Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C2SSD3

Protein Details
Accession A0A5C2SSD3    Localization Confidence High Confidence Score 20.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
387-409RSAPVSAQKRRGRPPKSKPVITDHydrophilic
418-441STPVLKGKTKARPRSLSRIRPGEAHydrophilic
446-469MGVGAKPKSRAKKAKEANARDLEAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
277-278RK
311-324ASKPRPKGKGKAKA
345-364SRGRPPKSKTQAPGSAAKRR
395-404KRRGRPPKSK
424-442GKTKARPRSLSRIRPGEAS
444-461ASMGVGAKPKSRAKKAKE
480-486KPKKRRK
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 11.5, cyto 7.5, mito 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
Amino Acid Sequences MVFGFFTRKPQPPPETVPLPPSPTASSSNQNASPDSKVEKNAQLRTPSPSVDSASAAHGKIHSASPSTKIARLSIEERQASPTRRGSIPGNLTAIAPATVFVPPEPTVESLTAHIAAIPPKTLHAYILSRIPRMPAENLPTLATFFDELAPPQKLHCVRCHKDFVEVENDDRSCLVPHDDESAEVERIGAAMRANRAPGTVGATFETLWGCCGKIVEGDGDQGPPDGWCYEGKHTTDIKRARFRADSTPHDDKLVSCLRLNCHGIRAQLPRGARSMRKRPRSVNLKEASTDEDVSEGGSDSGMDEMVGKSASKPRPKGKGKAKAAPQGDQMDVDDNASVAGSVRSRGRPPKSKTQAPGSAAKRRVRVTDSKVVPGTDGEDDDVQSVRSAPVSAQKRRGRPPKSKPVITDSDREMDVESTPVLKGKTKARPRSLSRIRPGEASDASMGVGAKPKSRAKKAKEANARDLEANADGADGDEEKPKKRRKVANT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.66
2 0.65
3 0.61
4 0.61
5 0.56
6 0.54
7 0.48
8 0.43
9 0.37
10 0.35
11 0.37
12 0.35
13 0.37
14 0.36
15 0.41
16 0.41
17 0.4
18 0.39
19 0.37
20 0.36
21 0.33
22 0.33
23 0.31
24 0.32
25 0.36
26 0.42
27 0.48
28 0.52
29 0.54
30 0.55
31 0.54
32 0.56
33 0.54
34 0.47
35 0.42
36 0.37
37 0.34
38 0.3
39 0.29
40 0.23
41 0.24
42 0.26
43 0.23
44 0.22
45 0.19
46 0.19
47 0.19
48 0.2
49 0.18
50 0.18
51 0.19
52 0.22
53 0.29
54 0.31
55 0.32
56 0.31
57 0.31
58 0.31
59 0.33
60 0.34
61 0.33
62 0.38
63 0.37
64 0.36
65 0.41
66 0.44
67 0.43
68 0.45
69 0.44
70 0.41
71 0.4
72 0.42
73 0.4
74 0.42
75 0.44
76 0.41
77 0.37
78 0.33
79 0.32
80 0.29
81 0.25
82 0.17
83 0.11
84 0.08
85 0.07
86 0.07
87 0.07
88 0.07
89 0.1
90 0.1
91 0.12
92 0.13
93 0.14
94 0.15
95 0.15
96 0.16
97 0.14
98 0.15
99 0.14
100 0.12
101 0.11
102 0.11
103 0.12
104 0.12
105 0.12
106 0.11
107 0.12
108 0.14
109 0.14
110 0.13
111 0.16
112 0.17
113 0.18
114 0.25
115 0.26
116 0.25
117 0.25
118 0.26
119 0.24
120 0.24
121 0.26
122 0.23
123 0.26
124 0.28
125 0.28
126 0.28
127 0.26
128 0.23
129 0.2
130 0.16
131 0.11
132 0.08
133 0.09
134 0.08
135 0.08
136 0.12
137 0.14
138 0.13
139 0.13
140 0.19
141 0.23
142 0.26
143 0.33
144 0.4
145 0.43
146 0.49
147 0.56
148 0.5
149 0.53
150 0.52
151 0.46
152 0.44
153 0.4
154 0.35
155 0.33
156 0.32
157 0.24
158 0.23
159 0.2
160 0.13
161 0.12
162 0.13
163 0.09
164 0.1
165 0.14
166 0.14
167 0.13
168 0.16
169 0.17
170 0.15
171 0.14
172 0.13
173 0.09
174 0.09
175 0.09
176 0.07
177 0.05
178 0.07
179 0.09
180 0.1
181 0.11
182 0.11
183 0.11
184 0.11
185 0.1
186 0.13
187 0.11
188 0.11
189 0.11
190 0.12
191 0.11
192 0.11
193 0.11
194 0.07
195 0.07
196 0.07
197 0.06
198 0.06
199 0.06
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.07
204 0.07
205 0.08
206 0.08
207 0.08
208 0.08
209 0.08
210 0.07
211 0.06
212 0.06
213 0.05
214 0.05
215 0.07
216 0.09
217 0.12
218 0.16
219 0.17
220 0.21
221 0.24
222 0.26
223 0.32
224 0.36
225 0.39
226 0.43
227 0.44
228 0.43
229 0.43
230 0.43
231 0.44
232 0.44
233 0.43
234 0.43
235 0.47
236 0.43
237 0.41
238 0.39
239 0.3
240 0.29
241 0.28
242 0.22
243 0.18
244 0.2
245 0.21
246 0.25
247 0.28
248 0.22
249 0.21
250 0.22
251 0.21
252 0.24
253 0.26
254 0.24
255 0.25
256 0.25
257 0.23
258 0.24
259 0.26
260 0.27
261 0.32
262 0.4
263 0.46
264 0.55
265 0.59
266 0.61
267 0.68
268 0.72
269 0.69
270 0.68
271 0.63
272 0.55
273 0.51
274 0.47
275 0.4
276 0.32
277 0.27
278 0.17
279 0.13
280 0.12
281 0.11
282 0.1
283 0.06
284 0.05
285 0.04
286 0.04
287 0.04
288 0.04
289 0.04
290 0.03
291 0.04
292 0.04
293 0.05
294 0.05
295 0.05
296 0.06
297 0.15
298 0.21
299 0.27
300 0.34
301 0.41
302 0.51
303 0.58
304 0.66
305 0.69
306 0.74
307 0.74
308 0.76
309 0.76
310 0.73
311 0.69
312 0.62
313 0.56
314 0.48
315 0.41
316 0.34
317 0.27
318 0.21
319 0.18
320 0.16
321 0.11
322 0.08
323 0.07
324 0.06
325 0.06
326 0.04
327 0.05
328 0.05
329 0.07
330 0.11
331 0.14
332 0.19
333 0.28
334 0.36
335 0.45
336 0.52
337 0.61
338 0.66
339 0.72
340 0.72
341 0.72
342 0.71
343 0.65
344 0.67
345 0.62
346 0.62
347 0.62
348 0.61
349 0.57
350 0.52
351 0.53
352 0.5
353 0.52
354 0.51
355 0.53
356 0.51
357 0.51
358 0.51
359 0.46
360 0.41
361 0.33
362 0.28
363 0.19
364 0.17
365 0.13
366 0.12
367 0.12
368 0.13
369 0.12
370 0.1
371 0.09
372 0.09
373 0.08
374 0.08
375 0.08
376 0.08
377 0.17
378 0.25
379 0.31
380 0.4
381 0.47
382 0.55
383 0.64
384 0.74
385 0.74
386 0.77
387 0.81
388 0.83
389 0.85
390 0.84
391 0.78
392 0.75
393 0.75
394 0.68
395 0.63
396 0.55
397 0.49
398 0.43
399 0.39
400 0.33
401 0.24
402 0.21
403 0.17
404 0.13
405 0.11
406 0.11
407 0.13
408 0.13
409 0.16
410 0.2
411 0.28
412 0.38
413 0.48
414 0.58
415 0.65
416 0.73
417 0.77
418 0.83
419 0.85
420 0.85
421 0.84
422 0.82
423 0.74
424 0.68
425 0.63
426 0.58
427 0.49
428 0.42
429 0.33
430 0.25
431 0.23
432 0.2
433 0.18
434 0.13
435 0.18
436 0.16
437 0.19
438 0.25
439 0.33
440 0.42
441 0.52
442 0.61
443 0.63
444 0.73
445 0.79
446 0.83
447 0.86
448 0.84
449 0.84
450 0.81
451 0.76
452 0.66
453 0.57
454 0.49
455 0.39
456 0.31
457 0.2
458 0.13
459 0.1
460 0.09
461 0.1
462 0.09
463 0.09
464 0.16
465 0.19
466 0.26
467 0.36
468 0.45
469 0.54
470 0.62