Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C2SQL9

Protein Details
Accession A0A5C2SQL9    Localization Confidence High Confidence Score 16.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
196-216EKEIKKARKLHKQQERLQKEKBasic
253-280RVGAKSKKTGVPKKKPNNKTKRGDLEGTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
200-208KKARKLHKQ
256-274AKSKKTGVPKKKPNNKTKR
Subcellular Location(s) nucl 15.5, mito 9, cyto_nucl 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039905  CD2BP2/Lin1  
IPR003169  GYF  
IPR035445  GYF-like_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005682  C:U5 snRNP  
Pfam View protein in Pfam  
PF02213  GYF  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50829  GYF  
Amino Acid Sequences MPPRPSHKRAAASGSDTTVADGSRKKTRFVEPSEDPANFAEEVDAQLENSGRRKGRVNTEGYESDSSDDGDGVVNSRKASANGAADEEEEDMFAMGDKEEKKAEETGKKKKEEFLRLGDIEGQEFGEQSDKDDDDNEEPEDEDDLERRKKAGMGFELSAFNMREEMEEGKFSADGMYVRTFDPHAVHDRWMEGMDEKEIKKARKLHKQQERLQKEKQKAEERELQELGGKDHIEQELVGMLKKGETVLEALQRVGAKSKKTGVPKKKPNNKTKRGDLEGTAMDVDPTPPANAGPSDIEQITHLASTLMSLGDTDIYSKTYEELVRSVRASGKVDKDWVPPSADVKYEYKWDVPEAGDPGQVFGPFSEEEMKAWHSAAYFGVSGEKVKVRKVGGEWGSWDEVVS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.43
3 0.36
4 0.31
5 0.24
6 0.19
7 0.18
8 0.2
9 0.23
10 0.31
11 0.32
12 0.36
13 0.41
14 0.49
15 0.55
16 0.57
17 0.61
18 0.57
19 0.63
20 0.64
21 0.58
22 0.51
23 0.42
24 0.38
25 0.28
26 0.23
27 0.17
28 0.12
29 0.13
30 0.12
31 0.12
32 0.09
33 0.1
34 0.12
35 0.14
36 0.17
37 0.23
38 0.23
39 0.26
40 0.33
41 0.39
42 0.47
43 0.52
44 0.54
45 0.51
46 0.56
47 0.55
48 0.52
49 0.47
50 0.37
51 0.31
52 0.25
53 0.23
54 0.16
55 0.14
56 0.1
57 0.09
58 0.09
59 0.09
60 0.12
61 0.13
62 0.13
63 0.15
64 0.16
65 0.16
66 0.19
67 0.21
68 0.21
69 0.21
70 0.22
71 0.21
72 0.2
73 0.2
74 0.18
75 0.13
76 0.09
77 0.08
78 0.06
79 0.06
80 0.06
81 0.05
82 0.04
83 0.09
84 0.09
85 0.11
86 0.13
87 0.14
88 0.16
89 0.2
90 0.27
91 0.32
92 0.4
93 0.49
94 0.56
95 0.6
96 0.6
97 0.62
98 0.64
99 0.64
100 0.62
101 0.58
102 0.57
103 0.53
104 0.52
105 0.48
106 0.39
107 0.3
108 0.24
109 0.18
110 0.1
111 0.1
112 0.09
113 0.09
114 0.09
115 0.1
116 0.13
117 0.13
118 0.13
119 0.14
120 0.16
121 0.15
122 0.17
123 0.15
124 0.13
125 0.12
126 0.13
127 0.12
128 0.1
129 0.09
130 0.1
131 0.14
132 0.16
133 0.16
134 0.16
135 0.16
136 0.18
137 0.21
138 0.25
139 0.24
140 0.25
141 0.26
142 0.27
143 0.27
144 0.24
145 0.24
146 0.18
147 0.13
148 0.1
149 0.09
150 0.08
151 0.09
152 0.11
153 0.1
154 0.1
155 0.1
156 0.1
157 0.09
158 0.09
159 0.08
160 0.06
161 0.06
162 0.08
163 0.09
164 0.09
165 0.09
166 0.1
167 0.1
168 0.1
169 0.11
170 0.11
171 0.16
172 0.16
173 0.17
174 0.17
175 0.17
176 0.17
177 0.16
178 0.14
179 0.09
180 0.09
181 0.09
182 0.12
183 0.12
184 0.16
185 0.19
186 0.2
187 0.24
188 0.32
189 0.38
190 0.46
191 0.55
192 0.61
193 0.67
194 0.76
195 0.79
196 0.81
197 0.81
198 0.76
199 0.75
200 0.72
201 0.69
202 0.66
203 0.66
204 0.64
205 0.59
206 0.59
207 0.59
208 0.55
209 0.52
210 0.46
211 0.39
212 0.32
213 0.29
214 0.24
215 0.17
216 0.15
217 0.11
218 0.13
219 0.12
220 0.1
221 0.09
222 0.08
223 0.09
224 0.09
225 0.09
226 0.07
227 0.06
228 0.06
229 0.07
230 0.07
231 0.04
232 0.05
233 0.06
234 0.08
235 0.11
236 0.12
237 0.11
238 0.13
239 0.14
240 0.13
241 0.17
242 0.18
243 0.16
244 0.19
245 0.24
246 0.28
247 0.37
248 0.47
249 0.53
250 0.61
251 0.7
252 0.79
253 0.84
254 0.89
255 0.9
256 0.92
257 0.91
258 0.88
259 0.87
260 0.85
261 0.8
262 0.73
263 0.63
264 0.57
265 0.47
266 0.39
267 0.3
268 0.21
269 0.16
270 0.13
271 0.11
272 0.07
273 0.07
274 0.07
275 0.06
276 0.06
277 0.08
278 0.08
279 0.09
280 0.11
281 0.11
282 0.14
283 0.13
284 0.14
285 0.13
286 0.13
287 0.12
288 0.09
289 0.08
290 0.06
291 0.06
292 0.06
293 0.06
294 0.05
295 0.05
296 0.05
297 0.05
298 0.06
299 0.06
300 0.07
301 0.07
302 0.08
303 0.09
304 0.09
305 0.09
306 0.12
307 0.14
308 0.14
309 0.17
310 0.19
311 0.22
312 0.22
313 0.23
314 0.24
315 0.26
316 0.29
317 0.32
318 0.34
319 0.34
320 0.38
321 0.39
322 0.4
323 0.4
324 0.38
325 0.35
326 0.31
327 0.32
328 0.3
329 0.28
330 0.27
331 0.26
332 0.26
333 0.28
334 0.28
335 0.28
336 0.27
337 0.27
338 0.26
339 0.25
340 0.26
341 0.25
342 0.24
343 0.24
344 0.22
345 0.22
346 0.2
347 0.19
348 0.15
349 0.11
350 0.13
351 0.11
352 0.13
353 0.16
354 0.15
355 0.16
356 0.18
357 0.2
358 0.18
359 0.18
360 0.18
361 0.14
362 0.14
363 0.15
364 0.15
365 0.13
366 0.12
367 0.15
368 0.14
369 0.15
370 0.18
371 0.23
372 0.22
373 0.25
374 0.3
375 0.29
376 0.34
377 0.36
378 0.42
379 0.4
380 0.41
381 0.41
382 0.41
383 0.41