
514 0.14
515 0.14
516 0.21
517 0.21
518 0.22
519 0.22
520 0.23
521 0.23
522 0.16
523 0.16
524 0.11
525 0.11
526 0.11
527 0.11
528 0.1
529 0.08
530 0.08
531 0.08
532 0.07
533 0.06
534 0.05
535 0.05
536 0.05
537 0.06
538 0.05
539 0.07
540 0.07
541 0.08
542 0.08
543 0.08
544 0.1
545 0.16
546 0.24
547 0.28
548 0.37
549 0.44
550 0.47
551 0.49
552 0.52
553 0.48
554 0.46
555 0.42
556 0.34
557 0.26
558 0.23
559 0.22
560 0.17
561 0.18
562 0.12
563 0.11
564 0.1
565 0.09
566 0.09
567 0.09
568 0.08
569 0.08
570 0.13
571 0.13
572 0.16
573 0.17
574 0.17
575 0.17
576 0.18
577 0.17
578 0.13
579 0.13
580 0.11
581 0.12
582 0.12
583 0.11
584 0.1
585 0.08
586 0.08
587 0.07
588 0.06
589 0.05
590 0.05
591 0.05
592 0.05
593 0.05
594 0.06
595 0.07
596 0.09
597 0.1
598 0.11
599 0.13
600 0.18
601 0.23
602 0.26
603 0.28
604 0.27
605 0.3
606 0.39
607 0.47
608 0.46
609 0.47
610 0.45
611 0.46
612 0.49
613 0.46
614 0.44
615 0.38
616 0.38
617 0.33
618 0.32
619 0.29
620 0.25
621 0.25
622 0.19
623 0.15
624 0.15
625 0.14
626 0.12
627 0.13
628 0.14
629 0.14
630 0.12
631 0.12
632 0.11
633 0.15
634 0.16
635 0.18
636 0.18
637 0.17
638 0.18
639 0.18
640 0.16
641 0.14
642 0.16
643 0.19
644 0.22
645 0.22
646 0.23
647 0.24
648 0.24
649 0.24
650 0.22
651 0.17
652 0.13
653 0.13
654 0.12
655 0.1
656 0.11
657 0.09
658 0.09
659 0.08
660 0.08
661 0.06
662 0.05
663 0.05
664 0.04
665 0.04
666 0.04
667 0.05
668 0.05
669 0.06
670 0.09
671 0.08
672 0.11
673 0.13
674 0.16
675 0.16
676 0.17
677 0.18
678 0.18
679 0.2
680 0.18
681 0.17
682 0.14
683 0.14
684 0.15
685 0.19
686 0.18
687 0.17
688 0.16
689 0.15
690 0.15
691 0.15
692 0.15
693 0.08
694 0.07
695 0.07
696 0.08
697 0.09
698 0.09
699 0.08
700 0.08
701 0.08
702 0.08
703 0.07
704 0.06
705 0.04
706 0.04
707 0.04
708 0.04
709 0.04
710 0.03
711 0.04
712 0.06
713 0.07
714 0.07
715 0.07
716 0.09
717 0.11
718 0.12
719 0.16
720 0.22
721 0.25
722 0.27
723 0.33
724 0.33
725 0.35
726 0.36
727 0.34
728 0.27
729 0.25
730 0.24
731 0.19
732 0.18
733 0.17
734 0.19
735 0.21
736 0.21
737 0.2
738 0.2
739 0.19
740 0.2
741 0.18
742 0.16
743 0.11
744 0.11
745 0.13
746 0.13
747 0.13
748 0.13
749 0.13
750 0.11
751 0.13
752 0.12
753 0.09
754 0.09
755 0.09
756 0.08
757 0.07
758 0.07
759 0.07
760 0.07
761 0.08
762 0.08
763 0.09
764 0.15
765 0.14
766 0.15
767 0.14
768 0.19
769 0.18
770 0.2
771 0.22
772 0.16
773 0.17
774 0.17
775 0.19
776 0.15
777 0.16
778 0.14
779 0.12
780 0.12
781 0.12
782 0.13
783 0.1
784 0.09
785 0.09
786 0.09
787 0.08
788 0.09
789 0.08
790 0.08
791 0.08
792 0.08
793 0.11
794 0.12
795 0.12
796 0.18
797 0.2
798 0.19
799 0.19
800 0.18
801 0.16
802 0.16
803 0.16
804 0.1
805 0.09
806 0.1
807 0.1
808 0.1
809 0.09
810 0.12
811 0.12
812 0.11
813 0.13
814 0.14
815 0.15
816 0.16
817 0.17
818 0.15
819 0.16
820 0.22
821 0.23
822 0.3
823 0.31
824 0.38
825 0.45
826 0.46
827 0.43
828 0.39
829 0.36
830 0.31
831 0.34
832 0.29
833 0.28
834 0.25
835 0.27
836 0.27
837 0.27
838 0.26
839 0.22
840 0.24
841 0.22
842 0.28
843 0.27
844 0.25
845 0.24
846 0.25
847 0.26
848 0.27
849 0.27
850 0.24
851 0.25
852 0.25
853 0.25
854 0.23
855 0.21
856 0.16
857 0.14
858 0.13
859 0.1
860 0.09
861 0.08
862 0.08
863 0.06
864 0.06
865 0.05
866 0.03
867 0.03
868 0.04
869 0.04
870 0.04
871 0.04
872 0.05
873 0.05
874 0.05
875 0.06
876 0.06
877 0.07
878 0.08
879 0.08
880 0.1
881 0.14
882 0.14
883 0.13
884 0.14
885 0.14
886 0.13
887 0.13
888 0.12
889 0.09
890 0.11
891 0.11
892 0.11
893 0.15
894 0.19
895 0.19
896 0.21
897 0.26
898 0.28
899 0.33
900 0.42
901 0.44
902 0.44
903 0.47
904 0.48
905 0.42
906 0.4
907 0.34
908 0.28
909 0.25
910 0.2
911 0.16
912 0.13
913 0.12
914 0.11
915 0.11
916 0.09
917 0.07
918 0.07
919 0.07
920 0.07
921 0.08
922 0.07
923 0.07
924 0.06
925 0.06
926 0.07
927 0.07
928 0.07
929 0.06
930 0.07
931 0.07
932 0.06
933 0.06
934 0.05
935 0.05
936 0.05
937 0.06
938 0.05
939 0.06
940 0.07
941 0.07