Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C2SQ81

Protein Details
Accession A0A5C2SQ81    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
106-133ESSMQTQEKKRGKNKRKGKGRSAQDDQSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
114-152KKRGKNKRKGKGRSAQDDQSRSRDGQGKHKAGKPAKPSK
Subcellular Location(s) nucl 13, mito 12, cyto_nucl 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017336  Snurportin-1  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0061015  P:snRNA import into nucleus  
Amino Acid Sequences MSQDRRASFKLPPASVRSRQTAQELRRARALEEQKRRRAERFDSTRQLDIFADLSLGHSDDEANDGAPDNVVREGISQFATMLPPLAPQPLSVPTPSESEQPPAPESSMQTQEKKRGKNKRKGKGRSAQDDQSRSRDGQGKHKAGKPAKPSKWADKCMYAELLEMKDGFDDSGVLQDGIPPDIETGWVAVTPIPVGKRCLAVTHQTSGIAGVVPNTTIRSRVLGKPLMKPFPSTLPPQTVLDCILDDNWRDNGILHVLDVISWKGQDVADCETPFRFWWRDTRLSELDSFPPPPNAAPSTAQSPSQPDKYQFPHPTTFAPIPYHTDTSLPQLLSTLVPLTRTTRTIPITISEPSPSDEAAMDTDSAPSLVQLHTVQAQVQSDGLLLYVAQASYEPGTSPLSNWIPLRAYQTREEQQQRGLSMAASPLDVFEGLVRRRLALGASSLPVVPEVEMES
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.58
2 0.62
3 0.63
4 0.61
5 0.56
6 0.55
7 0.59
8 0.6
9 0.56
10 0.59
11 0.59
12 0.56
13 0.58
14 0.56
15 0.48
16 0.49
17 0.54
18 0.55
19 0.6
20 0.66
21 0.69
22 0.77
23 0.8
24 0.77
25 0.75
26 0.73
27 0.73
28 0.72
29 0.73
30 0.73
31 0.73
32 0.71
33 0.63
34 0.57
35 0.46
36 0.38
37 0.29
38 0.2
39 0.16
40 0.11
41 0.12
42 0.1
43 0.1
44 0.08
45 0.08
46 0.08
47 0.08
48 0.1
49 0.09
50 0.09
51 0.08
52 0.09
53 0.09
54 0.09
55 0.09
56 0.08
57 0.08
58 0.08
59 0.08
60 0.09
61 0.09
62 0.1
63 0.11
64 0.1
65 0.1
66 0.11
67 0.11
68 0.09
69 0.1
70 0.08
71 0.09
72 0.09
73 0.12
74 0.11
75 0.11
76 0.13
77 0.16
78 0.18
79 0.17
80 0.18
81 0.17
82 0.21
83 0.22
84 0.24
85 0.21
86 0.23
87 0.25
88 0.25
89 0.25
90 0.22
91 0.22
92 0.2
93 0.21
94 0.23
95 0.29
96 0.3
97 0.36
98 0.39
99 0.47
100 0.53
101 0.59
102 0.63
103 0.66
104 0.73
105 0.77
106 0.83
107 0.84
108 0.88
109 0.88
110 0.89
111 0.88
112 0.86
113 0.85
114 0.81
115 0.78
116 0.75
117 0.72
118 0.65
119 0.61
120 0.54
121 0.45
122 0.43
123 0.43
124 0.38
125 0.42
126 0.49
127 0.51
128 0.54
129 0.58
130 0.62
131 0.61
132 0.65
133 0.65
134 0.65
135 0.63
136 0.66
137 0.66
138 0.68
139 0.71
140 0.7
141 0.63
142 0.59
143 0.57
144 0.5
145 0.46
146 0.36
147 0.28
148 0.24
149 0.21
150 0.15
151 0.13
152 0.1
153 0.09
154 0.09
155 0.07
156 0.05
157 0.05
158 0.04
159 0.06
160 0.06
161 0.06
162 0.06
163 0.07
164 0.08
165 0.08
166 0.08
167 0.06
168 0.06
169 0.06
170 0.06
171 0.05
172 0.05
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.05
178 0.05
179 0.06
180 0.07
181 0.08
182 0.1
183 0.11
184 0.13
185 0.13
186 0.14
187 0.15
188 0.2
189 0.21
190 0.21
191 0.21
192 0.19
193 0.18
194 0.17
195 0.15
196 0.09
197 0.06
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.05
202 0.06
203 0.06
204 0.07
205 0.07
206 0.09
207 0.12
208 0.15
209 0.2
210 0.24
211 0.27
212 0.33
213 0.37
214 0.39
215 0.36
216 0.35
217 0.31
218 0.3
219 0.3
220 0.27
221 0.25
222 0.24
223 0.25
224 0.25
225 0.24
226 0.2
227 0.18
228 0.15
229 0.13
230 0.09
231 0.09
232 0.09
233 0.09
234 0.1
235 0.09
236 0.09
237 0.09
238 0.09
239 0.09
240 0.09
241 0.09
242 0.07
243 0.07
244 0.06
245 0.06
246 0.07
247 0.06
248 0.05
249 0.05
250 0.05
251 0.06
252 0.06
253 0.07
254 0.08
255 0.12
256 0.15
257 0.15
258 0.16
259 0.15
260 0.16
261 0.16
262 0.18
263 0.15
264 0.13
265 0.21
266 0.27
267 0.35
268 0.36
269 0.42
270 0.4
271 0.4
272 0.41
273 0.35
274 0.32
275 0.26
276 0.27
277 0.21
278 0.2
279 0.19
280 0.17
281 0.18
282 0.17
283 0.17
284 0.16
285 0.18
286 0.21
287 0.21
288 0.22
289 0.19
290 0.23
291 0.25
292 0.28
293 0.29
294 0.27
295 0.32
296 0.35
297 0.44
298 0.44
299 0.45
300 0.43
301 0.42
302 0.42
303 0.42
304 0.39
305 0.33
306 0.3
307 0.26
308 0.28
309 0.3
310 0.3
311 0.24
312 0.24
313 0.22
314 0.25
315 0.27
316 0.21
317 0.18
318 0.17
319 0.17
320 0.16
321 0.16
322 0.12
323 0.08
324 0.09
325 0.11
326 0.13
327 0.15
328 0.17
329 0.19
330 0.23
331 0.25
332 0.26
333 0.25
334 0.24
335 0.25
336 0.25
337 0.24
338 0.19
339 0.18
340 0.18
341 0.18
342 0.16
343 0.14
344 0.12
345 0.12
346 0.11
347 0.11
348 0.1
349 0.09
350 0.1
351 0.09
352 0.09
353 0.08
354 0.06
355 0.07
356 0.07
357 0.09
358 0.09
359 0.1
360 0.13
361 0.13
362 0.14
363 0.15
364 0.16
365 0.14
366 0.14
367 0.12
368 0.1
369 0.09
370 0.08
371 0.06
372 0.04
373 0.05
374 0.06
375 0.05
376 0.05
377 0.05
378 0.07
379 0.08
380 0.08
381 0.08
382 0.09
383 0.12
384 0.13
385 0.14
386 0.2
387 0.21
388 0.24
389 0.25
390 0.27
391 0.26
392 0.28
393 0.35
394 0.32
395 0.34
396 0.35
397 0.43
398 0.45
399 0.53
400 0.58
401 0.53
402 0.55
403 0.55
404 0.52
405 0.44
406 0.39
407 0.3
408 0.24
409 0.23
410 0.17
411 0.13
412 0.12
413 0.11
414 0.11
415 0.11
416 0.09
417 0.1
418 0.17
419 0.17
420 0.23
421 0.23
422 0.23
423 0.24
424 0.25
425 0.23
426 0.19
427 0.22
428 0.19
429 0.2
430 0.2
431 0.2
432 0.19
433 0.18
434 0.16
435 0.12