Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C2RTX0

Protein Details
Accession A0A5C2RTX0    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
46-65VASTRRQARNARRREKIDLGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
88-92RKRKK
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 10.5, mito 7, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR046520  DUF6697  
Pfam View protein in Pfam  
PF20411  DUF6697  
Amino Acid Sequences MAVKIKRSPSPPPRNGNDAPTGTRDNPVQICQTDEEDGAPAGPSLVASTRRQARNARRREKIDLGMIELSDSENEVVRTATADPPSGRKRKKSAVALKEEPVVKIEAGVLRENSSYKQRKLNHADDDEDDKSNVSTQAEGEKTESGIIAADELEQAPFGSLLNKEFLLKDEDLLELVSRDSLKPFPITLASTKRSVTVTREQLSRRFGGSTMDTFPRPHKNRIAVHGRANFMCISLDWNPHGPQKPGHGGLFFETTVWPGDAWTANLKHSRTQVLFVKLQQWGNLPVHEKVRATWASEISESGWGKPIRARIHLRRTLGRDPTREEVENELGAFKDVSKDDVRDAVDSGNECICAWSMKCIGYDEDFQLELIELSESG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.77
2 0.76
3 0.71
4 0.67
5 0.6
6 0.54
7 0.5
8 0.5
9 0.43
10 0.43
11 0.38
12 0.36
13 0.35
14 0.35
15 0.35
16 0.29
17 0.31
18 0.3
19 0.32
20 0.27
21 0.25
22 0.22
23 0.18
24 0.18
25 0.14
26 0.12
27 0.09
28 0.07
29 0.07
30 0.06
31 0.06
32 0.1
33 0.14
34 0.15
35 0.23
36 0.32
37 0.36
38 0.41
39 0.5
40 0.57
41 0.63
42 0.73
43 0.75
44 0.75
45 0.78
46 0.8
47 0.78
48 0.72
49 0.69
50 0.6
51 0.54
52 0.46
53 0.4
54 0.32
55 0.24
56 0.19
57 0.11
58 0.11
59 0.07
60 0.07
61 0.08
62 0.08
63 0.08
64 0.07
65 0.09
66 0.1
67 0.14
68 0.13
69 0.16
70 0.17
71 0.25
72 0.34
73 0.42
74 0.46
75 0.5
76 0.56
77 0.63
78 0.71
79 0.73
80 0.75
81 0.75
82 0.78
83 0.75
84 0.69
85 0.65
86 0.57
87 0.47
88 0.38
89 0.29
90 0.2
91 0.16
92 0.16
93 0.13
94 0.13
95 0.15
96 0.14
97 0.14
98 0.15
99 0.16
100 0.16
101 0.24
102 0.29
103 0.31
104 0.38
105 0.42
106 0.51
107 0.59
108 0.64
109 0.63
110 0.59
111 0.58
112 0.52
113 0.53
114 0.45
115 0.37
116 0.29
117 0.21
118 0.18
119 0.17
120 0.16
121 0.1
122 0.09
123 0.09
124 0.14
125 0.14
126 0.15
127 0.15
128 0.14
129 0.13
130 0.13
131 0.12
132 0.07
133 0.07
134 0.06
135 0.05
136 0.04
137 0.04
138 0.04
139 0.04
140 0.04
141 0.04
142 0.04
143 0.04
144 0.04
145 0.04
146 0.05
147 0.06
148 0.07
149 0.08
150 0.08
151 0.09
152 0.09
153 0.1
154 0.13
155 0.12
156 0.12
157 0.12
158 0.11
159 0.11
160 0.11
161 0.09
162 0.05
163 0.05
164 0.06
165 0.05
166 0.05
167 0.07
168 0.07
169 0.08
170 0.09
171 0.09
172 0.09
173 0.1
174 0.11
175 0.14
176 0.18
177 0.19
178 0.2
179 0.2
180 0.21
181 0.21
182 0.21
183 0.22
184 0.24
185 0.29
186 0.3
187 0.34
188 0.34
189 0.37
190 0.39
191 0.35
192 0.28
193 0.23
194 0.2
195 0.18
196 0.18
197 0.16
198 0.16
199 0.17
200 0.17
201 0.18
202 0.21
203 0.29
204 0.32
205 0.35
206 0.38
207 0.44
208 0.47
209 0.54
210 0.58
211 0.52
212 0.55
213 0.54
214 0.5
215 0.42
216 0.4
217 0.32
218 0.24
219 0.2
220 0.13
221 0.12
222 0.12
223 0.14
224 0.14
225 0.16
226 0.17
227 0.23
228 0.25
229 0.23
230 0.23
231 0.27
232 0.31
233 0.32
234 0.31
235 0.26
236 0.24
237 0.24
238 0.25
239 0.19
240 0.14
241 0.11
242 0.11
243 0.11
244 0.1
245 0.08
246 0.06
247 0.08
248 0.08
249 0.09
250 0.14
251 0.14
252 0.17
253 0.21
254 0.23
255 0.24
256 0.27
257 0.32
258 0.28
259 0.33
260 0.36
261 0.37
262 0.38
263 0.36
264 0.38
265 0.37
266 0.36
267 0.32
268 0.28
269 0.28
270 0.27
271 0.28
272 0.26
273 0.25
274 0.27
275 0.29
276 0.27
277 0.22
278 0.28
279 0.26
280 0.26
281 0.27
282 0.26
283 0.26
284 0.26
285 0.25
286 0.19
287 0.24
288 0.22
289 0.19
290 0.24
291 0.22
292 0.23
293 0.25
294 0.31
295 0.29
296 0.37
297 0.45
298 0.48
299 0.59
300 0.65
301 0.67
302 0.67
303 0.7
304 0.7
305 0.71
306 0.68
307 0.62
308 0.61
309 0.62
310 0.6
311 0.54
312 0.48
313 0.44
314 0.4
315 0.36
316 0.3
317 0.25
318 0.2
319 0.19
320 0.17
321 0.11
322 0.13
323 0.13
324 0.17
325 0.19
326 0.2
327 0.21
328 0.26
329 0.27
330 0.23
331 0.24
332 0.21
333 0.21
334 0.21
335 0.21
336 0.17
337 0.16
338 0.15
339 0.15
340 0.14
341 0.14
342 0.14
343 0.17
344 0.19
345 0.21
346 0.22
347 0.24
348 0.26
349 0.27
350 0.3
351 0.27
352 0.27
353 0.25
354 0.23
355 0.22
356 0.19
357 0.15
358 0.12