Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C2SHW4

Protein Details
Accession A0A5C2SHW4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
175-200SDPYEHSRRVRKRFREQKKIDKAREEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
182-194RRVRKRFREQKKI
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 12.833, cyto 8, cyto_mito 5.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007590  Saf4/Yju2  
Gene Ontology GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF04502  Saf4_Yju2  
Amino Acid Sequences MQGFNKYYPPDYDPEKHSSLNAYRGKHALGDRARKIDQGILIVRFELPFNIWCGTCNNHIGMGVRYNAEKKKIGNYYSTPIYSFRCKCHLCDGWFEIQTDPKNTRYVVVSGARQKDEEWDPEENGGFAVHETDPNQGPIDPLAALEKSTEAQNHMNNVQVPRIEALQNLSDHYSSDPYEHSRRVRKRFREQKKIDKAREEVDEEVKSAYGLPEALALSADDDESRAKAKEAWKQGRQALEERESAKRRKVGLEIGVVPRTPSSLRASASGSRSLSSRSSGSSGGDPVSALRAKILGNTARQSGSLGGLGRLKPPDSKPVRVGLVKRT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.48
3 0.44
4 0.42
5 0.45
6 0.42
7 0.45
8 0.46
9 0.42
10 0.42
11 0.43
12 0.43
13 0.4
14 0.38
15 0.38
16 0.41
17 0.47
18 0.49
19 0.53
20 0.53
21 0.49
22 0.48
23 0.43
24 0.37
25 0.33
26 0.32
27 0.27
28 0.27
29 0.26
30 0.25
31 0.21
32 0.19
33 0.14
34 0.12
35 0.11
36 0.13
37 0.15
38 0.14
39 0.15
40 0.17
41 0.2
42 0.21
43 0.23
44 0.21
45 0.19
46 0.21
47 0.21
48 0.21
49 0.2
50 0.18
51 0.17
52 0.18
53 0.23
54 0.25
55 0.28
56 0.29
57 0.28
58 0.35
59 0.4
60 0.41
61 0.41
62 0.42
63 0.43
64 0.44
65 0.43
66 0.35
67 0.31
68 0.32
69 0.35
70 0.34
71 0.32
72 0.36
73 0.37
74 0.38
75 0.45
76 0.49
77 0.42
78 0.46
79 0.46
80 0.44
81 0.44
82 0.42
83 0.34
84 0.32
85 0.32
86 0.29
87 0.27
88 0.24
89 0.24
90 0.23
91 0.24
92 0.21
93 0.2
94 0.21
95 0.22
96 0.25
97 0.29
98 0.33
99 0.32
100 0.3
101 0.29
102 0.29
103 0.29
104 0.27
105 0.24
106 0.23
107 0.23
108 0.23
109 0.23
110 0.18
111 0.15
112 0.12
113 0.08
114 0.05
115 0.07
116 0.06
117 0.07
118 0.07
119 0.1
120 0.1
121 0.11
122 0.12
123 0.1
124 0.1
125 0.09
126 0.09
127 0.07
128 0.06
129 0.07
130 0.06
131 0.06
132 0.06
133 0.06
134 0.06
135 0.07
136 0.07
137 0.09
138 0.12
139 0.13
140 0.15
141 0.15
142 0.17
143 0.18
144 0.18
145 0.17
146 0.14
147 0.13
148 0.11
149 0.12
150 0.11
151 0.09
152 0.1
153 0.11
154 0.11
155 0.11
156 0.11
157 0.1
158 0.1
159 0.1
160 0.1
161 0.08
162 0.09
163 0.1
164 0.13
165 0.17
166 0.2
167 0.26
168 0.34
169 0.42
170 0.51
171 0.59
172 0.64
173 0.72
174 0.79
175 0.84
176 0.86
177 0.85
178 0.86
179 0.88
180 0.89
181 0.83
182 0.78
183 0.7
184 0.63
185 0.58
186 0.5
187 0.4
188 0.34
189 0.3
190 0.24
191 0.22
192 0.18
193 0.14
194 0.12
195 0.09
196 0.06
197 0.05
198 0.05
199 0.06
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.06
204 0.06
205 0.06
206 0.06
207 0.04
208 0.05
209 0.06
210 0.06
211 0.08
212 0.08
213 0.08
214 0.13
215 0.18
216 0.26
217 0.36
218 0.44
219 0.47
220 0.53
221 0.56
222 0.57
223 0.54
224 0.52
225 0.47
226 0.42
227 0.41
228 0.38
229 0.43
230 0.44
231 0.45
232 0.45
233 0.44
234 0.43
235 0.43
236 0.44
237 0.42
238 0.41
239 0.43
240 0.42
241 0.41
242 0.4
243 0.36
244 0.32
245 0.26
246 0.23
247 0.18
248 0.16
249 0.18
250 0.2
251 0.21
252 0.23
253 0.27
254 0.3
255 0.33
256 0.35
257 0.3
258 0.26
259 0.26
260 0.27
261 0.25
262 0.23
263 0.21
264 0.18
265 0.2
266 0.2
267 0.22
268 0.21
269 0.21
270 0.19
271 0.17
272 0.15
273 0.13
274 0.17
275 0.16
276 0.14
277 0.13
278 0.13
279 0.13
280 0.16
281 0.22
282 0.21
283 0.25
284 0.28
285 0.3
286 0.29
287 0.29
288 0.28
289 0.23
290 0.2
291 0.18
292 0.17
293 0.16
294 0.21
295 0.21
296 0.24
297 0.26
298 0.26
299 0.29
300 0.31
301 0.4
302 0.42
303 0.48
304 0.48
305 0.52
306 0.57
307 0.57