Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C2SDZ0

Protein Details
Accession A0A5C2SDZ0    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
108-133PTSNIILKVVKRKRRRKDGDSGDGPIHydrophilic
503-527EGTDKLPSRYRPKLKFGKHNMAKGAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
118-124KRKRRRK
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 12.5, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019136  TF_IIIC_su-5_HTH  
IPR040454  TF_IIIC_Tfc1/Sfc1  
IPR041499  Tfc1/Sfc1_N  
IPR042536  TFIIIC_tauA_Sfc1  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000127  C:transcription factor TFIIIC complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006384  P:transcription initiation at RNA polymerase III promoter  
Pfam View protein in Pfam  
PF09734  Tau95  
PF17682  Tau95_N  
Amino Acid Sequences MDIEAEQPVAGPSRTAVGPSIHTSSVDLGTPSSAPERPLPTTHFYSVEYPGFVQPASAPLAVERLGGQQAIDTAFRRATGRDRVESLLELRLRPDNPYAHPVPGEVVPTSNIILKVVKRKRRRKDGDSGDGPIGEYTVQAVGVAPKTARFRSMADFQYQPDMSDPVAQLRGAMDSMDVDGILRYHIPPEKEDYTISEAGPEAMNIDPLLLGEGEATKVRTRSNLRLFPAPLFSRQGVPQNYNYKANTASVETIVVDDETGIEQKRLINRMRWKGFGPISVSYAEKNVPDKPSAAVEEQRGQADKKILKRLEELFQERPIWTRAAIFNQFQPLEVRDIVNSKYLLPLVSYVFEDGPWRDTYVRLGYDPRQDPEARFYQRLYFRNVNHPILRPSVMTRRQEQRNESAEARFSGMDERRSHIFDGETITSETAAFQLCDITDEMLKEMIEADDEDSLRDACNERDGWYTTSALERIKSVLRLKFFSLLEGHVATREECEKLLVPQEGTDKLPSRYRPKLKFGKHNMAKGALRPEDAAAQRLMTAIEQQRKTFPPR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.15
3 0.16
4 0.16
5 0.19
6 0.23
7 0.27
8 0.24
9 0.24
10 0.24
11 0.24
12 0.23
13 0.2
14 0.17
15 0.13
16 0.14
17 0.14
18 0.14
19 0.15
20 0.16
21 0.17
22 0.22
23 0.27
24 0.29
25 0.33
26 0.36
27 0.39
28 0.43
29 0.44
30 0.4
31 0.38
32 0.38
33 0.39
34 0.35
35 0.3
36 0.26
37 0.25
38 0.23
39 0.21
40 0.18
41 0.13
42 0.14
43 0.16
44 0.14
45 0.13
46 0.12
47 0.15
48 0.14
49 0.14
50 0.13
51 0.11
52 0.12
53 0.12
54 0.12
55 0.1
56 0.11
57 0.12
58 0.13
59 0.12
60 0.13
61 0.14
62 0.15
63 0.16
64 0.17
65 0.22
66 0.3
67 0.35
68 0.37
69 0.39
70 0.4
71 0.41
72 0.4
73 0.35
74 0.32
75 0.29
76 0.25
77 0.24
78 0.28
79 0.26
80 0.28
81 0.31
82 0.29
83 0.3
84 0.37
85 0.37
86 0.34
87 0.33
88 0.31
89 0.28
90 0.24
91 0.23
92 0.15
93 0.14
94 0.13
95 0.14
96 0.14
97 0.14
98 0.13
99 0.12
100 0.15
101 0.18
102 0.28
103 0.36
104 0.45
105 0.53
106 0.64
107 0.73
108 0.81
109 0.87
110 0.85
111 0.87
112 0.88
113 0.87
114 0.81
115 0.74
116 0.64
117 0.54
118 0.46
119 0.35
120 0.25
121 0.14
122 0.09
123 0.06
124 0.05
125 0.05
126 0.05
127 0.05
128 0.07
129 0.08
130 0.09
131 0.08
132 0.12
133 0.16
134 0.17
135 0.18
136 0.18
137 0.2
138 0.24
139 0.31
140 0.3
141 0.3
142 0.31
143 0.3
144 0.35
145 0.32
146 0.27
147 0.21
148 0.2
149 0.16
150 0.18
151 0.18
152 0.14
153 0.15
154 0.14
155 0.13
156 0.12
157 0.13
158 0.09
159 0.09
160 0.06
161 0.05
162 0.06
163 0.05
164 0.05
165 0.04
166 0.04
167 0.04
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.08
172 0.11
173 0.12
174 0.14
175 0.2
176 0.22
177 0.23
178 0.23
179 0.23
180 0.25
181 0.25
182 0.24
183 0.18
184 0.16
185 0.15
186 0.15
187 0.12
188 0.08
189 0.06
190 0.07
191 0.06
192 0.06
193 0.05
194 0.05
195 0.05
196 0.04
197 0.04
198 0.04
199 0.04
200 0.05
201 0.05
202 0.07
203 0.08
204 0.09
205 0.09
206 0.15
207 0.2
208 0.29
209 0.37
210 0.42
211 0.43
212 0.47
213 0.48
214 0.43
215 0.43
216 0.36
217 0.29
218 0.26
219 0.24
220 0.21
221 0.22
222 0.27
223 0.25
224 0.26
225 0.3
226 0.34
227 0.35
228 0.37
229 0.36
230 0.3
231 0.28
232 0.26
233 0.21
234 0.16
235 0.15
236 0.11
237 0.11
238 0.09
239 0.09
240 0.08
241 0.06
242 0.05
243 0.04
244 0.04
245 0.04
246 0.05
247 0.05
248 0.05
249 0.06
250 0.08
251 0.11
252 0.16
253 0.18
254 0.24
255 0.32
256 0.41
257 0.43
258 0.43
259 0.41
260 0.42
261 0.41
262 0.37
263 0.32
264 0.23
265 0.22
266 0.21
267 0.21
268 0.15
269 0.15
270 0.13
271 0.11
272 0.12
273 0.14
274 0.14
275 0.15
276 0.15
277 0.15
278 0.16
279 0.17
280 0.17
281 0.16
282 0.16
283 0.19
284 0.19
285 0.19
286 0.19
287 0.17
288 0.17
289 0.21
290 0.23
291 0.25
292 0.32
293 0.33
294 0.33
295 0.37
296 0.38
297 0.37
298 0.4
299 0.39
300 0.33
301 0.34
302 0.34
303 0.3
304 0.28
305 0.25
306 0.19
307 0.15
308 0.15
309 0.14
310 0.18
311 0.21
312 0.2
313 0.2
314 0.24
315 0.23
316 0.21
317 0.21
318 0.17
319 0.17
320 0.17
321 0.15
322 0.12
323 0.14
324 0.14
325 0.16
326 0.15
327 0.12
328 0.12
329 0.12
330 0.12
331 0.1
332 0.11
333 0.09
334 0.09
335 0.09
336 0.09
337 0.09
338 0.09
339 0.1
340 0.09
341 0.11
342 0.11
343 0.12
344 0.12
345 0.12
346 0.15
347 0.18
348 0.18
349 0.17
350 0.2
351 0.22
352 0.31
353 0.33
354 0.31
355 0.31
356 0.31
357 0.31
358 0.33
359 0.38
360 0.33
361 0.32
362 0.32
363 0.35
364 0.42
365 0.43
366 0.45
367 0.43
368 0.42
369 0.51
370 0.55
371 0.53
372 0.49
373 0.49
374 0.45
375 0.41
376 0.39
377 0.3
378 0.29
379 0.33
380 0.37
381 0.38
382 0.41
383 0.47
384 0.55
385 0.6
386 0.6
387 0.59
388 0.57
389 0.58
390 0.53
391 0.47
392 0.4
393 0.35
394 0.32
395 0.23
396 0.19
397 0.21
398 0.22
399 0.26
400 0.26
401 0.28
402 0.29
403 0.31
404 0.31
405 0.26
406 0.23
407 0.19
408 0.22
409 0.2
410 0.19
411 0.18
412 0.17
413 0.15
414 0.15
415 0.13
416 0.09
417 0.09
418 0.07
419 0.06
420 0.07
421 0.07
422 0.08
423 0.09
424 0.09
425 0.1
426 0.1
427 0.11
428 0.11
429 0.11
430 0.1
431 0.1
432 0.08
433 0.08
434 0.08
435 0.08
436 0.1
437 0.1
438 0.1
439 0.11
440 0.11
441 0.1
442 0.12
443 0.12
444 0.1
445 0.16
446 0.16
447 0.17
448 0.21
449 0.24
450 0.25
451 0.25
452 0.25
453 0.21
454 0.23
455 0.24
456 0.21
457 0.19
458 0.17
459 0.18
460 0.2
461 0.26
462 0.29
463 0.32
464 0.35
465 0.37
466 0.38
467 0.42
468 0.39
469 0.36
470 0.31
471 0.27
472 0.26
473 0.25
474 0.22
475 0.18
476 0.19
477 0.16
478 0.17
479 0.18
480 0.16
481 0.15
482 0.18
483 0.17
484 0.19
485 0.24
486 0.24
487 0.23
488 0.24
489 0.28
490 0.28
491 0.29
492 0.32
493 0.29
494 0.3
495 0.37
496 0.42
497 0.46
498 0.55
499 0.63
500 0.65
501 0.72
502 0.78
503 0.81
504 0.84
505 0.86
506 0.86
507 0.84
508 0.84
509 0.78
510 0.75
511 0.68
512 0.62
513 0.61
514 0.52
515 0.46
516 0.4
517 0.37
518 0.37
519 0.36
520 0.33
521 0.25
522 0.22
523 0.21
524 0.2
525 0.19
526 0.12
527 0.19
528 0.24
529 0.32
530 0.35
531 0.37
532 0.43