Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C2SSP1

Protein Details
Accession A0A5C2SSP1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
5-33HTQASTSEVKHKKNRRKMAKKPARIAPAGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
14-29KHKKNRRKMAKKPARI
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 9.5, mito 8, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004087  KH_dom  
IPR036612  KH_dom_type_1_sf  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
CDD cd22391  KH-I_PNO1_rpt1  
cd22392  KH-I_PNO1_rpt2  
Amino Acid Sequences MVVLHTQASTSEVKHKKNRRKMAKKPARIAPAGGAEDSEDQEMEEQPPAAEGSNAEEHHETNWVDGDDDVMIDTDTAAPPTVDAPAFPPLPASAQRTALKSEIRRIPIPPHRMTPLKKDWVNIFSPLTEMLQLQVRMNVQRKCVEIRTSKHTKDIGAIQKGADFVKAYALGFDVNDSIALLRLDDLYLDSFEIKDVKTLHGDHLSRAIGRIAGQDGKTKFTIENASRTRIVLADTKIHILGSFQNIKIARDAIVSLILGSPPGKVYAGLRTVSARMRQRAM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.59
3 0.67
4 0.76
5 0.85
6 0.86
7 0.9
8 0.92
9 0.94
10 0.94
11 0.94
12 0.92
13 0.9
14 0.86
15 0.76
16 0.67
17 0.61
18 0.56
19 0.47
20 0.38
21 0.29
22 0.23
23 0.23
24 0.22
25 0.17
26 0.11
27 0.09
28 0.1
29 0.11
30 0.11
31 0.11
32 0.1
33 0.09
34 0.1
35 0.11
36 0.1
37 0.09
38 0.08
39 0.11
40 0.16
41 0.16
42 0.18
43 0.18
44 0.18
45 0.19
46 0.22
47 0.18
48 0.13
49 0.15
50 0.13
51 0.13
52 0.12
53 0.12
54 0.08
55 0.08
56 0.07
57 0.05
58 0.05
59 0.04
60 0.05
61 0.05
62 0.05
63 0.06
64 0.06
65 0.05
66 0.06
67 0.06
68 0.08
69 0.06
70 0.06
71 0.08
72 0.12
73 0.12
74 0.12
75 0.12
76 0.11
77 0.14
78 0.16
79 0.19
80 0.17
81 0.22
82 0.25
83 0.25
84 0.27
85 0.27
86 0.3
87 0.27
88 0.33
89 0.33
90 0.35
91 0.35
92 0.35
93 0.41
94 0.44
95 0.5
96 0.44
97 0.42
98 0.42
99 0.47
100 0.48
101 0.47
102 0.47
103 0.47
104 0.46
105 0.45
106 0.44
107 0.42
108 0.41
109 0.34
110 0.27
111 0.19
112 0.18
113 0.16
114 0.13
115 0.1
116 0.08
117 0.07
118 0.09
119 0.09
120 0.09
121 0.1
122 0.11
123 0.15
124 0.21
125 0.22
126 0.22
127 0.24
128 0.25
129 0.26
130 0.28
131 0.3
132 0.3
133 0.32
134 0.38
135 0.42
136 0.42
137 0.44
138 0.42
139 0.37
140 0.33
141 0.37
142 0.36
143 0.31
144 0.31
145 0.26
146 0.26
147 0.26
148 0.24
149 0.17
150 0.1
151 0.07
152 0.08
153 0.09
154 0.08
155 0.07
156 0.07
157 0.07
158 0.06
159 0.07
160 0.05
161 0.04
162 0.04
163 0.04
164 0.04
165 0.05
166 0.05
167 0.04
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.06
173 0.05
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.06
178 0.07
179 0.08
180 0.07
181 0.09
182 0.1
183 0.12
184 0.15
185 0.16
186 0.19
187 0.25
188 0.26
189 0.23
190 0.27
191 0.26
192 0.23
193 0.22
194 0.2
195 0.13
196 0.13
197 0.14
198 0.12
199 0.15
200 0.16
201 0.22
202 0.22
203 0.25
204 0.25
205 0.24
206 0.22
207 0.22
208 0.29
209 0.26
210 0.34
211 0.34
212 0.38
213 0.38
214 0.38
215 0.35
216 0.27
217 0.27
218 0.23
219 0.23
220 0.24
221 0.24
222 0.25
223 0.25
224 0.24
225 0.21
226 0.17
227 0.18
228 0.2
229 0.24
230 0.22
231 0.27
232 0.28
233 0.3
234 0.31
235 0.28
236 0.21
237 0.17
238 0.18
239 0.13
240 0.13
241 0.12
242 0.1
243 0.1
244 0.09
245 0.09
246 0.09
247 0.09
248 0.08
249 0.1
250 0.09
251 0.1
252 0.12
253 0.18
254 0.22
255 0.22
256 0.22
257 0.23
258 0.27
259 0.31
260 0.37
261 0.38