FuNGI

A0A5C2SE81

Protein Details

Accession

A0A5C2SE81

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-27	MSATEPPKTPKNKGKEKEKKAKSTGGG	Hydrophilic
350-373	SGAGVERKSRREREKERERDKDAS	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
8-25	KTPKNKGKEKEKKAKSTG
222-258	KKDDKKKGANAAKEKSADAQGGPSKKGGKKAAAAAKA
274-296	KAAPSTPSKGAAKPPKPQRERRG
356-374	RKSRREREKERERDKDASG
382-400	AHAQKATKEEKRERAPRGP
449-467	GGRGRGRGRGRGRGRGAAS

Subcellular Location(s)

nucl 19.5, cyto_nucl 12, mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR039722 Upf3 IPR005120 UPF3_dom
Gene Ontology	GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
Pfam	View protein in Pfam PF03467 Smg4_UPF3
CDD	cd12455 RRM_like_Smg4_UPF3

Amino Acid Sequences

MSATEPPKTPKNKGKEKEKKAKSTGGGQKSQTERLKTVVRRLPPNLPEEIFWQSVAKWVTDETVTWKTYYPGKFKTRLNKENIPSRAYIAFKDEKLLAEFSKEYDGHLFRDKAGNESIAVVEFAPFQKVPNEKKKADGRAGTIEKDEDYISFLESLKEASSKPFDADTLETLIASTQPAPLPTTTPLLEALKAEKSAQKDKEAIIRNHAHYKDPGTLASLSKKDDKKKGANAAKEKSADAQGGPSKKGGKKAAAAAKAGQQQSQPQAGTSKDAKAAPSTPSKGAAKPPKPQRERRGTTSSAAGKGAPSSSGPAAASTAAPTPADGASGEPSRRPRPVLGLASRQFEAALSGAGVERKSRREREKERERDKDASGAPSSDSPAHAQKATKEEKRERAPRGPPAPPTILQRDVQGGPAPPKILTRLPAAEGSAPSPVSATAGEGGDGPTGGGRGRGRGRGRGRGRGAASG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.83
2	0.85
3	0.89
4	0.91
5	0.92
6	0.91
7	0.87
8	0.87
9	0.8
10	0.79
11	0.78
12	0.76
13	0.72
14	0.64
15	0.65
16	0.61
17	0.66
18	0.62
19	0.57
20	0.5
21	0.49
22	0.56
23	0.53
24	0.58
25	0.56
26	0.57
27	0.6
28	0.63
29	0.67
30	0.62
31	0.61
32	0.57
33	0.51
34	0.45
35	0.4
36	0.4
37	0.32
38	0.27
39	0.24
40	0.19
41	0.23
42	0.23
43	0.19
44	0.15
45	0.15
46	0.16
47	0.16
48	0.16
49	0.17
50	0.22
51	0.22
52	0.23
53	0.23
54	0.23
55	0.3
56	0.36
57	0.37
58	0.4
59	0.47
60	0.53
61	0.59
62	0.68
63	0.71
64	0.73
65	0.74
66	0.74
67	0.73
68	0.76
69	0.73
70	0.66
71	0.56
72	0.51
73	0.47
74	0.39
75	0.34
76	0.31
77	0.31
78	0.28
79	0.3
80	0.28
81	0.25
82	0.25
83	0.27
84	0.2
85	0.19
86	0.19
87	0.17
88	0.21
89	0.2
90	0.19
91	0.22
92	0.24
93	0.23
94	0.29
95	0.29
96	0.25
97	0.31
98	0.3
99	0.27
100	0.28
101	0.25
102	0.19
103	0.19
104	0.18
105	0.12
106	0.12
107	0.09
108	0.08
109	0.08
110	0.08
111	0.1
112	0.09
113	0.1
114	0.15
115	0.22
116	0.3
117	0.39
118	0.47
119	0.45
120	0.53
121	0.61
122	0.63
123	0.63
124	0.58
125	0.52
126	0.53
127	0.55
128	0.48
129	0.41
130	0.34
131	0.27
132	0.25
133	0.21
134	0.12
135	0.11
136	0.1
137	0.09
138	0.09
139	0.09
140	0.09
141	0.09
142	0.09
143	0.08
144	0.09
145	0.09
146	0.11
147	0.13
148	0.14
149	0.15
150	0.14
151	0.14
152	0.15
153	0.16
154	0.14
155	0.14
156	0.13
157	0.12
158	0.11
159	0.11
160	0.09
161	0.08
162	0.07
163	0.06
164	0.07
165	0.07
166	0.09
167	0.09
168	0.11
169	0.12
170	0.14
171	0.13
172	0.13
173	0.15
174	0.14
175	0.14
176	0.13
177	0.14
178	0.12
179	0.12
180	0.13
181	0.13
182	0.17
183	0.24
184	0.26
185	0.27
186	0.27
187	0.28
188	0.35
189	0.4
190	0.36
191	0.36
192	0.39
193	0.38
194	0.43
195	0.43
196	0.37
197	0.31
198	0.32
199	0.29
200	0.25
201	0.23
202	0.18
203	0.18
204	0.18
205	0.2
206	0.19
207	0.17
208	0.23
209	0.28
210	0.32
211	0.37
212	0.43
213	0.45
214	0.5
215	0.58
216	0.57
217	0.6
218	0.62
219	0.58
220	0.55
221	0.5
222	0.43
223	0.35
224	0.3
225	0.23
226	0.15
227	0.16
228	0.16
229	0.17
230	0.17
231	0.17
232	0.21
233	0.23
234	0.29
235	0.28
236	0.28
237	0.29
238	0.35
239	0.4
240	0.37
241	0.36
242	0.31
243	0.33
244	0.35
245	0.33
246	0.27
247	0.21
248	0.22
249	0.24
250	0.26
251	0.21
252	0.16
253	0.18
254	0.17
255	0.2
256	0.19
257	0.18
258	0.18
259	0.19
260	0.19
261	0.18
262	0.2
263	0.2
264	0.23
265	0.24
266	0.22
267	0.26
268	0.27
269	0.27
270	0.34
271	0.4
272	0.4
273	0.46
274	0.56
275	0.62
276	0.68
277	0.75
278	0.77
279	0.78
280	0.78
281	0.77
282	0.74
283	0.66
284	0.6
285	0.58
286	0.51
287	0.42
288	0.36
289	0.29
290	0.21
291	0.2
292	0.18
293	0.12
294	0.09
295	0.09
296	0.09
297	0.1
298	0.1
299	0.09
300	0.09
301	0.09
302	0.09
303	0.08
304	0.09
305	0.08
306	0.08
307	0.07
308	0.08
309	0.08
310	0.08
311	0.07
312	0.07
313	0.1
314	0.13
315	0.14
316	0.16
317	0.22
318	0.25
319	0.28
320	0.29
321	0.28
322	0.31
323	0.39
324	0.43
325	0.43
326	0.48
327	0.49
328	0.49
329	0.48
330	0.41
331	0.33
332	0.25
333	0.2
334	0.11
335	0.09
336	0.05
337	0.06
338	0.06
339	0.08
340	0.08
341	0.11
342	0.14
343	0.21
344	0.29
345	0.38
346	0.47
347	0.56
348	0.66
349	0.74
350	0.82
351	0.85
352	0.87
353	0.88
354	0.85
355	0.79
356	0.71
357	0.67
358	0.59
359	0.53
360	0.44
361	0.36
362	0.31
363	0.26
364	0.27
365	0.21
366	0.2
367	0.18
368	0.21
369	0.23
370	0.24
371	0.25
372	0.27
373	0.35
374	0.43
375	0.45
376	0.5
377	0.56
378	0.63
379	0.72
380	0.76
381	0.75
382	0.75
383	0.77
384	0.78
385	0.77
386	0.73
387	0.68
388	0.66
389	0.63
390	0.56
391	0.55
392	0.51
393	0.48
394	0.42
395	0.39
396	0.38
397	0.33
398	0.33
399	0.3
400	0.27
401	0.27
402	0.29
403	0.28
404	0.24
405	0.25
406	0.27
407	0.27
408	0.26
409	0.28
410	0.28
411	0.3
412	0.31
413	0.31
414	0.29
415	0.27
416	0.25
417	0.22
418	0.19
419	0.17
420	0.15
421	0.14
422	0.12
423	0.11
424	0.11
425	0.1
426	0.1
427	0.11
428	0.11
429	0.12
430	0.1
431	0.1
432	0.09
433	0.07
434	0.07
435	0.07
436	0.12
437	0.12
438	0.19
439	0.25
440	0.34
441	0.38
442	0.47
443	0.55
444	0.6
445	0.67
446	0.7
447	0.71
448	0.7

A0A5C2SE81

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer