Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C2SM34

Protein Details
Accession A0A5C2SM34    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
5-27TTSSSSLSSRRSRRKSTTTLGSTHydrophilic
125-159TEEERSPKRLRRSRSRSPPPPPRRRSPSPVRGRGYBasic
628-647HIPSKSCTPKSPRRTIWTRPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
118-171KRARPRTTEEERSPKRLRRSRSRSPPPPPRRRSPSPVRGRGYDDRRDDRRGRAG
Subcellular Location(s) mito 19, mito_nucl 12.833, cyto_mito 11.333, nucl 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR022967  S1_dom  
IPR003029  S1_domain  
Gene Ontology GO:0032991  C:protein-containing complex  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00575  S1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS50126  S1  
CDD cd05684  S1_DHX8_helicase  
Amino Acid Sequences MLTCTTSSSSLSSRRSRRKSTTTLGSTTKHLPIGASFPESFIENVDRLILTLHPKHKKSLAASGKENASDGVLDETDKKKRLFPGLALKDQEWEPTAPKDAIMKEVDDMMSQLEGAAKRARPRTTEEERSPKRLRRSRSRSPPPPPRRRSPSPVRGRGYDDRRDDRRGRAGGRQLDERPVLFKIYNGRVNGIKDFGAFVQLEGVVGRVEGMVHVSNIQQGARANTPADLLSRGQSVKVKVMSVAGSRVGLSMKDVDQATGRDLTPHLRIKSEAELAAEEERRAAHGANAVPLKSRGAKEEVVRSAKRLTSPERWEIKQLISSGALDASEYPDLDEDFANPLARAEVEEELDVEIREEEPPFLAGQTKKTLEMSPVKIVKAPDGSLNRAALAGASLAKERRELRQQEANEEADSEARDFSAPWLDPMAKEGDRVFAQDLRRDLRGQKAGEQPKWKEATFNKATTYGEITSLSIQDQRKSLPIYKLRDALLQAIREHQVLIVVGDTGSGKTTQMTQYLAEDGFADKGKIGCTQPRRVAAMSVAKRVAEEVGCRLGQEVGYTIRFEDCTSPETRIKYMTDGMLQRECLMDPDRLSNADQTSSLSLPLPRSTPRSSRSTSSAVPSSPSPVGHIPSKSCTPKSPRRTIWTRP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.61
2 0.69
3 0.75
4 0.8
5 0.82
6 0.83
7 0.83
8 0.83
9 0.79
10 0.76
11 0.72
12 0.65
13 0.59
14 0.56
15 0.5
16 0.41
17 0.35
18 0.29
19 0.25
20 0.28
21 0.27
22 0.26
23 0.23
24 0.22
25 0.22
26 0.23
27 0.21
28 0.18
29 0.19
30 0.14
31 0.14
32 0.15
33 0.14
34 0.13
35 0.14
36 0.14
37 0.17
38 0.25
39 0.34
40 0.42
41 0.44
42 0.49
43 0.53
44 0.57
45 0.55
46 0.58
47 0.58
48 0.56
49 0.59
50 0.59
51 0.57
52 0.51
53 0.46
54 0.36
55 0.27
56 0.2
57 0.16
58 0.13
59 0.1
60 0.11
61 0.15
62 0.2
63 0.26
64 0.31
65 0.31
66 0.33
67 0.39
68 0.47
69 0.47
70 0.49
71 0.54
72 0.57
73 0.62
74 0.6
75 0.54
76 0.49
77 0.45
78 0.4
79 0.31
80 0.25
81 0.21
82 0.21
83 0.25
84 0.21
85 0.22
86 0.25
87 0.23
88 0.26
89 0.25
90 0.23
91 0.2
92 0.22
93 0.21
94 0.16
95 0.15
96 0.11
97 0.09
98 0.08
99 0.08
100 0.09
101 0.09
102 0.12
103 0.17
104 0.19
105 0.26
106 0.33
107 0.36
108 0.35
109 0.42
110 0.49
111 0.53
112 0.6
113 0.62
114 0.67
115 0.68
116 0.74
117 0.75
118 0.73
119 0.74
120 0.72
121 0.73
122 0.73
123 0.77
124 0.8
125 0.83
126 0.87
127 0.86
128 0.89
129 0.91
130 0.91
131 0.93
132 0.9
133 0.89
134 0.87
135 0.85
136 0.84
137 0.84
138 0.83
139 0.83
140 0.85
141 0.79
142 0.73
143 0.72
144 0.72
145 0.68
146 0.66
147 0.63
148 0.61
149 0.62
150 0.66
151 0.63
152 0.6
153 0.61
154 0.58
155 0.53
156 0.53
157 0.56
158 0.55
159 0.55
160 0.54
161 0.47
162 0.47
163 0.44
164 0.37
165 0.31
166 0.25
167 0.24
168 0.18
169 0.19
170 0.21
171 0.26
172 0.31
173 0.29
174 0.3
175 0.31
176 0.33
177 0.33
178 0.27
179 0.21
180 0.16
181 0.16
182 0.14
183 0.14
184 0.11
185 0.1
186 0.09
187 0.09
188 0.09
189 0.08
190 0.08
191 0.05
192 0.05
193 0.05
194 0.03
195 0.03
196 0.03
197 0.05
198 0.05
199 0.06
200 0.06
201 0.07
202 0.08
203 0.09
204 0.09
205 0.09
206 0.09
207 0.12
208 0.13
209 0.14
210 0.13
211 0.13
212 0.13
213 0.12
214 0.12
215 0.11
216 0.1
217 0.1
218 0.12
219 0.12
220 0.13
221 0.16
222 0.16
223 0.19
224 0.19
225 0.19
226 0.17
227 0.18
228 0.18
229 0.15
230 0.15
231 0.11
232 0.1
233 0.1
234 0.1
235 0.09
236 0.07
237 0.08
238 0.08
239 0.08
240 0.11
241 0.11
242 0.11
243 0.12
244 0.13
245 0.13
246 0.13
247 0.13
248 0.11
249 0.11
250 0.14
251 0.18
252 0.23
253 0.22
254 0.21
255 0.22
256 0.24
257 0.26
258 0.26
259 0.21
260 0.16
261 0.15
262 0.15
263 0.17
264 0.15
265 0.12
266 0.1
267 0.09
268 0.09
269 0.1
270 0.09
271 0.07
272 0.1
273 0.11
274 0.14
275 0.15
276 0.14
277 0.15
278 0.15
279 0.15
280 0.15
281 0.15
282 0.14
283 0.16
284 0.19
285 0.21
286 0.27
287 0.3
288 0.32
289 0.32
290 0.31
291 0.3
292 0.29
293 0.29
294 0.26
295 0.27
296 0.3
297 0.34
298 0.41
299 0.43
300 0.43
301 0.43
302 0.41
303 0.37
304 0.32
305 0.27
306 0.2
307 0.16
308 0.15
309 0.12
310 0.1
311 0.09
312 0.06
313 0.05
314 0.06
315 0.05
316 0.05
317 0.05
318 0.05
319 0.05
320 0.06
321 0.06
322 0.05
323 0.07
324 0.07
325 0.07
326 0.07
327 0.07
328 0.06
329 0.06
330 0.06
331 0.06
332 0.06
333 0.07
334 0.07
335 0.07
336 0.07
337 0.07
338 0.07
339 0.06
340 0.05
341 0.05
342 0.06
343 0.06
344 0.06
345 0.05
346 0.06
347 0.06
348 0.06
349 0.1
350 0.1
351 0.12
352 0.16
353 0.17
354 0.17
355 0.19
356 0.19
357 0.2
358 0.25
359 0.26
360 0.28
361 0.3
362 0.29
363 0.3
364 0.3
365 0.28
366 0.23
367 0.2
368 0.2
369 0.2
370 0.23
371 0.22
372 0.22
373 0.2
374 0.18
375 0.17
376 0.11
377 0.08
378 0.06
379 0.05
380 0.05
381 0.06
382 0.08
383 0.08
384 0.12
385 0.13
386 0.18
387 0.26
388 0.29
389 0.34
390 0.41
391 0.41
392 0.42
393 0.44
394 0.4
395 0.31
396 0.28
397 0.23
398 0.16
399 0.15
400 0.12
401 0.08
402 0.07
403 0.07
404 0.07
405 0.07
406 0.11
407 0.11
408 0.11
409 0.13
410 0.13
411 0.13
412 0.15
413 0.18
414 0.13
415 0.14
416 0.14
417 0.15
418 0.15
419 0.17
420 0.17
421 0.17
422 0.18
423 0.21
424 0.24
425 0.23
426 0.25
427 0.25
428 0.26
429 0.3
430 0.35
431 0.32
432 0.36
433 0.43
434 0.49
435 0.53
436 0.58
437 0.53
438 0.54
439 0.56
440 0.49
441 0.47
442 0.42
443 0.46
444 0.44
445 0.44
446 0.38
447 0.36
448 0.37
449 0.31
450 0.32
451 0.23
452 0.18
453 0.17
454 0.16
455 0.14
456 0.14
457 0.14
458 0.15
459 0.16
460 0.17
461 0.18
462 0.19
463 0.22
464 0.25
465 0.3
466 0.34
467 0.4
468 0.44
469 0.47
470 0.5
471 0.47
472 0.46
473 0.41
474 0.39
475 0.35
476 0.32
477 0.28
478 0.27
479 0.27
480 0.25
481 0.23
482 0.17
483 0.14
484 0.11
485 0.11
486 0.07
487 0.06
488 0.06
489 0.06
490 0.07
491 0.06
492 0.06
493 0.06
494 0.06
495 0.07
496 0.1
497 0.12
498 0.13
499 0.15
500 0.15
501 0.16
502 0.18
503 0.18
504 0.15
505 0.13
506 0.12
507 0.13
508 0.12
509 0.11
510 0.09
511 0.1
512 0.11
513 0.15
514 0.17
515 0.23
516 0.3
517 0.39
518 0.44
519 0.48
520 0.5
521 0.47
522 0.46
523 0.44
524 0.47
525 0.42
526 0.41
527 0.38
528 0.34
529 0.33
530 0.32
531 0.28
532 0.19
533 0.18
534 0.16
535 0.19
536 0.19
537 0.19
538 0.19
539 0.18
540 0.16
541 0.15
542 0.14
543 0.13
544 0.14
545 0.15
546 0.15
547 0.15
548 0.16
549 0.16
550 0.18
551 0.16
552 0.19
553 0.2
554 0.25
555 0.28
556 0.3
557 0.31
558 0.3
559 0.3
560 0.3
561 0.32
562 0.29
563 0.31
564 0.31
565 0.34
566 0.34
567 0.33
568 0.29
569 0.27
570 0.25
571 0.22
572 0.21
573 0.2
574 0.19
575 0.23
576 0.24
577 0.25
578 0.26
579 0.27
580 0.26
581 0.24
582 0.23
583 0.21
584 0.22
585 0.21
586 0.21
587 0.18
588 0.19
589 0.21
590 0.23
591 0.24
592 0.25
593 0.31
594 0.36
595 0.42
596 0.45
597 0.49
598 0.51
599 0.53
600 0.55
601 0.55
602 0.52
603 0.5
604 0.5
605 0.43
606 0.41
607 0.37
608 0.36
609 0.33
610 0.29
611 0.27
612 0.26
613 0.3
614 0.33
615 0.36
616 0.34
617 0.38
618 0.46
619 0.49
620 0.49
621 0.54
622 0.58
623 0.64
624 0.71
625 0.76
626 0.76
627 0.79