FuNGI

A0A5C2SMC1

Protein Details

Accession

A0A5C2SMC1

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
818-838	VKEDVRKRDKRTYDKEQPLCL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
944-959	KTPSKRGRAAGPAGKS

Subcellular Location(s)

mito 14, nucl 7.5, cyto_nucl 5, pero 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007855 RNA-dep_RNA_pol_euk-typ
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding GO:0003968 F:RNA-dependent RNA polymerase activity GO:0031047 P:RNA-mediated gene silencing
Pfam	View protein in Pfam PF05183 RdRP

Amino Acid Sequences

MPQTPSRSAYARHSSVDSPSPSRRVPETPTISRVCDSFASTVGLRTPASSSARRLEDIRRALDDSKPAGGVCVIAHSKEVQKLFDRMHISWAVQYEIARGVSLGWWDWDEVTAEKLKLLQGLNNSAAAQVSQMIRGRAIGATTPLDVAIWAELDREEAAIREGRLRGLGLQGEWQEQANWYGGHIQQVARLEQTDNSFRLVLAKMEMRKSHRFARFLGSRRLLQISVPVTMMYERPDALRDFFRQRFVLCGRVFVVLGAKDNKAFLMEVPEEYERGCGVPGDEQRMSLEDFINWHNPLQRNGDQPVKKYVTRFDLGFSISVPVLSFAKIFYIRDEYVPGYGPDSDRNAPAECIYTDGCGYMNGAALCAIARQMGLEERPTAVQGRIAGAKGLWMLHFRDQSSTGIPKIWIRESQVKIQLDHDNVHPAHRIFDLLAPPRVSVPSRLSRLTILNLAHNGVSVDVFEELMRNTVDTEVKALTDWLGPKAMLLLWRAVDKAGGVAMKRIMQHAQGTTRATGLTGRIREDDSEQSDDLFDPSLIDELQGLDEDEMPSVNSLRDPSTGEPLSIHATVMDLLMAGFHPMRQQLLYDKLKKIVTDVIEGIIKDFHISVPLSAEAFIVPDPYGVLKEGEIHFRSTKDLKDAVEHSQPHIILGEVLIYRNPCRLPSDVRKVTAVDCPELSEYANVIVLPTVGPCSYASILAGGDTCVCIYDPRIVEPFVNSEIFTASENFLKDNFEDQGKIQQVSALATEMTQAPDTEARRRKLQEALLCGLVTAPIGQYSSFHENAIYMNGYDHPDTIRIAFMFNTILDSRKTGHVVKEDVRKRDKRTYDKEQPLCLKSTKSAAGPSQDNFLQLKRGPGLGRFVLDDLLAAGKQMRDEKLKQYDKLATFRYERDPDLVAPYNRARPFMTHDTFKDDLALIEQHVLEHITKYQATVGASFKTPKTPSKRGRAAGPAGKSGKSMRVLWDELVRSFAAGPDIPRDSPVVALGDLEQLKASWAYEKNMKFAWKVAFQALCRIKASTRNPVALTSEFADMMSIPSTAGRVLEQSRLALA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.44
2	0.45
3	0.49
4	0.45
5	0.42
6	0.45
7	0.48
8	0.46
9	0.48
10	0.48
11	0.46
12	0.47
13	0.51
14	0.54
15	0.54
16	0.59
17	0.58
18	0.56
19	0.52
20	0.46
21	0.38
22	0.32
23	0.29
24	0.23
25	0.21
26	0.22
27	0.21
28	0.22
29	0.21
30	0.21
31	0.18
32	0.18
33	0.18
34	0.2
35	0.26
36	0.28
37	0.31
38	0.36
39	0.39
40	0.4
41	0.42
42	0.44
43	0.48
44	0.5
45	0.5
46	0.46
47	0.46
48	0.46
49	0.47
50	0.45
51	0.38
52	0.34
53	0.31
54	0.27
55	0.24
56	0.22
57	0.19
58	0.13
59	0.16
60	0.15
61	0.15
62	0.16
63	0.18
64	0.22
65	0.27
66	0.29
67	0.26
68	0.29
69	0.34
70	0.36
71	0.4
72	0.41
73	0.36
74	0.4
75	0.38
76	0.34
77	0.32
78	0.31
79	0.26
80	0.22
81	0.21
82	0.18
83	0.18
84	0.18
85	0.15
86	0.13
87	0.12
88	0.12
89	0.13
90	0.12
91	0.1
92	0.1
93	0.11
94	0.11
95	0.12
96	0.12
97	0.11
98	0.14
99	0.16
100	0.16
101	0.15
102	0.17
103	0.17
104	0.19
105	0.2
106	0.2
107	0.21
108	0.26
109	0.27
110	0.27
111	0.26
112	0.22
113	0.21
114	0.17
115	0.13
116	0.11
117	0.11
118	0.14
119	0.16
120	0.17
121	0.17
122	0.17
123	0.18
124	0.15
125	0.16
126	0.13
127	0.13
128	0.14
129	0.14
130	0.14
131	0.12
132	0.11
133	0.1
134	0.09
135	0.07
136	0.06
137	0.06
138	0.06
139	0.06
140	0.08
141	0.08
142	0.08
143	0.07
144	0.07
145	0.1
146	0.12
147	0.13
148	0.16
149	0.17
150	0.17
151	0.18
152	0.18
153	0.17
154	0.18
155	0.18
156	0.14
157	0.18
158	0.19
159	0.19
160	0.19
161	0.19
162	0.16
163	0.15
164	0.16
165	0.14
166	0.12
167	0.11
168	0.15
169	0.16
170	0.19
171	0.2
172	0.18
173	0.19
174	0.22
175	0.23
176	0.19
177	0.2
178	0.17
179	0.18
180	0.23
181	0.24
182	0.22
183	0.23
184	0.22
185	0.21
186	0.23
187	0.21
188	0.17
189	0.16
190	0.2
191	0.22
192	0.27
193	0.32
194	0.35
195	0.42
196	0.45
197	0.52
198	0.53
199	0.52
200	0.49
201	0.54
202	0.56
203	0.55
204	0.6
205	0.54
206	0.49
207	0.5
208	0.5
209	0.41
210	0.33
211	0.33
212	0.25
213	0.22
214	0.21
215	0.17
216	0.15
217	0.16
218	0.16
219	0.13
220	0.12
221	0.11
222	0.12
223	0.14
224	0.15
225	0.17
226	0.21
227	0.23
228	0.3
229	0.32
230	0.36
231	0.35
232	0.33
233	0.37
234	0.35
235	0.39
236	0.31
237	0.31
238	0.27
239	0.27
240	0.27
241	0.2
242	0.21
243	0.14
244	0.17
245	0.17
246	0.17
247	0.16
248	0.16
249	0.16
250	0.13
251	0.13
252	0.1
253	0.14
254	0.14
255	0.14
256	0.17
257	0.17
258	0.17
259	0.16
260	0.17
261	0.1
262	0.1
263	0.09
264	0.06
265	0.07
266	0.13
267	0.15
268	0.2
269	0.2
270	0.2
271	0.21
272	0.22
273	0.22
274	0.18
275	0.16
276	0.1
277	0.12
278	0.14
279	0.18
280	0.17
281	0.17
282	0.22
283	0.24
284	0.26
285	0.32
286	0.33
287	0.34
288	0.37
289	0.45
290	0.41
291	0.41
292	0.47
293	0.44
294	0.42
295	0.4
296	0.41
297	0.38
298	0.38
299	0.35
300	0.28
301	0.26
302	0.25
303	0.23
304	0.19
305	0.14
306	0.12
307	0.11
308	0.09
309	0.08
310	0.08
311	0.08
312	0.08
313	0.06
314	0.09
315	0.1
316	0.11
317	0.11
318	0.16
319	0.17
320	0.17
321	0.19
322	0.17
323	0.17
324	0.18
325	0.16
326	0.12
327	0.13
328	0.13
329	0.13
330	0.17
331	0.17
332	0.17
333	0.19
334	0.18
335	0.18
336	0.17
337	0.17
338	0.13
339	0.14
340	0.13
341	0.11
342	0.1
343	0.1
344	0.1
345	0.08
346	0.08
347	0.06
348	0.08
349	0.07
350	0.07
351	0.07
352	0.06
353	0.06
354	0.06
355	0.05
356	0.03
357	0.03
358	0.03
359	0.04
360	0.06
361	0.07
362	0.08
363	0.09
364	0.09
365	0.1
366	0.11
367	0.11
368	0.1
369	0.11
370	0.1
371	0.11
372	0.12
373	0.12
374	0.11
375	0.1
376	0.1
377	0.09
378	0.09
379	0.08
380	0.08
381	0.1
382	0.14
383	0.17
384	0.16
385	0.18
386	0.19
387	0.19
388	0.21
389	0.21
390	0.17
391	0.16
392	0.17
393	0.17
394	0.18
395	0.19
396	0.18
397	0.21
398	0.29
399	0.31
400	0.36
401	0.41
402	0.39
403	0.38
404	0.4
405	0.39
406	0.32
407	0.31
408	0.26
409	0.25
410	0.24
411	0.24
412	0.23
413	0.19
414	0.19
415	0.17
416	0.17
417	0.11
418	0.14
419	0.18
420	0.18
421	0.21
422	0.19
423	0.19
424	0.19
425	0.2
426	0.18
427	0.16
428	0.19
429	0.22
430	0.25
431	0.26
432	0.26
433	0.26
434	0.27
435	0.25
436	0.24
437	0.18
438	0.17
439	0.17
440	0.16
441	0.14
442	0.12
443	0.11
444	0.07
445	0.06
446	0.04
447	0.04
448	0.04
449	0.04
450	0.04
451	0.05
452	0.04
453	0.06
454	0.06
455	0.05
456	0.05
457	0.07
458	0.08
459	0.07
460	0.09
461	0.08
462	0.08
463	0.08
464	0.08
465	0.07
466	0.08
467	0.09
468	0.08
469	0.08
470	0.08
471	0.08
472	0.08
473	0.08
474	0.08
475	0.08
476	0.09
477	0.09
478	0.09
479	0.1
480	0.09
481	0.08
482	0.06
483	0.06
484	0.06
485	0.06
486	0.05
487	0.06
488	0.07
489	0.09
490	0.1
491	0.11
492	0.11
493	0.11
494	0.13
495	0.14
496	0.15
497	0.16
498	0.17
499	0.16
500	0.15
501	0.14
502	0.12
503	0.11
504	0.11
505	0.12
506	0.12
507	0.13
508	0.14
509	0.14
510	0.15
511	0.17
512	0.18
513	0.16
514	0.18
515	0.16
516	0.15
517	0.15
518	0.15
519	0.12
520	0.1
521	0.07
522	0.05
523	0.05
524	0.05
525	0.05
526	0.04
527	0.04
528	0.04
529	0.04
530	0.04
531	0.04
532	0.04
533	0.05
534	0.05
535	0.05
536	0.04
537	0.04
538	0.04
539	0.05
540	0.05
541	0.05
542	0.06
543	0.07
544	0.08
545	0.1
546	0.11
547	0.16
548	0.16
549	0.16
550	0.15
551	0.15
552	0.17
553	0.15
554	0.14
555	0.08
556	0.08
557	0.08
558	0.07
559	0.06
560	0.03
561	0.03
562	0.03
563	0.03
564	0.04
565	0.03
566	0.04
567	0.05
568	0.05
569	0.06
570	0.06
571	0.07
572	0.09
573	0.18
574	0.24
575	0.28
576	0.29
577	0.33
578	0.34
579	0.33
580	0.31
581	0.27
582	0.22
583	0.19
584	0.18
585	0.15
586	0.15
587	0.15
588	0.14
589	0.1
590	0.09
591	0.07
592	0.06
593	0.05
594	0.06
595	0.07
596	0.06
597	0.07
598	0.08
599	0.08
600	0.08
601	0.08
602	0.06
603	0.06
604	0.06
605	0.05
606	0.05
607	0.05
608	0.05
609	0.05
610	0.05
611	0.06
612	0.06
613	0.05
614	0.09
615	0.1
616	0.15
617	0.16
618	0.18
619	0.18
620	0.19
621	0.22
622	0.21
623	0.21
624	0.2
625	0.22
626	0.2
627	0.22
628	0.24
629	0.25
630	0.29
631	0.28
632	0.25
633	0.26
634	0.25
635	0.22
636	0.2
637	0.15
638	0.09
639	0.08
640	0.09
641	0.06
642	0.07
643	0.07
644	0.08
645	0.09
646	0.12
647	0.12
648	0.11
649	0.14
650	0.16
651	0.24
652	0.32
653	0.42
654	0.43
655	0.44
656	0.44
657	0.43
658	0.41
659	0.37
660	0.3
661	0.21
662	0.17
663	0.17
664	0.17
665	0.16
666	0.15
667	0.1
668	0.09
669	0.08
670	0.08
671	0.06
672	0.06
673	0.05
674	0.05
675	0.04
676	0.04
677	0.05
678	0.04
679	0.06
680	0.06
681	0.08
682	0.09
683	0.09
684	0.09
685	0.08
686	0.08
687	0.08
688	0.08
689	0.05
690	0.05
691	0.05
692	0.05
693	0.04
694	0.04
695	0.05
696	0.06
697	0.12
698	0.12
699	0.14
700	0.16
701	0.17
702	0.17
703	0.18
704	0.19
705	0.15
706	0.15
707	0.13
708	0.12
709	0.12
710	0.12
711	0.12
712	0.1
713	0.09
714	0.11
715	0.11
716	0.12
717	0.12
718	0.12
719	0.12
720	0.13
721	0.14
722	0.13
723	0.14
724	0.14
725	0.21
726	0.22
727	0.22
728	0.19
729	0.19
730	0.18
731	0.18
732	0.17
733	0.1
734	0.08
735	0.07
736	0.08
737	0.08
738	0.08
739	0.08
740	0.07
741	0.08
742	0.13
743	0.15
744	0.24
745	0.3
746	0.32
747	0.39
748	0.42
749	0.44
750	0.46
751	0.5
752	0.47
753	0.45
754	0.44
755	0.39
756	0.36
757	0.32
758	0.26
759	0.19
760	0.13
761	0.08
762	0.05
763	0.04
764	0.05
765	0.05
766	0.06
767	0.11
768	0.16
769	0.17
770	0.17
771	0.16
772	0.16
773	0.17
774	0.18
775	0.14
776	0.09
777	0.09
778	0.11
779	0.13
780	0.13
781	0.13
782	0.12
783	0.12
784	0.13
785	0.12
786	0.13
787	0.11
788	0.11
789	0.11
790	0.11
791	0.1
792	0.1
793	0.12
794	0.11
795	0.13
796	0.12
797	0.14
798	0.15
799	0.17
800	0.21
801	0.2
802	0.24
803	0.27
804	0.32
805	0.37
806	0.44
807	0.48
808	0.53
809	0.6
810	0.62
811	0.64
812	0.69
813	0.73
814	0.73
815	0.76
816	0.78
817	0.79
818	0.83
819	0.82
820	0.8
821	0.77
822	0.7
823	0.65
824	0.56
825	0.48
826	0.4
827	0.39
828	0.34
829	0.29
830	0.31
831	0.3
832	0.33
833	0.34
834	0.33
835	0.32
836	0.29
837	0.3
838	0.26
839	0.24
840	0.24
841	0.22
842	0.25
843	0.22
844	0.25
845	0.24
846	0.25
847	0.3
848	0.26
849	0.26
850	0.23
851	0.22
852	0.19
853	0.17
854	0.15
855	0.09
856	0.09
857	0.08
858	0.07
859	0.08
860	0.08
861	0.11
862	0.15
863	0.18
864	0.23
865	0.27
866	0.35
867	0.45
868	0.51
869	0.5
870	0.52
871	0.57
872	0.55
873	0.58
874	0.53
875	0.48
876	0.45
877	0.47
878	0.49
879	0.45
880	0.42
881	0.38
882	0.36
883	0.32
884	0.36
885	0.39
886	0.32
887	0.33
888	0.36
889	0.41
890	0.4
891	0.41
892	0.35
893	0.31
894	0.39
895	0.43
896	0.44
897	0.41
898	0.42
899	0.47
900	0.47
901	0.44
902	0.37
903	0.28
904	0.23
905	0.2
906	0.2
907	0.12
908	0.14
909	0.14
910	0.12
911	0.12
912	0.13
913	0.11
914	0.11
915	0.13
916	0.14
917	0.14
918	0.15
919	0.16
920	0.17
921	0.18
922	0.19
923	0.2
924	0.19
925	0.22
926	0.24
927	0.23
928	0.28
929	0.31
930	0.37
931	0.44
932	0.52
933	0.59
934	0.67
935	0.75
936	0.71
937	0.75
938	0.74
939	0.74
940	0.71
941	0.65
942	0.62
943	0.56
944	0.53
945	0.47
946	0.42
947	0.39
948	0.36
949	0.35
950	0.32
951	0.36
952	0.37
953	0.37
954	0.41
955	0.37
956	0.33
957	0.34
958	0.27
959	0.22
960	0.2
961	0.18
962	0.15
963	0.14
964	0.15
965	0.18
966	0.22
967	0.21
968	0.22
969	0.23
970	0.2
971	0.2
972	0.2
973	0.16
974	0.13
975	0.13
976	0.13
977	0.17
978	0.17
979	0.16
980	0.14
981	0.12
982	0.14
983	0.14
984	0.14
985	0.14
986	0.17
987	0.22
988	0.3
989	0.32
990	0.34
991	0.38
992	0.41
993	0.35
994	0.38
995	0.4
996	0.36
997	0.38
998	0.4
999	0.41
1000	0.38
1001	0.47
1002	0.47
1003	0.44
1004	0.41
1005	0.4
1006	0.37
1007	0.42
1008	0.48
1009	0.48
1010	0.49
1011	0.51
1012	0.51
1013	0.51
1014	0.52
1015	0.44
1016	0.41
1017	0.32
1018	0.28
1019	0.22
1020	0.21
1021	0.19
1022	0.14
1023	0.14
1024	0.12
1025	0.09
1026	0.08
1027	0.08
1028	0.09
1029	0.09
1030	0.09
1031	0.09
1032	0.13
1033	0.15
1034	0.2
1035	0.21

A0A5C2SMC1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer