Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C5G5T3

Protein Details
Accession A0A5C5G5T3    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
383-406PAAPAPSSKKRKRTKDGSGSSRPSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
133-139RKKRKAA
390-397SKKRKRTK
619-669KPGRGGARGGRGGGRGGARGGGRGGAGGAGRGGKRQDPLKGGAFKFGGGKK
Subcellular Location(s) cyto 19, cyto_nucl 12, nucl 3, mito 2, extr 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR014014  RNA_helicase_DEAD_Q_motif  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF00271  Helicase_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
PS51195  Q_MOTIF  
CDD cd18787  SF2_C_DEAD  
Amino Acid Sequences MSKAKQVAFADLEPQLHPLLLRALSSLSFPVPTPIQATLIPLALSSSRDVLARARTGSGKTLAYAIPLVQGILQRRDRGELDGTRALVLVPTRELAEQVRGQVNKLVDGLGLADQQGEGIRVVNLVGDQAHSRKKRKAAGGERIERMQLADRPEIVVATPSRALAHLRAETLHLEHLDYLVIDEADLILSYGHSSDDIRSILSGPWGLPKVYQSFLMSATLTGEVEELKGVVLRNPVVLKLEEDEDELANLSQYCVRCSEEDKFLLLYVILKLKLIKGKCLIFVNDTDRGYRVKLFLEKYGIKSGVLNAELPFNSRYHAVQEFNRGVFDYLIATDESGLEGHDRDTNEEDEAEVEAEGSGLITTQPAGETSTSADATDADATPAAPAPSSKKRKRTKDGSGSSRPSTSEYGVSRGVDFVDVACVINFDLPFSSRSYTHRVGRTARAGRTGTSLSFVVPRELWGKQKKNDVSLETARYDDKVWARIDKAQRAKGQEVKEYRFDLKQVEGFRYRMEDGLRSVTKAAVREARIKEIKNEVLNSEKLKAHFEDNPRDLAFLRHDKTLHPSRVQPHLKHVPGYLMPRIAAVGANDAAVAASAAAAGSGAGEGATGVVGNVPFHKPGRGGARGGRGGGRGGARGGGRGGAGGAGRGGKRQDPLKGGAFKFGGGKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.21
3 0.17
4 0.17
5 0.14
6 0.16
7 0.15
8 0.15
9 0.14
10 0.15
11 0.15
12 0.16
13 0.16
14 0.13
15 0.13
16 0.13
17 0.16
18 0.16
19 0.17
20 0.19
21 0.18
22 0.2
23 0.19
24 0.22
25 0.19
26 0.19
27 0.18
28 0.14
29 0.15
30 0.13
31 0.14
32 0.12
33 0.13
34 0.12
35 0.13
36 0.14
37 0.17
38 0.22
39 0.24
40 0.24
41 0.25
42 0.28
43 0.29
44 0.32
45 0.32
46 0.27
47 0.24
48 0.25
49 0.22
50 0.21
51 0.2
52 0.16
53 0.14
54 0.13
55 0.12
56 0.11
57 0.15
58 0.18
59 0.25
60 0.29
61 0.3
62 0.31
63 0.35
64 0.35
65 0.35
66 0.38
67 0.34
68 0.37
69 0.37
70 0.36
71 0.32
72 0.31
73 0.26
74 0.21
75 0.18
76 0.13
77 0.11
78 0.11
79 0.12
80 0.12
81 0.14
82 0.14
83 0.18
84 0.19
85 0.22
86 0.28
87 0.27
88 0.28
89 0.31
90 0.29
91 0.25
92 0.24
93 0.2
94 0.13
95 0.13
96 0.13
97 0.1
98 0.09
99 0.08
100 0.07
101 0.07
102 0.07
103 0.07
104 0.07
105 0.06
106 0.06
107 0.06
108 0.06
109 0.07
110 0.07
111 0.06
112 0.06
113 0.06
114 0.07
115 0.09
116 0.13
117 0.22
118 0.29
119 0.35
120 0.41
121 0.48
122 0.55
123 0.61
124 0.68
125 0.69
126 0.73
127 0.77
128 0.78
129 0.74
130 0.67
131 0.59
132 0.48
133 0.39
134 0.34
135 0.27
136 0.24
137 0.23
138 0.22
139 0.23
140 0.23
141 0.21
142 0.16
143 0.17
144 0.13
145 0.13
146 0.13
147 0.12
148 0.13
149 0.14
150 0.15
151 0.14
152 0.18
153 0.17
154 0.17
155 0.17
156 0.18
157 0.19
158 0.18
159 0.18
160 0.13
161 0.12
162 0.12
163 0.11
164 0.1
165 0.09
166 0.08
167 0.06
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.04
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.03
176 0.03
177 0.03
178 0.04
179 0.04
180 0.04
181 0.05
182 0.06
183 0.09
184 0.09
185 0.09
186 0.09
187 0.11
188 0.1
189 0.11
190 0.11
191 0.08
192 0.12
193 0.14
194 0.13
195 0.13
196 0.15
197 0.17
198 0.17
199 0.19
200 0.16
201 0.15
202 0.16
203 0.17
204 0.14
205 0.11
206 0.11
207 0.1
208 0.09
209 0.08
210 0.07
211 0.06
212 0.06
213 0.05
214 0.04
215 0.04
216 0.05
217 0.06
218 0.07
219 0.09
220 0.09
221 0.11
222 0.12
223 0.12
224 0.13
225 0.13
226 0.12
227 0.12
228 0.13
229 0.11
230 0.12
231 0.12
232 0.1
233 0.1
234 0.09
235 0.08
236 0.07
237 0.06
238 0.06
239 0.08
240 0.08
241 0.09
242 0.1
243 0.12
244 0.12
245 0.16
246 0.2
247 0.21
248 0.22
249 0.22
250 0.21
251 0.19
252 0.18
253 0.15
254 0.12
255 0.08
256 0.1
257 0.09
258 0.09
259 0.09
260 0.11
261 0.16
262 0.16
263 0.18
264 0.2
265 0.21
266 0.24
267 0.26
268 0.25
269 0.22
270 0.24
271 0.25
272 0.25
273 0.24
274 0.21
275 0.2
276 0.2
277 0.19
278 0.18
279 0.15
280 0.13
281 0.17
282 0.18
283 0.19
284 0.24
285 0.25
286 0.26
287 0.29
288 0.26
289 0.22
290 0.21
291 0.2
292 0.16
293 0.15
294 0.13
295 0.1
296 0.12
297 0.11
298 0.13
299 0.13
300 0.1
301 0.1
302 0.1
303 0.1
304 0.12
305 0.15
306 0.15
307 0.16
308 0.22
309 0.23
310 0.23
311 0.22
312 0.19
313 0.17
314 0.15
315 0.13
316 0.07
317 0.05
318 0.06
319 0.06
320 0.05
321 0.05
322 0.05
323 0.05
324 0.04
325 0.04
326 0.04
327 0.04
328 0.05
329 0.07
330 0.08
331 0.09
332 0.11
333 0.12
334 0.12
335 0.11
336 0.11
337 0.09
338 0.09
339 0.07
340 0.05
341 0.04
342 0.04
343 0.04
344 0.04
345 0.03
346 0.03
347 0.02
348 0.02
349 0.02
350 0.03
351 0.03
352 0.03
353 0.03
354 0.05
355 0.05
356 0.05
357 0.06
358 0.08
359 0.08
360 0.08
361 0.08
362 0.07
363 0.07
364 0.08
365 0.07
366 0.06
367 0.06
368 0.06
369 0.06
370 0.06
371 0.06
372 0.04
373 0.05
374 0.11
375 0.21
376 0.31
377 0.37
378 0.47
379 0.56
380 0.67
381 0.76
382 0.79
383 0.8
384 0.81
385 0.84
386 0.83
387 0.82
388 0.77
389 0.68
390 0.6
391 0.5
392 0.42
393 0.35
394 0.27
395 0.23
396 0.2
397 0.21
398 0.21
399 0.21
400 0.18
401 0.16
402 0.15
403 0.1
404 0.09
405 0.06
406 0.06
407 0.06
408 0.06
409 0.05
410 0.05
411 0.05
412 0.07
413 0.07
414 0.06
415 0.06
416 0.07
417 0.08
418 0.1
419 0.12
420 0.12
421 0.15
422 0.22
423 0.27
424 0.32
425 0.36
426 0.39
427 0.41
428 0.45
429 0.51
430 0.5
431 0.46
432 0.46
433 0.42
434 0.38
435 0.38
436 0.34
437 0.25
438 0.21
439 0.19
440 0.14
441 0.16
442 0.16
443 0.14
444 0.13
445 0.15
446 0.15
447 0.17
448 0.25
449 0.31
450 0.38
451 0.41
452 0.5
453 0.51
454 0.54
455 0.57
456 0.51
457 0.49
458 0.46
459 0.46
460 0.37
461 0.36
462 0.3
463 0.27
464 0.25
465 0.23
466 0.2
467 0.22
468 0.22
469 0.24
470 0.26
471 0.32
472 0.38
473 0.42
474 0.47
475 0.48
476 0.51
477 0.53
478 0.58
479 0.57
480 0.54
481 0.53
482 0.53
483 0.5
484 0.5
485 0.48
486 0.45
487 0.4
488 0.37
489 0.32
490 0.28
491 0.29
492 0.27
493 0.29
494 0.3
495 0.29
496 0.28
497 0.3
498 0.27
499 0.25
500 0.24
501 0.21
502 0.2
503 0.27
504 0.26
505 0.23
506 0.23
507 0.23
508 0.24
509 0.23
510 0.25
511 0.24
512 0.26
513 0.34
514 0.36
515 0.42
516 0.45
517 0.45
518 0.45
519 0.47
520 0.49
521 0.45
522 0.44
523 0.37
524 0.37
525 0.39
526 0.37
527 0.34
528 0.31
529 0.28
530 0.3
531 0.29
532 0.28
533 0.32
534 0.37
535 0.42
536 0.42
537 0.45
538 0.41
539 0.41
540 0.37
541 0.33
542 0.33
543 0.32
544 0.32
545 0.31
546 0.31
547 0.32
548 0.4
549 0.47
550 0.46
551 0.42
552 0.46
553 0.47
554 0.57
555 0.64
556 0.58
557 0.58
558 0.61
559 0.6
560 0.56
561 0.52
562 0.47
563 0.43
564 0.46
565 0.4
566 0.32
567 0.29
568 0.27
569 0.26
570 0.21
571 0.17
572 0.13
573 0.12
574 0.11
575 0.1
576 0.1
577 0.1
578 0.09
579 0.07
580 0.07
581 0.03
582 0.03
583 0.03
584 0.03
585 0.03
586 0.03
587 0.02
588 0.03
589 0.03
590 0.03
591 0.02
592 0.03
593 0.03
594 0.03
595 0.03
596 0.03
597 0.03
598 0.05
599 0.05
600 0.06
601 0.09
602 0.11
603 0.15
604 0.16
605 0.19
606 0.18
607 0.24
608 0.32
609 0.34
610 0.37
611 0.4
612 0.47
613 0.47
614 0.48
615 0.44
616 0.37
617 0.33
618 0.33
619 0.29
620 0.21
621 0.2
622 0.22
623 0.19
624 0.19
625 0.19
626 0.16
627 0.14
628 0.13
629 0.12
630 0.1
631 0.1
632 0.09
633 0.09
634 0.13
635 0.13
636 0.16
637 0.19
638 0.21
639 0.27
640 0.32
641 0.37
642 0.38
643 0.44
644 0.49
645 0.55
646 0.52
647 0.53
648 0.48
649 0.43