Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G4TU00

Protein Details
Accession G4TU00    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
359-380GGYGGQRGKRRRGAPRGGGRGGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
303-334KPSNRGGTAGRGAGEEGAGGRGRGRGRARREE
365-382RGKRRRGAPRGGGRGGGA
Subcellular Location(s) mito 13.5, cyto_mito 8, nucl 6, extr 4, plas 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019050  FDF_dom  
IPR025761  FFD_box  
IPR025609  Lsm14-like_N  
IPR010920  LSM_dom_sf  
IPR025768  TFG_box  
Pfam View protein in Pfam  
PF09532  FDF  
PF12701  LSM14  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51513  FFD  
PS51536  TFG  
Amino Acid Sequences MGTNSKTCRIISKQNIRYSGIMLSIDAVAQKIRVTDVRCYGTEDRPTDMFVPPMAHSFGLIEFNVSDLSDLKFEDPIPAPEPQTAPPPSAAVANPPVAPPQQTQYQQRPMQDNKPVQQQQPAAPPTAPAANFSAEKAMPPGFSGHQLPNQQQASVNASQPPRQQQNNTDSLTRSMGAMKINNGQHGGPSPTGGQATGSAPQQGGRGQSNRRGRGGRPNGTHHGQHQRADLKIPSTDFDFEAANNRFDKSAATKHHQLLQGTTPPTVNEETPEEPKSADTKEDKGYNPTKSFFDNLSSDLTAKKPSNRGGTAGRGAGEEGAGGRGRGRGRARREEEREKNVETFGEPGGVGLMGPGAYIGGYGGQRGKRRRGAPRGGGRGGGAPRVTAQNS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.71
2 0.74
3 0.69
4 0.64
5 0.55
6 0.47
7 0.38
8 0.3
9 0.22
10 0.19
11 0.15
12 0.14
13 0.12
14 0.1
15 0.08
16 0.08
17 0.09
18 0.08
19 0.11
20 0.15
21 0.18
22 0.24
23 0.31
24 0.35
25 0.35
26 0.41
27 0.43
28 0.45
29 0.5
30 0.45
31 0.42
32 0.38
33 0.4
34 0.36
35 0.33
36 0.27
37 0.2
38 0.21
39 0.18
40 0.2
41 0.18
42 0.16
43 0.15
44 0.15
45 0.14
46 0.14
47 0.13
48 0.12
49 0.1
50 0.11
51 0.11
52 0.1
53 0.09
54 0.07
55 0.09
56 0.09
57 0.1
58 0.1
59 0.11
60 0.11
61 0.16
62 0.16
63 0.18
64 0.2
65 0.22
66 0.22
67 0.24
68 0.25
69 0.22
70 0.27
71 0.25
72 0.24
73 0.23
74 0.22
75 0.2
76 0.21
77 0.19
78 0.16
79 0.18
80 0.18
81 0.18
82 0.17
83 0.19
84 0.17
85 0.2
86 0.17
87 0.17
88 0.23
89 0.28
90 0.35
91 0.41
92 0.49
93 0.51
94 0.54
95 0.58
96 0.57
97 0.59
98 0.6
99 0.59
100 0.53
101 0.6
102 0.6
103 0.54
104 0.55
105 0.51
106 0.46
107 0.48
108 0.45
109 0.37
110 0.32
111 0.31
112 0.25
113 0.26
114 0.22
115 0.15
116 0.15
117 0.15
118 0.16
119 0.15
120 0.17
121 0.13
122 0.13
123 0.13
124 0.12
125 0.1
126 0.11
127 0.13
128 0.11
129 0.13
130 0.16
131 0.16
132 0.2
133 0.23
134 0.24
135 0.29
136 0.29
137 0.27
138 0.25
139 0.25
140 0.25
141 0.24
142 0.24
143 0.21
144 0.22
145 0.25
146 0.27
147 0.32
148 0.32
149 0.34
150 0.36
151 0.38
152 0.44
153 0.47
154 0.45
155 0.4
156 0.35
157 0.33
158 0.31
159 0.24
160 0.18
161 0.12
162 0.12
163 0.12
164 0.13
165 0.12
166 0.17
167 0.18
168 0.18
169 0.18
170 0.16
171 0.15
172 0.16
173 0.16
174 0.1
175 0.1
176 0.1
177 0.1
178 0.1
179 0.09
180 0.08
181 0.07
182 0.08
183 0.09
184 0.09
185 0.08
186 0.08
187 0.09
188 0.1
189 0.1
190 0.11
191 0.12
192 0.17
193 0.19
194 0.27
195 0.34
196 0.36
197 0.39
198 0.39
199 0.39
200 0.45
201 0.52
202 0.51
203 0.47
204 0.51
205 0.52
206 0.52
207 0.51
208 0.46
209 0.46
210 0.42
211 0.39
212 0.38
213 0.37
214 0.34
215 0.36
216 0.32
217 0.23
218 0.22
219 0.21
220 0.17
221 0.15
222 0.16
223 0.13
224 0.13
225 0.12
226 0.1
227 0.17
228 0.18
229 0.18
230 0.18
231 0.18
232 0.17
233 0.17
234 0.19
235 0.15
236 0.21
237 0.25
238 0.3
239 0.36
240 0.37
241 0.43
242 0.45
243 0.41
244 0.37
245 0.36
246 0.36
247 0.31
248 0.3
249 0.24
250 0.21
251 0.23
252 0.22
253 0.17
254 0.13
255 0.16
256 0.18
257 0.22
258 0.23
259 0.21
260 0.19
261 0.21
262 0.21
263 0.18
264 0.21
265 0.21
266 0.23
267 0.28
268 0.33
269 0.33
270 0.38
271 0.42
272 0.44
273 0.44
274 0.42
275 0.39
276 0.36
277 0.37
278 0.31
279 0.29
280 0.24
281 0.23
282 0.24
283 0.23
284 0.21
285 0.2
286 0.2
287 0.21
288 0.22
289 0.27
290 0.29
291 0.35
292 0.42
293 0.42
294 0.45
295 0.44
296 0.47
297 0.45
298 0.4
299 0.34
300 0.27
301 0.25
302 0.21
303 0.16
304 0.1
305 0.07
306 0.08
307 0.08
308 0.07
309 0.08
310 0.12
311 0.13
312 0.2
313 0.28
314 0.34
315 0.43
316 0.54
317 0.6
318 0.66
319 0.74
320 0.78
321 0.79
322 0.8
323 0.77
324 0.69
325 0.64
326 0.55
327 0.47
328 0.37
329 0.3
330 0.22
331 0.18
332 0.14
333 0.12
334 0.11
335 0.1
336 0.08
337 0.06
338 0.06
339 0.04
340 0.04
341 0.04
342 0.03
343 0.03
344 0.03
345 0.03
346 0.06
347 0.06
348 0.09
349 0.14
350 0.2
351 0.28
352 0.35
353 0.45
354 0.51
355 0.59
356 0.68
357 0.73
358 0.78
359 0.81
360 0.85
361 0.85
362 0.78
363 0.71
364 0.62
365 0.57
366 0.49
367 0.44
368 0.33
369 0.25
370 0.25