FuNGI

A0A5C2SKJ8

Protein Details

Accession

A0A5C2SKJ8

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-25	MDETPRPSRPAPRPVKKGARSSLGK	Hydrophilic
138-161	RRSSSSPNARRKRSSQQKRVAMSS	Hydrophilic
623-649	DENTPKAVKVKPRPRPRRRSASATSSI	Hydrophilic
744-764	MTSTYRPKRTHDWQPNLRSGN	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
9-19	RPAPRPVKKGA
563-580	KRKSRAGSVSRGRPAGRG
629-641	AVKVKPRPRPRRR

Subcellular Location(s)

nucl 22, cyto_nucl 14.5, cyto 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039024 RTC4 IPR028094 RTC4_C
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005634 C:nucleus
Pfam	View protein in Pfam PF14474 RTC4

Amino Acid Sequences

MDETPRPSRPAPRPVKKGARSSLGKSQTVPDLGVHSSQEKSQPLSRSQTVQEFIHISSDESDVPRTDARRVAKGKGRAKADDPFACLSPLSSHTRDKSKDRTDPIGDLSPLTSPSRKKCKDPLSSFPMPSPLSSPGSRRSSSSPNARRKRSSQQKRVAMSSSDDDDDKPSHRTLRPFPMETQVLASLRASSLVSKKATVDSDGEAVTGMYGKRRQRESERFSFDGNSDSDDDMFLDPSVDPKTLCPWCDERLPDEPTPHLRALISATKRVSRPEDRLTNPLGLRAPPAAFVGVCQRHRFERDWIPRARQKGWPTKIAWDRLADRVIRLEATLQAIVEDVDEDFAPSMTHGSCSRRLRKENEFWQEVVKNVRKQGSRQATGVRGQFLHFNKTQPGYYGELGYVIIHQTLCDLFPPSEFHPDATLPLTPADFITQVLVPETAVHLIMKDLSLPRDKAIQTLRESVEYGVAMFPADDGEGDLTSGASGASRIGKLGATEQMFMDRARARRKELEEEERREEEELAKARDASKLKPCPRVKGKASEIATDVESAGPTSSPPSGGFTKRKSRAGSVSRGRPAGRGPGPGSIVIELSSDTGSEAAGPSKRRKKTADVWSGAETEVTPTDENTPKAVKVKPRPRPRRRSASATSSIQGGDDARSDTLDSDPEVPPPHTSRSMPFGRQDETTGVETGIHARGIPEATPRAKPKVQRSDARSILPVPPEAGTSKPKTPLEIARERHKQSSARMTSTYRPKRTHDWQPNLRSGNIVSLDSTDDDLDVPTSKASTAKAGDFRWLLDDSSQSRPSSPSTSH

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.81
2	0.87
3	0.85
4	0.86
5	0.82
6	0.8
7	0.76
8	0.73
9	0.73
10	0.69
11	0.63
12	0.55
13	0.52
14	0.48
15	0.44
16	0.39
17	0.3
18	0.26
19	0.26
20	0.26
21	0.24
22	0.2
23	0.2
24	0.22
25	0.26
26	0.26
27	0.29
28	0.33
29	0.37
30	0.4
31	0.47
32	0.48
33	0.47
34	0.49
35	0.51
36	0.49
37	0.44
38	0.42
39	0.36
40	0.33
41	0.32
42	0.27
43	0.22
44	0.19
45	0.2
46	0.19
47	0.18
48	0.2
49	0.17
50	0.19
51	0.22
52	0.22
53	0.25
54	0.29
55	0.32
56	0.4
57	0.43
58	0.48
59	0.52
60	0.6
61	0.64
62	0.65
63	0.66
64	0.61
65	0.62
66	0.61
67	0.61
68	0.54
69	0.51
70	0.46
71	0.41
72	0.37
73	0.32
74	0.26
75	0.21
76	0.22
77	0.25
78	0.26
79	0.32
80	0.36
81	0.45
82	0.49
83	0.54
84	0.6
85	0.62
86	0.67
87	0.67
88	0.7
89	0.66
90	0.64
91	0.61
92	0.56
93	0.47
94	0.39
95	0.33
96	0.26
97	0.25
98	0.24
99	0.24
100	0.25
101	0.34
102	0.44
103	0.48
104	0.53
105	0.61
106	0.68
107	0.74
108	0.76
109	0.76
110	0.74
111	0.76
112	0.71
113	0.62
114	0.58
115	0.48
116	0.41
117	0.35
118	0.3
119	0.28
120	0.29
121	0.31
122	0.33
123	0.39
124	0.39
125	0.38
126	0.4
127	0.43
128	0.49
129	0.56
130	0.57
131	0.62
132	0.71
133	0.76
134	0.77
135	0.76
136	0.79
137	0.8
138	0.81
139	0.81
140	0.82
141	0.83
142	0.81
143	0.78
144	0.7
145	0.61
146	0.54
147	0.46
148	0.39
149	0.31
150	0.27
151	0.24
152	0.23
153	0.23
154	0.21
155	0.2
156	0.2
157	0.25
158	0.29
159	0.35
160	0.39
161	0.48
162	0.53
163	0.53
164	0.53
165	0.53
166	0.5
167	0.44
168	0.4
169	0.33
170	0.26
171	0.23
172	0.21
173	0.15
174	0.13
175	0.14
176	0.11
177	0.11
178	0.14
179	0.18
180	0.19
181	0.19
182	0.21
183	0.23
184	0.24
185	0.23
186	0.22
187	0.18
188	0.19
189	0.18
190	0.16
191	0.13
192	0.11
193	0.09
194	0.09
195	0.08
196	0.1
197	0.16
198	0.2
199	0.27
200	0.31
201	0.38
202	0.46
203	0.57
204	0.61
205	0.66
206	0.69
207	0.64
208	0.61
209	0.56
210	0.46
211	0.39
212	0.31
213	0.24
214	0.18
215	0.17
216	0.15
217	0.14
218	0.14
219	0.11
220	0.11
221	0.09
222	0.08
223	0.07
224	0.09
225	0.11
226	0.1
227	0.1
228	0.1
229	0.17
230	0.19
231	0.2
232	0.22
233	0.24
234	0.26
235	0.31
236	0.32
237	0.29
238	0.33
239	0.37
240	0.35
241	0.33
242	0.34
243	0.34
244	0.36
245	0.32
246	0.27
247	0.21
248	0.2
249	0.23
250	0.27
251	0.24
252	0.24
253	0.25
254	0.28
255	0.29
256	0.32
257	0.35
258	0.34
259	0.38
260	0.42
261	0.49
262	0.48
263	0.51
264	0.5
265	0.48
266	0.42
267	0.38
268	0.31
269	0.23
270	0.22
271	0.2
272	0.17
273	0.13
274	0.14
275	0.11
276	0.09
277	0.1
278	0.16
279	0.2
280	0.22
281	0.23
282	0.25
283	0.27
284	0.31
285	0.33
286	0.32
287	0.37
288	0.44
289	0.5
290	0.53
291	0.57
292	0.57
293	0.59
294	0.56
295	0.52
296	0.52
297	0.54
298	0.54
299	0.53
300	0.51
301	0.55
302	0.57
303	0.54
304	0.48
305	0.41
306	0.39
307	0.35
308	0.37
309	0.28
310	0.23
311	0.2
312	0.19
313	0.16
314	0.13
315	0.11
316	0.09
317	0.11
318	0.1
319	0.08
320	0.07
321	0.07
322	0.07
323	0.06
324	0.05
325	0.03
326	0.04
327	0.04
328	0.04
329	0.04
330	0.04
331	0.04
332	0.04
333	0.05
334	0.05
335	0.06
336	0.09
337	0.12
338	0.19
339	0.27
340	0.35
341	0.41
342	0.47
343	0.51
344	0.58
345	0.63
346	0.65
347	0.65
348	0.59
349	0.52
350	0.51
351	0.45
352	0.38
353	0.37
354	0.33
355	0.28
356	0.29
357	0.34
358	0.32
359	0.33
360	0.41
361	0.42
362	0.39
363	0.39
364	0.39
365	0.36
366	0.39
367	0.38
368	0.3
369	0.22
370	0.2
371	0.24
372	0.22
373	0.24
374	0.21
375	0.21
376	0.22
377	0.23
378	0.23
379	0.18
380	0.2
381	0.18
382	0.17
383	0.16
384	0.14
385	0.12
386	0.12
387	0.11
388	0.08
389	0.05
390	0.05
391	0.04
392	0.04
393	0.04
394	0.04
395	0.04
396	0.05
397	0.06
398	0.06
399	0.07
400	0.1
401	0.11
402	0.16
403	0.16
404	0.16
405	0.16
406	0.16
407	0.16
408	0.15
409	0.13
410	0.09
411	0.09
412	0.08
413	0.07
414	0.07
415	0.07
416	0.06
417	0.06
418	0.06
419	0.06
420	0.06
421	0.07
422	0.07
423	0.06
424	0.05
425	0.06
426	0.05
427	0.05
428	0.05
429	0.04
430	0.04
431	0.05
432	0.04
433	0.05
434	0.06
435	0.08
436	0.11
437	0.12
438	0.12
439	0.18
440	0.18
441	0.21
442	0.23
443	0.26
444	0.26
445	0.31
446	0.31
447	0.26
448	0.27
449	0.23
450	0.2
451	0.15
452	0.13
453	0.08
454	0.07
455	0.06
456	0.05
457	0.04
458	0.03
459	0.03
460	0.03
461	0.03
462	0.04
463	0.04
464	0.04
465	0.04
466	0.03
467	0.03
468	0.03
469	0.03
470	0.02
471	0.03
472	0.04
473	0.05
474	0.05
475	0.05
476	0.06
477	0.06
478	0.07
479	0.08
480	0.12
481	0.11
482	0.12
483	0.12
484	0.13
485	0.14
486	0.13
487	0.16
488	0.15
489	0.19
490	0.27
491	0.29
492	0.33
493	0.39
494	0.43
495	0.48
496	0.51
497	0.57
498	0.58
499	0.61
500	0.61
501	0.55
502	0.52
503	0.44
504	0.38
505	0.29
506	0.26
507	0.24
508	0.21
509	0.2
510	0.2
511	0.2
512	0.25
513	0.25
514	0.24
515	0.3
516	0.38
517	0.43
518	0.53
519	0.55
520	0.59
521	0.65
522	0.7
523	0.65
524	0.65
525	0.64
526	0.62
527	0.61
528	0.53
529	0.46
530	0.38
531	0.34
532	0.25
533	0.2
534	0.12
535	0.1
536	0.08
537	0.07
538	0.05
539	0.05
540	0.06
541	0.07
542	0.07
543	0.08
544	0.12
545	0.16
546	0.22
547	0.28
548	0.33
549	0.43
550	0.48
551	0.54
552	0.53
553	0.54
554	0.57
555	0.57
556	0.61
557	0.59
558	0.61
559	0.59
560	0.59
561	0.55
562	0.47
563	0.42
564	0.41
565	0.36
566	0.32
567	0.3
568	0.3
569	0.31
570	0.29
571	0.28
572	0.2
573	0.17
574	0.12
575	0.11
576	0.08
577	0.07
578	0.07
579	0.06
580	0.06
581	0.05
582	0.05
583	0.05
584	0.05
585	0.08
586	0.11
587	0.15
588	0.25
589	0.34
590	0.39
591	0.45
592	0.49
593	0.54
594	0.6
595	0.67
596	0.68
597	0.63
598	0.62
599	0.58
600	0.55
601	0.47
602	0.37
603	0.26
604	0.17
605	0.14
606	0.12
607	0.1
608	0.1
609	0.16
610	0.19
611	0.2
612	0.21
613	0.22
614	0.23
615	0.28
616	0.32
617	0.35
618	0.43
619	0.52
620	0.6
621	0.69
622	0.78
623	0.85
624	0.91
625	0.91
626	0.92
627	0.88
628	0.87
629	0.83
630	0.81
631	0.77
632	0.7
633	0.6
634	0.5
635	0.43
636	0.34
637	0.27
638	0.19
639	0.13
640	0.1
641	0.11
642	0.1
643	0.1
644	0.11
645	0.11
646	0.11
647	0.11
648	0.11
649	0.14
650	0.14
651	0.16
652	0.19
653	0.19
654	0.22
655	0.24
656	0.28
657	0.28
658	0.3
659	0.3
660	0.35
661	0.41
662	0.41
663	0.44
664	0.42
665	0.41
666	0.4
667	0.39
668	0.33
669	0.31
670	0.29
671	0.23
672	0.19
673	0.17
674	0.16
675	0.17
676	0.16
677	0.12
678	0.1
679	0.1
680	0.12
681	0.13
682	0.13
683	0.15
684	0.2
685	0.23
686	0.3
687	0.34
688	0.4
689	0.44
690	0.51
691	0.57
692	0.62
693	0.67
694	0.69
695	0.72
696	0.75
697	0.75
698	0.7
699	0.62
700	0.54
701	0.5
702	0.43
703	0.37
704	0.28
705	0.24
706	0.23
707	0.22
708	0.23
709	0.25
710	0.28
711	0.31
712	0.38
713	0.38
714	0.4
715	0.43
716	0.48
717	0.5
718	0.54
719	0.55
720	0.58
721	0.66
722	0.66
723	0.66
724	0.64
725	0.6
726	0.59
727	0.64
728	0.6
729	0.56
730	0.56
731	0.55
732	0.58
733	0.64
734	0.66
735	0.64
736	0.62
737	0.64
738	0.69
739	0.73
740	0.76
741	0.76
742	0.76
743	0.78
744	0.81
745	0.84
746	0.79
747	0.7
748	0.61
749	0.51
750	0.47
751	0.39
752	0.31
753	0.23
754	0.2
755	0.22
756	0.2
757	0.21
758	0.14
759	0.12
760	0.12
761	0.11
762	0.12
763	0.11
764	0.11
765	0.1
766	0.1
767	0.11
768	0.13
769	0.14
770	0.18
771	0.2
772	0.26
773	0.32
774	0.32
775	0.38
776	0.37
777	0.36
778	0.34
779	0.32
780	0.27
781	0.23
782	0.28
783	0.25
784	0.32
785	0.36
786	0.33
787	0.33
788	0.34
789	0.37

A0A5C2SKJ8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer