Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C2SND7

Protein Details
Accession A0A5C2SND7    Localization Confidence High Confidence Score 27
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-27SSSAAQKLTKKQKKALAFRERKGKGKHydrophilic
246-278ARLEKVKKRNKELHDQRKKQVMKRTSGKKKTGEBasic
319-346DEEGRPAKKRGSKKGKSRPPKPLGTGVNBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
10-29TKKQKKALAFRERKGKGKGK
64-103KGRAKAGAKGADGVGEGAAEGAGKAKGSGKKRKRGEDEGG
107-127GDGAERKEGGAQKQAKKKRKG
243-275KSEARLEKVKKRNKELHDQRKKQVMKRTSGKKK
323-340RPAKKRGSKKGKSRPPKP
Subcellular Location(s) nucl 25
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034228  Nop6_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12400  RRM_Nop6  
Amino Acid Sequences MSSSAAQKLTKKQKKALAFRERKGKGKGKPTSFDELDNDVPVAEDQDLAEAELDAEAASVEAPKGRAKAGAKGADGVGEGAAEGAGKAKGSGKKRKRGEDEGGDGDGDGAERKEGGAQKQAKKKRKGVDGAVEVDGEEEAGEGGSKKEKGQQKQRYILFVGNLKYTTTKEAVEQHFAKCDPPPTVRLMTPKPSATSKSTTKSKGFAFVEFSHKNALQQGLKLHQSELDGRKINVELTAGGGGKSEARLEKVKKRNKELHDQRKKQVMKRTSGKKKTGEEGAQDDDVQMERPQRYSATSGVELVPLKKRTWSIPEADDVDEEGRPAKKRGSKKGKSRPPKPLGTGVNAIPVG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.76
2 0.81
3 0.82
4 0.82
5 0.83
6 0.82
7 0.85
8 0.82
9 0.79
10 0.78
11 0.76
12 0.73
13 0.74
14 0.77
15 0.74
16 0.76
17 0.74
18 0.74
19 0.67
20 0.62
21 0.55
22 0.5
23 0.44
24 0.37
25 0.31
26 0.22
27 0.2
28 0.17
29 0.14
30 0.09
31 0.08
32 0.07
33 0.08
34 0.08
35 0.08
36 0.08
37 0.07
38 0.06
39 0.06
40 0.06
41 0.04
42 0.04
43 0.04
44 0.03
45 0.03
46 0.04
47 0.04
48 0.06
49 0.07
50 0.1
51 0.11
52 0.12
53 0.18
54 0.19
55 0.27
56 0.33
57 0.37
58 0.35
59 0.35
60 0.34
61 0.29
62 0.27
63 0.2
64 0.12
65 0.07
66 0.06
67 0.04
68 0.04
69 0.03
70 0.03
71 0.04
72 0.04
73 0.04
74 0.05
75 0.11
76 0.17
77 0.26
78 0.37
79 0.45
80 0.55
81 0.63
82 0.72
83 0.74
84 0.76
85 0.77
86 0.74
87 0.71
88 0.64
89 0.56
90 0.46
91 0.38
92 0.3
93 0.21
94 0.13
95 0.08
96 0.05
97 0.04
98 0.04
99 0.04
100 0.08
101 0.11
102 0.13
103 0.21
104 0.29
105 0.37
106 0.46
107 0.56
108 0.62
109 0.67
110 0.73
111 0.72
112 0.74
113 0.73
114 0.7
115 0.69
116 0.64
117 0.59
118 0.52
119 0.43
120 0.34
121 0.27
122 0.2
123 0.11
124 0.06
125 0.03
126 0.03
127 0.03
128 0.03
129 0.03
130 0.04
131 0.06
132 0.07
133 0.08
134 0.15
135 0.22
136 0.3
137 0.41
138 0.5
139 0.56
140 0.64
141 0.65
142 0.61
143 0.56
144 0.5
145 0.41
146 0.35
147 0.28
148 0.21
149 0.19
150 0.16
151 0.16
152 0.15
153 0.15
154 0.13
155 0.12
156 0.13
157 0.19
158 0.21
159 0.25
160 0.26
161 0.24
162 0.25
163 0.25
164 0.23
165 0.18
166 0.18
167 0.16
168 0.16
169 0.18
170 0.19
171 0.21
172 0.22
173 0.26
174 0.27
175 0.29
176 0.31
177 0.29
178 0.28
179 0.28
180 0.29
181 0.28
182 0.3
183 0.29
184 0.33
185 0.38
186 0.41
187 0.4
188 0.41
189 0.38
190 0.41
191 0.37
192 0.32
193 0.31
194 0.29
195 0.35
196 0.31
197 0.31
198 0.26
199 0.25
200 0.25
201 0.21
202 0.23
203 0.16
204 0.18
205 0.2
206 0.2
207 0.23
208 0.23
209 0.21
210 0.18
211 0.19
212 0.24
213 0.25
214 0.27
215 0.26
216 0.26
217 0.27
218 0.26
219 0.24
220 0.18
221 0.15
222 0.09
223 0.09
224 0.11
225 0.09
226 0.08
227 0.08
228 0.08
229 0.08
230 0.08
231 0.09
232 0.08
233 0.11
234 0.18
235 0.23
236 0.33
237 0.43
238 0.51
239 0.57
240 0.65
241 0.71
242 0.71
243 0.77
244 0.78
245 0.8
246 0.83
247 0.82
248 0.79
249 0.8
250 0.8
251 0.76
252 0.74
253 0.71
254 0.69
255 0.72
256 0.76
257 0.77
258 0.8
259 0.81
260 0.79
261 0.76
262 0.72
263 0.71
264 0.64
265 0.58
266 0.53
267 0.49
268 0.43
269 0.38
270 0.32
271 0.24
272 0.2
273 0.17
274 0.14
275 0.16
276 0.16
277 0.18
278 0.19
279 0.19
280 0.22
281 0.23
282 0.24
283 0.24
284 0.24
285 0.25
286 0.24
287 0.26
288 0.24
289 0.24
290 0.29
291 0.26
292 0.26
293 0.28
294 0.3
295 0.32
296 0.39
297 0.41
298 0.39
299 0.39
300 0.44
301 0.43
302 0.42
303 0.37
304 0.31
305 0.27
306 0.21
307 0.18
308 0.17
309 0.18
310 0.2
311 0.22
312 0.29
313 0.35
314 0.45
315 0.56
316 0.64
317 0.7
318 0.78
319 0.87
320 0.9
321 0.92
322 0.93
323 0.93
324 0.9
325 0.89
326 0.84
327 0.83
328 0.77
329 0.72
330 0.67
331 0.57