Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C2SLI1

Protein Details
Accession A0A5C2SLI1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
274-300VLSPSSKKKVRYRYGRRARPKEMCNWIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
280-293KKKVRYRYGRRARP
Subcellular Location(s) nucl 10.5, mito 9, cyto_nucl 8.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002893  Znf_MYND  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF01753  zf-MYND  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50865  ZF_MYND_2  
Amino Acid Sequences MPGRHYSKFIPPSLAMSELECQKLDNDATDMLIDKWLERPHRPDSYYDWFQRVRERKHLANANARRDQVLLWNKGVFVPENIFTRTVDTGRLIPLDRTWVTHVYHHRSMKRLTMMPVIFSMLPELMLLRGMHDRGCDEIYVIVTDLKRHEMDQVTEYFQYVCQNTAQGFCKPSVEQKINHDYILLNNALDRRTPCFPQIDLTLRAILHEKRPPFIVLFSHQTMSYSQILFAHPTFVPSHDMYHDFPSGCPNPGCTDNCCELIRFPKQGPENAAVLSPSSKKKVRYRYGRRARPKEMCNWIECDVCFSDERDILPLSGSEGSSEGSVEGSDLGSECSAGSNKAFTGLVCSRCKLVKYCSADHQRRDWEEHKRVCAKPLGES
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.32
3 0.27
4 0.3
5 0.27
6 0.28
7 0.24
8 0.22
9 0.2
10 0.23
11 0.22
12 0.19
13 0.17
14 0.16
15 0.16
16 0.16
17 0.17
18 0.13
19 0.15
20 0.13
21 0.12
22 0.16
23 0.22
24 0.27
25 0.31
26 0.36
27 0.41
28 0.5
29 0.51
30 0.49
31 0.51
32 0.55
33 0.58
34 0.56
35 0.54
36 0.49
37 0.49
38 0.56
39 0.57
40 0.55
41 0.57
42 0.59
43 0.59
44 0.66
45 0.72
46 0.7
47 0.71
48 0.72
49 0.71
50 0.7
51 0.65
52 0.56
53 0.48
54 0.41
55 0.4
56 0.41
57 0.35
58 0.32
59 0.32
60 0.32
61 0.32
62 0.33
63 0.24
64 0.17
65 0.17
66 0.17
67 0.19
68 0.21
69 0.21
70 0.19
71 0.21
72 0.21
73 0.19
74 0.18
75 0.16
76 0.16
77 0.17
78 0.19
79 0.17
80 0.15
81 0.16
82 0.2
83 0.18
84 0.19
85 0.21
86 0.22
87 0.23
88 0.28
89 0.35
90 0.36
91 0.44
92 0.48
93 0.48
94 0.49
95 0.5
96 0.5
97 0.49
98 0.45
99 0.4
100 0.41
101 0.38
102 0.34
103 0.32
104 0.28
105 0.22
106 0.18
107 0.16
108 0.08
109 0.08
110 0.07
111 0.06
112 0.05
113 0.06
114 0.06
115 0.07
116 0.09
117 0.09
118 0.1
119 0.1
120 0.11
121 0.11
122 0.12
123 0.1
124 0.09
125 0.09
126 0.09
127 0.09
128 0.08
129 0.09
130 0.08
131 0.1
132 0.1
133 0.12
134 0.12
135 0.12
136 0.16
137 0.16
138 0.18
139 0.19
140 0.2
141 0.2
142 0.19
143 0.19
144 0.15
145 0.14
146 0.14
147 0.12
148 0.11
149 0.09
150 0.1
151 0.11
152 0.14
153 0.16
154 0.15
155 0.16
156 0.15
157 0.17
158 0.16
159 0.21
160 0.25
161 0.26
162 0.26
163 0.31
164 0.38
165 0.38
166 0.37
167 0.32
168 0.25
169 0.22
170 0.23
171 0.17
172 0.09
173 0.09
174 0.1
175 0.1
176 0.11
177 0.11
178 0.11
179 0.14
180 0.15
181 0.16
182 0.17
183 0.17
184 0.18
185 0.21
186 0.22
187 0.22
188 0.21
189 0.21
190 0.19
191 0.19
192 0.2
193 0.17
194 0.18
195 0.2
196 0.2
197 0.19
198 0.21
199 0.22
200 0.19
201 0.2
202 0.17
203 0.16
204 0.2
205 0.2
206 0.19
207 0.18
208 0.18
209 0.17
210 0.18
211 0.17
212 0.13
213 0.12
214 0.13
215 0.13
216 0.14
217 0.14
218 0.13
219 0.11
220 0.13
221 0.13
222 0.13
223 0.16
224 0.15
225 0.16
226 0.15
227 0.18
228 0.18
229 0.2
230 0.21
231 0.18
232 0.18
233 0.23
234 0.23
235 0.23
236 0.21
237 0.19
238 0.2
239 0.24
240 0.26
241 0.22
242 0.26
243 0.25
244 0.29
245 0.28
246 0.25
247 0.23
248 0.28
249 0.3
250 0.28
251 0.27
252 0.3
253 0.33
254 0.36
255 0.38
256 0.34
257 0.31
258 0.28
259 0.27
260 0.21
261 0.18
262 0.17
263 0.17
264 0.17
265 0.21
266 0.25
267 0.32
268 0.41
269 0.51
270 0.59
271 0.66
272 0.74
273 0.8
274 0.87
275 0.9
276 0.92
277 0.91
278 0.9
279 0.88
280 0.82
281 0.8
282 0.79
283 0.73
284 0.64
285 0.59
286 0.52
287 0.46
288 0.4
289 0.35
290 0.26
291 0.24
292 0.22
293 0.19
294 0.2
295 0.19
296 0.2
297 0.18
298 0.18
299 0.16
300 0.16
301 0.14
302 0.13
303 0.13
304 0.12
305 0.1
306 0.1
307 0.1
308 0.1
309 0.1
310 0.08
311 0.06
312 0.06
313 0.06
314 0.06
315 0.05
316 0.05
317 0.05
318 0.06
319 0.06
320 0.06
321 0.06
322 0.08
323 0.09
324 0.1
325 0.11
326 0.11
327 0.11
328 0.14
329 0.14
330 0.11
331 0.19
332 0.23
333 0.3
334 0.32
335 0.33
336 0.34
337 0.37
338 0.41
339 0.38
340 0.39
341 0.41
342 0.45
343 0.49
344 0.56
345 0.64
346 0.69
347 0.7
348 0.71
349 0.71
350 0.69
351 0.72
352 0.69
353 0.69
354 0.71
355 0.72
356 0.74
357 0.73
358 0.71
359 0.69
360 0.69