FuNGI

A0A5C2SHB7

Protein Details

Accession

A0A5C2SHB7

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
2-27	AESPVMFKRTKPKHTQRARISTPDAE	Hydrophilic
41-65	TPSAVAAKLKKKSRAKTKSTLSFGG	Hydrophilic
72-93	GEAFKLKKSKLSKKLQLGKSSI	Hydrophilic
231-253	ERIALGRKSRKKEAQKRRLEINE	Basic
686-708	IPARRRFLTRRYKLLRNLLQWRK	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
48-56	KLKKKSRAK
236-248	GRKSRKKEAQKRR

Subcellular Location(s)

nucl 11.5, mito 10, cyto_nucl 9, cyto 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012890 GCFC2-like
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome
Pfam	View protein in Pfam PF15458 NTR2

Amino Acid Sequences

MAESPVMFKRTKPKHTQRARISTPDAEAAPTIGEEAEVEETPSAVAAKLKKKSRAKTKSTLSFGGDEEEGDGEAFKLKKSKLSKKLQLGKSSIGVPPSAFEPTLARPSTGPTYDAAYLSQLKASTPSARPTLPIGEAYDADVSMDVDSPSQMSALSTIAGTAIPSASSILAAKEKRDRLRKSTAGEDYISLSLTKRDDFSQGPHPESRLMREEDELGDADDEFAEYTSAQERIALGRKSRKKEAQKRRLEINEMIVDAEEEDEETQEWEQEQLRRGGLRPESAEPAPKPVYKPASIPPVTHIPTMAAAIARLTQSMSELTTSHAEHSAAMSKLGEEQRILEAREKEMRDMIAKAEEKRSWFSAFREWVESVATFLDEKFPPLERLEDEHLSIMKERADMIATRRRAEDEDDLMLFLGTPPSLRPQSEEVDELGRAIPSANSPQARANRTAAREARRVRRRAVNQQARQEEEGFSTDAELPQGDEEDYRIAMGRLLSDAKEIMADVKAEEFRDPTVGLGKWFGEWRTKFSDIYTGAWGGLGMVGAWEFWVRLEILGWNPVERPRSLDSFSWYKSLYIYSRPSEADEEEEPELGPDGDLVSAMITTALIPRFCRILEGGGLDAYSASDIRRLVDLMEEIEISVDKQNQKFELLLKSVHTVFSEAVEATETTLAPFLELNQPRFDPAAIPARRRFLTRRYKLLRNLLQWRKYAGDRYGLGTLATRLVGSSMMPVAESGWEVGGEDTMRKVAQALPPELVPPSLRQLRAA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.74
2	0.84
3	0.91
4	0.91
5	0.92
6	0.89
7	0.86
8	0.8
9	0.73
10	0.66
11	0.59
12	0.48
13	0.39
14	0.32
15	0.24
16	0.19
17	0.14
18	0.12
19	0.08
20	0.07
21	0.06
22	0.08
23	0.1
24	0.09
25	0.1
26	0.1
27	0.1
28	0.1
29	0.1
30	0.09
31	0.07
32	0.11
33	0.17
34	0.26
35	0.34
36	0.42
37	0.52
38	0.61
39	0.7
40	0.78
41	0.81
42	0.82
43	0.84
44	0.86
45	0.86
46	0.83
47	0.77
48	0.69
49	0.61
50	0.53
51	0.46
52	0.36
53	0.26
54	0.21
55	0.17
56	0.13
57	0.1
58	0.1
59	0.07
60	0.11
61	0.12
62	0.12
63	0.18
64	0.19
65	0.27
66	0.37
67	0.47
68	0.53
69	0.64
70	0.72
71	0.76
72	0.86
73	0.86
74	0.84
75	0.78
76	0.71
77	0.63
78	0.57
79	0.48
80	0.39
81	0.32
82	0.23
83	0.2
84	0.18
85	0.18
86	0.14
87	0.13
88	0.15
89	0.18
90	0.26
91	0.25
92	0.24
93	0.22
94	0.27
95	0.32
96	0.3
97	0.26
98	0.2
99	0.23
100	0.24
101	0.24
102	0.2
103	0.18
104	0.19
105	0.18
106	0.19
107	0.15
108	0.14
109	0.16
110	0.19
111	0.22
112	0.23
113	0.27
114	0.29
115	0.29
116	0.3
117	0.3
118	0.31
119	0.26
120	0.25
121	0.22
122	0.21
123	0.2
124	0.21
125	0.18
126	0.14
127	0.12
128	0.11
129	0.09
130	0.07
131	0.08
132	0.07
133	0.06
134	0.07
135	0.07
136	0.07
137	0.06
138	0.06
139	0.05
140	0.06
141	0.06
142	0.06
143	0.06
144	0.05
145	0.06
146	0.06
147	0.05
148	0.05
149	0.05
150	0.04
151	0.05
152	0.05
153	0.05
154	0.06
155	0.06
156	0.07
157	0.13
158	0.14
159	0.18
160	0.25
161	0.33
162	0.41
163	0.5
164	0.54
165	0.55
166	0.65
167	0.67
168	0.64
169	0.65
170	0.61
171	0.55
172	0.49
173	0.43
174	0.36
175	0.3
176	0.26
177	0.17
178	0.13
179	0.13
180	0.14
181	0.14
182	0.13
183	0.14
184	0.17
185	0.18
186	0.22
187	0.29
188	0.32
189	0.35
190	0.35
191	0.34
192	0.36
193	0.36
194	0.36
195	0.32
196	0.31
197	0.28
198	0.28
199	0.28
200	0.24
201	0.24
202	0.19
203	0.14
204	0.12
205	0.1
206	0.09
207	0.07
208	0.06
209	0.05
210	0.05
211	0.04
212	0.04
213	0.05
214	0.07
215	0.07
216	0.07
217	0.08
218	0.08
219	0.12
220	0.19
221	0.2
222	0.24
223	0.33
224	0.41
225	0.47
226	0.55
227	0.6
228	0.65
229	0.73
230	0.8
231	0.81
232	0.83
233	0.82
234	0.83
235	0.78
236	0.72
237	0.63
238	0.58
239	0.49
240	0.39
241	0.34
242	0.25
243	0.2
244	0.14
245	0.12
246	0.06
247	0.04
248	0.04
249	0.04
250	0.05
251	0.05
252	0.05
253	0.05
254	0.06
255	0.07
256	0.1
257	0.13
258	0.16
259	0.17
260	0.18
261	0.19
262	0.2
263	0.24
264	0.23
265	0.23
266	0.23
267	0.23
268	0.26
269	0.26
270	0.3
271	0.24
272	0.28
273	0.28
274	0.27
275	0.26
276	0.28
277	0.32
278	0.28
279	0.31
280	0.29
281	0.36
282	0.35
283	0.34
284	0.31
285	0.34
286	0.34
287	0.32
288	0.27
289	0.18
290	0.17
291	0.17
292	0.15
293	0.07
294	0.06
295	0.06
296	0.07
297	0.06
298	0.06
299	0.05
300	0.05
301	0.06
302	0.06
303	0.06
304	0.06
305	0.06
306	0.08
307	0.1
308	0.1
309	0.1
310	0.11
311	0.11
312	0.1
313	0.11
314	0.13
315	0.11
316	0.11
317	0.1
318	0.09
319	0.14
320	0.15
321	0.14
322	0.1
323	0.11
324	0.14
325	0.16
326	0.17
327	0.17
328	0.17
329	0.19
330	0.25
331	0.24
332	0.22
333	0.22
334	0.21
335	0.18
336	0.17
337	0.16
338	0.16
339	0.17
340	0.18
341	0.21
342	0.22
343	0.22
344	0.24
345	0.25
346	0.22
347	0.22
348	0.22
349	0.25
350	0.26
351	0.25
352	0.26
353	0.24
354	0.22
355	0.21
356	0.19
357	0.13
358	0.1
359	0.09
360	0.06
361	0.05
362	0.09
363	0.08
364	0.09
365	0.09
366	0.1
367	0.12
368	0.12
369	0.14
370	0.11
371	0.15
372	0.18
373	0.17
374	0.16
375	0.16
376	0.15
377	0.14
378	0.14
379	0.12
380	0.08
381	0.08
382	0.08
383	0.07
384	0.08
385	0.08
386	0.12
387	0.19
388	0.19
389	0.2
390	0.21
391	0.21
392	0.22
393	0.24
394	0.23
395	0.18
396	0.18
397	0.17
398	0.16
399	0.15
400	0.14
401	0.1
402	0.07
403	0.05
404	0.03
405	0.03
406	0.04
407	0.08
408	0.1
409	0.1
410	0.12
411	0.15
412	0.18
413	0.19
414	0.2
415	0.17
416	0.17
417	0.16
418	0.14
419	0.11
420	0.09
421	0.07
422	0.06
423	0.06
424	0.06
425	0.08
426	0.12
427	0.12
428	0.13
429	0.19
430	0.24
431	0.27
432	0.28
433	0.3
434	0.31
435	0.32
436	0.38
437	0.38
438	0.38
439	0.42
440	0.46
441	0.53
442	0.57
443	0.58
444	0.56
445	0.6
446	0.62
447	0.66
448	0.7
449	0.71
450	0.68
451	0.73
452	0.72
453	0.65
454	0.6
455	0.51
456	0.4
457	0.31
458	0.26
459	0.18
460	0.14
461	0.12
462	0.11
463	0.1
464	0.09
465	0.08
466	0.07
467	0.06
468	0.07
469	0.06
470	0.05
471	0.06
472	0.06
473	0.06
474	0.06
475	0.06
476	0.06
477	0.07
478	0.07
479	0.06
480	0.07
481	0.08
482	0.08
483	0.08
484	0.08
485	0.07
486	0.07
487	0.07
488	0.07
489	0.06
490	0.06
491	0.06
492	0.08
493	0.09
494	0.1
495	0.1
496	0.1
497	0.1
498	0.11
499	0.11
500	0.09
501	0.12
502	0.12
503	0.12
504	0.13
505	0.12
506	0.12
507	0.14
508	0.15
509	0.19
510	0.19
511	0.23
512	0.29
513	0.3
514	0.3
515	0.29
516	0.34
517	0.28
518	0.29
519	0.27
520	0.21
521	0.18
522	0.18
523	0.17
524	0.1
525	0.08
526	0.06
527	0.03
528	0.03
529	0.03
530	0.03
531	0.03
532	0.03
533	0.03
534	0.03
535	0.04
536	0.05
537	0.05
538	0.06
539	0.07
540	0.08
541	0.12
542	0.13
543	0.12
544	0.13
545	0.17
546	0.19
547	0.17
548	0.21
549	0.21
550	0.25
551	0.27
552	0.27
553	0.29
554	0.33
555	0.34
556	0.32
557	0.29
558	0.26
559	0.23
560	0.26
561	0.22
562	0.23
563	0.26
564	0.26
565	0.28
566	0.28
567	0.3
568	0.29
569	0.27
570	0.25
571	0.21
572	0.22
573	0.2
574	0.2
575	0.17
576	0.15
577	0.14
578	0.1
579	0.09
580	0.06
581	0.05
582	0.05
583	0.05
584	0.05
585	0.04
586	0.04
587	0.04
588	0.04
589	0.03
590	0.03
591	0.07
592	0.09
593	0.1
594	0.11
595	0.12
596	0.14
597	0.14
598	0.16
599	0.13
600	0.14
601	0.15
602	0.16
603	0.15
604	0.14
605	0.14
606	0.12
607	0.11
608	0.08
609	0.07
610	0.05
611	0.05
612	0.07
613	0.08
614	0.09
615	0.1
616	0.11
617	0.1
618	0.12
619	0.13
620	0.11
621	0.12
622	0.11
623	0.1
624	0.1
625	0.09
626	0.08
627	0.1
628	0.14
629	0.19
630	0.21
631	0.25
632	0.26
633	0.28
634	0.28
635	0.3
636	0.31
637	0.28
638	0.28
639	0.26
640	0.28
641	0.27
642	0.27
643	0.23
644	0.18
645	0.16
646	0.16
647	0.15
648	0.12
649	0.11
650	0.11
651	0.11
652	0.1
653	0.11
654	0.1
655	0.08
656	0.1
657	0.1
658	0.09
659	0.09
660	0.1
661	0.18
662	0.23
663	0.25
664	0.27
665	0.28
666	0.29
667	0.3
668	0.29
669	0.21
670	0.21
671	0.29
672	0.3
673	0.36
674	0.39
675	0.44
676	0.45
677	0.49
678	0.49
679	0.49
680	0.56
681	0.58
682	0.65
683	0.66
684	0.73
685	0.77
686	0.82
687	0.8
688	0.78
689	0.8
690	0.79
691	0.78
692	0.71
693	0.67
694	0.6
695	0.56
696	0.54
697	0.47
698	0.44
699	0.4
700	0.41
701	0.39
702	0.35
703	0.31
704	0.25
705	0.23
706	0.17
707	0.16
708	0.12
709	0.09
710	0.1
711	0.1
712	0.08
713	0.09
714	0.09
715	0.09
716	0.09
717	0.09
718	0.09
719	0.09
720	0.1
721	0.08
722	0.07
723	0.07
724	0.08
725	0.08
726	0.09
727	0.09
728	0.09
729	0.1
730	0.11
731	0.11
732	0.11
733	0.12
734	0.16
735	0.2
736	0.27
737	0.29
738	0.29
739	0.29
740	0.31
741	0.3
742	0.27
743	0.23
744	0.19
745	0.25
746	0.3

A0A5C2SHB7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer