FuNGI

A0A5C2RR51

Protein Details

Accession

A0A5C2RR51

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
271-311	SDDERSSKEKERKRKRRERDDDSPRRDRKRSKRSRSSSGSD	Basic
314-424	DSESEDERERRRRKKKGKSRSRAASSDDESDDERERRKRKKKRSRESSDVEMSEGEDRRSKSKRKKSKRRHSSSESDSGSGSESDRSRTRSRSRSKSKASSSSKRKRSVSP	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
277-305	SKEKERKRKRRERDDDSPRRDRKRSKRSR
321-337	RERRRRKKKGKSRSRAA
347-359	RERRKRKKKRSRE
370-385	DRRSKSKRKKSKRRHS
399-420	RSRTRSRSRSKSKASSSSKRKR

Subcellular Location(s)

nucl 21, mito 3, cyto 3, cyto_mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007832 RNA_pol_Rpc34 IPR016049 RNA_pol_Rpc34-like IPR036388 WH-like_DNA-bd_sf IPR036390 WH_DNA-bd_sf
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05158 RNA_pol_Rpc34

Amino Acid Sequences

MSGRKLNSLEQKLHQAALADPKHTLTQKECEALIPDAAARTAALNFLLGTGLLKAMKDTKGAVSFRAVMKKELEVKKDLSGEEAMILSYIQAAKNEGIWTKHLKAKTELHQTVIDRCLKSLVQKQLIKATKSVKYPTRKIYMLYHLQPSDEMTGGPWYTDNELDTEFIKLLCSACVRFIRDRSTPKQKHTDSSSSGTQPLYPISAAPQYPTAQQIQSFLSKSRITETELTVEHVETLLNVLVLDGDIERVPAFGAAMWDTSDNAARASGASDDERSSKEKERKRKRRERDDDSPRRDRKRSKRSRSSSGSDSEDSESEDERERRRRKKKGKSRSRAASSDDESDDERERRKRKKKRSRESSDVEMSEGEDRRSKSKRKKSKRRHSSSESDSGSGSESDRSRTRSRSRSKSKASSSSKRKRSVSPGGAEDVTAAFLQEDYGAYVYRAVQQERAAGGGGGLSQAPCVRCPTFDFCKDGGPVNPQECEYYGTWLSAAEVAKG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.45
2	0.37
3	0.33
4	0.37
5	0.36
6	0.28
7	0.26
8	0.27
9	0.32
10	0.33
11	0.34
12	0.29
13	0.34
14	0.38
15	0.4
16	0.39
17	0.35
18	0.36
19	0.34
20	0.29
21	0.22
22	0.18
23	0.16
24	0.15
25	0.13
26	0.09
27	0.09
28	0.09
29	0.09
30	0.08
31	0.08
32	0.08
33	0.08
34	0.08
35	0.06
36	0.06
37	0.06
38	0.08
39	0.08
40	0.08
41	0.09
42	0.14
43	0.15
44	0.16
45	0.17
46	0.21
47	0.28
48	0.29
49	0.29
50	0.28
51	0.31
52	0.34
53	0.4
54	0.37
55	0.32
56	0.33
57	0.37
58	0.43
59	0.46
60	0.45
61	0.41
62	0.42
63	0.44
64	0.45
65	0.4
66	0.33
67	0.28
68	0.24
69	0.2
70	0.18
71	0.13
72	0.1
73	0.09
74	0.06
75	0.07
76	0.08
77	0.08
78	0.08
79	0.1
80	0.1
81	0.13
82	0.15
83	0.16
84	0.17
85	0.2
86	0.25
87	0.28
88	0.33
89	0.34
90	0.35
91	0.39
92	0.45
93	0.5
94	0.54
95	0.51
96	0.49
97	0.51
98	0.49
99	0.48
100	0.46
101	0.43
102	0.32
103	0.31
104	0.31
105	0.27
106	0.32
107	0.35
108	0.38
109	0.41
110	0.43
111	0.45
112	0.51
113	0.56
114	0.52
115	0.48
116	0.46
117	0.43
118	0.45
119	0.49
120	0.48
121	0.51
122	0.56
123	0.59
124	0.59
125	0.55
126	0.53
127	0.53
128	0.52
129	0.51
130	0.48
131	0.46
132	0.4
133	0.39
134	0.36
135	0.32
136	0.25
137	0.18
138	0.14
139	0.09
140	0.11
141	0.11
142	0.11
143	0.09
144	0.09
145	0.1
146	0.11
147	0.1
148	0.09
149	0.1
150	0.1
151	0.1
152	0.1
153	0.09
154	0.08
155	0.08
156	0.08
157	0.07
158	0.08
159	0.09
160	0.09
161	0.13
162	0.17
163	0.2
164	0.23
165	0.26
166	0.3
167	0.35
168	0.42
169	0.45
170	0.53
171	0.55
172	0.58
173	0.65
174	0.61
175	0.61
176	0.61
177	0.59
178	0.52
179	0.51
180	0.49
181	0.4
182	0.4
183	0.34
184	0.27
185	0.21
186	0.17
187	0.14
188	0.1
189	0.08
190	0.08
191	0.11
192	0.11
193	0.11
194	0.13
195	0.13
196	0.14
197	0.16
198	0.15
199	0.13
200	0.14
201	0.15
202	0.14
203	0.16
204	0.16
205	0.15
206	0.18
207	0.18
208	0.18
209	0.19
210	0.18
211	0.19
212	0.2
213	0.2
214	0.2
215	0.19
216	0.21
217	0.18
218	0.17
219	0.13
220	0.11
221	0.09
222	0.06
223	0.06
224	0.04
225	0.04
226	0.04
227	0.03
228	0.03
229	0.03
230	0.03
231	0.03
232	0.03
233	0.03
234	0.03
235	0.03
236	0.04
237	0.04
238	0.03
239	0.03
240	0.03
241	0.04
242	0.04
243	0.04
244	0.05
245	0.05
246	0.05
247	0.06
248	0.06
249	0.06
250	0.06
251	0.06
252	0.05
253	0.05
254	0.06
255	0.06
256	0.06
257	0.06
258	0.07
259	0.08
260	0.1
261	0.11
262	0.13
263	0.16
264	0.23
265	0.31
266	0.37
267	0.47
268	0.57
269	0.67
270	0.76
271	0.83
272	0.86
273	0.9
274	0.93
275	0.91
276	0.9
277	0.91
278	0.9
279	0.88
280	0.87
281	0.83
282	0.8
283	0.78
284	0.77
285	0.77
286	0.78
287	0.81
288	0.82
289	0.85
290	0.85
291	0.88
292	0.85
293	0.8
294	0.73
295	0.66
296	0.6
297	0.49
298	0.44
299	0.36
300	0.29
301	0.24
302	0.2
303	0.16
304	0.13
305	0.17
306	0.18
307	0.23
308	0.33
309	0.41
310	0.5
311	0.6
312	0.69
313	0.75
314	0.83
315	0.89
316	0.9
317	0.93
318	0.93
319	0.93
320	0.92
321	0.89
322	0.81
323	0.75
324	0.7
325	0.62
326	0.55
327	0.45
328	0.36
329	0.3
330	0.29
331	0.27
332	0.23
333	0.26
334	0.3
335	0.38
336	0.48
337	0.57
338	0.66
339	0.74
340	0.83
341	0.88
342	0.91
343	0.94
344	0.93
345	0.92
346	0.88
347	0.85
348	0.8
349	0.69
350	0.59
351	0.47
352	0.39
353	0.34
354	0.28
355	0.21
356	0.19
357	0.2
358	0.26
359	0.33
360	0.42
361	0.48
362	0.58
363	0.68
364	0.75
365	0.85
366	0.9
367	0.94
368	0.95
369	0.95
370	0.94
371	0.91
372	0.89
373	0.85
374	0.83
375	0.74
376	0.63
377	0.53
378	0.44
379	0.37
380	0.28
381	0.21
382	0.16
383	0.15
384	0.19
385	0.22
386	0.28
387	0.31
388	0.39
389	0.48
390	0.53
391	0.62
392	0.69
393	0.75
394	0.8
395	0.85
396	0.86
397	0.85
398	0.86
399	0.85
400	0.85
401	0.85
402	0.86
403	0.85
404	0.84
405	0.8
406	0.78
407	0.77
408	0.78
409	0.75
410	0.71
411	0.65
412	0.6
413	0.56
414	0.48
415	0.39
416	0.28
417	0.21
418	0.14
419	0.11
420	0.06
421	0.06
422	0.06
423	0.06
424	0.06
425	0.06
426	0.07
427	0.07
428	0.08
429	0.09
430	0.1
431	0.15
432	0.19
433	0.2
434	0.22
435	0.23
436	0.27
437	0.26
438	0.26
439	0.21
440	0.17
441	0.15
442	0.12
443	0.1
444	0.07
445	0.07
446	0.06
447	0.07
448	0.1
449	0.11
450	0.12
451	0.18
452	0.18
453	0.2
454	0.25
455	0.32
456	0.38
457	0.41
458	0.46
459	0.42
460	0.46
461	0.46
462	0.45
463	0.41
464	0.39
465	0.41
466	0.38
467	0.39
468	0.35
469	0.35
470	0.32
471	0.33
472	0.27
473	0.26
474	0.24
475	0.22
476	0.21
477	0.19
478	0.19
479	0.19

A0A5C2RR51

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer