FuNGI

A0A5C2S5B3

Protein Details

Accession

A0A5C2S5B3

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
278-302	GEQKKGKGRGRRNRGKGKGKNKEEA	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
256-264	KAPKRRRGG
278-300	GEQKKGKGRGRRNRGKGKGKNKE
525-531	RLKKKKA

Subcellular Location(s)

cyto 19.5, cyto_nucl 13.5, nucl 6.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR028884 Trm82 IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR001680 WD40_repeat IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0036265 P:RNA (guanine-N7)-methylation GO:0030488 P:tRNA methylation
Pfam	View protein in Pfam PF00400 WD40
PROSITE	View protein in PROSITE PS50082 WD_REPEATS_2

Amino Acid Sequences

MAHYPPTHLVLEQDISLLVSGYHFHVLNPTTGDLLQSTATFADDVLEKLRKSGPIRCVAVDAKRAHITTTGDDKKLKVWSSVTDNLQLVNERELPKKPTEVSFTQDGQTIVVSDKFGDVFSYPLHPEPLSMSSSEQASTSKRGSLTSHENPSNGTLILGHASMLTTFLLTPDERYIVTADRDEHIRVSWYPQGYNIERYCLGHEKFVSALHIPSFQPSTLVSGGGDPMLKVWDWMSGKLLASINVFPTVEPYIKVKAPKRRRGGSDGDGDGEGEGGEGEQKKGKGRGRRNRGKGKGKNKEEAREDSADVEEAEATEPKANEEHGDSPMPDAAAQDPGKGDTQASSAAPEEVLVFVAHRISSVDRGKHGRFIIFNAVGATALFYTALPAEGKSNMPVHTVEFGVPVSDFTVGPNGDVWALLDAEWSDPPSAEKPQFVRLLTWDGATVRLSEATSSDSKLLASLNSNCLVPATPEDLKALDLYSDLSSMPKNVDPEHDPLIRDTLSEAAAVDLDTDGKGLTQRELGRLKKKKALLAKIQEKEQQKRGASEVAETQAEAGREVKRTRSESGEGDGKDKEAVYEEDVEMK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.14
2	0.13
3	0.13
4	0.11
5	0.07
6	0.06
7	0.07
8	0.09
9	0.12
10	0.11
11	0.12
12	0.17
13	0.19
14	0.21
15	0.22
16	0.21
17	0.2
18	0.19
19	0.2
20	0.15
21	0.15
22	0.13
23	0.11
24	0.11
25	0.1
26	0.1
27	0.09
28	0.08
29	0.09
30	0.09
31	0.1
32	0.14
33	0.19
34	0.18
35	0.21
36	0.24
37	0.29
38	0.32
39	0.39
40	0.42
41	0.47
42	0.5
43	0.49
44	0.5
45	0.49
46	0.5
47	0.5
48	0.44
49	0.4
50	0.41
51	0.4
52	0.36
53	0.36
54	0.33
55	0.3
56	0.39
57	0.39
58	0.38
59	0.4
60	0.4
61	0.4
62	0.44
63	0.4
64	0.34
65	0.3
66	0.32
67	0.38
68	0.44
69	0.42
70	0.4
71	0.39
72	0.36
73	0.35
74	0.32
75	0.26
76	0.23
77	0.26
78	0.24
79	0.27
80	0.31
81	0.34
82	0.35
83	0.38
84	0.37
85	0.36
86	0.4
87	0.39
88	0.39
89	0.4
90	0.39
91	0.35
92	0.35
93	0.3
94	0.24
95	0.21
96	0.17
97	0.13
98	0.12
99	0.11
100	0.09
101	0.1
102	0.1
103	0.09
104	0.1
105	0.08
106	0.09
107	0.09
108	0.13
109	0.13
110	0.14
111	0.16
112	0.15
113	0.15
114	0.17
115	0.19
116	0.16
117	0.16
118	0.16
119	0.15
120	0.16
121	0.16
122	0.13
123	0.13
124	0.14
125	0.18
126	0.18
127	0.19
128	0.19
129	0.21
130	0.22
131	0.26
132	0.33
133	0.36
134	0.42
135	0.41
136	0.4
137	0.39
138	0.39
139	0.35
140	0.25
141	0.18
142	0.11
143	0.1
144	0.1
145	0.09
146	0.07
147	0.06
148	0.06
149	0.06
150	0.06
151	0.05
152	0.05
153	0.05
154	0.05
155	0.07
156	0.07
157	0.09
158	0.09
159	0.11
160	0.1
161	0.11
162	0.12
163	0.13
164	0.14
165	0.14
166	0.14
167	0.15
168	0.17
169	0.17
170	0.16
171	0.14
172	0.15
173	0.14
174	0.16
175	0.2
176	0.19
177	0.19
178	0.21
179	0.26
180	0.25
181	0.32
182	0.28
183	0.27
184	0.26
185	0.27
186	0.28
187	0.29
188	0.28
189	0.24
190	0.24
191	0.22
192	0.22
193	0.22
194	0.2
195	0.14
196	0.14
197	0.11
198	0.14
199	0.12
200	0.14
201	0.14
202	0.12
203	0.12
204	0.11
205	0.14
206	0.12
207	0.12
208	0.1
209	0.09
210	0.09
211	0.09
212	0.09
213	0.05
214	0.05
215	0.06
216	0.05
217	0.05
218	0.05
219	0.1
220	0.11
221	0.12
222	0.13
223	0.14
224	0.14
225	0.17
226	0.17
227	0.12
228	0.13
229	0.13
230	0.12
231	0.12
232	0.12
233	0.09
234	0.1
235	0.11
236	0.1
237	0.1
238	0.12
239	0.13
240	0.15
241	0.21
242	0.26
243	0.35
244	0.45
245	0.53
246	0.59
247	0.63
248	0.65
249	0.65
250	0.66
251	0.6
252	0.56
253	0.47
254	0.4
255	0.34
256	0.29
257	0.23
258	0.16
259	0.11
260	0.05
261	0.04
262	0.02
263	0.04
264	0.05
265	0.05
266	0.08
267	0.09
268	0.11
269	0.17
270	0.22
271	0.3
272	0.4
273	0.5
274	0.59
275	0.68
276	0.75
277	0.8
278	0.85
279	0.86
280	0.85
281	0.86
282	0.85
283	0.8
284	0.79
285	0.73
286	0.7
287	0.64
288	0.59
289	0.53
290	0.45
291	0.4
292	0.32
293	0.28
294	0.21
295	0.17
296	0.12
297	0.07
298	0.05
299	0.06
300	0.05
301	0.05
302	0.07
303	0.07
304	0.07
305	0.08
306	0.07
307	0.08
308	0.1
309	0.11
310	0.12
311	0.12
312	0.12
313	0.12
314	0.13
315	0.12
316	0.09
317	0.08
318	0.07
319	0.12
320	0.11
321	0.11
322	0.11
323	0.12
324	0.13
325	0.13
326	0.12
327	0.07
328	0.08
329	0.09
330	0.09
331	0.08
332	0.08
333	0.08
334	0.08
335	0.07
336	0.07
337	0.05
338	0.06
339	0.05
340	0.05
341	0.05
342	0.05
343	0.05
344	0.05
345	0.06
346	0.06
347	0.13
348	0.17
349	0.18
350	0.22
351	0.28
352	0.28
353	0.33
354	0.33
355	0.29
356	0.25
357	0.27
358	0.3
359	0.25
360	0.24
361	0.19
362	0.18
363	0.15
364	0.14
365	0.12
366	0.05
367	0.05
368	0.04
369	0.04
370	0.04
371	0.04
372	0.05
373	0.05
374	0.06
375	0.07
376	0.08
377	0.09
378	0.11
379	0.13
380	0.13
381	0.14
382	0.14
383	0.14
384	0.14
385	0.15
386	0.13
387	0.11
388	0.1
389	0.09
390	0.09
391	0.08
392	0.07
393	0.07
394	0.07
395	0.06
396	0.11
397	0.1
398	0.1
399	0.1
400	0.1
401	0.09
402	0.09
403	0.09
404	0.06
405	0.06
406	0.06
407	0.06
408	0.05
409	0.07
410	0.07
411	0.08
412	0.07
413	0.07
414	0.09
415	0.11
416	0.17
417	0.17
418	0.21
419	0.22
420	0.29
421	0.33
422	0.31
423	0.3
424	0.27
425	0.31
426	0.28
427	0.26
428	0.21
429	0.17
430	0.18
431	0.17
432	0.15
433	0.1
434	0.1
435	0.1
436	0.09
437	0.09
438	0.12
439	0.13
440	0.13
441	0.14
442	0.13
443	0.13
444	0.13
445	0.13
446	0.11
447	0.14
448	0.16
449	0.18
450	0.19
451	0.19
452	0.18
453	0.18
454	0.17
455	0.14
456	0.14
457	0.16
458	0.16
459	0.17
460	0.18
461	0.18
462	0.18
463	0.17
464	0.15
465	0.09
466	0.08
467	0.09
468	0.09
469	0.09
470	0.08
471	0.09
472	0.1
473	0.1
474	0.13
475	0.14
476	0.15
477	0.16
478	0.21
479	0.23
480	0.27
481	0.32
482	0.33
483	0.31
484	0.3
485	0.32
486	0.27
487	0.24
488	0.2
489	0.16
490	0.14
491	0.13
492	0.12
493	0.08
494	0.09
495	0.08
496	0.08
497	0.06
498	0.06
499	0.06
500	0.06
501	0.05
502	0.06
503	0.09
504	0.09
505	0.11
506	0.16
507	0.18
508	0.26
509	0.34
510	0.41
511	0.49
512	0.57
513	0.62
514	0.64
515	0.67
516	0.68
517	0.7
518	0.72
519	0.72
520	0.74
521	0.78
522	0.74
523	0.75
524	0.74
525	0.73
526	0.71
527	0.69
528	0.66
529	0.59
530	0.58
531	0.56
532	0.55
533	0.47
534	0.42
535	0.39
536	0.33
537	0.3
538	0.27
539	0.25
540	0.21
541	0.2
542	0.18
543	0.17
544	0.17
545	0.23
546	0.25
547	0.31
548	0.36
549	0.4
550	0.44
551	0.47
552	0.48
553	0.45
554	0.5
555	0.5
556	0.44
557	0.42
558	0.39
559	0.33
560	0.3
561	0.27
562	0.21
563	0.17
564	0.18
565	0.18
566	0.22

A0A5C2S5B3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer