Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C2SJW4

Protein Details
Accession A0A5C2SJW4    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
6-33AAVAQERQQRRQEKKDRKQQLRQSGESSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
16-58RQEKKDRKQQLRQSGESSRGRGGGSVGRRGGGGGGGIGGGSAK
Subcellular Location(s) cyto_nucl 10.5, nucl 10, cyto 9, mito 3, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002745  Ptrans_KptA/Tpt1  
IPR042081  RNA_2'-PTrans_C  
IPR042080  RNA_2'-PTrans_N  
Gene Ontology GO:0000215  F:tRNA 2'-phosphotransferase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF01885  PTS_2-RNA  
Amino Acid Sequences MATTDAAVAQERQQRRQEKKDRKQQLRQSGESSRGRGGGSVGRRGGGGGGGIGGGSAKLRGLPKDSHDVRISKTLSWILRHGSQSEGLAMRKDGYVRVNDLLALPKMRELNLEALQDIVKGDAKGRYSLVLEANPDGGEESWWIRANQGHSMKSVVLDLEPISSHSDIPTGIAVHGTNKAAWEVIKEQGLSKMSRNHIHLAQGVPGSGVISGMRKSSDILIYINVQEAIDAGLKFYLSANGVVLTEGDDRGYLKPEFFSRVETAKGSLLPGYDGPKGVPPKGPVSIEVSAAIATDSPEGPGEQISRSVGPSKKDEGVQASLQEIEKKMESTNV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.53
2 0.6
3 0.7
4 0.75
5 0.78
6 0.85
7 0.89
8 0.91
9 0.92
10 0.93
11 0.92
12 0.92
13 0.9
14 0.84
15 0.8
16 0.74
17 0.73
18 0.67
19 0.6
20 0.52
21 0.44
22 0.4
23 0.33
24 0.3
25 0.28
26 0.27
27 0.31
28 0.29
29 0.27
30 0.27
31 0.27
32 0.24
33 0.18
34 0.13
35 0.06
36 0.06
37 0.05
38 0.05
39 0.04
40 0.04
41 0.03
42 0.03
43 0.04
44 0.04
45 0.07
46 0.1
47 0.12
48 0.17
49 0.2
50 0.24
51 0.34
52 0.37
53 0.39
54 0.42
55 0.42
56 0.4
57 0.45
58 0.43
59 0.33
60 0.34
61 0.34
62 0.32
63 0.32
64 0.32
65 0.28
66 0.31
67 0.32
68 0.3
69 0.26
70 0.24
71 0.22
72 0.23
73 0.21
74 0.17
75 0.16
76 0.16
77 0.15
78 0.14
79 0.15
80 0.14
81 0.15
82 0.16
83 0.18
84 0.18
85 0.17
86 0.17
87 0.17
88 0.17
89 0.16
90 0.14
91 0.12
92 0.13
93 0.14
94 0.14
95 0.14
96 0.13
97 0.17
98 0.2
99 0.2
100 0.17
101 0.17
102 0.17
103 0.16
104 0.14
105 0.09
106 0.07
107 0.07
108 0.09
109 0.11
110 0.12
111 0.13
112 0.13
113 0.14
114 0.13
115 0.15
116 0.15
117 0.14
118 0.14
119 0.13
120 0.13
121 0.11
122 0.1
123 0.09
124 0.07
125 0.06
126 0.06
127 0.06
128 0.08
129 0.1
130 0.1
131 0.1
132 0.12
133 0.14
134 0.21
135 0.24
136 0.22
137 0.22
138 0.23
139 0.22
140 0.2
141 0.19
142 0.11
143 0.07
144 0.07
145 0.06
146 0.06
147 0.05
148 0.06
149 0.08
150 0.08
151 0.08
152 0.07
153 0.08
154 0.07
155 0.07
156 0.07
157 0.06
158 0.05
159 0.06
160 0.06
161 0.06
162 0.08
163 0.08
164 0.07
165 0.07
166 0.08
167 0.07
168 0.07
169 0.08
170 0.09
171 0.1
172 0.11
173 0.11
174 0.12
175 0.15
176 0.17
177 0.16
178 0.17
179 0.21
180 0.24
181 0.28
182 0.3
183 0.3
184 0.29
185 0.3
186 0.3
187 0.24
188 0.23
189 0.19
190 0.16
191 0.13
192 0.11
193 0.09
194 0.07
195 0.06
196 0.04
197 0.05
198 0.06
199 0.06
200 0.07
201 0.07
202 0.08
203 0.1
204 0.11
205 0.11
206 0.11
207 0.11
208 0.12
209 0.13
210 0.12
211 0.11
212 0.09
213 0.08
214 0.07
215 0.07
216 0.08
217 0.07
218 0.07
219 0.07
220 0.07
221 0.07
222 0.08
223 0.08
224 0.07
225 0.07
226 0.08
227 0.08
228 0.08
229 0.08
230 0.08
231 0.08
232 0.08
233 0.08
234 0.07
235 0.07
236 0.09
237 0.09
238 0.13
239 0.12
240 0.12
241 0.14
242 0.16
243 0.21
244 0.2
245 0.24
246 0.23
247 0.25
248 0.26
249 0.25
250 0.25
251 0.22
252 0.22
253 0.18
254 0.16
255 0.13
256 0.13
257 0.14
258 0.16
259 0.15
260 0.15
261 0.15
262 0.21
263 0.24
264 0.25
265 0.27
266 0.27
267 0.31
268 0.35
269 0.35
270 0.31
271 0.34
272 0.33
273 0.29
274 0.26
275 0.22
276 0.17
277 0.16
278 0.14
279 0.08
280 0.07
281 0.08
282 0.07
283 0.08
284 0.08
285 0.09
286 0.09
287 0.11
288 0.12
289 0.12
290 0.13
291 0.15
292 0.16
293 0.18
294 0.25
295 0.26
296 0.29
297 0.33
298 0.36
299 0.38
300 0.39
301 0.41
302 0.39
303 0.41
304 0.39
305 0.35
306 0.31
307 0.3
308 0.29
309 0.29
310 0.25
311 0.23
312 0.23
313 0.22