FuNGI

A0A5C2SCW2

Protein Details

Accession

A0A5C2SCW2

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
31-82	RREAQKRKEVEEKERREREQEAKLRIKRLEEQKREQERRERQERERQAKERE	Basic
439-463	ALAEEKRHEEEKRRRKKEKEKRGNY	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
30-85	QRREAQKRKEVEEKERREREQEAKLRIKRLEEQKREQERRERQERERQAKERELQR
349-379	KASASANRAIPKKRRSPSSSVSPPPARRRPA
444-461	KRHEEEKRRRKKEKEKRG

Subcellular Location(s)

nucl 16.5, cyto_nucl 10, mito 7

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013256 Chromatin_SPT2
Pfam	View protein in Pfam PF08243 SPT2

Amino Acid Sequences

MTSWQALMAISATQTQQAKEAVQSALAERQRREAQKRKEVEEKERREREQEAKLRIKRLEEQKREQERRERQERERQAKERELQRREEQQRDALLHGPKRSRDGQGYPVSGSAKRRHSSASDDDEAGPSNALTREEKRQRRLEAELRGGRSTARRSTMGGGGYNKAGRRLPGGAVDITTTLSGSSSQSSPGKSQSVRERLAAEPAKLIKLNTNKRDTRTIDEIIQDRAKLRQGKVLDGESAREFNDWFGKAKKDPPKKPAVSATSASTSRANTPAVGAGSQSKAASGSVSPSAYSSAPSKSQSQPKSSISSSKPAPAKTANPARTPASKAASSKPLPSSSRTPVPSASKASASANRAIPKKRRSPSSSVSPPPARRRPAPGGSSNDISSEIWKLFGKDRSSYLQRDVFSDDEDMEAGAFDVEKEELRSSRLAKKEDLEALAEEKRHEEEKRRRKKEKEKRGNY

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.17
2	0.16
3	0.19
4	0.2
5	0.21
6	0.21
7	0.25
8	0.2
9	0.2
10	0.21
11	0.19
12	0.26
13	0.29
14	0.32
15	0.3
16	0.37
17	0.44
18	0.52
19	0.6
20	0.62
21	0.68
22	0.73
23	0.79
24	0.78
25	0.8
26	0.78
27	0.79
28	0.8
29	0.79
30	0.8
31	0.81
32	0.77
33	0.72
34	0.72
35	0.69
36	0.68
37	0.67
38	0.66
39	0.68
40	0.7
41	0.72
42	0.68
43	0.65
44	0.63
45	0.66
46	0.67
47	0.66
48	0.7
49	0.74
50	0.82
51	0.84
52	0.83
53	0.83
54	0.83
55	0.84
56	0.85
57	0.82
58	0.8
59	0.83
60	0.86
61	0.86
62	0.85
63	0.82
64	0.8
65	0.8
66	0.79
67	0.78
68	0.77
69	0.73
70	0.7
71	0.7
72	0.73
73	0.72
74	0.71
75	0.65
76	0.6
77	0.6
78	0.54
79	0.49
80	0.44
81	0.43
82	0.4
83	0.42
84	0.42
85	0.39
86	0.42
87	0.44
88	0.43
89	0.43
90	0.43
91	0.46
92	0.48
93	0.48
94	0.43
95	0.41
96	0.38
97	0.35
98	0.36
99	0.35
100	0.36
101	0.35
102	0.36
103	0.37
104	0.37
105	0.41
106	0.43
107	0.44
108	0.38
109	0.39
110	0.38
111	0.35
112	0.33
113	0.27
114	0.19
115	0.11
116	0.11
117	0.1
118	0.11
119	0.14
120	0.16
121	0.26
122	0.36
123	0.44
124	0.5
125	0.56
126	0.58
127	0.6
128	0.65
129	0.62
130	0.6
131	0.61
132	0.58
133	0.54
134	0.5
135	0.45
136	0.39
137	0.36
138	0.33
139	0.28
140	0.27
141	0.25
142	0.26
143	0.29
144	0.31
145	0.28
146	0.26
147	0.24
148	0.21
149	0.22
150	0.23
151	0.2
152	0.19
153	0.18
154	0.16
155	0.17
156	0.18
157	0.17
158	0.17
159	0.19
160	0.17
161	0.16
162	0.16
163	0.13
164	0.11
165	0.1
166	0.07
167	0.05
168	0.05
169	0.05
170	0.06
171	0.07
172	0.07
173	0.1
174	0.12
175	0.14
176	0.15
177	0.17
178	0.21
179	0.2
180	0.25
181	0.31
182	0.36
183	0.36
184	0.36
185	0.37
186	0.33
187	0.4
188	0.37
189	0.28
190	0.24
191	0.23
192	0.23
193	0.2
194	0.2
195	0.18
196	0.25
197	0.33
198	0.37
199	0.44
200	0.45
201	0.48
202	0.55
203	0.52
204	0.49
205	0.45
206	0.41
207	0.35
208	0.35
209	0.33
210	0.29
211	0.27
212	0.22
213	0.17
214	0.17
215	0.2
216	0.21
217	0.2
218	0.22
219	0.22
220	0.24
221	0.26
222	0.26
223	0.23
224	0.19
225	0.2
226	0.15
227	0.15
228	0.13
229	0.11
230	0.1
231	0.08
232	0.12
233	0.11
234	0.12
235	0.14
236	0.16
237	0.18
238	0.26
239	0.35
240	0.41
241	0.47
242	0.52
243	0.6
244	0.59
245	0.61
246	0.61
247	0.55
248	0.49
249	0.44
250	0.4
251	0.33
252	0.31
253	0.29
254	0.23
255	0.19
256	0.17
257	0.17
258	0.16
259	0.12
260	0.12
261	0.13
262	0.12
263	0.11
264	0.1
265	0.09
266	0.1
267	0.11
268	0.1
269	0.08
270	0.08
271	0.08
272	0.08
273	0.06
274	0.08
275	0.09
276	0.09
277	0.09
278	0.09
279	0.11
280	0.1
281	0.12
282	0.11
283	0.12
284	0.14
285	0.16
286	0.21
287	0.26
288	0.35
289	0.38
290	0.41
291	0.45
292	0.45
293	0.48
294	0.45
295	0.47
296	0.4
297	0.42
298	0.38
299	0.39
300	0.4
301	0.36
302	0.38
303	0.34
304	0.35
305	0.38
306	0.46
307	0.44
308	0.42
309	0.45
310	0.44
311	0.44
312	0.45
313	0.4
314	0.35
315	0.33
316	0.33
317	0.35
318	0.4
319	0.38
320	0.38
321	0.38
322	0.4
323	0.38
324	0.41
325	0.42
326	0.4
327	0.46
328	0.43
329	0.42
330	0.41
331	0.45
332	0.44
333	0.43
334	0.39
335	0.32
336	0.32
337	0.34
338	0.34
339	0.31
340	0.32
341	0.32
342	0.36
343	0.4
344	0.46
345	0.51
346	0.54
347	0.62
348	0.64
349	0.68
350	0.69
351	0.72
352	0.72
353	0.74
354	0.74
355	0.7
356	0.71
357	0.7
358	0.71
359	0.73
360	0.74
361	0.69
362	0.65
363	0.68
364	0.68
365	0.68
366	0.67
367	0.64
368	0.63
369	0.61
370	0.6
371	0.51
372	0.43
373	0.37
374	0.3
375	0.24
376	0.2
377	0.15
378	0.15
379	0.15
380	0.17
381	0.21
382	0.28
383	0.3
384	0.3
385	0.33
386	0.39
387	0.44
388	0.46
389	0.47
390	0.45
391	0.42
392	0.42
393	0.42
394	0.35
395	0.31
396	0.29
397	0.22
398	0.18
399	0.17
400	0.14
401	0.1
402	0.09
403	0.07
404	0.05
405	0.05
406	0.04
407	0.05
408	0.06
409	0.07
410	0.1
411	0.13
412	0.14
413	0.16
414	0.21
415	0.25
416	0.32
417	0.39
418	0.41
419	0.42
420	0.44
421	0.48
422	0.49
423	0.46
424	0.4
425	0.34
426	0.35
427	0.34
428	0.32
429	0.26
430	0.23
431	0.25
432	0.28
433	0.31
434	0.38
435	0.45
436	0.55
437	0.66
438	0.74
439	0.81
440	0.87
441	0.93
442	0.93
443	0.94

A0A5C2SCW2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer