Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C2SW40

Protein Details
Accession A0A5C2SW40    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
260-288GASRDRHWLHRQRQRQRRRRSPVPAALEWHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
253-280RRRRQSSGASRDRHWLHRQRQRQRRRRS
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12, cyto 3.5, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011583  Chitinase_II  
IPR001223  Glyco_hydro18_cat  
IPR001579  Glyco_hydro_18_chit_AS  
IPR017853  Glycoside_hydrolase_SF  
Gene Ontology GO:0008061  F:chitin binding  
GO:0004568  F:chitinase activity  
GO:0006032  P:chitin catabolic process  
GO:0000272  P:polysaccharide catabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF00704  Glyco_hydro_18  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01095  GH18_1  
PS51910  GH18_2  
Amino Acid Sequences MAYYPDWVSDDYPPEKIDFGRFDWIDFAFAVPDSTFNLSWDGSDDAPDTLRRLVQRAHASGKRVKLSVGGWTGSTYFSSAAATPQGRTTLANNIYALYLQFGLDGIDIDWEYPGQGGNSGNGVSPDDSANFLEFLRILRSTLPPDAVITAATQTVPFADSDGNPMQDVSEFARVLDWVLLMNYDTWGSSSDPGPNAPLSNACGNSTQGSANALSALQAWTAAGFAAHQLVLGVPSYGYLSRSTDTVLQTRALRRRRQSSGASRDRHWLHRQRQRQRRRRSPVPAALEWFSSLADVLPGAVRVKNEDGGSDDGQVQFRELVKQGVIQAYSSSPAATTPADGSSLHVDSTDASNSTDGSTTTSSGALRLAIENAEPRSLFAGDKGFVRMWDACSSTPYLRSAGAGQVVAYDDPVSLEMKAQLVRQAGMRGVNVFDVHGDTDAWDLTDAVRRGLGLV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.27
3 0.27
4 0.29
5 0.26
6 0.27
7 0.34
8 0.33
9 0.32
10 0.33
11 0.32
12 0.27
13 0.23
14 0.2
15 0.12
16 0.12
17 0.12
18 0.1
19 0.1
20 0.11
21 0.15
22 0.14
23 0.14
24 0.17
25 0.15
26 0.15
27 0.17
28 0.17
29 0.13
30 0.15
31 0.15
32 0.13
33 0.15
34 0.16
35 0.16
36 0.15
37 0.18
38 0.19
39 0.21
40 0.24
41 0.31
42 0.38
43 0.41
44 0.48
45 0.48
46 0.53
47 0.55
48 0.59
49 0.55
50 0.47
51 0.42
52 0.37
53 0.34
54 0.36
55 0.33
56 0.27
57 0.23
58 0.23
59 0.24
60 0.2
61 0.2
62 0.13
63 0.09
64 0.09
65 0.1
66 0.09
67 0.1
68 0.15
69 0.15
70 0.15
71 0.16
72 0.18
73 0.17
74 0.18
75 0.19
76 0.23
77 0.24
78 0.25
79 0.24
80 0.23
81 0.22
82 0.21
83 0.19
84 0.11
85 0.09
86 0.07
87 0.07
88 0.06
89 0.06
90 0.06
91 0.06
92 0.05
93 0.06
94 0.06
95 0.06
96 0.06
97 0.06
98 0.06
99 0.05
100 0.06
101 0.05
102 0.07
103 0.07
104 0.08
105 0.09
106 0.09
107 0.09
108 0.09
109 0.1
110 0.09
111 0.09
112 0.1
113 0.09
114 0.1
115 0.11
116 0.11
117 0.1
118 0.09
119 0.09
120 0.09
121 0.09
122 0.1
123 0.1
124 0.09
125 0.11
126 0.14
127 0.16
128 0.18
129 0.18
130 0.16
131 0.16
132 0.16
133 0.14
134 0.12
135 0.09
136 0.08
137 0.07
138 0.07
139 0.06
140 0.05
141 0.05
142 0.06
143 0.05
144 0.06
145 0.06
146 0.07
147 0.12
148 0.13
149 0.13
150 0.13
151 0.13
152 0.12
153 0.11
154 0.12
155 0.09
156 0.12
157 0.11
158 0.11
159 0.12
160 0.11
161 0.12
162 0.11
163 0.08
164 0.05
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.04
172 0.05
173 0.06
174 0.07
175 0.08
176 0.09
177 0.11
178 0.12
179 0.12
180 0.13
181 0.12
182 0.12
183 0.11
184 0.11
185 0.1
186 0.12
187 0.12
188 0.12
189 0.13
190 0.13
191 0.13
192 0.14
193 0.12
194 0.09
195 0.1
196 0.09
197 0.08
198 0.07
199 0.06
200 0.05
201 0.06
202 0.06
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.03
207 0.04
208 0.03
209 0.03
210 0.02
211 0.03
212 0.03
213 0.03
214 0.03
215 0.03
216 0.03
217 0.04
218 0.04
219 0.04
220 0.03
221 0.03
222 0.04
223 0.04
224 0.05
225 0.06
226 0.07
227 0.08
228 0.08
229 0.09
230 0.12
231 0.13
232 0.14
233 0.15
234 0.15
235 0.18
236 0.24
237 0.31
238 0.34
239 0.39
240 0.43
241 0.5
242 0.52
243 0.56
244 0.58
245 0.61
246 0.64
247 0.67
248 0.64
249 0.58
250 0.6
251 0.58
252 0.56
253 0.55
254 0.54
255 0.54
256 0.61
257 0.69
258 0.72
259 0.8
260 0.85
261 0.86
262 0.87
263 0.89
264 0.89
265 0.88
266 0.87
267 0.87
268 0.84
269 0.81
270 0.71
271 0.64
272 0.55
273 0.46
274 0.36
275 0.27
276 0.18
277 0.11
278 0.09
279 0.06
280 0.05
281 0.04
282 0.04
283 0.04
284 0.05
285 0.06
286 0.07
287 0.07
288 0.1
289 0.11
290 0.14
291 0.14
292 0.13
293 0.15
294 0.18
295 0.19
296 0.18
297 0.17
298 0.16
299 0.17
300 0.17
301 0.14
302 0.12
303 0.12
304 0.14
305 0.13
306 0.14
307 0.13
308 0.14
309 0.16
310 0.16
311 0.16
312 0.13
313 0.14
314 0.13
315 0.14
316 0.12
317 0.1
318 0.07
319 0.07
320 0.09
321 0.08
322 0.09
323 0.08
324 0.09
325 0.1
326 0.1
327 0.12
328 0.14
329 0.14
330 0.13
331 0.12
332 0.11
333 0.11
334 0.13
335 0.13
336 0.1
337 0.1
338 0.1
339 0.11
340 0.11
341 0.11
342 0.09
343 0.11
344 0.11
345 0.12
346 0.12
347 0.13
348 0.13
349 0.12
350 0.13
351 0.1
352 0.1
353 0.1
354 0.1
355 0.09
356 0.1
357 0.13
358 0.14
359 0.15
360 0.14
361 0.14
362 0.16
363 0.16
364 0.15
365 0.14
366 0.16
367 0.15
368 0.17
369 0.2
370 0.18
371 0.17
372 0.21
373 0.2
374 0.2
375 0.23
376 0.24
377 0.21
378 0.23
379 0.27
380 0.25
381 0.26
382 0.24
383 0.22
384 0.2
385 0.21
386 0.2
387 0.19
388 0.2
389 0.17
390 0.15
391 0.15
392 0.15
393 0.14
394 0.13
395 0.1
396 0.07
397 0.08
398 0.09
399 0.09
400 0.08
401 0.09
402 0.1
403 0.13
404 0.14
405 0.15
406 0.19
407 0.2
408 0.21
409 0.22
410 0.23
411 0.23
412 0.24
413 0.24
414 0.21
415 0.2
416 0.21
417 0.19
418 0.16
419 0.14
420 0.13
421 0.13
422 0.12
423 0.11
424 0.1
425 0.11
426 0.11
427 0.1
428 0.09
429 0.09
430 0.09
431 0.17
432 0.17
433 0.16
434 0.17